Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A397SQP6

Protein Details
Accession A0A397SQP6    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
624-645GTIFNQRRKKEKEQLLRKRMIIHydrophilic
867-887EEQQKKKKEALQALKKQRDKEBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
632-633KK
871-898KKKKEALQALKKQRDKESARELKGFVKR
Subcellular Location(s) plas 12, nucl 5, E.R. 3, mito_nucl 3, pero 2, golg 2, vacu 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR030225  SCAP  
IPR000731  SSD  
IPR015943  WD40/YVTN_repeat-like_dom_sf  
IPR001680  WD40_repeat  
IPR036322  WD40_repeat_dom_sf  
Gene Ontology GO:0005789  C:endoplasmic reticulum membrane  
GO:0012507  C:ER to Golgi transport vesicle membrane  
GO:0000139  C:Golgi membrane  
GO:0032934  F:sterol binding  
GO:0006629  P:lipid metabolic process  
GO:0032933  P:SREBP signaling pathway  
Pfam View protein in Pfam  
PF12349  Sterol-sensing  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50156  SSD  
PS50082  WD_REPEATS_2  
Amino Acid Sequences MELDVKERVGKGLEKVGVSMTKNMVIRLFILFIISTAIDLVQEFCIFTSVAIMIDYLLQMTFFITTLSIDLRRLKISNLYTRRVGAPLIPTKTFNRNPKSINGIKGATNSSHNVSNGMFIYLMIAIFVMAIMYQTNRDFSSVLSSFTRSFSDLSVNKNTVSNITTANTFFETSTAADAEAFWDVVNPKKVNQYFEIRYPRKFTLFGTLNGRTNSLAGSTGSTRSSGSSPFLLEIAGTKLSLRSIVKSLKYIIVFPSVIIFAISYLVSRLVPSDQNDKDATPNDDKYSINKISLPDSLYKISSSFMATPRVVTLRGRHSADVNLLCANPNGMIITTATDKHITSWDGKRGVSLKKLERYMRKCDSCKCGITKGMKRCISWPVRSMCMSEKIELAAAGFEDGVVRVWDINSGQAIYILKDTVEDVESVISAMSGHTVNERVTCLQFVVPAASSMPHTPTCEKGYMNFSVRPASTQQAPSMLLASYRNGYFREWDLVSGQVVHTIATNQKGGISHLCVVDDGKLDYNQDDLRVFTGARDGSVKCWSRTIYYSENVSSSTNINELRKSRWKSTYTIAGEPGNAITCIATKVVKTANSTYGIVITGAADGETRVYDYLTGKPITTLSRGTIFNQRRKKEKEQLLRKRMIIRQQKLYNNNPSSNSDWYDFDFDDDEYDETENTDDDDDDELSHQDAITNIIINLIKQESCPCGNTEYGGFSIVTSSADEKVHVWQLVRDVMDCTCVAFDSKNVTKNATKNGRLQQKDVTEWDGVVSYHPKFIGRVSQPGGTVIVFIRENIVGVRKAKHNLGSKHGIPRCHGAEGEWEMWMLEINDPKVIESTQDDQENFDEIDVAELSVRTIPLVNEEDLFIEEQQKKKKEALQALKKQRDKESARELKGFVKRRPLTNNNIVGTNFGPTFPISSLPSNVNNHDHHTHHDHDNHEDTQGQVVDYRQSQRRRIALQRIYPDEKQLSLLDEEDEMNEFLPFALVRQLVKIGDDGVAIAYGNFVKVVLFEDSDGIL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.3
2 0.3
3 0.32
4 0.33
5 0.32
6 0.33
7 0.27
8 0.29
9 0.29
10 0.3
11 0.27
12 0.23
13 0.23
14 0.2
15 0.2
16 0.14
17 0.14
18 0.13
19 0.11
20 0.12
21 0.11
22 0.09
23 0.08
24 0.08
25 0.07
26 0.07
27 0.09
28 0.08
29 0.09
30 0.09
31 0.08
32 0.1
33 0.1
34 0.09
35 0.1
36 0.09
37 0.09
38 0.09
39 0.08
40 0.07
41 0.08
42 0.08
43 0.06
44 0.06
45 0.05
46 0.05
47 0.06
48 0.06
49 0.05
50 0.06
51 0.06
52 0.06
53 0.08
54 0.11
55 0.12
56 0.15
57 0.2
58 0.23
59 0.26
60 0.27
61 0.28
62 0.33
63 0.39
64 0.46
65 0.48
66 0.5
67 0.49
68 0.51
69 0.51
70 0.44
71 0.38
72 0.31
73 0.33
74 0.36
75 0.38
76 0.37
77 0.38
78 0.41
79 0.5
80 0.55
81 0.55
82 0.55
83 0.57
84 0.59
85 0.62
86 0.67
87 0.63
88 0.61
89 0.56
90 0.51
91 0.46
92 0.46
93 0.42
94 0.35
95 0.33
96 0.3
97 0.27
98 0.29
99 0.27
100 0.25
101 0.22
102 0.23
103 0.21
104 0.19
105 0.16
106 0.11
107 0.12
108 0.11
109 0.1
110 0.07
111 0.06
112 0.05
113 0.05
114 0.04
115 0.03
116 0.02
117 0.03
118 0.04
119 0.04
120 0.07
121 0.08
122 0.1
123 0.11
124 0.12
125 0.12
126 0.12
127 0.2
128 0.19
129 0.21
130 0.21
131 0.23
132 0.23
133 0.24
134 0.25
135 0.18
136 0.18
137 0.17
138 0.24
139 0.24
140 0.28
141 0.34
142 0.33
143 0.33
144 0.34
145 0.33
146 0.27
147 0.25
148 0.21
149 0.17
150 0.17
151 0.18
152 0.16
153 0.18
154 0.17
155 0.16
156 0.15
157 0.13
158 0.13
159 0.12
160 0.13
161 0.11
162 0.1
163 0.09
164 0.09
165 0.09
166 0.09
167 0.08
168 0.06
169 0.08
170 0.09
171 0.15
172 0.22
173 0.22
174 0.23
175 0.32
176 0.35
177 0.37
178 0.41
179 0.44
180 0.41
181 0.49
182 0.59
183 0.53
184 0.54
185 0.56
186 0.54
187 0.49
188 0.46
189 0.39
190 0.38
191 0.38
192 0.38
193 0.4
194 0.41
195 0.41
196 0.41
197 0.4
198 0.3
199 0.27
200 0.23
201 0.16
202 0.13
203 0.09
204 0.11
205 0.12
206 0.13
207 0.13
208 0.14
209 0.13
210 0.14
211 0.15
212 0.14
213 0.15
214 0.15
215 0.15
216 0.15
217 0.15
218 0.12
219 0.11
220 0.11
221 0.11
222 0.1
223 0.09
224 0.08
225 0.09
226 0.09
227 0.13
228 0.13
229 0.13
230 0.18
231 0.24
232 0.25
233 0.27
234 0.29
235 0.3
236 0.3
237 0.29
238 0.25
239 0.23
240 0.22
241 0.19
242 0.19
243 0.14
244 0.13
245 0.12
246 0.1
247 0.05
248 0.06
249 0.06
250 0.05
251 0.05
252 0.06
253 0.06
254 0.06
255 0.07
256 0.09
257 0.12
258 0.15
259 0.23
260 0.23
261 0.26
262 0.27
263 0.27
264 0.28
265 0.28
266 0.31
267 0.27
268 0.29
269 0.28
270 0.29
271 0.29
272 0.29
273 0.34
274 0.3
275 0.26
276 0.26
277 0.25
278 0.25
279 0.27
280 0.26
281 0.21
282 0.23
283 0.23
284 0.21
285 0.2
286 0.18
287 0.16
288 0.15
289 0.14
290 0.14
291 0.15
292 0.19
293 0.19
294 0.19
295 0.2
296 0.2
297 0.19
298 0.18
299 0.21
300 0.23
301 0.29
302 0.3
303 0.29
304 0.3
305 0.3
306 0.34
307 0.29
308 0.24
309 0.19
310 0.17
311 0.17
312 0.15
313 0.14
314 0.08
315 0.08
316 0.07
317 0.05
318 0.06
319 0.05
320 0.07
321 0.08
322 0.08
323 0.09
324 0.1
325 0.1
326 0.11
327 0.13
328 0.13
329 0.17
330 0.22
331 0.27
332 0.28
333 0.28
334 0.3
335 0.32
336 0.34
337 0.35
338 0.37
339 0.37
340 0.41
341 0.47
342 0.51
343 0.56
344 0.58
345 0.61
346 0.63
347 0.63
348 0.62
349 0.63
350 0.62
351 0.58
352 0.58
353 0.52
354 0.46
355 0.45
356 0.5
357 0.52
358 0.53
359 0.57
360 0.56
361 0.53
362 0.52
363 0.55
364 0.53
365 0.48
366 0.46
367 0.4
368 0.4
369 0.4
370 0.39
371 0.33
372 0.34
373 0.32
374 0.26
375 0.24
376 0.21
377 0.2
378 0.18
379 0.15
380 0.07
381 0.06
382 0.05
383 0.04
384 0.04
385 0.03
386 0.03
387 0.04
388 0.04
389 0.04
390 0.04
391 0.04
392 0.05
393 0.05
394 0.06
395 0.06
396 0.06
397 0.06
398 0.07
399 0.08
400 0.07
401 0.08
402 0.07
403 0.06
404 0.06
405 0.07
406 0.06
407 0.06
408 0.06
409 0.05
410 0.05
411 0.05
412 0.05
413 0.05
414 0.04
415 0.03
416 0.03
417 0.04
418 0.04
419 0.04
420 0.05
421 0.07
422 0.07
423 0.08
424 0.09
425 0.09
426 0.1
427 0.1
428 0.1
429 0.09
430 0.09
431 0.08
432 0.08
433 0.07
434 0.07
435 0.07
436 0.06
437 0.07
438 0.07
439 0.09
440 0.09
441 0.11
442 0.12
443 0.15
444 0.18
445 0.19
446 0.18
447 0.18
448 0.21
449 0.23
450 0.25
451 0.24
452 0.22
453 0.22
454 0.22
455 0.21
456 0.19
457 0.17
458 0.17
459 0.17
460 0.16
461 0.16
462 0.16
463 0.15
464 0.14
465 0.12
466 0.09
467 0.09
468 0.09
469 0.09
470 0.08
471 0.09
472 0.09
473 0.1
474 0.11
475 0.11
476 0.14
477 0.13
478 0.13
479 0.13
480 0.13
481 0.12
482 0.11
483 0.1
484 0.07
485 0.07
486 0.06
487 0.06
488 0.06
489 0.07
490 0.09
491 0.09
492 0.08
493 0.09
494 0.09
495 0.1
496 0.1
497 0.11
498 0.11
499 0.11
500 0.11
501 0.1
502 0.1
503 0.1
504 0.09
505 0.08
506 0.07
507 0.07
508 0.08
509 0.08
510 0.09
511 0.08
512 0.09
513 0.08
514 0.08
515 0.08
516 0.08
517 0.08
518 0.06
519 0.09
520 0.08
521 0.08
522 0.11
523 0.1
524 0.11
525 0.19
526 0.21
527 0.18
528 0.2
529 0.21
530 0.21
531 0.22
532 0.26
533 0.22
534 0.22
535 0.24
536 0.22
537 0.22
538 0.21
539 0.19
540 0.15
541 0.12
542 0.1
543 0.11
544 0.12
545 0.13
546 0.15
547 0.16
548 0.21
549 0.29
550 0.33
551 0.36
552 0.41
553 0.43
554 0.43
555 0.45
556 0.49
557 0.43
558 0.41
559 0.37
560 0.3
561 0.28
562 0.25
563 0.21
564 0.12
565 0.09
566 0.07
567 0.05
568 0.05
569 0.05
570 0.06
571 0.06
572 0.06
573 0.08
574 0.1
575 0.12
576 0.15
577 0.16
578 0.19
579 0.21
580 0.21
581 0.19
582 0.17
583 0.15
584 0.13
585 0.1
586 0.07
587 0.05
588 0.04
589 0.04
590 0.04
591 0.03
592 0.04
593 0.04
594 0.04
595 0.04
596 0.04
597 0.05
598 0.07
599 0.1
600 0.13
601 0.13
602 0.13
603 0.13
604 0.15
605 0.15
606 0.16
607 0.14
608 0.12
609 0.16
610 0.17
611 0.19
612 0.27
613 0.32
614 0.39
615 0.47
616 0.49
617 0.54
618 0.61
619 0.68
620 0.69
621 0.71
622 0.74
623 0.76
624 0.83
625 0.84
626 0.81
627 0.75
628 0.72
629 0.66
630 0.65
631 0.64
632 0.58
633 0.59
634 0.61
635 0.65
636 0.65
637 0.68
638 0.68
639 0.63
640 0.6
641 0.54
642 0.5
643 0.46
644 0.42
645 0.38
646 0.29
647 0.25
648 0.24
649 0.24
650 0.21
651 0.18
652 0.16
653 0.13
654 0.13
655 0.12
656 0.11
657 0.09
658 0.09
659 0.08
660 0.07
661 0.07
662 0.07
663 0.06
664 0.06
665 0.06
666 0.06
667 0.08
668 0.07
669 0.08
670 0.08
671 0.08
672 0.08
673 0.08
674 0.07
675 0.06
676 0.06
677 0.08
678 0.08
679 0.08
680 0.07
681 0.1
682 0.1
683 0.09
684 0.11
685 0.1
686 0.1
687 0.09
688 0.12
689 0.13
690 0.15
691 0.16
692 0.16
693 0.17
694 0.17
695 0.17
696 0.16
697 0.14
698 0.13
699 0.13
700 0.11
701 0.09
702 0.09
703 0.09
704 0.08
705 0.07
706 0.08
707 0.09
708 0.1
709 0.1
710 0.11
711 0.13
712 0.16
713 0.17
714 0.16
715 0.15
716 0.17
717 0.2
718 0.2
719 0.17
720 0.15
721 0.14
722 0.16
723 0.14
724 0.12
725 0.09
726 0.09
727 0.09
728 0.08
729 0.09
730 0.15
731 0.19
732 0.24
733 0.25
734 0.29
735 0.33
736 0.37
737 0.45
738 0.46
739 0.47
740 0.49
741 0.57
742 0.62
743 0.6
744 0.59
745 0.56
746 0.51
747 0.51
748 0.45
749 0.4
750 0.31
751 0.28
752 0.25
753 0.19
754 0.15
755 0.14
756 0.15
757 0.12
758 0.14
759 0.14
760 0.14
761 0.14
762 0.16
763 0.23
764 0.22
765 0.28
766 0.29
767 0.31
768 0.31
769 0.31
770 0.3
771 0.21
772 0.19
773 0.13
774 0.13
775 0.11
776 0.1
777 0.11
778 0.1
779 0.1
780 0.1
781 0.14
782 0.14
783 0.17
784 0.21
785 0.24
786 0.27
787 0.3
788 0.37
789 0.42
790 0.43
791 0.48
792 0.51
793 0.51
794 0.58
795 0.58
796 0.53
797 0.46
798 0.49
799 0.45
800 0.4
801 0.35
802 0.26
803 0.29
804 0.31
805 0.29
806 0.22
807 0.19
808 0.17
809 0.17
810 0.17
811 0.11
812 0.09
813 0.11
814 0.12
815 0.14
816 0.14
817 0.14
818 0.15
819 0.14
820 0.13
821 0.14
822 0.18
823 0.21
824 0.25
825 0.25
826 0.25
827 0.26
828 0.27
829 0.22
830 0.18
831 0.14
832 0.1
833 0.12
834 0.1
835 0.09
836 0.07
837 0.07
838 0.08
839 0.08
840 0.08
841 0.07
842 0.08
843 0.08
844 0.12
845 0.16
846 0.16
847 0.15
848 0.16
849 0.16
850 0.16
851 0.17
852 0.13
853 0.17
854 0.21
855 0.27
856 0.35
857 0.39
858 0.4
859 0.45
860 0.5
861 0.52
862 0.58
863 0.63
864 0.65
865 0.72
866 0.8
867 0.84
868 0.83
869 0.8
870 0.77
871 0.76
872 0.71
873 0.69
874 0.69
875 0.69
876 0.69
877 0.68
878 0.62
879 0.6
880 0.64
881 0.63
882 0.56
883 0.58
884 0.57
885 0.6
886 0.68
887 0.67
888 0.68
889 0.69
890 0.72
891 0.63
892 0.61
893 0.54
894 0.47
895 0.4
896 0.34
897 0.24
898 0.16
899 0.16
900 0.13
901 0.15
902 0.13
903 0.16
904 0.16
905 0.18
906 0.21
907 0.24
908 0.3
909 0.31
910 0.35
911 0.38
912 0.37
913 0.4
914 0.42
915 0.4
916 0.4
917 0.43
918 0.44
919 0.45
920 0.49
921 0.45
922 0.47
923 0.5
924 0.45
925 0.4
926 0.36
927 0.29
928 0.28
929 0.26
930 0.2
931 0.17
932 0.17
933 0.2
934 0.24
935 0.3
936 0.34
937 0.4
938 0.47
939 0.53
940 0.59
941 0.62
942 0.68
943 0.71
944 0.72
945 0.73
946 0.75
947 0.76
948 0.75
949 0.68
950 0.66
951 0.58
952 0.49
953 0.44
954 0.36
955 0.31
956 0.26
957 0.25
958 0.19
959 0.18
960 0.18
961 0.15
962 0.16
963 0.13
964 0.12
965 0.11
966 0.1
967 0.08
968 0.09
969 0.08
970 0.07
971 0.12
972 0.13
973 0.14
974 0.16
975 0.19
976 0.18
977 0.19
978 0.19
979 0.15
980 0.14
981 0.13
982 0.12
983 0.1
984 0.09
985 0.08
986 0.07
987 0.08
988 0.07
989 0.07
990 0.07
991 0.06
992 0.06
993 0.06
994 0.1
995 0.11
996 0.11
997 0.12