Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A397SDD4

Protein Details
Accession A0A397SDD4    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
104-129RNEDKEILEKKKKRRRRYLGLQIFQTHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
111-120LEKKKKRRRR
Subcellular Location(s) nucl 22.5, cyto_nucl 13.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR011425  Med9  
Gene Ontology GO:0016592  C:mediator complex  
GO:0003712  F:transcription coregulator activity  
GO:0006357  P:regulation of transcription by RNA polymerase II  
Pfam View protein in Pfam  
PF07544  Med9  
Amino Acid Sequences MQSYTSFDSTLLATPGSSFVLSQSQPQTPVTATGSTFEIDRFPREEFSFLPHIIQILDKVETGKNEQEIRAMMRKLKEKIHRCQKILDDLPGADLSRERQEKLRNEDKEILEKKKKRRRRYLGLQIFQTAATICYNNQSNPINPDTTTIIPTEDNQMDTTEG
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.1
2 0.11
3 0.11
4 0.1
5 0.08
6 0.09
7 0.14
8 0.14
9 0.19
10 0.22
11 0.23
12 0.24
13 0.25
14 0.25
15 0.21
16 0.23
17 0.21
18 0.18
19 0.17
20 0.16
21 0.17
22 0.15
23 0.15
24 0.12
25 0.13
26 0.12
27 0.15
28 0.15
29 0.16
30 0.19
31 0.2
32 0.21
33 0.18
34 0.22
35 0.24
36 0.22
37 0.21
38 0.18
39 0.17
40 0.15
41 0.15
42 0.11
43 0.08
44 0.09
45 0.08
46 0.1
47 0.1
48 0.11
49 0.14
50 0.14
51 0.16
52 0.17
53 0.17
54 0.17
55 0.16
56 0.18
57 0.2
58 0.2
59 0.19
60 0.22
61 0.27
62 0.29
63 0.35
64 0.41
65 0.44
66 0.52
67 0.6
68 0.63
69 0.59
70 0.6
71 0.56
72 0.55
73 0.5
74 0.42
75 0.32
76 0.25
77 0.25
78 0.21
79 0.18
80 0.1
81 0.09
82 0.09
83 0.14
84 0.15
85 0.15
86 0.2
87 0.27
88 0.34
89 0.42
90 0.49
91 0.45
92 0.5
93 0.55
94 0.53
95 0.55
96 0.53
97 0.54
98 0.54
99 0.59
100 0.64
101 0.68
102 0.76
103 0.77
104 0.83
105 0.85
106 0.86
107 0.9
108 0.91
109 0.91
110 0.87
111 0.79
112 0.69
113 0.59
114 0.48
115 0.37
116 0.26
117 0.16
118 0.12
119 0.1
120 0.09
121 0.13
122 0.16
123 0.16
124 0.21
125 0.23
126 0.25
127 0.29
128 0.32
129 0.29
130 0.27
131 0.29
132 0.28
133 0.27
134 0.25
135 0.21
136 0.2
137 0.19
138 0.2
139 0.24
140 0.21
141 0.21
142 0.2