Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A397TGE0

Protein Details
Accession A0A397TGE0    Localization Confidence High Confidence Score 21.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-20MPPKKKNTKSNQIQPENPVDHydrophilic
39-71STSPSQEMSTPKKRTRKPRTTKKKDLSSQEESNHydrophilic
90-115QEIVTSTKKRPGRKPKVKQQEVDTVKHydrophilic
145-172ATPEEPVKKKPGRKPKAKKQEEVQQQQHHydrophilic
257-277SPAPAPSKRGRPKKVKVDSQTHydrophilic
284-310TESHDTKPAPTRKRKPRKQEVSTEPDKBasic
337-362DEQPKAANPPKKRRTKKRDAATTQITHydrophilic
379-403RQPPAKTTKRGRPKKIKSVDKPPVSBasic
596-619YEEHQRKKTNPKEIIRQERKREEABasic
645-688IESVEKWEKKQEKKAKKSDVAFTDYNQVAHKKYKKQINELKPDIHydrophilic
749-770VNKTIAKREKSSRQKTVNEEDDHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
50-62KKRTRKPRTTKKK
97-105KKRPGRKPK
152-163KKKPGRKPKAKK
263-270SKRGRPKK
293-301PTRKRKPRK
343-354ANPPKKRRTKKR
380-396QPPAKTTKRGRPKKIKS
Subcellular Location(s) nucl 23.5, cyto_nucl 13.833, mito_nucl 12.666
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR013260  mRNA_splic_SYF2  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
Pfam View protein in Pfam  
PF08231  SYF2  
Amino Acid Sequences MPPKKKNTKSNQIQPENPVDQIIQNVVQDFVNEATSTSSTSPSQEMSTPKKRTRKPRTTKKKDLSSQEESNIMDPDVSASPVVNSETQSQEIVTSTKKRPGRKPKVKQQEVDTVKEELQEQQQQQQYMATSMTAAPQHQLLFINATPEEPVKKKPGRKPKAKKQEEVQQQQHPEEKIVNIQPKPAAIPTSSSSPAAIRNLINLDEDSFHPYGFNKREINLSESQGKKNYNSPPVAPSPVVHPTIAPIVNPLSTVTPSPAPAPSKRGRPKKVKVDSQTGNAPDITESHDTKPAPTRKRKPRKQEVSTEPDKQSEIIVGEISALQEQMDLKQQQIEEEDEQPKAANPPKKRRTKKRDAATTQITSAVESTSIDQTPVQKERQPPAKTTKRGRPKKIKSVDKPPVSDETVAIKMEQVDATEPRSGIESHIVELQPQQISSIDEDSIPSNVKVEQQKPTHSAKSSISPKNSVLLNEDLEISEPEHQEQDKQNSSHTVDENDVKLTEGFENNNKFQASVVEDVTMEDAQNKEEEAVNSLIGEQIVKRKRSLDNGDSDDEDSDKPTPKKLSRIEEIKARMEKFSKLRSRLDEGESANRKEVYEEHQRKKTNPKEIIRQERKREEAEKLLAKQQAEERGEDYERSKFWEYSIESVEKWEKKQEKKAKKSDVAFTDYNQVAHKKYKKQINELKPDIVTYNEQKAAAMASSSLIATEDGQIVSVDTESTFYRDVNSLQYASVDNQPSREAIERVVADVNKTIAKREKSSRQKTVNEEDDITYINERNRRFNEKIGRYYDKYTKEIKENFERGTAL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.81
2 0.79
3 0.7
4 0.6
5 0.51
6 0.41
7 0.33
8 0.3
9 0.26
10 0.19
11 0.18
12 0.18
13 0.17
14 0.16
15 0.15
16 0.15
17 0.13
18 0.12
19 0.11
20 0.11
21 0.12
22 0.13
23 0.15
24 0.14
25 0.16
26 0.15
27 0.18
28 0.19
29 0.18
30 0.2
31 0.22
32 0.29
33 0.36
34 0.45
35 0.52
36 0.59
37 0.67
38 0.74
39 0.81
40 0.84
41 0.86
42 0.87
43 0.9
44 0.93
45 0.94
46 0.96
47 0.95
48 0.95
49 0.92
50 0.91
51 0.88
52 0.85
53 0.8
54 0.71
55 0.64
56 0.54
57 0.48
58 0.39
59 0.3
60 0.21
61 0.15
62 0.15
63 0.13
64 0.12
65 0.11
66 0.09
67 0.1
68 0.11
69 0.13
70 0.12
71 0.13
72 0.16
73 0.18
74 0.2
75 0.2
76 0.18
77 0.17
78 0.17
79 0.17
80 0.19
81 0.24
82 0.27
83 0.34
84 0.4
85 0.48
86 0.57
87 0.67
88 0.73
89 0.77
90 0.84
91 0.87
92 0.93
93 0.93
94 0.88
95 0.84
96 0.83
97 0.77
98 0.71
99 0.62
100 0.54
101 0.45
102 0.41
103 0.35
104 0.27
105 0.29
106 0.31
107 0.3
108 0.34
109 0.38
110 0.37
111 0.36
112 0.35
113 0.29
114 0.24
115 0.22
116 0.15
117 0.11
118 0.11
119 0.14
120 0.13
121 0.12
122 0.12
123 0.13
124 0.14
125 0.14
126 0.15
127 0.13
128 0.15
129 0.15
130 0.18
131 0.16
132 0.16
133 0.15
134 0.16
135 0.2
136 0.19
137 0.23
138 0.3
139 0.37
140 0.46
141 0.55
142 0.64
143 0.7
144 0.79
145 0.86
146 0.88
147 0.91
148 0.91
149 0.88
150 0.85
151 0.85
152 0.84
153 0.83
154 0.79
155 0.75
156 0.7
157 0.66
158 0.64
159 0.54
160 0.45
161 0.37
162 0.31
163 0.3
164 0.32
165 0.36
166 0.31
167 0.33
168 0.33
169 0.31
170 0.32
171 0.27
172 0.23
173 0.16
174 0.19
175 0.18
176 0.22
177 0.23
178 0.21
179 0.2
180 0.19
181 0.22
182 0.2
183 0.21
184 0.16
185 0.17
186 0.18
187 0.19
188 0.19
189 0.16
190 0.15
191 0.13
192 0.14
193 0.17
194 0.16
195 0.15
196 0.14
197 0.15
198 0.22
199 0.24
200 0.29
201 0.25
202 0.26
203 0.32
204 0.33
205 0.37
206 0.33
207 0.33
208 0.36
209 0.37
210 0.39
211 0.39
212 0.38
213 0.35
214 0.38
215 0.42
216 0.42
217 0.41
218 0.4
219 0.4
220 0.42
221 0.43
222 0.36
223 0.3
224 0.26
225 0.28
226 0.28
227 0.22
228 0.19
229 0.17
230 0.21
231 0.21
232 0.16
233 0.13
234 0.13
235 0.13
236 0.13
237 0.12
238 0.09
239 0.1
240 0.1
241 0.11
242 0.11
243 0.11
244 0.13
245 0.16
246 0.18
247 0.19
248 0.26
249 0.29
250 0.39
251 0.48
252 0.56
253 0.62
254 0.69
255 0.76
256 0.8
257 0.84
258 0.83
259 0.8
260 0.79
261 0.73
262 0.67
263 0.62
264 0.53
265 0.44
266 0.35
267 0.29
268 0.2
269 0.17
270 0.17
271 0.15
272 0.16
273 0.17
274 0.21
275 0.21
276 0.23
277 0.31
278 0.36
279 0.42
280 0.5
281 0.59
282 0.66
283 0.77
284 0.84
285 0.87
286 0.9
287 0.91
288 0.88
289 0.88
290 0.85
291 0.83
292 0.79
293 0.74
294 0.64
295 0.55
296 0.47
297 0.37
298 0.28
299 0.21
300 0.16
301 0.1
302 0.08
303 0.07
304 0.07
305 0.07
306 0.07
307 0.05
308 0.05
309 0.04
310 0.05
311 0.05
312 0.06
313 0.11
314 0.11
315 0.11
316 0.14
317 0.14
318 0.14
319 0.16
320 0.18
321 0.14
322 0.19
323 0.2
324 0.18
325 0.18
326 0.17
327 0.16
328 0.18
329 0.22
330 0.23
331 0.3
332 0.41
333 0.51
334 0.61
335 0.71
336 0.78
337 0.83
338 0.87
339 0.89
340 0.88
341 0.89
342 0.83
343 0.81
344 0.76
345 0.67
346 0.56
347 0.49
348 0.38
349 0.28
350 0.23
351 0.15
352 0.08
353 0.07
354 0.08
355 0.08
356 0.08
357 0.08
358 0.08
359 0.11
360 0.15
361 0.18
362 0.19
363 0.21
364 0.25
365 0.32
366 0.4
367 0.4
368 0.4
369 0.46
370 0.54
371 0.57
372 0.61
373 0.63
374 0.65
375 0.72
376 0.78
377 0.79
378 0.79
379 0.82
380 0.85
381 0.86
382 0.81
383 0.83
384 0.82
385 0.76
386 0.68
387 0.6
388 0.54
389 0.45
390 0.39
391 0.28
392 0.22
393 0.19
394 0.17
395 0.15
396 0.12
397 0.1
398 0.1
399 0.09
400 0.06
401 0.06
402 0.07
403 0.09
404 0.09
405 0.09
406 0.09
407 0.1
408 0.1
409 0.09
410 0.13
411 0.11
412 0.11
413 0.14
414 0.13
415 0.12
416 0.13
417 0.15
418 0.11
419 0.11
420 0.1
421 0.08
422 0.09
423 0.1
424 0.1
425 0.08
426 0.08
427 0.08
428 0.09
429 0.09
430 0.09
431 0.08
432 0.07
433 0.08
434 0.12
435 0.17
436 0.2
437 0.26
438 0.28
439 0.32
440 0.36
441 0.4
442 0.39
443 0.35
444 0.36
445 0.3
446 0.36
447 0.41
448 0.42
449 0.4
450 0.38
451 0.37
452 0.37
453 0.37
454 0.29
455 0.23
456 0.2
457 0.18
458 0.16
459 0.16
460 0.12
461 0.12
462 0.11
463 0.09
464 0.1
465 0.1
466 0.1
467 0.11
468 0.12
469 0.15
470 0.19
471 0.25
472 0.27
473 0.27
474 0.28
475 0.3
476 0.31
477 0.31
478 0.28
479 0.23
480 0.2
481 0.22
482 0.22
483 0.19
484 0.17
485 0.13
486 0.12
487 0.12
488 0.11
489 0.1
490 0.11
491 0.16
492 0.2
493 0.2
494 0.23
495 0.22
496 0.2
497 0.19
498 0.2
499 0.17
500 0.15
501 0.15
502 0.12
503 0.12
504 0.13
505 0.14
506 0.12
507 0.08
508 0.08
509 0.08
510 0.08
511 0.08
512 0.08
513 0.07
514 0.09
515 0.1
516 0.11
517 0.12
518 0.11
519 0.11
520 0.11
521 0.1
522 0.08
523 0.08
524 0.06
525 0.14
526 0.2
527 0.21
528 0.22
529 0.26
530 0.3
531 0.39
532 0.46
533 0.44
534 0.45
535 0.48
536 0.49
537 0.46
538 0.43
539 0.35
540 0.28
541 0.22
542 0.16
543 0.14
544 0.19
545 0.19
546 0.23
547 0.3
548 0.32
549 0.4
550 0.46
551 0.51
552 0.52
553 0.57
554 0.56
555 0.56
556 0.57
557 0.55
558 0.53
559 0.47
560 0.42
561 0.38
562 0.41
563 0.39
564 0.45
565 0.46
566 0.46
567 0.51
568 0.53
569 0.57
570 0.55
571 0.53
572 0.49
573 0.43
574 0.48
575 0.48
576 0.44
577 0.4
578 0.36
579 0.32
580 0.28
581 0.28
582 0.24
583 0.3
584 0.39
585 0.44
586 0.51
587 0.54
588 0.58
589 0.67
590 0.69
591 0.68
592 0.67
593 0.66
594 0.69
595 0.77
596 0.83
597 0.83
598 0.84
599 0.83
600 0.82
601 0.8
602 0.75
603 0.69
604 0.63
605 0.6
606 0.58
607 0.55
608 0.49
609 0.51
610 0.48
611 0.43
612 0.41
613 0.38
614 0.39
615 0.34
616 0.33
617 0.28
618 0.29
619 0.3
620 0.29
621 0.27
622 0.22
623 0.21
624 0.25
625 0.28
626 0.24
627 0.23
628 0.3
629 0.29
630 0.3
631 0.34
632 0.3
633 0.27
634 0.31
635 0.38
636 0.33
637 0.33
638 0.38
639 0.42
640 0.48
641 0.59
642 0.66
643 0.69
644 0.76
645 0.85
646 0.86
647 0.86
648 0.84
649 0.81
650 0.77
651 0.72
652 0.62
653 0.53
654 0.51
655 0.43
656 0.38
657 0.33
658 0.29
659 0.26
660 0.34
661 0.4
662 0.42
663 0.49
664 0.57
665 0.62
666 0.7
667 0.77
668 0.79
669 0.81
670 0.77
671 0.73
672 0.65
673 0.58
674 0.49
675 0.41
676 0.36
677 0.3
678 0.31
679 0.29
680 0.29
681 0.27
682 0.26
683 0.24
684 0.19
685 0.15
686 0.09
687 0.07
688 0.08
689 0.08
690 0.07
691 0.07
692 0.07
693 0.07
694 0.09
695 0.1
696 0.09
697 0.1
698 0.09
699 0.09
700 0.09
701 0.09
702 0.07
703 0.06
704 0.08
705 0.08
706 0.1
707 0.11
708 0.11
709 0.13
710 0.15
711 0.16
712 0.19
713 0.22
714 0.2
715 0.19
716 0.21
717 0.2
718 0.21
719 0.26
720 0.26
721 0.24
722 0.25
723 0.26
724 0.25
725 0.26
726 0.28
727 0.22
728 0.19
729 0.24
730 0.23
731 0.24
732 0.29
733 0.26
734 0.24
735 0.24
736 0.25
737 0.23
738 0.23
739 0.27
740 0.3
741 0.35
742 0.41
743 0.49
744 0.57
745 0.64
746 0.74
747 0.78
748 0.79
749 0.81
750 0.83
751 0.83
752 0.8
753 0.73
754 0.66
755 0.57
756 0.49
757 0.43
758 0.36
759 0.28
760 0.25
761 0.26
762 0.29
763 0.3
764 0.38
765 0.43
766 0.5
767 0.51
768 0.57
769 0.63
770 0.66
771 0.72
772 0.72
773 0.73
774 0.69
775 0.72
776 0.71
777 0.66
778 0.62
779 0.61
780 0.6
781 0.61
782 0.64
783 0.64
784 0.66
785 0.66
786 0.63