Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A397SIC4

Protein Details
Accession A0A397SIC4    Localization Confidence High Confidence Score 16.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
10-40TQESAKEPATRRRVRNWRNKLPKPQTQTTTFHydrophilic
191-215DQNSSGSKSKRRRYKGASLKKDITEHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
198-206KSKRRRYKG
Subcellular Location(s) nucl 23.5, cyto_nucl 14.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR034352  Rim4_RRM1  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
CDD cd12453  RRM1_RIM4_like  
Amino Acid Sequences MEPSTIRKSTQESAKEPATRRRVRNWRNKLPKPQTQTTTFNNITSDAINNIPELDVKVKPLPKSNDEIQKFQKFDAVAKTAKTTTVKQKDEILVKNEQTLSKLKIQTSSNIAIPNNIIQGSPKSNSQNSPKLSEKNISNHISPKPNVQELPAKIGGQVSPKTNVQAPPLPVVRGKYSPKSNGQISLTKLNDQNSSGSKSKRRRYKGASLKKDITENQPNSQHLKSNDFDEASKLMNDQKIVVFKKDEDMENQSAPTTIVGKNEETKTDVSSNNQPISGKMVNDQVPVVEKNEVVEQMKEDIDNKKIRNTTIDKDQDCLNKYTDFAVVIERDKFGVEQQITSISITESEVIEETNSSDIQNLSVKDKKEIVQESQLEDSAIKKTEEKKVELISSNELSSKAEEESVATTDETSPSAFVKKFKEPVIDNDENDTQRERVEIPSVCATELQGTSKRGLPAGCLFVASLPSIKSDGELHKSVWNHFSRWGILLNVKVLKDWLFRPYSFVQFENVCDARRALVEAHNTVIEGRHIRVEQARVNRTLFIGRLNRSMSEEDIRKLLEPYGATEDIHLLRTYSTGKSKGCAFVKFCYRDDAIRAYMNLRQNTSNYVIEWAANLEKAVPGPEDIDKRSIFVGQLNQVEVTKESLVEKFGCYGRIREVQYIVRKFFRTIGPPRSAFAFIYYNDEEASRKAIEAENNTRYFDRTIRVQYRESQEFRNQQIQLLRQQQEVRRKAFQESYYNVPIRPPPLSRAQNYYVSAQKTSIGQGRRNSIIPKEMPIISAPVFYPQVSVGIHKVNTNGNKELKGKGPEVTSMQNNTVSNMRQPELMYYPPPTSIPTSVGMIPAYSGSPREGLTYPYAPSMTFMGAINHNNGTSYTRDGPGHETTSSTTVSKAPLASNILHSYVPPYVSGQPVNEYGHSAQYCGIPIPIQITMQPPMYFYPSPPIDPGYTISHLQTLEEPTSGYEADTEIHTQEKAAIGEIAKEEGPSSSKAAAQEPVAI
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.58
2 0.62
3 0.62
4 0.64
5 0.66
6 0.67
7 0.69
8 0.73
9 0.77
10 0.81
11 0.86
12 0.87
13 0.88
14 0.9
15 0.93
16 0.94
17 0.92
18 0.91
19 0.89
20 0.87
21 0.83
22 0.79
23 0.76
24 0.71
25 0.7
26 0.62
27 0.55
28 0.47
29 0.41
30 0.35
31 0.3
32 0.25
33 0.18
34 0.18
35 0.17
36 0.16
37 0.15
38 0.14
39 0.13
40 0.14
41 0.15
42 0.15
43 0.18
44 0.25
45 0.3
46 0.33
47 0.41
48 0.45
49 0.47
50 0.53
51 0.57
52 0.61
53 0.6
54 0.64
55 0.64
56 0.66
57 0.62
58 0.55
59 0.52
60 0.42
61 0.42
62 0.42
63 0.39
64 0.33
65 0.33
66 0.37
67 0.33
68 0.37
69 0.36
70 0.35
71 0.41
72 0.49
73 0.51
74 0.49
75 0.55
76 0.57
77 0.62
78 0.61
79 0.54
80 0.52
81 0.49
82 0.52
83 0.48
84 0.42
85 0.37
86 0.35
87 0.36
88 0.36
89 0.4
90 0.37
91 0.4
92 0.41
93 0.43
94 0.45
95 0.43
96 0.38
97 0.38
98 0.36
99 0.31
100 0.31
101 0.28
102 0.23
103 0.2
104 0.17
105 0.15
106 0.19
107 0.23
108 0.23
109 0.26
110 0.3
111 0.34
112 0.41
113 0.47
114 0.51
115 0.5
116 0.55
117 0.56
118 0.55
119 0.55
120 0.55
121 0.53
122 0.52
123 0.56
124 0.53
125 0.5
126 0.51
127 0.53
128 0.54
129 0.49
130 0.5
131 0.48
132 0.49
133 0.47
134 0.45
135 0.47
136 0.41
137 0.47
138 0.41
139 0.35
140 0.31
141 0.32
142 0.29
143 0.27
144 0.28
145 0.23
146 0.25
147 0.25
148 0.27
149 0.31
150 0.31
151 0.31
152 0.34
153 0.34
154 0.36
155 0.37
156 0.37
157 0.34
158 0.35
159 0.33
160 0.34
161 0.37
162 0.39
163 0.44
164 0.49
165 0.54
166 0.57
167 0.55
168 0.55
169 0.53
170 0.5
171 0.47
172 0.49
173 0.43
174 0.42
175 0.42
176 0.38
177 0.36
178 0.33
179 0.33
180 0.28
181 0.32
182 0.33
183 0.37
184 0.43
185 0.5
186 0.58
187 0.64
188 0.69
189 0.72
190 0.76
191 0.81
192 0.83
193 0.84
194 0.85
195 0.83
196 0.81
197 0.74
198 0.7
199 0.63
200 0.61
201 0.6
202 0.53
203 0.52
204 0.51
205 0.51
206 0.51
207 0.49
208 0.46
209 0.38
210 0.4
211 0.35
212 0.33
213 0.34
214 0.3
215 0.29
216 0.25
217 0.24
218 0.19
219 0.19
220 0.16
221 0.17
222 0.17
223 0.17
224 0.16
225 0.18
226 0.24
227 0.26
228 0.27
229 0.25
230 0.24
231 0.29
232 0.31
233 0.3
234 0.26
235 0.31
236 0.32
237 0.3
238 0.3
239 0.25
240 0.22
241 0.2
242 0.17
243 0.13
244 0.11
245 0.13
246 0.15
247 0.17
248 0.22
249 0.23
250 0.24
251 0.23
252 0.23
253 0.23
254 0.25
255 0.24
256 0.23
257 0.3
258 0.34
259 0.33
260 0.33
261 0.3
262 0.27
263 0.32
264 0.3
265 0.22
266 0.19
267 0.23
268 0.23
269 0.24
270 0.23
271 0.17
272 0.19
273 0.19
274 0.18
275 0.14
276 0.12
277 0.12
278 0.14
279 0.16
280 0.14
281 0.13
282 0.13
283 0.14
284 0.14
285 0.13
286 0.14
287 0.16
288 0.21
289 0.26
290 0.26
291 0.3
292 0.32
293 0.33
294 0.38
295 0.41
296 0.39
297 0.43
298 0.5
299 0.44
300 0.44
301 0.47
302 0.45
303 0.42
304 0.4
305 0.32
306 0.24
307 0.24
308 0.24
309 0.21
310 0.16
311 0.13
312 0.14
313 0.13
314 0.14
315 0.15
316 0.13
317 0.13
318 0.12
319 0.12
320 0.1
321 0.16
322 0.14
323 0.14
324 0.14
325 0.15
326 0.15
327 0.15
328 0.15
329 0.08
330 0.08
331 0.08
332 0.08
333 0.06
334 0.06
335 0.06
336 0.06
337 0.06
338 0.06
339 0.06
340 0.06
341 0.06
342 0.06
343 0.07
344 0.07
345 0.08
346 0.11
347 0.12
348 0.15
349 0.19
350 0.2
351 0.21
352 0.24
353 0.25
354 0.29
355 0.31
356 0.29
357 0.32
358 0.34
359 0.33
360 0.32
361 0.3
362 0.23
363 0.2
364 0.18
365 0.13
366 0.13
367 0.11
368 0.14
369 0.18
370 0.26
371 0.3
372 0.31
373 0.32
374 0.33
375 0.36
376 0.35
377 0.32
378 0.28
379 0.25
380 0.23
381 0.21
382 0.18
383 0.15
384 0.13
385 0.13
386 0.09
387 0.08
388 0.08
389 0.08
390 0.09
391 0.09
392 0.09
393 0.08
394 0.08
395 0.08
396 0.08
397 0.08
398 0.07
399 0.07
400 0.07
401 0.1
402 0.11
403 0.14
404 0.18
405 0.22
406 0.26
407 0.28
408 0.32
409 0.31
410 0.36
411 0.42
412 0.4
413 0.36
414 0.35
415 0.37
416 0.31
417 0.31
418 0.26
419 0.16
420 0.14
421 0.15
422 0.12
423 0.1
424 0.15
425 0.14
426 0.15
427 0.18
428 0.19
429 0.18
430 0.16
431 0.15
432 0.13
433 0.13
434 0.13
435 0.13
436 0.14
437 0.15
438 0.18
439 0.18
440 0.17
441 0.16
442 0.16
443 0.15
444 0.17
445 0.15
446 0.12
447 0.12
448 0.11
449 0.11
450 0.09
451 0.08
452 0.06
453 0.06
454 0.07
455 0.07
456 0.07
457 0.09
458 0.12
459 0.15
460 0.16
461 0.17
462 0.2
463 0.21
464 0.21
465 0.26
466 0.25
467 0.21
468 0.23
469 0.23
470 0.2
471 0.2
472 0.2
473 0.14
474 0.14
475 0.13
476 0.13
477 0.14
478 0.13
479 0.12
480 0.12
481 0.12
482 0.13
483 0.13
484 0.15
485 0.15
486 0.15
487 0.2
488 0.22
489 0.25
490 0.24
491 0.24
492 0.21
493 0.19
494 0.2
495 0.2
496 0.19
497 0.15
498 0.14
499 0.14
500 0.12
501 0.12
502 0.12
503 0.08
504 0.11
505 0.13
506 0.13
507 0.14
508 0.13
509 0.13
510 0.12
511 0.11
512 0.09
513 0.08
514 0.08
515 0.09
516 0.09
517 0.11
518 0.13
519 0.16
520 0.19
521 0.25
522 0.28
523 0.28
524 0.28
525 0.28
526 0.26
527 0.24
528 0.2
529 0.18
530 0.2
531 0.2
532 0.22
533 0.23
534 0.23
535 0.23
536 0.24
537 0.2
538 0.2
539 0.2
540 0.17
541 0.17
542 0.17
543 0.15
544 0.15
545 0.14
546 0.11
547 0.1
548 0.11
549 0.15
550 0.15
551 0.14
552 0.14
553 0.15
554 0.14
555 0.15
556 0.12
557 0.08
558 0.07
559 0.09
560 0.11
561 0.11
562 0.14
563 0.17
564 0.17
565 0.19
566 0.21
567 0.26
568 0.27
569 0.29
570 0.28
571 0.29
572 0.38
573 0.4
574 0.38
575 0.36
576 0.34
577 0.31
578 0.31
579 0.29
580 0.23
581 0.2
582 0.2
583 0.17
584 0.21
585 0.26
586 0.24
587 0.23
588 0.22
589 0.22
590 0.25
591 0.27
592 0.23
593 0.17
594 0.18
595 0.16
596 0.15
597 0.14
598 0.12
599 0.09
600 0.08
601 0.08
602 0.06
603 0.06
604 0.06
605 0.07
606 0.06
607 0.06
608 0.08
609 0.11
610 0.14
611 0.15
612 0.18
613 0.17
614 0.18
615 0.18
616 0.17
617 0.14
618 0.14
619 0.16
620 0.17
621 0.18
622 0.18
623 0.18
624 0.17
625 0.17
626 0.15
627 0.14
628 0.09
629 0.09
630 0.1
631 0.1
632 0.11
633 0.12
634 0.11
635 0.12
636 0.13
637 0.16
638 0.16
639 0.17
640 0.2
641 0.26
642 0.28
643 0.27
644 0.29
645 0.32
646 0.39
647 0.42
648 0.4
649 0.38
650 0.37
651 0.36
652 0.36
653 0.34
654 0.34
655 0.37
656 0.42
657 0.45
658 0.44
659 0.44
660 0.43
661 0.4
662 0.32
663 0.28
664 0.22
665 0.17
666 0.22
667 0.22
668 0.19
669 0.18
670 0.19
671 0.16
672 0.14
673 0.16
674 0.1
675 0.1
676 0.11
677 0.13
678 0.17
679 0.23
680 0.29
681 0.33
682 0.34
683 0.35
684 0.34
685 0.33
686 0.32
687 0.27
688 0.23
689 0.22
690 0.3
691 0.36
692 0.39
693 0.4
694 0.44
695 0.49
696 0.54
697 0.51
698 0.47
699 0.48
700 0.51
701 0.53
702 0.54
703 0.47
704 0.43
705 0.45
706 0.43
707 0.43
708 0.45
709 0.43
710 0.39
711 0.45
712 0.47
713 0.53
714 0.56
715 0.53
716 0.49
717 0.49
718 0.5
719 0.51
720 0.49
721 0.47
722 0.44
723 0.45
724 0.47
725 0.46
726 0.41
727 0.37
728 0.35
729 0.31
730 0.31
731 0.26
732 0.23
733 0.32
734 0.38
735 0.39
736 0.43
737 0.44
738 0.46
739 0.46
740 0.46
741 0.41
742 0.37
743 0.35
744 0.29
745 0.26
746 0.21
747 0.23
748 0.25
749 0.25
750 0.28
751 0.32
752 0.37
753 0.38
754 0.4
755 0.39
756 0.36
757 0.38
758 0.34
759 0.33
760 0.32
761 0.29
762 0.27
763 0.25
764 0.25
765 0.19
766 0.19
767 0.15
768 0.15
769 0.15
770 0.14
771 0.14
772 0.11
773 0.13
774 0.12
775 0.14
776 0.13
777 0.16
778 0.17
779 0.18
780 0.2
781 0.24
782 0.29
783 0.32
784 0.36
785 0.35
786 0.39
787 0.41
788 0.42
789 0.42
790 0.41
791 0.38
792 0.35
793 0.34
794 0.32
795 0.33
796 0.34
797 0.32
798 0.3
799 0.3
800 0.31
801 0.29
802 0.28
803 0.29
804 0.25
805 0.25
806 0.27
807 0.25
808 0.23
809 0.23
810 0.26
811 0.25
812 0.27
813 0.25
814 0.24
815 0.24
816 0.23
817 0.24
818 0.22
819 0.22
820 0.21
821 0.21
822 0.19
823 0.21
824 0.2
825 0.21
826 0.19
827 0.15
828 0.13
829 0.12
830 0.11
831 0.09
832 0.09
833 0.09
834 0.1
835 0.11
836 0.14
837 0.14
838 0.17
839 0.21
840 0.22
841 0.22
842 0.23
843 0.23
844 0.19
845 0.2
846 0.19
847 0.14
848 0.13
849 0.12
850 0.13
851 0.17
852 0.18
853 0.2
854 0.19
855 0.18
856 0.18
857 0.18
858 0.17
859 0.16
860 0.2
861 0.2
862 0.23
863 0.24
864 0.25
865 0.3
866 0.32
867 0.33
868 0.28
869 0.26
870 0.24
871 0.26
872 0.26
873 0.21
874 0.18
875 0.17
876 0.18
877 0.19
878 0.19
879 0.18
880 0.2
881 0.23
882 0.23
883 0.26
884 0.26
885 0.26
886 0.24
887 0.23
888 0.22
889 0.21
890 0.2
891 0.16
892 0.17
893 0.18
894 0.22
895 0.24
896 0.22
897 0.23
898 0.27
899 0.28
900 0.25
901 0.26
902 0.23
903 0.29
904 0.27
905 0.25
906 0.23
907 0.22
908 0.23
909 0.19
910 0.19
911 0.12
912 0.13
913 0.15
914 0.14
915 0.13
916 0.14
917 0.17
918 0.19
919 0.22
920 0.22
921 0.2
922 0.21
923 0.27
924 0.26
925 0.23
926 0.3
927 0.29
928 0.31
929 0.31
930 0.32
931 0.28
932 0.29
933 0.31
934 0.28
935 0.28
936 0.27
937 0.26
938 0.26
939 0.25
940 0.25
941 0.25
942 0.23
943 0.22
944 0.2
945 0.2
946 0.17
947 0.19
948 0.18
949 0.15
950 0.11
951 0.1
952 0.11
953 0.12
954 0.13
955 0.12
956 0.13
957 0.13
958 0.13
959 0.15
960 0.17
961 0.15
962 0.15
963 0.17
964 0.15
965 0.19
966 0.2
967 0.2
968 0.16
969 0.16
970 0.15
971 0.14
972 0.17
973 0.15
974 0.18
975 0.17
976 0.2
977 0.22
978 0.25
979 0.26