Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A397SHN5

Protein Details
Accession A0A397SHN5    Localization Confidence High Confidence Score 19.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
179-203PPPASNNKEKQPNKKKNKELTPHIVHydrophilic
345-391SHNTFRSNKSPDKKSRGSKDTSKKSKHSSKDSTKKNKPKTWSNSSSPHydrophilic
403-427VQLLTKQDSKKSRKRSKSHGGSKANHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
353-383KSPDKKSRGSKDTSKKSKHSSKDSTKKNKPK
412-426KKSRKRSKSHGGSKA
Subcellular Location(s) nucl 18.5, cyto_nucl 13.5, cyto 5.5
Family & Domain DBs
Amino Acid Sequences MGATISQHTDLFYNEYVASLEAKNFCRLEWGAQEAFLKKYNLWVDMKQGSIVNNTAHLVKGVSDNTAISRNILYLVSGVISTFYEDNMNKLVHRLEAIFKESQNKDLIIAERTAALDAAQYSNMEISSGSTSTINTNDSSILKPITIPDDQPIQSQPDQLQELMHLDKPDDELPKPVTPPPASNNKEKQPNKKKNKELTPHIVTEYTTPPTLKKNVRDVMLYDIPGTWDAEKIAEEINKNLGSLIKVSVTAKGKYRCVRFSDDWSLAQRQQQLSQQAVIKDLPSTCKELDIFNNQEFKETFNWEAIKLVKTPKGSKLIGYFGHHDDLIKAFQLPFIISNKSYNWSHNTFRSNKSPDKKSRGSKDTSKKSKHSSKDSTKKNKPKTWSNSSSPTGSLAEVLATLVQLLTKQDSKKSRKRSKSHGGSKAN
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.16
2 0.16
3 0.16
4 0.16
5 0.17
6 0.13
7 0.17
8 0.2
9 0.23
10 0.28
11 0.28
12 0.27
13 0.3
14 0.31
15 0.32
16 0.31
17 0.35
18 0.3
19 0.31
20 0.35
21 0.31
22 0.33
23 0.32
24 0.28
25 0.22
26 0.29
27 0.3
28 0.32
29 0.34
30 0.33
31 0.36
32 0.38
33 0.39
34 0.33
35 0.31
36 0.27
37 0.26
38 0.27
39 0.2
40 0.18
41 0.19
42 0.18
43 0.16
44 0.15
45 0.12
46 0.11
47 0.15
48 0.14
49 0.14
50 0.14
51 0.14
52 0.16
53 0.19
54 0.18
55 0.15
56 0.15
57 0.14
58 0.15
59 0.14
60 0.12
61 0.08
62 0.09
63 0.08
64 0.07
65 0.07
66 0.06
67 0.06
68 0.07
69 0.07
70 0.07
71 0.12
72 0.12
73 0.14
74 0.16
75 0.17
76 0.15
77 0.17
78 0.18
79 0.14
80 0.16
81 0.16
82 0.17
83 0.2
84 0.24
85 0.24
86 0.24
87 0.32
88 0.31
89 0.33
90 0.3
91 0.27
92 0.24
93 0.26
94 0.27
95 0.2
96 0.2
97 0.17
98 0.15
99 0.15
100 0.14
101 0.11
102 0.08
103 0.07
104 0.08
105 0.08
106 0.08
107 0.07
108 0.07
109 0.08
110 0.08
111 0.07
112 0.06
113 0.06
114 0.08
115 0.08
116 0.09
117 0.08
118 0.09
119 0.1
120 0.12
121 0.12
122 0.1
123 0.11
124 0.12
125 0.13
126 0.13
127 0.14
128 0.13
129 0.11
130 0.11
131 0.12
132 0.14
133 0.13
134 0.13
135 0.14
136 0.19
137 0.19
138 0.2
139 0.21
140 0.22
141 0.21
142 0.23
143 0.22
144 0.2
145 0.21
146 0.19
147 0.18
148 0.14
149 0.15
150 0.15
151 0.16
152 0.12
153 0.11
154 0.11
155 0.13
156 0.15
157 0.16
158 0.14
159 0.16
160 0.19
161 0.21
162 0.22
163 0.22
164 0.25
165 0.23
166 0.26
167 0.27
168 0.34
169 0.35
170 0.42
171 0.46
172 0.46
173 0.56
174 0.59
175 0.65
176 0.66
177 0.74
178 0.77
179 0.81
180 0.85
181 0.84
182 0.88
183 0.84
184 0.81
185 0.79
186 0.72
187 0.64
188 0.55
189 0.46
190 0.36
191 0.31
192 0.25
193 0.18
194 0.14
195 0.13
196 0.13
197 0.16
198 0.22
199 0.24
200 0.27
201 0.34
202 0.36
203 0.37
204 0.37
205 0.35
206 0.35
207 0.32
208 0.27
209 0.19
210 0.16
211 0.15
212 0.14
213 0.14
214 0.07
215 0.06
216 0.06
217 0.06
218 0.06
219 0.07
220 0.08
221 0.09
222 0.1
223 0.1
224 0.13
225 0.13
226 0.12
227 0.12
228 0.11
229 0.1
230 0.1
231 0.1
232 0.07
233 0.09
234 0.09
235 0.14
236 0.16
237 0.17
238 0.23
239 0.26
240 0.31
241 0.36
242 0.4
243 0.4
244 0.41
245 0.47
246 0.44
247 0.48
248 0.49
249 0.45
250 0.43
251 0.41
252 0.41
253 0.35
254 0.35
255 0.32
256 0.27
257 0.27
258 0.3
259 0.3
260 0.27
261 0.29
262 0.29
263 0.24
264 0.25
265 0.22
266 0.18
267 0.17
268 0.16
269 0.17
270 0.15
271 0.19
272 0.17
273 0.19
274 0.19
275 0.2
276 0.23
277 0.27
278 0.29
279 0.29
280 0.34
281 0.32
282 0.34
283 0.32
284 0.3
285 0.25
286 0.25
287 0.23
288 0.21
289 0.22
290 0.19
291 0.22
292 0.22
293 0.2
294 0.2
295 0.23
296 0.23
297 0.27
298 0.31
299 0.34
300 0.39
301 0.38
302 0.39
303 0.38
304 0.39
305 0.38
306 0.38
307 0.35
308 0.3
309 0.31
310 0.28
311 0.24
312 0.2
313 0.19
314 0.16
315 0.13
316 0.12
317 0.1
318 0.11
319 0.12
320 0.11
321 0.12
322 0.14
323 0.17
324 0.17
325 0.19
326 0.2
327 0.24
328 0.25
329 0.26
330 0.3
331 0.32
332 0.36
333 0.4
334 0.47
335 0.48
336 0.52
337 0.57
338 0.59
339 0.63
340 0.67
341 0.7
342 0.72
343 0.76
344 0.8
345 0.8
346 0.83
347 0.81
348 0.8
349 0.8
350 0.81
351 0.82
352 0.84
353 0.83
354 0.8
355 0.82
356 0.84
357 0.83
358 0.83
359 0.82
360 0.83
361 0.85
362 0.88
363 0.89
364 0.91
365 0.92
366 0.92
367 0.89
368 0.87
369 0.87
370 0.86
371 0.86
372 0.83
373 0.8
374 0.78
375 0.74
376 0.67
377 0.57
378 0.51
379 0.41
380 0.33
381 0.26
382 0.18
383 0.14
384 0.11
385 0.11
386 0.08
387 0.06
388 0.06
389 0.05
390 0.05
391 0.06
392 0.08
393 0.12
394 0.18
395 0.21
396 0.29
397 0.4
398 0.5
399 0.59
400 0.68
401 0.75
402 0.8
403 0.86
404 0.89
405 0.9
406 0.91
407 0.92