FuNGI

A0A397THX6

Protein Details

Accession

A0A397THX6

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

10.3

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
451-470	EKDKDKDKTKDKPKERAIPT	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
428-467	DSEKQKDKEKEKLEKEKEKEKQQEKDKDKDKTKDKPKERA

Subcellular Location(s)

cyto 9.5, cyto_nucl 9, nucl 7.5, mito 5, E.R. 2

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR045117 ATXN2-like IPR009604 LsmAD_domain IPR025852 SM_dom_ATX
Gene Ontology	GO:0003723 F:RNA binding
Pfam	View protein in Pfam PF06741 LsmAD PF14438 SM-ATX

Amino Acid Sequences

MHDRLMFLLVNFIGMNVTVTVRSGAKYQGLFKSASTKGELGVVLKMARKVLTKAEEKTEKTQNRVIPTYLIMAKDLMEIHACGIDFTTCDGDREAGAGSGFRTDTDISGRSEIRERELHKWTPDESGELMKGLEDDINSDSGNTSWDQFAANEQLFGIKTDFNEEIYTTKLDRSRADFKERERQAIAIANEITRSSTTNVHLLEERGFIVEESQMDEEERYGAVVRNRDPNKYTPPHLRKIQEQQQLQGGSVPVVKKLEPTKEPAKEVKIKSAEETKPTKQSQPSPTTTTATATATVTATATTITTSPATATTQKIPPFSSSSPLVNPVVSRKAGVDAEGKPIEDQIVKTFKQFATNEKERLQQRMQAIKKKDMDEKVDELRKWRQTFKLNLPLPQDLLPIMTKDKTKQQQLTAESATALNEKEKDKDSEKQKDKEKEKLEKEKEKEKQQEKDKDKDKTKDKPKERAIPTQNLEPKMKPEIKIEEDKSQKSNGDSTESKSANDKASDKPISAADKAPPQFPGRTAATTSNNSQFKLNAKANEWKPNPNAASFTPITPNTQDKRSPGSSPFFGTRQLRKNTATLKDGFTPFQKGKPVANPSSITPTWPFGNRPFRHQFTVTNNYEEDIYSQAAVTQGFGFAAYPVGHYRYPPNTQFVSVPPIPIQQGAPMPYMQPGQFVPGMPFTTAPMPPNGAPPMYSAQLPSVMPQHFGSQGYPSPGRTPMVPATMHPQMYQPYQNPHAMPPMMRFPHDMVPHVPPNGVMMGQRPVIMEQHYVNPEAAPMEGMPVSEPTTTQ

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.1
2	0.11
3	0.07
4	0.08
5	0.07
6	0.08
7	0.11
8	0.11
9	0.12
10	0.14
11	0.16
12	0.2
13	0.23
14	0.29
15	0.32
16	0.34
17	0.33
18	0.32
19	0.38
20	0.35
21	0.35
22	0.33
23	0.28
24	0.26
25	0.28
26	0.28
27	0.21
28	0.2
29	0.19
30	0.18
31	0.2
32	0.21
33	0.2
34	0.21
35	0.23
36	0.24
37	0.3
38	0.35
39	0.39
40	0.42
41	0.5
42	0.55
43	0.57
44	0.61
45	0.64
46	0.62
47	0.61
48	0.63
49	0.59
50	0.58
51	0.57
52	0.52
53	0.44
54	0.4
55	0.4
56	0.36
57	0.31
58	0.24
59	0.21
60	0.2
61	0.19
62	0.18
63	0.13
64	0.12
65	0.11
66	0.11
67	0.13
68	0.12
69	0.1
70	0.1
71	0.1
72	0.09
73	0.1
74	0.14
75	0.13
76	0.14
77	0.15
78	0.15
79	0.14
80	0.15
81	0.14
82	0.1
83	0.1
84	0.09
85	0.09
86	0.1
87	0.1
88	0.09
89	0.11
90	0.11
91	0.12
92	0.16
93	0.18
94	0.18
95	0.22
96	0.23
97	0.22
98	0.28
99	0.28
100	0.29
101	0.33
102	0.35
103	0.39
104	0.45
105	0.49
106	0.46
107	0.48
108	0.45
109	0.44
110	0.4
111	0.36
112	0.3
113	0.28
114	0.25
115	0.22
116	0.2
117	0.14
118	0.13
119	0.11
120	0.11
121	0.07
122	0.09
123	0.1
124	0.11
125	0.1
126	0.11
127	0.1
128	0.09
129	0.11
130	0.09
131	0.1
132	0.09
133	0.1
134	0.1
135	0.1
136	0.13
137	0.17
138	0.16
139	0.15
140	0.14
141	0.16
142	0.15
143	0.16
144	0.15
145	0.11
146	0.11
147	0.15
148	0.16
149	0.15
150	0.15
151	0.15
152	0.14
153	0.15
154	0.17
155	0.14
156	0.17
157	0.2
158	0.21
159	0.24
160	0.3
161	0.37
162	0.4
163	0.49
164	0.49
165	0.52
166	0.59
167	0.59
168	0.57
169	0.49
170	0.44
171	0.38
172	0.39
173	0.34
174	0.28
175	0.26
176	0.21
177	0.2
178	0.2
179	0.18
180	0.12
181	0.14
182	0.11
183	0.14
184	0.16
185	0.2
186	0.2
187	0.21
188	0.22
189	0.21
190	0.21
191	0.18
192	0.17
193	0.13
194	0.13
195	0.1
196	0.1
197	0.1
198	0.08
199	0.1
200	0.1
201	0.09
202	0.1
203	0.1
204	0.09
205	0.09
206	0.08
207	0.06
208	0.07
209	0.1
210	0.13
211	0.17
212	0.2
213	0.28
214	0.31
215	0.34
216	0.36
217	0.39
218	0.45
219	0.45
220	0.48
221	0.5
222	0.55
223	0.59
224	0.63
225	0.61
226	0.59
227	0.64
228	0.68
229	0.65
230	0.59
231	0.54
232	0.53
233	0.5
234	0.42
235	0.34
236	0.25
237	0.17
238	0.19
239	0.17
240	0.12
241	0.13
242	0.13
243	0.15
244	0.2
245	0.25
246	0.24
247	0.31
248	0.38
249	0.4
250	0.45
251	0.45
252	0.47
253	0.49
254	0.49
255	0.51
256	0.47
257	0.43
258	0.42
259	0.47
260	0.43
261	0.41
262	0.45
263	0.4
264	0.44
265	0.46
266	0.48
267	0.44
268	0.5
269	0.53
270	0.55
271	0.55
272	0.52
273	0.53
274	0.49
275	0.44
276	0.37
277	0.3
278	0.23
279	0.19
280	0.14
281	0.13
282	0.1
283	0.1
284	0.09
285	0.07
286	0.06
287	0.05
288	0.05
289	0.04
290	0.05
291	0.06
292	0.06
293	0.06
294	0.06
295	0.07
296	0.09
297	0.11
298	0.13
299	0.15
300	0.2
301	0.22
302	0.23
303	0.23
304	0.23
305	0.26
306	0.25
307	0.25
308	0.23
309	0.22
310	0.22
311	0.23
312	0.22
313	0.17
314	0.17
315	0.16
316	0.17
317	0.16
318	0.15
319	0.13
320	0.15
321	0.15
322	0.16
323	0.17
324	0.14
325	0.19
326	0.19
327	0.19
328	0.16
329	0.16
330	0.16
331	0.13
332	0.12
333	0.11
334	0.16
335	0.16
336	0.16
337	0.2
338	0.19
339	0.26
340	0.26
341	0.27
342	0.32
343	0.36
344	0.39
345	0.37
346	0.43
347	0.38
348	0.43
349	0.39
350	0.34
351	0.35
352	0.41
353	0.44
354	0.45
355	0.47
356	0.48
357	0.51
358	0.5
359	0.5
360	0.45
361	0.44
362	0.41
363	0.41
364	0.4
365	0.4
366	0.37
367	0.35
368	0.38
369	0.4
370	0.39
371	0.39
372	0.39
373	0.41
374	0.47
375	0.51
376	0.54
377	0.49
378	0.5
379	0.5
380	0.44
381	0.39
382	0.33
383	0.26
384	0.15
385	0.15
386	0.11
387	0.09
388	0.09
389	0.1
390	0.1
391	0.11
392	0.19
393	0.24
394	0.3
395	0.33
396	0.36
397	0.4
398	0.42
399	0.45
400	0.37
401	0.32
402	0.26
403	0.22
404	0.19
405	0.13
406	0.11
407	0.08
408	0.1
409	0.1
410	0.12
411	0.14
412	0.17
413	0.2
414	0.27
415	0.35
416	0.43
417	0.49
418	0.54
419	0.6
420	0.66
421	0.67
422	0.69
423	0.68
424	0.67
425	0.69
426	0.73
427	0.73
428	0.72
429	0.72
430	0.73
431	0.72
432	0.71
433	0.72
434	0.69
435	0.69
436	0.7
437	0.76
438	0.72
439	0.75
440	0.73
441	0.72
442	0.72
443	0.72
444	0.71
445	0.7
446	0.75
447	0.76
448	0.77
449	0.78
450	0.78
451	0.8
452	0.77
453	0.77
454	0.72
455	0.7
456	0.65
457	0.63
458	0.59
459	0.53
460	0.5
461	0.41
462	0.38
463	0.37
464	0.38
465	0.32
466	0.31
467	0.33
468	0.35
469	0.42
470	0.42
471	0.43
472	0.44
473	0.45
474	0.42
475	0.39
476	0.36
477	0.3
478	0.3
479	0.23
480	0.24
481	0.23
482	0.25
483	0.3
484	0.29
485	0.28
486	0.28
487	0.3
488	0.26
489	0.28
490	0.27
491	0.22
492	0.3
493	0.3
494	0.27
495	0.26
496	0.27
497	0.27
498	0.26
499	0.25
500	0.2
501	0.26
502	0.27
503	0.26
504	0.25
505	0.25
506	0.24
507	0.23
508	0.26
509	0.21
510	0.22
511	0.23
512	0.25
513	0.27
514	0.29
515	0.31
516	0.33
517	0.33
518	0.32
519	0.3
520	0.28
521	0.27
522	0.32
523	0.33
524	0.28
525	0.3
526	0.39
527	0.42
528	0.51
529	0.5
530	0.48
531	0.46
532	0.5
533	0.48
534	0.4
535	0.39
536	0.29
537	0.33
538	0.28
539	0.26
540	0.23
541	0.23
542	0.24
543	0.23
544	0.3
545	0.27
546	0.31
547	0.32
548	0.31
549	0.37
550	0.38
551	0.39
552	0.36
553	0.39
554	0.36
555	0.36
556	0.37
557	0.31
558	0.34
559	0.37
560	0.4
561	0.43
562	0.46
563	0.48
564	0.47
565	0.52
566	0.53
567	0.52
568	0.48
569	0.42
570	0.41
571	0.41
572	0.41
573	0.37
574	0.32
575	0.33
576	0.3
577	0.31
578	0.34
579	0.3
580	0.33
581	0.39
582	0.45
583	0.41
584	0.45
585	0.42
586	0.39
587	0.44
588	0.4
589	0.34
590	0.28
591	0.27
592	0.25
593	0.26
594	0.28
595	0.28
596	0.39
597	0.38
598	0.45
599	0.51
600	0.52
601	0.55
602	0.54
603	0.52
604	0.5
605	0.59
606	0.52
607	0.47
608	0.43
609	0.38
610	0.36
611	0.3
612	0.22
613	0.14
614	0.13
615	0.1
616	0.09
617	0.1
618	0.1
619	0.1
620	0.1
621	0.08
622	0.07
623	0.07
624	0.07
625	0.07
626	0.06
627	0.08
628	0.07
629	0.08
630	0.1
631	0.13
632	0.14
633	0.15
634	0.21
635	0.25
636	0.32
637	0.33
638	0.37
639	0.36
640	0.37
641	0.38
642	0.34
643	0.36
644	0.3
645	0.29
646	0.25
647	0.25
648	0.24
649	0.23
650	0.21
651	0.17
652	0.2
653	0.2
654	0.2
655	0.18
656	0.18
657	0.19
658	0.22
659	0.18
660	0.17
661	0.15
662	0.17
663	0.18
664	0.18
665	0.18
666	0.18
667	0.19
668	0.18
669	0.18
670	0.16
671	0.19
672	0.2
673	0.19
674	0.18
675	0.2
676	0.2
677	0.25
678	0.26
679	0.22
680	0.21
681	0.22
682	0.24
683	0.22
684	0.22
685	0.18
686	0.17
687	0.19
688	0.19
689	0.18
690	0.2
691	0.2
692	0.22
693	0.22
694	0.23
695	0.23
696	0.24
697	0.23
698	0.21
699	0.23
700	0.27
701	0.28
702	0.27
703	0.27
704	0.29
705	0.29
706	0.26
707	0.29
708	0.27
709	0.3
710	0.29
711	0.27
712	0.31
713	0.35
714	0.35
715	0.3
716	0.29
717	0.28
718	0.32
719	0.38
720	0.36
721	0.37
722	0.41
723	0.46
724	0.44
725	0.42
726	0.45
727	0.4
728	0.38
729	0.35
730	0.4
731	0.38
732	0.38
733	0.38
734	0.35
735	0.41
736	0.41
737	0.4
738	0.34
739	0.39
740	0.42
741	0.4
742	0.37
743	0.29
744	0.28
745	0.26
746	0.23
747	0.17
748	0.15
749	0.18
750	0.18
751	0.19
752	0.18
753	0.18
754	0.2
755	0.21
756	0.21
757	0.2
758	0.27
759	0.28
760	0.29
761	0.27
762	0.25
763	0.23
764	0.21
765	0.19
766	0.12
767	0.1
768	0.11
769	0.11
770	0.11
771	0.11
772	0.12
773	0.14

A0A397THX6

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer