FuNGI

A0A397S0C2

Protein Details

Accession

A0A397S0C2

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

12.4

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
807-829	ASSPSAKKKSKKSKSDSNHSQSI	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
813-819	KKKSKKS

Subcellular Location(s)

nucl 17.5, cyto_nucl 11.833, cyto 5, cyto_mito 3.833, pero 2

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR039745 Vps54 IPR012501 Vps54_C IPR019515 VPS54_N
Gene Ontology	GO:0005829 C:cytosol GO:0000938 C:GARP complex GO:0015031 P:protein transport GO:0042147 P:retrograde transport, endosome to Golgi
Pfam	View protein in Pfam PF07928 Vps54 PF10475 Vps54_N

Amino Acid Sequences

MDRNEEIKQNSKSPTIDVESSVAGRSDSTSPKSSKTQGSAASPPQTPRRFSSSSARSFDNSDYFTNTFKNQRVPSAMSLYGRGYSRGLARRVSMNSSISNFSTMSETSLPWTTKDIGFNAISGVLNNPNTKSSNSVRPSKNDIPTVPHVNIRKVKPSDFNSYIKQITPVFERYSHNKELGAEGLQSRKSTLPITESPATSVTNLLASNLENLQGSKETENQIPVHRLASTRNPYTVHLPLPSPGDDRTPEPVIELPLLETVPSIFFDPEFNLENPRTFDIVCEQTDIIGGNPNNPTISTNAILQEKLSHYLDTVEVHLIKEISLRSSSFFAALSNLQALHSETLECISQINNLREKLNEVDNTQAKKGLEVVRLKRRRVNMGRLYEGLRMVSEIRSTQPMIQVLLGQGDYFSALDLIDEANNILHGDESQRIQLEEKIVELETKNLEIINPKTTMVRRLNNVADEFKRSGTIDLRSVKVLMHFSGQLTEMYKSIGVMMENDLLNMLFLDFEENVEKVNKSDIIKSLYNYKIPQSTKQSTTSINVTIDSEIMEKEDNLKKRITPLILGLYRVNRLASTFHAYHERILEEIKKIIQVQKHHPSSISHTDSREDQLSDWPKEQSSKMAKLLKGMTFDSFLDMLLSIYAVLLEGMKRIAIYNELFTTILGDVEISGYQIQIGTEITEGEKKPLNDDNQTLGNESDVKDEQATATPKNDSSISLDKESKLKNDSNGSLDRLTISRKDSNSSLDKEENSKSDSSSSVNSTSSLNSRFSALKITTGIKSIIQKTSSLTNKPSLSTPAEKEAVVASSPSAKKKSKKSKSDSNHSQSISDSAQIVYAAADLAHVRCANLIAVRADQNAQLNQKDFYRLFNVTSAFVLECEGLCGRMCYGLRGTIMSQAKAFLNHFHMERTRQAATLVENEQWVQEQVPIDFQRIIDKIVSAAISGLSDFKDDPADSTSSPISPVFPMSRFSTSSRNGDSENTIKNTSNGTTKTPPVSQLNSGSSKYIFVEERRFFVVGCSLTLIKLLGDYLRCMANIPTLTTEAMNRIVDILNLFNSRTCQVILGAGAMKSAGLKNITAKHLALASQSLGLMIILIPFIRECIRHSLNTKQAVMLTEFDRIKRDYVNHQNEIHGKLVSIMSERLAVHLKSFQAINWDEVSSREGPNQYMEVLVKETTTLHKVLNKYLPPEILQNVMTEVFNSSNTKLSEEIGNTKIITATGKKRLMTDAQYYIRKLSTLEGLQGPSNDLEIAVNNIQINDNSSKEDLPNVANTTTNTSPPSSK

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.46
2	0.43
3	0.4
4	0.35
5	0.33
6	0.3
7	0.29
8	0.27
9	0.21
10	0.15
11	0.13
12	0.15
13	0.18
14	0.22
15	0.26
16	0.32
17	0.34
18	0.39
19	0.46
20	0.49
21	0.51
22	0.5
23	0.52
24	0.5
25	0.54
26	0.56
27	0.56
28	0.56
29	0.52
30	0.52
31	0.56
32	0.56
33	0.54
34	0.52
35	0.53
36	0.51
37	0.51
38	0.57
39	0.56
40	0.59
41	0.59
42	0.57
43	0.51
44	0.51
45	0.51
46	0.46
47	0.39
48	0.32
49	0.34
50	0.32
51	0.32
52	0.32
53	0.32
54	0.34
55	0.35
56	0.42
57	0.39
58	0.44
59	0.48
60	0.5
61	0.5
62	0.48
63	0.47
64	0.4
65	0.4
66	0.35
67	0.33
68	0.29
69	0.26
70	0.21
71	0.21
72	0.27
73	0.32
74	0.34
75	0.33
76	0.35
77	0.4
78	0.42
79	0.44
80	0.41
81	0.37
82	0.37
83	0.37
84	0.38
85	0.32
86	0.3
87	0.25
88	0.22
89	0.21
90	0.18
91	0.19
92	0.17
93	0.17
94	0.18
95	0.23
96	0.23
97	0.21
98	0.25
99	0.24
100	0.26
101	0.29
102	0.27
103	0.27
104	0.26
105	0.25
106	0.22
107	0.21
108	0.18
109	0.15
110	0.16
111	0.15
112	0.18
113	0.2
114	0.2
115	0.22
116	0.24
117	0.25
118	0.29
119	0.29
120	0.37
121	0.41
122	0.49
123	0.51
124	0.55
125	0.63
126	0.66
127	0.67
128	0.63
129	0.59
130	0.56
131	0.58
132	0.59
133	0.51
134	0.49
135	0.46
136	0.49
137	0.54
138	0.51
139	0.54
140	0.51
141	0.55
142	0.57
143	0.59
144	0.6
145	0.58
146	0.59
147	0.54
148	0.55
149	0.52
150	0.44
151	0.42
152	0.34
153	0.32
154	0.32
155	0.32
156	0.29
157	0.31
158	0.35
159	0.39
160	0.44
161	0.45
162	0.41
163	0.39
164	0.37
165	0.35
166	0.32
167	0.27
168	0.21
169	0.2
170	0.23
171	0.24
172	0.23
173	0.22
174	0.21
175	0.22
176	0.22
177	0.22
178	0.23
179	0.25
180	0.32
181	0.33
182	0.32
183	0.32
184	0.31
185	0.3
186	0.24
187	0.21
188	0.15
189	0.13
190	0.12
191	0.11
192	0.11
193	0.1
194	0.12
195	0.11
196	0.12
197	0.1
198	0.11
199	0.12
200	0.13
201	0.14
202	0.14
203	0.18
204	0.21
205	0.23
206	0.26
207	0.27
208	0.29
209	0.31
210	0.3
211	0.27
212	0.25
213	0.24
214	0.25
215	0.32
216	0.35
217	0.34
218	0.37
219	0.37
220	0.38
221	0.42
222	0.41
223	0.34
224	0.29
225	0.27
226	0.26
227	0.28
228	0.27
229	0.24
230	0.21
231	0.22
232	0.22
233	0.23
234	0.27
235	0.26
236	0.24
237	0.23
238	0.24
239	0.22
240	0.21
241	0.18
242	0.13
243	0.12
244	0.12
245	0.1
246	0.09
247	0.07
248	0.07
249	0.08
250	0.08
251	0.07
252	0.08
253	0.09
254	0.11
255	0.13
256	0.16
257	0.16
258	0.19
259	0.2
260	0.22
261	0.24
262	0.25
263	0.23
264	0.19
265	0.2
266	0.21
267	0.24
268	0.22
269	0.22
270	0.19
271	0.18
272	0.19
273	0.18
274	0.13
275	0.15
276	0.14
277	0.16
278	0.17
279	0.17
280	0.17
281	0.17
282	0.18
283	0.13
284	0.16
285	0.14
286	0.15
287	0.18
288	0.19
289	0.18
290	0.17
291	0.19
292	0.18
293	0.21
294	0.2
295	0.16
296	0.15
297	0.17
298	0.18
299	0.15
300	0.15
301	0.14
302	0.13
303	0.13
304	0.14
305	0.12
306	0.11
307	0.13
308	0.12
309	0.12
310	0.12
311	0.13
312	0.13
313	0.15
314	0.16
315	0.13
316	0.13
317	0.11
318	0.12
319	0.12
320	0.11
321	0.1
322	0.1
323	0.09
324	0.1
325	0.11
326	0.09
327	0.09
328	0.09
329	0.08
330	0.09
331	0.09
332	0.08
333	0.07
334	0.07
335	0.11
336	0.17
337	0.22
338	0.25
339	0.27
340	0.28
341	0.28
342	0.31
343	0.29
344	0.28
345	0.26
346	0.22
347	0.28
348	0.33
349	0.35
350	0.32
351	0.33
352	0.27
353	0.25
354	0.3
355	0.28
356	0.29
357	0.35
358	0.42
359	0.49
360	0.56
361	0.59
362	0.59
363	0.58
364	0.62
365	0.62
366	0.64
367	0.62
368	0.62
369	0.62
370	0.59
371	0.57
372	0.48
373	0.4
374	0.3
375	0.21
376	0.16
377	0.13
378	0.12
379	0.11
380	0.1
381	0.11
382	0.13
383	0.14
384	0.15
385	0.17
386	0.17
387	0.17
388	0.16
389	0.16
390	0.13
391	0.13
392	0.12
393	0.08
394	0.07
395	0.06
396	0.06
397	0.05
398	0.05
399	0.04
400	0.03
401	0.03
402	0.04
403	0.04
404	0.04
405	0.04
406	0.04
407	0.04
408	0.04
409	0.05
410	0.04
411	0.04
412	0.04
413	0.06
414	0.08
415	0.09
416	0.1
417	0.1
418	0.11
419	0.12
420	0.14
421	0.14
422	0.13
423	0.12
424	0.12
425	0.12
426	0.13
427	0.12
428	0.12
429	0.11
430	0.11
431	0.1
432	0.09
433	0.1
434	0.13
435	0.15
436	0.16
437	0.16
438	0.16
439	0.19
440	0.2
441	0.28
442	0.3
443	0.32
444	0.32
445	0.36
446	0.38
447	0.37
448	0.38
449	0.35
450	0.29
451	0.3
452	0.28
453	0.23
454	0.22
455	0.2
456	0.2
457	0.19
458	0.2
459	0.21
460	0.23
461	0.24
462	0.23
463	0.23
464	0.21
465	0.2
466	0.19
467	0.13
468	0.12
469	0.12
470	0.11
471	0.12
472	0.12
473	0.11
474	0.11
475	0.11
476	0.09
477	0.09
478	0.09
479	0.08
480	0.08
481	0.08
482	0.06
483	0.06
484	0.07
485	0.09
486	0.09
487	0.09
488	0.09
489	0.08
490	0.07
491	0.06
492	0.05
493	0.03
494	0.03
495	0.04
496	0.04
497	0.05
498	0.06
499	0.06
500	0.07
501	0.09
502	0.09
503	0.08
504	0.1
505	0.12
506	0.13
507	0.15
508	0.18
509	0.21
510	0.23
511	0.23
512	0.29
513	0.28
514	0.29
515	0.28
516	0.27
517	0.29
518	0.29
519	0.35
520	0.35
521	0.38
522	0.39
523	0.41
524	0.41
525	0.36
526	0.37
527	0.33
528	0.27
529	0.22
530	0.19
531	0.16
532	0.14
533	0.13
534	0.11
535	0.09
536	0.06
537	0.07
538	0.06
539	0.05
540	0.11
541	0.16
542	0.19
543	0.2
544	0.21
545	0.21
546	0.25
547	0.29
548	0.25
549	0.21
550	0.2
551	0.25
552	0.25
553	0.26
554	0.23
555	0.21
556	0.21
557	0.2
558	0.17
559	0.1
560	0.1
561	0.1
562	0.11
563	0.15
564	0.14
565	0.15
566	0.2
567	0.2
568	0.21
569	0.21
570	0.19
571	0.14
572	0.15
573	0.16
574	0.12
575	0.12
576	0.12
577	0.12
578	0.13
579	0.16
580	0.18
581	0.21
582	0.28
583	0.36
584	0.38
585	0.37
586	0.37
587	0.35
588	0.38
589	0.42
590	0.38
591	0.31
592	0.29
593	0.3
594	0.3
595	0.31
596	0.26
597	0.18
598	0.14
599	0.19
600	0.24
601	0.24
602	0.24
603	0.23
604	0.22
605	0.23
606	0.23
607	0.23
608	0.23
609	0.25
610	0.3
611	0.34
612	0.34
613	0.35
614	0.39
615	0.33
616	0.3
617	0.27
618	0.21
619	0.18
620	0.17
621	0.15
622	0.12
623	0.1
624	0.08
625	0.07
626	0.06
627	0.04
628	0.04
629	0.03
630	0.03
631	0.03
632	0.02
633	0.02
634	0.02
635	0.03
636	0.03
637	0.03
638	0.03
639	0.03
640	0.04
641	0.04
642	0.06
643	0.07
644	0.08
645	0.08
646	0.09
647	0.09
648	0.09
649	0.09
650	0.07
651	0.07
652	0.05
653	0.05
654	0.04
655	0.04
656	0.04
657	0.03
658	0.03
659	0.03
660	0.03
661	0.04
662	0.04
663	0.04
664	0.04
665	0.04
666	0.04
667	0.04
668	0.05
669	0.08
670	0.08
671	0.1
672	0.12
673	0.12
674	0.15
675	0.2
676	0.22
677	0.21
678	0.23
679	0.24
680	0.24
681	0.25
682	0.22
683	0.17
684	0.15
685	0.14
686	0.13
687	0.13
688	0.1
689	0.1
690	0.09
691	0.09
692	0.09
693	0.12
694	0.14
695	0.12
696	0.13
697	0.14
698	0.14
699	0.15
700	0.15
701	0.12
702	0.15
703	0.2
704	0.21
705	0.23
706	0.24
707	0.24
708	0.29
709	0.29
710	0.26
711	0.25
712	0.25
713	0.25
714	0.28
715	0.29
716	0.28
717	0.29
718	0.29
719	0.25
720	0.23
721	0.2
722	0.16
723	0.16
724	0.15
725	0.17
726	0.19
727	0.2
728	0.22
729	0.23
730	0.27
731	0.3
732	0.31
733	0.3
734	0.28
735	0.28
736	0.29
737	0.3
738	0.27
739	0.24
740	0.22
741	0.18
742	0.17
743	0.17
744	0.15
745	0.15
746	0.16
747	0.15
748	0.15
749	0.15
750	0.14
751	0.14
752	0.16
753	0.16
754	0.15
755	0.14
756	0.16
757	0.16
758	0.15
759	0.19
760	0.16
761	0.15
762	0.16
763	0.18
764	0.16
765	0.17
766	0.18
767	0.15
768	0.19
769	0.2
770	0.22
771	0.2
772	0.2
773	0.2
774	0.27
775	0.29
776	0.28
777	0.27
778	0.29
779	0.3
780	0.3
781	0.3
782	0.26
783	0.26
784	0.28
785	0.27
786	0.26
787	0.26
788	0.25
789	0.24
790	0.21
791	0.17
792	0.13
793	0.11
794	0.07
795	0.13
796	0.14
797	0.17
798	0.23
799	0.27
800	0.34
801	0.45
802	0.56
803	0.59
804	0.68
805	0.73
806	0.78
807	0.82
808	0.86
809	0.86
810	0.81
811	0.77
812	0.67
813	0.6
814	0.5
815	0.44
816	0.33
817	0.24
818	0.18
819	0.11
820	0.11
821	0.1
822	0.09
823	0.06
824	0.06
825	0.05
826	0.04
827	0.04
828	0.04
829	0.05
830	0.07
831	0.07
832	0.06
833	0.07
834	0.07
835	0.08
836	0.08
837	0.1
838	0.09
839	0.11
840	0.12
841	0.13
842	0.13
843	0.14
844	0.15
845	0.17
846	0.19
847	0.19
848	0.19
849	0.19
850	0.2
851	0.23
852	0.2
853	0.2
854	0.22
855	0.21
856	0.21
857	0.23
858	0.23
859	0.19
860	0.19
861	0.17
862	0.12
863	0.11
864	0.11
865	0.08
866	0.07
867	0.07
868	0.07
869	0.07
870	0.07
871	0.07
872	0.07
873	0.1
874	0.11
875	0.11
876	0.12
877	0.14
878	0.14
879	0.15
880	0.16
881	0.19
882	0.21
883	0.2
884	0.19
885	0.18
886	0.18
887	0.19
888	0.19
889	0.15
890	0.17
891	0.19
892	0.19
893	0.21
894	0.23
895	0.24
896	0.27
897	0.29
898	0.25
899	0.24
900	0.24
901	0.22
902	0.21
903	0.23
904	0.21
905	0.17
906	0.17
907	0.16
908	0.16
909	0.15
910	0.13
911	0.09
912	0.1
913	0.1
914	0.1
915	0.16
916	0.16
917	0.17
918	0.18
919	0.17
920	0.2
921	0.2
922	0.21
923	0.16
924	0.15
925	0.13
926	0.14
927	0.14
928	0.08
929	0.08
930	0.06
931	0.06
932	0.06
933	0.07
934	0.06
935	0.07
936	0.07
937	0.07
938	0.09
939	0.09
940	0.11
941	0.13
942	0.15
943	0.14
944	0.16
945	0.17
946	0.14
947	0.16
948	0.14
949	0.13
950	0.11
951	0.14
952	0.15
953	0.15
954	0.18
955	0.2
956	0.23
957	0.24
958	0.26
959	0.31
960	0.32
961	0.36
962	0.37
963	0.35
964	0.33
965	0.33
966	0.35
967	0.32
968	0.33
969	0.31
970	0.3
971	0.29
972	0.29
973	0.29
974	0.26
975	0.27
976	0.24
977	0.27
978	0.28
979	0.31
980	0.34
981	0.33
982	0.36
983	0.35
984	0.37
985	0.35
986	0.36
987	0.38
988	0.37
989	0.37
990	0.33
991	0.28
992	0.26
993	0.23
994	0.22
995	0.19
996	0.19
997	0.28
998	0.28
999	0.3
1000	0.32
1001	0.31
1002	0.27
1003	0.26
1004	0.28
1005	0.19
1006	0.18
1007	0.18
1008	0.15
1009	0.15
1010	0.16
1011	0.14
1012	0.09
1013	0.08
1014	0.08
1015	0.08
1016	0.09
1017	0.1
1018	0.11
1019	0.12
1020	0.12
1021	0.13
1022	0.13
1023	0.16
1024	0.16
1025	0.16
1026	0.17
1027	0.17
1028	0.18
1029	0.17
1030	0.18
1031	0.15
1032	0.17
1033	0.16
1034	0.14
1035	0.14
1036	0.13
1037	0.13
1038	0.13
1039	0.12
1040	0.12
1041	0.13
1042	0.13
1043	0.12
1044	0.14
1045	0.15
1046	0.15
1047	0.14
1048	0.12
1049	0.12
1050	0.13
1051	0.12
1052	0.12
1053	0.13
1054	0.11
1055	0.11
1056	0.1
1057	0.09
1058	0.09
1059	0.09
1060	0.1
1061	0.09
1062	0.1
1063	0.16
1064	0.22
1065	0.24
1066	0.25
1067	0.25
1068	0.24
1069	0.24
1070	0.24
1071	0.2
1072	0.16
1073	0.14
1074	0.12
1075	0.12
1076	0.1
1077	0.09
1078	0.08
1079	0.07
1080	0.05
1081	0.05
1082	0.04
1083	0.04
1084	0.05
1085	0.04
1086	0.06
1087	0.08
1088	0.08
1089	0.11
1090	0.2
1091	0.24
1092	0.28
1093	0.33
1094	0.4
1095	0.47
1096	0.52
1097	0.5
1098	0.43
1099	0.41
1100	0.39
1101	0.37
1102	0.31
1103	0.24
1104	0.25
1105	0.26
1106	0.25
1107	0.27
1108	0.26
1109	0.26
1110	0.28
1111	0.3
1112	0.34
1113	0.43
1114	0.51
1115	0.53
1116	0.53
1117	0.57
1118	0.57
1119	0.56
1120	0.48
1121	0.37
1122	0.28
1123	0.24
1124	0.23
1125	0.19
1126	0.16
1127	0.14
1128	0.13
1129	0.16
1130	0.16
1131	0.16
1132	0.2
1133	0.19
1134	0.19
1135	0.22
1136	0.22
1137	0.2
1138	0.21
1139	0.19
1140	0.22
1141	0.23
1142	0.24
1143	0.22
1144	0.22
1145	0.2
1146	0.21
1147	0.25
1148	0.2
1149	0.2
1150	0.21
1151	0.21
1152	0.22
1153	0.25
1154	0.25
1155	0.21
1156	0.21
1157	0.2
1158	0.17
1159	0.18
1160	0.17
1161	0.14
1162	0.13
1163	0.14
1164	0.15
1165	0.18
1166	0.18
1167	0.19
1168	0.24
1169	0.27
1170	0.34
1171	0.41
1172	0.41
1173	0.42
1174	0.44
1175	0.43
1176	0.4
1177	0.42
1178	0.37
1179	0.31
1180	0.28
1181	0.24
1182	0.22
1183	0.21
1184	0.19
1185	0.15
1186	0.15
1187	0.13
1188	0.15
1189	0.17
1190	0.16
1191	0.21
1192	0.22
1193	0.23
1194	0.22
1195	0.23
1196	0.25
1197	0.26
1198	0.31
1199	0.27
1200	0.28
1201	0.26
1202	0.26
1203	0.25
1204	0.2
1205	0.21
1206	0.22
1207	0.28
1208	0.35
1209	0.4
1210	0.41
1211	0.42
1212	0.47
1213	0.49
1214	0.48
1215	0.47
1216	0.47
1217	0.5
1218	0.54
1219	0.53
1220	0.51
1221	0.45
1222	0.39
1223	0.33
1224	0.27
1225	0.27
1226	0.24
1227	0.27
1228	0.28
1229	0.29
1230	0.3
1231	0.3
1232	0.29
1233	0.22
1234	0.21
1235	0.16
1236	0.13
1237	0.11
1238	0.1
1239	0.15
1240	0.14
1241	0.15
1242	0.15
1243	0.16
1244	0.17
1245	0.17
1246	0.21
1247	0.19
1248	0.2
1249	0.21
1250	0.23
1251	0.24
1252	0.24
1253	0.27
1254	0.25
1255	0.24
1256	0.28
1257	0.27
1258	0.27
1259	0.27
1260	0.27
1261	0.31
1262	0.3
1263	0.3
1264	0.28

A0A397S0C2

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer