Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A397T492

Protein Details
Accession A0A397T492    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-20MDKRKQKHRTVRNSKTEIDLHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 22.5, cyto_nucl 13.5, cyto 3.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR004212  GTF2I  
IPR036647  GTF2I-like_rpt_sf  
IPR009071  HMG_box_dom  
IPR036910  HMG_box_dom_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
Pfam View protein in Pfam  
PF02946  GTF2I  
PF09011  HMG_box_2  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51139  GTF2I  
CDD cd00084  HMG-box_SF  
Amino Acid Sequences MDKRKQKHRTVRNSKTEIDLPNEFDHQESIINHEETMLIDSDSQNQKDQWTEMEQSIQAALMNNNNNCNNDNSVEITQDINTVSVQDLSVGEIDNDIISVNTIDVDYEENSEIGERNDKKASNRLTQLTEEAIHKLDEEFYRHDMAIKQIAQDLNIDVSWIQKYVKNHHETVTIDHKNKKSGYNVFQDTEWWPNHKEEFSSFGVESNKACAIAWRSLSESDKQKYEEKAALENEKMKEIQFNYIEDPRKRHVQAQSDINNIKTTVRCMEKKCGLEVAILIVPNRSNDSFSSTFVGTSSGEAFFRASPEMYPLLDKFEIYTKNRYLEQTGQIVTPPTKRIKRELSATSNSTSKYNEISHNPIAVSSTHRNINSADVKARVRAILRARYNNALGTEGLIIPYKKWKDHQGEIEVIGWPKDVPFDDFGVLKVAQKKQILDCLHNISFRKKDDKIVL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.81
2 0.77
3 0.72
4 0.65
5 0.6
6 0.53
7 0.46
8 0.43
9 0.42
10 0.36
11 0.3
12 0.27
13 0.21
14 0.21
15 0.17
16 0.19
17 0.23
18 0.23
19 0.22
20 0.22
21 0.21
22 0.18
23 0.2
24 0.16
25 0.1
26 0.11
27 0.12
28 0.2
29 0.25
30 0.26
31 0.27
32 0.27
33 0.29
34 0.3
35 0.31
36 0.27
37 0.26
38 0.28
39 0.26
40 0.29
41 0.26
42 0.24
43 0.23
44 0.19
45 0.15
46 0.13
47 0.14
48 0.16
49 0.22
50 0.23
51 0.28
52 0.31
53 0.32
54 0.31
55 0.33
56 0.3
57 0.25
58 0.25
59 0.24
60 0.22
61 0.21
62 0.21
63 0.19
64 0.16
65 0.16
66 0.14
67 0.11
68 0.1
69 0.09
70 0.09
71 0.09
72 0.08
73 0.08
74 0.07
75 0.08
76 0.09
77 0.08
78 0.07
79 0.07
80 0.07
81 0.06
82 0.06
83 0.05
84 0.04
85 0.04
86 0.04
87 0.04
88 0.04
89 0.04
90 0.04
91 0.05
92 0.07
93 0.07
94 0.09
95 0.1
96 0.09
97 0.09
98 0.1
99 0.1
100 0.1
101 0.18
102 0.17
103 0.21
104 0.25
105 0.28
106 0.3
107 0.38
108 0.43
109 0.42
110 0.46
111 0.46
112 0.45
113 0.44
114 0.43
115 0.36
116 0.32
117 0.26
118 0.22
119 0.18
120 0.15
121 0.14
122 0.12
123 0.14
124 0.14
125 0.15
126 0.17
127 0.18
128 0.2
129 0.2
130 0.21
131 0.19
132 0.2
133 0.23
134 0.21
135 0.19
136 0.21
137 0.21
138 0.2
139 0.19
140 0.17
141 0.12
142 0.11
143 0.1
144 0.07
145 0.08
146 0.08
147 0.08
148 0.09
149 0.1
150 0.14
151 0.21
152 0.3
153 0.33
154 0.34
155 0.35
156 0.39
157 0.37
158 0.39
159 0.41
160 0.38
161 0.38
162 0.42
163 0.42
164 0.43
165 0.44
166 0.43
167 0.39
168 0.41
169 0.43
170 0.45
171 0.46
172 0.42
173 0.4
174 0.38
175 0.33
176 0.31
177 0.26
178 0.21
179 0.19
180 0.2
181 0.22
182 0.21
183 0.2
184 0.16
185 0.2
186 0.19
187 0.19
188 0.18
189 0.18
190 0.19
191 0.19
192 0.18
193 0.15
194 0.14
195 0.11
196 0.11
197 0.1
198 0.12
199 0.14
200 0.15
201 0.14
202 0.15
203 0.17
204 0.18
205 0.21
206 0.24
207 0.23
208 0.24
209 0.26
210 0.28
211 0.28
212 0.29
213 0.28
214 0.23
215 0.26
216 0.26
217 0.26
218 0.23
219 0.26
220 0.23
221 0.21
222 0.2
223 0.16
224 0.18
225 0.16
226 0.2
227 0.17
228 0.17
229 0.19
230 0.25
231 0.3
232 0.29
233 0.32
234 0.3
235 0.35
236 0.35
237 0.38
238 0.39
239 0.41
240 0.45
241 0.49
242 0.5
243 0.49
244 0.49
245 0.43
246 0.38
247 0.3
248 0.27
249 0.18
250 0.17
251 0.16
252 0.21
253 0.25
254 0.28
255 0.35
256 0.39
257 0.4
258 0.39
259 0.37
260 0.32
261 0.27
262 0.24
263 0.19
264 0.13
265 0.12
266 0.11
267 0.1
268 0.1
269 0.09
270 0.12
271 0.1
272 0.1
273 0.1
274 0.17
275 0.18
276 0.19
277 0.21
278 0.19
279 0.18
280 0.17
281 0.18
282 0.11
283 0.11
284 0.11
285 0.09
286 0.09
287 0.09
288 0.1
289 0.09
290 0.1
291 0.1
292 0.09
293 0.08
294 0.11
295 0.12
296 0.11
297 0.13
298 0.12
299 0.16
300 0.16
301 0.15
302 0.14
303 0.18
304 0.24
305 0.25
306 0.31
307 0.3
308 0.32
309 0.35
310 0.36
311 0.35
312 0.34
313 0.35
314 0.33
315 0.31
316 0.29
317 0.27
318 0.28
319 0.25
320 0.23
321 0.24
322 0.28
323 0.33
324 0.36
325 0.43
326 0.5
327 0.53
328 0.57
329 0.6
330 0.6
331 0.59
332 0.59
333 0.54
334 0.48
335 0.43
336 0.37
337 0.3
338 0.24
339 0.22
340 0.23
341 0.26
342 0.28
343 0.34
344 0.35
345 0.35
346 0.33
347 0.29
348 0.27
349 0.23
350 0.25
351 0.22
352 0.24
353 0.27
354 0.27
355 0.29
356 0.28
357 0.35
358 0.34
359 0.32
360 0.32
361 0.31
362 0.32
363 0.33
364 0.34
365 0.29
366 0.25
367 0.29
368 0.33
369 0.38
370 0.44
371 0.49
372 0.52
373 0.54
374 0.54
375 0.49
376 0.43
377 0.35
378 0.27
379 0.22
380 0.2
381 0.15
382 0.14
383 0.15
384 0.14
385 0.13
386 0.23
387 0.25
388 0.27
389 0.32
390 0.41
391 0.46
392 0.55
393 0.62
394 0.59
395 0.59
396 0.57
397 0.54
398 0.47
399 0.4
400 0.31
401 0.23
402 0.17
403 0.13
404 0.15
405 0.14
406 0.15
407 0.16
408 0.18
409 0.2
410 0.2
411 0.2
412 0.21
413 0.2
414 0.22
415 0.27
416 0.29
417 0.34
418 0.37
419 0.41
420 0.41
421 0.5
422 0.5
423 0.47
424 0.49
425 0.5
426 0.5
427 0.51
428 0.5
429 0.49
430 0.51
431 0.52
432 0.54
433 0.49