Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A397TIW3

Protein Details
Accession A0A397TIW3    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
200-228SSRNDRDYRPYDRRDRDRGRDRDRRGRRTBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
212-228RRDRDRGRDRDRRGRRT
Subcellular Location(s) nucl 22.5, cyto_nucl 14, cyto 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR011082  Exosome-assoc_fac/DNA_repair  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0006364  P:rRNA processing  
Amino Acid Sequences MSGNKNGKQMDVSIKDSISTDTELEVQADSLFTKIRNTLSELEGGFDDIDSLLEPLLSQPLSELASSLGPIDRARLYLLYGYTLNSLISLFLELKGQDSKIRILEEQYRRIQDCSEKITNTVNPPQPSLSLNRDAASRFVKHALSNAKDRDRDTRENSRATSSGTHIRFNDEDDYGGASNNRSNSRFVRDDRDRDNRSRSSRNDRDYRPYDRRDRDRGRDRDRRGRRT
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.35
2 0.34
3 0.33
4 0.3
5 0.23
6 0.19
7 0.15
8 0.14
9 0.15
10 0.15
11 0.15
12 0.13
13 0.11
14 0.09
15 0.09
16 0.08
17 0.07
18 0.08
19 0.08
20 0.1
21 0.13
22 0.15
23 0.16
24 0.2
25 0.23
26 0.23
27 0.26
28 0.24
29 0.23
30 0.2
31 0.19
32 0.15
33 0.11
34 0.1
35 0.06
36 0.06
37 0.05
38 0.05
39 0.04
40 0.04
41 0.04
42 0.04
43 0.07
44 0.06
45 0.06
46 0.06
47 0.08
48 0.09
49 0.09
50 0.08
51 0.07
52 0.07
53 0.08
54 0.08
55 0.07
56 0.07
57 0.07
58 0.09
59 0.09
60 0.09
61 0.1
62 0.1
63 0.1
64 0.11
65 0.11
66 0.11
67 0.1
68 0.1
69 0.1
70 0.1
71 0.09
72 0.07
73 0.07
74 0.05
75 0.05
76 0.06
77 0.05
78 0.05
79 0.06
80 0.06
81 0.08
82 0.09
83 0.09
84 0.1
85 0.11
86 0.13
87 0.14
88 0.15
89 0.14
90 0.16
91 0.24
92 0.27
93 0.32
94 0.33
95 0.34
96 0.33
97 0.34
98 0.32
99 0.28
100 0.26
101 0.26
102 0.26
103 0.23
104 0.23
105 0.26
106 0.26
107 0.26
108 0.29
109 0.28
110 0.26
111 0.26
112 0.26
113 0.24
114 0.24
115 0.24
116 0.22
117 0.21
118 0.21
119 0.21
120 0.21
121 0.21
122 0.22
123 0.21
124 0.18
125 0.15
126 0.17
127 0.18
128 0.17
129 0.21
130 0.25
131 0.25
132 0.31
133 0.35
134 0.37
135 0.39
136 0.4
137 0.44
138 0.44
139 0.48
140 0.49
141 0.54
142 0.54
143 0.55
144 0.55
145 0.5
146 0.43
147 0.39
148 0.34
149 0.27
150 0.31
151 0.28
152 0.31
153 0.28
154 0.31
155 0.3
156 0.3
157 0.29
158 0.21
159 0.2
160 0.17
161 0.19
162 0.15
163 0.15
164 0.13
165 0.11
166 0.13
167 0.17
168 0.2
169 0.19
170 0.23
171 0.26
172 0.33
173 0.38
174 0.39
175 0.45
176 0.49
177 0.55
178 0.59
179 0.66
180 0.65
181 0.65
182 0.69
183 0.68
184 0.67
185 0.69
186 0.69
187 0.69
188 0.73
189 0.76
190 0.77
191 0.75
192 0.77
193 0.75
194 0.76
195 0.75
196 0.74
197 0.76
198 0.77
199 0.8
200 0.81
201 0.84
202 0.85
203 0.86
204 0.88
205 0.88
206 0.88
207 0.88
208 0.89