Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A397SSL2

Protein Details
Accession A0A397SSL2    Localization Confidence Low Confidence Score 7.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
375-403SFNEAKKYFKNLNRHKKPFRPFQKGERELHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 11.5, cyto_nucl 8.833, cyto_mito 5.333, cyto 5, mito 4.5, E.R. 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR036890  HATPase_C_sf  
IPR020568  Ribosomal_S5_D2-typ_fold  
IPR014721  Ribosomal_S5_D2-typ_fold_subgr  
IPR001241  Topo_IIA  
IPR013760  Topo_IIA-like_dom_sf  
IPR013758  Topo_IIA_A/C_ab  
IPR013759  Topo_IIA_B_C  
IPR013506  Topo_IIA_bsu_dom2  
IPR002205  Topo_IIA_dom_A  
IPR031660  TOPRIM_C  
Gene Ontology GO:0005524  F:ATP binding  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0003918  F:DNA topoisomerase type II (double strand cut, ATP-hydrolyzing) activity  
GO:0006265  P:DNA topological change  
Pfam View protein in Pfam  
PF00204  DNA_gyraseB  
PF00521  DNA_topoisoIV  
PF16898  TOPRIM_C  
Amino Acid Sequences MHLKDMKILHCFCNRHHFGISIEIHKEENVWVPGLIFGHLLTSSNYDDSEKKVTGGRNGYGAKLANIFSTEXIVETADLTVCKRYCQTFKDNMSVTEKPKITNYSKNSKREEYTMITFKPDFEEFNMSQFDDDIIALLEKLYLSERDDPQPSIIHEHVNERWEIGVLPSPEFQFQQAFILCCLIFVLNNISFVNKTKGGTHVNYIADQLADRIIAAVKNKKKEANIKKNQVKNHMWIFVKCLIENLTLKTTSFGSLITRIAKLDDANNAGGRNAKDCTLILTEGGLRYGHLMIMVDHDHDGSHIKGLIINFMYHFFPSLLRIKGFLLEFITPIVKYTKCDMEVSFFTIPEYERWKETIPDIKSWKIKYYKGLGTSSFNEAKKYFKNLNRHKKPFRPFQKGERELINMFFNKKKADDRKEWLKNYEPGTFMNHEITISDFINKELILFSRADNIRSIPNVLDGPKPTDNHCNVVGSNNINVLHGEGQFGTRAQVGKDATSARYIIVTILALTRNIFHPQGDALLTYCNDDSQLVELE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.55
2 0.51
3 0.5
4 0.46
5 0.39
6 0.46
7 0.46
8 0.4
9 0.38
10 0.34
11 0.33
12 0.3
13 0.3
14 0.22
15 0.24
16 0.2
17 0.19
18 0.18
19 0.17
20 0.19
21 0.19
22 0.17
23 0.11
24 0.09
25 0.1
26 0.1
27 0.1
28 0.1
29 0.12
30 0.13
31 0.14
32 0.15
33 0.16
34 0.18
35 0.21
36 0.26
37 0.23
38 0.23
39 0.27
40 0.3
41 0.35
42 0.39
43 0.36
44 0.38
45 0.39
46 0.38
47 0.37
48 0.34
49 0.28
50 0.25
51 0.24
52 0.17
53 0.17
54 0.17
55 0.13
56 0.15
57 0.13
58 0.11
59 0.11
60 0.1
61 0.09
62 0.09
63 0.11
64 0.09
65 0.1
66 0.16
67 0.16
68 0.18
69 0.21
70 0.26
71 0.3
72 0.36
73 0.44
74 0.47
75 0.52
76 0.59
77 0.57
78 0.55
79 0.55
80 0.54
81 0.49
82 0.47
83 0.43
84 0.37
85 0.39
86 0.43
87 0.41
88 0.46
89 0.5
90 0.52
91 0.6
92 0.67
93 0.69
94 0.67
95 0.65
96 0.6
97 0.59
98 0.54
99 0.52
100 0.5
101 0.44
102 0.42
103 0.39
104 0.35
105 0.33
106 0.28
107 0.23
108 0.19
109 0.26
110 0.22
111 0.25
112 0.26
113 0.22
114 0.21
115 0.2
116 0.17
117 0.1
118 0.1
119 0.07
120 0.06
121 0.06
122 0.06
123 0.05
124 0.05
125 0.04
126 0.05
127 0.06
128 0.07
129 0.1
130 0.16
131 0.19
132 0.23
133 0.26
134 0.26
135 0.27
136 0.28
137 0.26
138 0.26
139 0.24
140 0.22
141 0.21
142 0.25
143 0.25
144 0.25
145 0.24
146 0.19
147 0.18
148 0.15
149 0.14
150 0.11
151 0.13
152 0.12
153 0.13
154 0.15
155 0.15
156 0.16
157 0.16
158 0.16
159 0.12
160 0.12
161 0.14
162 0.14
163 0.14
164 0.13
165 0.14
166 0.13
167 0.12
168 0.12
169 0.08
170 0.07
171 0.07
172 0.11
173 0.09
174 0.11
175 0.11
176 0.11
177 0.12
178 0.14
179 0.17
180 0.14
181 0.15
182 0.15
183 0.2
184 0.24
185 0.24
186 0.25
187 0.26
188 0.26
189 0.25
190 0.25
191 0.2
192 0.15
193 0.14
194 0.12
195 0.06
196 0.05
197 0.05
198 0.04
199 0.05
200 0.06
201 0.1
202 0.17
203 0.21
204 0.26
205 0.29
206 0.32
207 0.36
208 0.45
209 0.53
210 0.57
211 0.62
212 0.68
213 0.74
214 0.76
215 0.76
216 0.74
217 0.66
218 0.61
219 0.55
220 0.51
221 0.44
222 0.39
223 0.39
224 0.35
225 0.32
226 0.26
227 0.23
228 0.18
229 0.19
230 0.2
231 0.17
232 0.14
233 0.13
234 0.14
235 0.14
236 0.12
237 0.11
238 0.1
239 0.09
240 0.08
241 0.09
242 0.11
243 0.11
244 0.11
245 0.1
246 0.11
247 0.11
248 0.1
249 0.1
250 0.11
251 0.11
252 0.11
253 0.12
254 0.12
255 0.11
256 0.14
257 0.12
258 0.12
259 0.11
260 0.11
261 0.1
262 0.1
263 0.13
264 0.11
265 0.11
266 0.09
267 0.09
268 0.09
269 0.08
270 0.09
271 0.07
272 0.05
273 0.06
274 0.06
275 0.05
276 0.05
277 0.05
278 0.05
279 0.07
280 0.07
281 0.07
282 0.07
283 0.07
284 0.06
285 0.07
286 0.08
287 0.06
288 0.07
289 0.07
290 0.07
291 0.09
292 0.09
293 0.11
294 0.1
295 0.1
296 0.1
297 0.11
298 0.11
299 0.09
300 0.1
301 0.08
302 0.08
303 0.11
304 0.15
305 0.15
306 0.15
307 0.16
308 0.16
309 0.18
310 0.18
311 0.15
312 0.13
313 0.11
314 0.11
315 0.11
316 0.12
317 0.08
318 0.09
319 0.12
320 0.1
321 0.11
322 0.15
323 0.18
324 0.19
325 0.21
326 0.2
327 0.22
328 0.22
329 0.26
330 0.23
331 0.19
332 0.17
333 0.17
334 0.17
335 0.15
336 0.2
337 0.16
338 0.17
339 0.19
340 0.2
341 0.21
342 0.24
343 0.3
344 0.27
345 0.32
346 0.35
347 0.38
348 0.43
349 0.43
350 0.46
351 0.44
352 0.44
353 0.44
354 0.47
355 0.47
356 0.46
357 0.47
358 0.41
359 0.4
360 0.4
361 0.39
362 0.38
363 0.33
364 0.31
365 0.29
366 0.32
367 0.31
368 0.35
369 0.38
370 0.39
371 0.5
372 0.58
373 0.69
374 0.75
375 0.81
376 0.84
377 0.85
378 0.87
379 0.87
380 0.87
381 0.86
382 0.8
383 0.81
384 0.82
385 0.78
386 0.72
387 0.65
388 0.59
389 0.49
390 0.46
391 0.41
392 0.32
393 0.31
394 0.31
395 0.29
396 0.27
397 0.29
398 0.36
399 0.41
400 0.47
401 0.52
402 0.58
403 0.66
404 0.74
405 0.75
406 0.71
407 0.68
408 0.65
409 0.61
410 0.57
411 0.47
412 0.39
413 0.4
414 0.37
415 0.31
416 0.28
417 0.24
418 0.19
419 0.18
420 0.19
421 0.16
422 0.14
423 0.15
424 0.13
425 0.13
426 0.15
427 0.14
428 0.12
429 0.11
430 0.11
431 0.11
432 0.12
433 0.12
434 0.2
435 0.21
436 0.22
437 0.22
438 0.23
439 0.24
440 0.25
441 0.27
442 0.18
443 0.2
444 0.22
445 0.22
446 0.25
447 0.23
448 0.28
449 0.31
450 0.32
451 0.33
452 0.4
453 0.4
454 0.4
455 0.4
456 0.36
457 0.32
458 0.34
459 0.34
460 0.27
461 0.25
462 0.24
463 0.23
464 0.2
465 0.2
466 0.19
467 0.17
468 0.15
469 0.15
470 0.12
471 0.13
472 0.14
473 0.14
474 0.13
475 0.13
476 0.14
477 0.13
478 0.18
479 0.19
480 0.19
481 0.23
482 0.24
483 0.23
484 0.24
485 0.24
486 0.19
487 0.18
488 0.17
489 0.14
490 0.12
491 0.11
492 0.09
493 0.11
494 0.12
495 0.12
496 0.12
497 0.13
498 0.15
499 0.19
500 0.19
501 0.17
502 0.17
503 0.18
504 0.2
505 0.19
506 0.17
507 0.14
508 0.17
509 0.17
510 0.18
511 0.17
512 0.14
513 0.14
514 0.14
515 0.14