Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A397SMX6

Protein Details
Accession A0A397SMX6    Localization Confidence High Confidence Score 15.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
277-297QQQIKAKEKIKKKQLKESLISHydrophilic
310-338ESNHQMLKELKRQKRKQAELKKLSVKQLLHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
285-289KIKKK
320-330KRQKRKQAELK
Subcellular Location(s) nucl 14, cyto_nucl 10.5, mito 8, cyto 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR011907  RNase_III  
IPR000999  RNase_III_dom  
IPR036389  RNase_III_sf  
Gene Ontology GO:0004525  F:ribonuclease III activity  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0006364  P:rRNA processing  
Pfam View protein in Pfam  
PF14622  Ribonucleas_3_3  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50142  RNASE_3_2  
CDD cd00593  RIBOc  
Amino Acid Sequences MFSQYSKSVETKIKSLISRIAKSSLNPSFPSGNKKLPPIKDTYLLLTALKTYGNYNTSENSHHTFTRLAFLGDSILGYNGTKIFYFSFECLTLVSNIIFTFSKVTDHLHEKFPSYSNGKLTLYRSMLVSSSQLSTFARQWGLDEIAKVDLTLAKKNNRILGEALEAYIGAFYLDCCQMYGVSDAHMKKLHQAAIKAMIKEIEVTDGANNTKSESDKQEMNLIPGGAANRKSKSAIILKAENPNTKITDTINQSKSLENPTQTKNTSIKSKNTQELTQQQIKAKEKIKKKQLKESLISHDLVTKNISKKIESNHQMLKELKRQKRKQAELKKLSVKQLLTRLRRLV
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.42
2 0.43
3 0.46
4 0.47
5 0.48
6 0.47
7 0.45
8 0.41
9 0.41
10 0.47
11 0.45
12 0.41
13 0.39
14 0.39
15 0.41
16 0.43
17 0.5
18 0.46
19 0.48
20 0.47
21 0.54
22 0.58
23 0.58
24 0.59
25 0.58
26 0.56
27 0.53
28 0.51
29 0.47
30 0.41
31 0.36
32 0.32
33 0.25
34 0.21
35 0.17
36 0.15
37 0.12
38 0.11
39 0.15
40 0.16
41 0.17
42 0.19
43 0.21
44 0.22
45 0.25
46 0.27
47 0.27
48 0.28
49 0.26
50 0.26
51 0.26
52 0.24
53 0.27
54 0.23
55 0.2
56 0.17
57 0.17
58 0.16
59 0.13
60 0.13
61 0.08
62 0.07
63 0.07
64 0.07
65 0.07
66 0.07
67 0.08
68 0.08
69 0.08
70 0.09
71 0.11
72 0.13
73 0.13
74 0.15
75 0.14
76 0.15
77 0.14
78 0.14
79 0.13
80 0.11
81 0.1
82 0.09
83 0.08
84 0.1
85 0.09
86 0.08
87 0.1
88 0.09
89 0.11
90 0.11
91 0.13
92 0.16
93 0.22
94 0.24
95 0.27
96 0.28
97 0.29
98 0.3
99 0.3
100 0.31
101 0.28
102 0.28
103 0.25
104 0.28
105 0.27
106 0.28
107 0.28
108 0.28
109 0.27
110 0.24
111 0.22
112 0.19
113 0.18
114 0.16
115 0.15
116 0.1
117 0.1
118 0.09
119 0.1
120 0.1
121 0.12
122 0.12
123 0.14
124 0.13
125 0.12
126 0.13
127 0.14
128 0.16
129 0.14
130 0.13
131 0.12
132 0.12
133 0.12
134 0.11
135 0.09
136 0.09
137 0.1
138 0.14
139 0.17
140 0.2
141 0.24
142 0.26
143 0.3
144 0.28
145 0.28
146 0.25
147 0.23
148 0.21
149 0.18
150 0.16
151 0.11
152 0.1
153 0.08
154 0.07
155 0.05
156 0.02
157 0.02
158 0.02
159 0.04
160 0.05
161 0.05
162 0.05
163 0.05
164 0.05
165 0.06
166 0.08
167 0.06
168 0.07
169 0.12
170 0.12
171 0.14
172 0.16
173 0.15
174 0.17
175 0.2
176 0.23
177 0.21
178 0.22
179 0.21
180 0.29
181 0.32
182 0.28
183 0.25
184 0.21
185 0.19
186 0.19
187 0.17
188 0.09
189 0.07
190 0.07
191 0.07
192 0.08
193 0.09
194 0.1
195 0.1
196 0.09
197 0.11
198 0.12
199 0.14
200 0.17
201 0.19
202 0.2
203 0.21
204 0.27
205 0.26
206 0.26
207 0.25
208 0.2
209 0.17
210 0.16
211 0.17
212 0.12
213 0.16
214 0.18
215 0.17
216 0.19
217 0.2
218 0.2
219 0.24
220 0.28
221 0.29
222 0.31
223 0.35
224 0.37
225 0.44
226 0.47
227 0.44
228 0.4
229 0.37
230 0.34
231 0.3
232 0.28
233 0.22
234 0.24
235 0.27
236 0.34
237 0.34
238 0.34
239 0.35
240 0.35
241 0.35
242 0.35
243 0.33
244 0.28
245 0.31
246 0.33
247 0.38
248 0.38
249 0.41
250 0.39
251 0.4
252 0.46
253 0.46
254 0.5
255 0.53
256 0.59
257 0.61
258 0.61
259 0.59
260 0.57
261 0.59
262 0.59
263 0.57
264 0.54
265 0.51
266 0.56
267 0.58
268 0.58
269 0.58
270 0.58
271 0.6
272 0.66
273 0.72
274 0.74
275 0.76
276 0.8
277 0.82
278 0.83
279 0.8
280 0.77
281 0.75
282 0.69
283 0.62
284 0.52
285 0.48
286 0.39
287 0.34
288 0.3
289 0.28
290 0.28
291 0.33
292 0.34
293 0.3
294 0.35
295 0.41
296 0.49
297 0.48
298 0.5
299 0.53
300 0.53
301 0.57
302 0.57
303 0.58
304 0.56
305 0.61
306 0.64
307 0.68
308 0.73
309 0.78
310 0.84
311 0.87
312 0.89
313 0.89
314 0.91
315 0.9
316 0.91
317 0.9
318 0.85
319 0.82
320 0.77
321 0.69
322 0.65
323 0.65
324 0.65
325 0.62