Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A397TDM3

Protein Details
Accession A0A397TDM3    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
184-215AVIVSTKILKKKKKEKTKEKGKGKEKIVRREIBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
192-212LKKKKKEKTKEKGKGKEKIVR
Subcellular Location(s) nucl 17.5, cyto_nucl 12, cyto 5.5, mito 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR028119  Snapin/Pallidin/Snn1  
Pfam View protein in Pfam  
PF14712  Snapin_Pallidin  
Amino Acid Sequences MSNDTLSIETAALTLLDFVVSDASSNLFSENTSDRNIKSPREMELSEKINPAIPLLSEGFLAHFIPTLTQVEEQLQELEKKQKLLLEEMRTTNTRMENQDNYEYIALSFSKISQYHGKLQYIRNTMISMLSRSKNLKQRVAQLKIMKEQQLAQIAEIQKRERTFDQTVLAAKVVEHNPPPIPEAVIVSTKILKKKKKEKTKEKGKGKEKIVRREIEFSSSSSSSVVESKIEATKDKSIENIEEE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.06
2 0.05
3 0.04
4 0.04
5 0.04
6 0.05
7 0.05
8 0.06
9 0.06
10 0.07
11 0.08
12 0.08
13 0.08
14 0.07
15 0.08
16 0.11
17 0.13
18 0.15
19 0.18
20 0.2
21 0.21
22 0.29
23 0.33
24 0.33
25 0.38
26 0.37
27 0.38
28 0.41
29 0.42
30 0.38
31 0.41
32 0.42
33 0.37
34 0.36
35 0.32
36 0.29
37 0.28
38 0.24
39 0.17
40 0.13
41 0.13
42 0.13
43 0.13
44 0.1
45 0.1
46 0.1
47 0.1
48 0.1
49 0.08
50 0.07
51 0.06
52 0.07
53 0.08
54 0.09
55 0.1
56 0.1
57 0.1
58 0.11
59 0.12
60 0.12
61 0.12
62 0.12
63 0.12
64 0.14
65 0.21
66 0.21
67 0.21
68 0.21
69 0.22
70 0.22
71 0.27
72 0.31
73 0.3
74 0.32
75 0.33
76 0.35
77 0.34
78 0.33
79 0.3
80 0.26
81 0.23
82 0.23
83 0.26
84 0.26
85 0.28
86 0.3
87 0.27
88 0.26
89 0.23
90 0.19
91 0.15
92 0.13
93 0.09
94 0.07
95 0.07
96 0.06
97 0.09
98 0.09
99 0.12
100 0.17
101 0.19
102 0.26
103 0.3
104 0.32
105 0.33
106 0.36
107 0.4
108 0.38
109 0.36
110 0.29
111 0.26
112 0.23
113 0.21
114 0.19
115 0.14
116 0.14
117 0.14
118 0.16
119 0.18
120 0.24
121 0.3
122 0.34
123 0.39
124 0.38
125 0.47
126 0.54
127 0.56
128 0.56
129 0.53
130 0.52
131 0.49
132 0.5
133 0.42
134 0.33
135 0.3
136 0.28
137 0.29
138 0.26
139 0.22
140 0.23
141 0.24
142 0.26
143 0.26
144 0.24
145 0.21
146 0.22
147 0.25
148 0.22
149 0.27
150 0.27
151 0.28
152 0.29
153 0.28
154 0.29
155 0.26
156 0.24
157 0.17
158 0.14
159 0.16
160 0.16
161 0.16
162 0.16
163 0.17
164 0.18
165 0.19
166 0.21
167 0.17
168 0.16
169 0.14
170 0.15
171 0.14
172 0.15
173 0.14
174 0.14
175 0.18
176 0.2
177 0.27
178 0.33
179 0.39
180 0.47
181 0.58
182 0.67
183 0.74
184 0.82
185 0.86
186 0.9
187 0.93
188 0.94
189 0.94
190 0.94
191 0.92
192 0.9
193 0.87
194 0.85
195 0.82
196 0.82
197 0.8
198 0.76
199 0.71
200 0.68
201 0.61
202 0.58
203 0.5
204 0.41
205 0.39
206 0.33
207 0.29
208 0.23
209 0.21
210 0.17
211 0.18
212 0.17
213 0.11
214 0.12
215 0.15
216 0.19
217 0.2
218 0.22
219 0.24
220 0.3
221 0.31
222 0.32
223 0.32
224 0.32