Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A397TAJ5

Protein Details
Accession A0A397TAJ5    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
119-138LLSARKKKWESENQRRHKDEBasic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 22, cyto 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR045200  CHIP  
IPR045202  CHIP_RING-Ubox  
IPR041312  CHIP_TPR_N  
IPR011990  TPR-like_helical_dom_sf  
IPR019734  TPR_repeat  
IPR003613  Ubox_domain  
IPR013083  Znf_RING/FYVE/PHD  
Gene Ontology GO:0061630  F:ubiquitin protein ligase activity  
GO:0000209  P:protein polyubiquitination  
Pfam View protein in Pfam  
PF18391  CHIP_TPR_N  
PF13414  TPR_11  
PF04564  U-box  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50005  TPR  
PS51698  U_BOX  
CDD cd16654  RING-Ubox_CHIP  
Amino Acid Sequences MSAESYKAKGNIYFNEKDYESAVKEYSEAISRNSRNAVYYTNRALCYLKLGKYDNVISDCNLAIGIDTKSVKGHYMLGQALTEKANFDSAVSHLQIAYELSITDKVTKVNFSGEIIQALLSARKKKWESENQRRHKDETEFLKYIKGLINAEREKQLQKVIQNKNSFGSTFSKLVNLHPTEIQDKLDQINKIHDEKLSQIEQVFAQSEENHHGPKEIPDYFLDKISFNIMHDPVITPSGITYERAHLKEHFKKIGQFDPLSRLECRESDLYPNLALKEAIEDYLSKNGWAADY
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.42
2 0.45
3 0.43
4 0.39
5 0.36
6 0.33
7 0.27
8 0.25
9 0.24
10 0.19
11 0.19
12 0.19
13 0.19
14 0.19
15 0.18
16 0.19
17 0.28
18 0.29
19 0.32
20 0.34
21 0.33
22 0.3
23 0.31
24 0.33
25 0.3
26 0.34
27 0.38
28 0.4
29 0.39
30 0.39
31 0.38
32 0.33
33 0.35
34 0.35
35 0.31
36 0.31
37 0.34
38 0.34
39 0.37
40 0.39
41 0.35
42 0.32
43 0.3
44 0.25
45 0.24
46 0.22
47 0.18
48 0.15
49 0.11
50 0.08
51 0.09
52 0.09
53 0.1
54 0.11
55 0.11
56 0.12
57 0.13
58 0.14
59 0.13
60 0.15
61 0.15
62 0.18
63 0.19
64 0.19
65 0.19
66 0.18
67 0.18
68 0.16
69 0.13
70 0.1
71 0.09
72 0.1
73 0.09
74 0.09
75 0.08
76 0.09
77 0.12
78 0.12
79 0.12
80 0.1
81 0.1
82 0.1
83 0.09
84 0.08
85 0.05
86 0.05
87 0.05
88 0.07
89 0.07
90 0.09
91 0.09
92 0.1
93 0.11
94 0.12
95 0.12
96 0.12
97 0.13
98 0.12
99 0.14
100 0.13
101 0.12
102 0.12
103 0.11
104 0.09
105 0.09
106 0.11
107 0.11
108 0.15
109 0.15
110 0.22
111 0.23
112 0.27
113 0.36
114 0.44
115 0.53
116 0.6
117 0.7
118 0.73
119 0.81
120 0.79
121 0.73
122 0.67
123 0.59
124 0.55
125 0.51
126 0.49
127 0.41
128 0.39
129 0.37
130 0.32
131 0.29
132 0.25
133 0.19
134 0.13
135 0.14
136 0.22
137 0.22
138 0.23
139 0.24
140 0.23
141 0.22
142 0.23
143 0.23
144 0.19
145 0.22
146 0.31
147 0.37
148 0.42
149 0.44
150 0.44
151 0.42
152 0.4
153 0.35
154 0.28
155 0.24
156 0.2
157 0.19
158 0.19
159 0.2
160 0.19
161 0.21
162 0.26
163 0.22
164 0.21
165 0.2
166 0.22
167 0.21
168 0.21
169 0.21
170 0.14
171 0.14
172 0.15
173 0.19
174 0.18
175 0.17
176 0.22
177 0.24
178 0.26
179 0.26
180 0.24
181 0.21
182 0.22
183 0.26
184 0.21
185 0.19
186 0.17
187 0.17
188 0.16
189 0.16
190 0.15
191 0.1
192 0.1
193 0.1
194 0.11
195 0.14
196 0.16
197 0.16
198 0.15
199 0.15
200 0.15
201 0.19
202 0.23
203 0.2
204 0.2
205 0.2
206 0.25
207 0.24
208 0.27
209 0.24
210 0.19
211 0.18
212 0.2
213 0.19
214 0.16
215 0.2
216 0.17
217 0.16
218 0.17
219 0.17
220 0.15
221 0.15
222 0.14
223 0.09
224 0.09
225 0.11
226 0.11
227 0.13
228 0.13
229 0.18
230 0.25
231 0.27
232 0.29
233 0.32
234 0.41
235 0.48
236 0.54
237 0.55
238 0.51
239 0.56
240 0.59
241 0.61
242 0.58
243 0.51
244 0.47
245 0.47
246 0.47
247 0.44
248 0.4
249 0.36
250 0.32
251 0.3
252 0.32
253 0.28
254 0.26
255 0.29
256 0.32
257 0.31
258 0.3
259 0.31
260 0.27
261 0.26
262 0.24
263 0.18
264 0.18
265 0.17
266 0.15
267 0.13
268 0.14
269 0.15
270 0.21
271 0.21
272 0.17
273 0.17