Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A397T861

Protein Details
Accession A0A397T861    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-46MPPKKNQPSDKSKQKEKQKIIEDKTFGLKNKKKSAKVQQQIKQIQSHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
12-19SKQKEKQK
27-33GLKNKKK
Subcellular Location(s) nucl 13.5, cyto_nucl 9.833, mito 5, cyto 5, cyto_pero 3.833
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR032378  ZC3H15/TMA46_C  
IPR000571  Znf_CCCH  
IPR036855  Znf_CCCH_sf  
Gene Ontology GO:0046872  F:metal ion binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF16543  DFRP_C  
PF00642  zf-CCCH  
PF14608  zf-CCCH_2  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50103  ZF_C3H1  
Amino Acid Sequences MPPKKNQPSDKSKQKEKQKIIEDKTFGLKNKKKSAKVQQQIKQIQSQVMSAGNRKTLKEKETEKQALANKKLAEQKKKEELAELFKPVQVQQKVPFGVDPKTVLCQFFKTGQCQKGDKCKFSHDLNVERKSAKIDLYTDSRNEDDDKKADTMDKWDQEKLEQVVKSKQGNPKTTTDIVCKYFLEAIENQKYGWFWECPNGGKKCMYRHALPPGFVLKSKAQKKAEEEEADQITIEDFLETERHKLGSNLTPVTLETFTEWKKNRKAKLEAEEELKRSTKEAAFKAGKAQGMSGRDLFTFNPDLVNQLEDYDDGDDIFDLSGYKQDDDEQEELKSEQAFHEQSDEDGKENIAENPYEEGSSNSTSNNKVENTTTTLVTEEGLEVKEDLFAAEDLEDLDDDDE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.89
2 0.89
3 0.88
4 0.88
5 0.87
6 0.88
7 0.85
8 0.85
9 0.77
10 0.7
11 0.68
12 0.63
13 0.58
14 0.59
15 0.58
16 0.58
17 0.66
18 0.71
19 0.72
20 0.77
21 0.82
22 0.82
23 0.85
24 0.86
25 0.83
26 0.84
27 0.84
28 0.78
29 0.73
30 0.65
31 0.59
32 0.49
33 0.43
34 0.34
35 0.31
36 0.29
37 0.27
38 0.27
39 0.3
40 0.32
41 0.33
42 0.38
43 0.4
44 0.41
45 0.45
46 0.5
47 0.51
48 0.59
49 0.62
50 0.56
51 0.56
52 0.59
53 0.6
54 0.57
55 0.54
56 0.45
57 0.46
58 0.54
59 0.56
60 0.59
61 0.56
62 0.61
63 0.65
64 0.69
65 0.63
66 0.61
67 0.57
68 0.54
69 0.51
70 0.47
71 0.38
72 0.35
73 0.35
74 0.31
75 0.36
76 0.31
77 0.3
78 0.3
79 0.36
80 0.36
81 0.36
82 0.35
83 0.29
84 0.3
85 0.28
86 0.25
87 0.19
88 0.23
89 0.24
90 0.23
91 0.22
92 0.21
93 0.22
94 0.27
95 0.29
96 0.32
97 0.38
98 0.42
99 0.45
100 0.47
101 0.5
102 0.54
103 0.58
104 0.55
105 0.5
106 0.51
107 0.51
108 0.5
109 0.53
110 0.48
111 0.51
112 0.54
113 0.56
114 0.52
115 0.48
116 0.45
117 0.4
118 0.35
119 0.27
120 0.21
121 0.18
122 0.19
123 0.24
124 0.25
125 0.23
126 0.24
127 0.23
128 0.22
129 0.23
130 0.22
131 0.21
132 0.2
133 0.22
134 0.21
135 0.21
136 0.22
137 0.19
138 0.23
139 0.26
140 0.29
141 0.28
142 0.3
143 0.29
144 0.28
145 0.31
146 0.27
147 0.26
148 0.22
149 0.23
150 0.26
151 0.3
152 0.33
153 0.35
154 0.39
155 0.41
156 0.46
157 0.47
158 0.46
159 0.47
160 0.47
161 0.43
162 0.41
163 0.37
164 0.33
165 0.31
166 0.28
167 0.23
168 0.21
169 0.18
170 0.17
171 0.15
172 0.19
173 0.21
174 0.22
175 0.2
176 0.2
177 0.2
178 0.18
179 0.18
180 0.13
181 0.09
182 0.14
183 0.16
184 0.18
185 0.25
186 0.25
187 0.25
188 0.27
189 0.29
190 0.3
191 0.35
192 0.36
193 0.31
194 0.35
195 0.43
196 0.42
197 0.4
198 0.36
199 0.33
200 0.3
201 0.28
202 0.26
203 0.2
204 0.27
205 0.32
206 0.38
207 0.38
208 0.41
209 0.45
210 0.48
211 0.5
212 0.44
213 0.4
214 0.36
215 0.34
216 0.3
217 0.26
218 0.2
219 0.13
220 0.11
221 0.09
222 0.04
223 0.03
224 0.04
225 0.06
226 0.07
227 0.08
228 0.09
229 0.1
230 0.1
231 0.11
232 0.15
233 0.18
234 0.22
235 0.21
236 0.21
237 0.2
238 0.2
239 0.22
240 0.18
241 0.13
242 0.1
243 0.13
244 0.14
245 0.21
246 0.25
247 0.3
248 0.39
249 0.46
250 0.52
251 0.56
252 0.63
253 0.64
254 0.69
255 0.68
256 0.63
257 0.62
258 0.59
259 0.52
260 0.47
261 0.4
262 0.32
263 0.26
264 0.27
265 0.24
266 0.26
267 0.26
268 0.33
269 0.34
270 0.34
271 0.39
272 0.38
273 0.36
274 0.3
275 0.3
276 0.25
277 0.24
278 0.26
279 0.22
280 0.19
281 0.18
282 0.19
283 0.17
284 0.17
285 0.16
286 0.14
287 0.14
288 0.13
289 0.15
290 0.14
291 0.15
292 0.11
293 0.1
294 0.1
295 0.09
296 0.1
297 0.09
298 0.08
299 0.07
300 0.07
301 0.06
302 0.06
303 0.06
304 0.05
305 0.05
306 0.05
307 0.09
308 0.1
309 0.11
310 0.11
311 0.14
312 0.16
313 0.21
314 0.23
315 0.2
316 0.2
317 0.21
318 0.21
319 0.2
320 0.18
321 0.14
322 0.13
323 0.18
324 0.18
325 0.17
326 0.2
327 0.19
328 0.19
329 0.24
330 0.24
331 0.19
332 0.19
333 0.19
334 0.17
335 0.18
336 0.2
337 0.16
338 0.15
339 0.15
340 0.17
341 0.18
342 0.17
343 0.16
344 0.15
345 0.16
346 0.19
347 0.19
348 0.18
349 0.21
350 0.23
351 0.25
352 0.28
353 0.26
354 0.26
355 0.28
356 0.29
357 0.33
358 0.32
359 0.3
360 0.26
361 0.25
362 0.23
363 0.2
364 0.17
365 0.12
366 0.11
367 0.11
368 0.11
369 0.11
370 0.11
371 0.11
372 0.1
373 0.09
374 0.09
375 0.09
376 0.09
377 0.08
378 0.08
379 0.08
380 0.09
381 0.09