Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A397SKW2

Protein Details
Accession A0A397SKW2    Localization Confidence Low Confidence Score 9.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
188-209MSEQRIRLGRKRQNQNQSEKNGHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 23, cyto_nucl 14.333, mito_nucl 12.999
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR016024  ARM-type_fold  
IPR015797  NUDIX_hydrolase-like_dom_sf  
IPR000086  NUDIX_hydrolase_dom  
IPR003307  W2_domain  
IPR045877  ZFP36-like  
IPR000571  Znf_CCCH  
IPR036855  Znf_CCCH_sf  
Gene Ontology GO:0046872  F:metal ion binding  
GO:0003729  F:mRNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00293  NUDIX  
PF02020  W2  
PF00642  zf-CCCH  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51462  NUDIX  
PS51363  W2  
PS50103  ZF_C3H1  
Amino Acid Sequences MDENKSQPLHVTGILIYRIQRQVEFLLLNDTFSHKRHWTAPKGTVIRQEDEVKCALRNTIETTGLSVKDLRIEEGFRAEITYLSGTRPKRVVYYLAQVSDNARVYTTGEGLNFAWLSLNLAMEKALYKSMQEVIKKASIFIENNKPPKNIESSQRSRIDKHQITSDRLDHKMKNLNLALPLDSQRQAMSEQRIRLGRKRQNQNQSEKNGSGNGNGSVNNGNGLNGGYASPLHSPVMPFENPLYKTRLCERFETEGYCPYGPKCTFAHGTVELRERPANVEEKPDASPTAKDGPENPLYKTRLCERFMKENFCQYGPKCNFAHGENELRDRPNASRGDNGSERESPEPHHQQQRPITTQQHPQHQSEQQYHGRYQHPHHQARLNGVNNNDFEKLEKRTIPVSPGIGGGFRSEIQNGILGRIPMIMNADSHSTAHNSAHVEELKSETIEDKKKAEEIPEENKAENEHEINELKEHEENSEVRNTEDSSTASPTVSGKSTSSAKRRVGKDIVSVDEKPWMQVVELSNVELERLGKIKKADNVPTSDKKGSHDEIIIADLKKFFIQSREQNKSISDEIKEITLIETRKDLSKFQLFNVLLPSMYDDMSLDVVNEDLVQKEKLFKTFIRGSQDQITFLKSWEKYLNTRNSKLLPKATLLFKAFYDKDYVEEDSVLAWYEQAKDTSDVKKKCAVFIDWLKNAEEED
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.24
2 0.23
3 0.22
4 0.25
5 0.29
6 0.29
7 0.28
8 0.27
9 0.27
10 0.3
11 0.29
12 0.23
13 0.25
14 0.23
15 0.24
16 0.22
17 0.24
18 0.23
19 0.23
20 0.3
21 0.25
22 0.3
23 0.38
24 0.47
25 0.52
26 0.57
27 0.63
28 0.66
29 0.69
30 0.69
31 0.7
32 0.65
33 0.58
34 0.55
35 0.56
36 0.47
37 0.45
38 0.44
39 0.36
40 0.33
41 0.31
42 0.28
43 0.22
44 0.23
45 0.25
46 0.27
47 0.27
48 0.26
49 0.28
50 0.3
51 0.28
52 0.27
53 0.23
54 0.19
55 0.22
56 0.23
57 0.21
58 0.2
59 0.21
60 0.21
61 0.23
62 0.23
63 0.18
64 0.18
65 0.16
66 0.14
67 0.15
68 0.16
69 0.13
70 0.15
71 0.21
72 0.22
73 0.27
74 0.29
75 0.29
76 0.3
77 0.32
78 0.35
79 0.33
80 0.41
81 0.41
82 0.41
83 0.39
84 0.36
85 0.35
86 0.35
87 0.32
88 0.23
89 0.19
90 0.16
91 0.17
92 0.18
93 0.18
94 0.14
95 0.12
96 0.14
97 0.14
98 0.16
99 0.14
100 0.12
101 0.11
102 0.09
103 0.12
104 0.11
105 0.11
106 0.09
107 0.09
108 0.09
109 0.09
110 0.1
111 0.08
112 0.1
113 0.09
114 0.09
115 0.12
116 0.17
117 0.22
118 0.23
119 0.24
120 0.27
121 0.31
122 0.31
123 0.29
124 0.27
125 0.27
126 0.28
127 0.32
128 0.38
129 0.41
130 0.48
131 0.52
132 0.49
133 0.46
134 0.47
135 0.49
136 0.42
137 0.44
138 0.47
139 0.5
140 0.58
141 0.64
142 0.63
143 0.59
144 0.62
145 0.63
146 0.58
147 0.54
148 0.55
149 0.53
150 0.55
151 0.56
152 0.56
153 0.5
154 0.49
155 0.52
156 0.44
157 0.44
158 0.48
159 0.44
160 0.45
161 0.41
162 0.39
163 0.37
164 0.36
165 0.32
166 0.25
167 0.27
168 0.22
169 0.21
170 0.2
171 0.17
172 0.16
173 0.17
174 0.19
175 0.25
176 0.27
177 0.28
178 0.33
179 0.38
180 0.41
181 0.46
182 0.52
183 0.53
184 0.57
185 0.66
186 0.71
187 0.76
188 0.81
189 0.83
190 0.81
191 0.79
192 0.74
193 0.64
194 0.56
195 0.5
196 0.42
197 0.34
198 0.27
199 0.22
200 0.18
201 0.17
202 0.17
203 0.14
204 0.14
205 0.13
206 0.11
207 0.1
208 0.09
209 0.09
210 0.07
211 0.06
212 0.06
213 0.05
214 0.05
215 0.07
216 0.07
217 0.08
218 0.08
219 0.09
220 0.09
221 0.1
222 0.15
223 0.14
224 0.14
225 0.15
226 0.2
227 0.22
228 0.24
229 0.27
230 0.23
231 0.26
232 0.33
233 0.4
234 0.36
235 0.37
236 0.4
237 0.41
238 0.42
239 0.43
240 0.36
241 0.33
242 0.33
243 0.3
244 0.25
245 0.2
246 0.26
247 0.22
248 0.24
249 0.2
250 0.22
251 0.23
252 0.24
253 0.28
254 0.23
255 0.25
256 0.25
257 0.28
258 0.24
259 0.24
260 0.24
261 0.2
262 0.19
263 0.2
264 0.2
265 0.17
266 0.21
267 0.2
268 0.21
269 0.22
270 0.21
271 0.19
272 0.17
273 0.16
274 0.15
275 0.2
276 0.18
277 0.17
278 0.18
279 0.22
280 0.28
281 0.29
282 0.28
283 0.29
284 0.3
285 0.31
286 0.32
287 0.35
288 0.35
289 0.36
290 0.42
291 0.4
292 0.48
293 0.51
294 0.55
295 0.48
296 0.48
297 0.47
298 0.41
299 0.4
300 0.3
301 0.37
302 0.32
303 0.36
304 0.29
305 0.3
306 0.3
307 0.27
308 0.31
309 0.23
310 0.27
311 0.23
312 0.26
313 0.26
314 0.25
315 0.24
316 0.22
317 0.2
318 0.21
319 0.22
320 0.2
321 0.23
322 0.23
323 0.28
324 0.28
325 0.29
326 0.26
327 0.25
328 0.25
329 0.22
330 0.21
331 0.19
332 0.24
333 0.3
334 0.31
335 0.39
336 0.39
337 0.44
338 0.49
339 0.52
340 0.49
341 0.46
342 0.47
343 0.41
344 0.49
345 0.47
346 0.5
347 0.48
348 0.46
349 0.47
350 0.46
351 0.47
352 0.41
353 0.43
354 0.4
355 0.39
356 0.38
357 0.38
358 0.38
359 0.36
360 0.36
361 0.39
362 0.44
363 0.44
364 0.46
365 0.46
366 0.43
367 0.45
368 0.49
369 0.42
370 0.35
371 0.33
372 0.33
373 0.29
374 0.29
375 0.25
376 0.17
377 0.16
378 0.17
379 0.19
380 0.19
381 0.19
382 0.19
383 0.2
384 0.21
385 0.22
386 0.21
387 0.18
388 0.16
389 0.16
390 0.14
391 0.12
392 0.11
393 0.09
394 0.08
395 0.08
396 0.07
397 0.07
398 0.07
399 0.07
400 0.1
401 0.09
402 0.1
403 0.11
404 0.1
405 0.1
406 0.11
407 0.1
408 0.08
409 0.09
410 0.08
411 0.07
412 0.08
413 0.1
414 0.09
415 0.09
416 0.1
417 0.1
418 0.1
419 0.1
420 0.12
421 0.12
422 0.12
423 0.15
424 0.16
425 0.15
426 0.14
427 0.16
428 0.14
429 0.13
430 0.13
431 0.11
432 0.16
433 0.2
434 0.22
435 0.21
436 0.21
437 0.24
438 0.25
439 0.26
440 0.26
441 0.27
442 0.32
443 0.37
444 0.38
445 0.35
446 0.34
447 0.32
448 0.28
449 0.24
450 0.19
451 0.13
452 0.14
453 0.15
454 0.15
455 0.15
456 0.14
457 0.14
458 0.15
459 0.14
460 0.12
461 0.14
462 0.15
463 0.16
464 0.2
465 0.19
466 0.18
467 0.19
468 0.19
469 0.17
470 0.18
471 0.17
472 0.14
473 0.16
474 0.16
475 0.15
476 0.14
477 0.14
478 0.14
479 0.14
480 0.13
481 0.11
482 0.14
483 0.2
484 0.26
485 0.33
486 0.39
487 0.44
488 0.51
489 0.54
490 0.58
491 0.57
492 0.52
493 0.52
494 0.48
495 0.45
496 0.42
497 0.39
498 0.32
499 0.33
500 0.3
501 0.24
502 0.21
503 0.17
504 0.13
505 0.16
506 0.17
507 0.16
508 0.17
509 0.16
510 0.16
511 0.15
512 0.15
513 0.12
514 0.11
515 0.08
516 0.1
517 0.11
518 0.14
519 0.17
520 0.22
521 0.27
522 0.34
523 0.4
524 0.42
525 0.47
526 0.52
527 0.56
528 0.57
529 0.55
530 0.49
531 0.45
532 0.47
533 0.43
534 0.38
535 0.33
536 0.28
537 0.25
538 0.26
539 0.27
540 0.21
541 0.19
542 0.17
543 0.16
544 0.15
545 0.16
546 0.15
547 0.16
548 0.23
549 0.32
550 0.41
551 0.49
552 0.5
553 0.5
554 0.5
555 0.5
556 0.46
557 0.4
558 0.32
559 0.27
560 0.26
561 0.25
562 0.24
563 0.19
564 0.16
565 0.17
566 0.16
567 0.15
568 0.16
569 0.17
570 0.22
571 0.24
572 0.24
573 0.27
574 0.35
575 0.35
576 0.34
577 0.42
578 0.37
579 0.37
580 0.38
581 0.32
582 0.23
583 0.21
584 0.23
585 0.14
586 0.14
587 0.13
588 0.09
589 0.1
590 0.11
591 0.11
592 0.08
593 0.07
594 0.07
595 0.07
596 0.07
597 0.06
598 0.07
599 0.09
600 0.1
601 0.11
602 0.18
603 0.21
604 0.24
605 0.27
606 0.27
607 0.33
608 0.4
609 0.45
610 0.46
611 0.45
612 0.46
613 0.51
614 0.51
615 0.46
616 0.39
617 0.38
618 0.3
619 0.3
620 0.33
621 0.25
622 0.29
623 0.31
624 0.35
625 0.38
626 0.46
627 0.56
628 0.56
629 0.6
630 0.61
631 0.61
632 0.65
633 0.65
634 0.62
635 0.55
636 0.51
637 0.53
638 0.51
639 0.52
640 0.47
641 0.41
642 0.35
643 0.4
644 0.37
645 0.32
646 0.33
647 0.26
648 0.26
649 0.29
650 0.3
651 0.23
652 0.23
653 0.21
654 0.17
655 0.17
656 0.15
657 0.11
658 0.09
659 0.09
660 0.12
661 0.14
662 0.15
663 0.17
664 0.2
665 0.25
666 0.34
667 0.42
668 0.42
669 0.44
670 0.51
671 0.49
672 0.51
673 0.52
674 0.46
675 0.46
676 0.53
677 0.59
678 0.56
679 0.57
680 0.53