Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A397TX71

Protein Details
Accession A0A397TX71    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
112-133FEKEFIKKIRPERKWKHEDGSKBasic
409-429SKDPDHKKIEHTRKRFQELLKBasic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 18.5, cyto_nucl 12.5, cyto 5.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR003607  HD/PDEase_dom  
IPR045509  HD_assoc_2  
IPR006674  HD_domain  
Pfam View protein in Pfam  
PF01966  HD  
PF19276  HD_assoc_2  
CDD cd00077  HDc  
Amino Acid Sequences MNQSRMRFQDPIHGLMEFEDWVVKVIDTEHFQRLRNIKQLGTTYYVYPGACHNRFEHSLGVAHLANSLVTRIYETHKQPELPKLEYNERDLKCVTLAALCHDLGHGPFSHLFEKEFIKKIRPERKWKHEDGSKMMVNHLFEVYGSKILGDLDTNDEKFIKDLIDGNRTNRSPYLFDVVANKRNSIDVDKFDYLARDCHYLGMKSEFDHSRLMKFSRVYENQITYYFKESYNIYDLFHTRYSLHKKAYNHRVGKAIDFMIRDALIEADPILKISESINDPNEYLKMDDTILNKIEFSNDEELKKSQDIIKRIRTRNLYKFVDEFLVPEDLKDKLTEQKINPVEIADKELKVDDIIVDRLVLNYGMKAENPVNHVKFYDKKKGDKVFTLEKSQVSYLVPEQFEELNIRIFSKDPDHKKIEHTRKRFQELLKKITNKDQKTYYTR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.29
2 0.27
3 0.28
4 0.17
5 0.14
6 0.11
7 0.09
8 0.11
9 0.11
10 0.1
11 0.09
12 0.1
13 0.14
14 0.17
15 0.21
16 0.28
17 0.3
18 0.32
19 0.39
20 0.45
21 0.48
22 0.52
23 0.52
24 0.45
25 0.48
26 0.51
27 0.47
28 0.45
29 0.4
30 0.32
31 0.32
32 0.33
33 0.27
34 0.23
35 0.27
36 0.31
37 0.31
38 0.33
39 0.32
40 0.35
41 0.38
42 0.4
43 0.35
44 0.27
45 0.27
46 0.25
47 0.27
48 0.21
49 0.18
50 0.16
51 0.14
52 0.12
53 0.1
54 0.1
55 0.07
56 0.07
57 0.08
58 0.09
59 0.14
60 0.22
61 0.25
62 0.32
63 0.36
64 0.4
65 0.42
66 0.49
67 0.5
68 0.46
69 0.47
70 0.45
71 0.5
72 0.49
73 0.52
74 0.52
75 0.47
76 0.47
77 0.43
78 0.37
79 0.29
80 0.27
81 0.21
82 0.14
83 0.14
84 0.14
85 0.16
86 0.15
87 0.14
88 0.14
89 0.14
90 0.12
91 0.14
92 0.11
93 0.1
94 0.12
95 0.15
96 0.17
97 0.17
98 0.17
99 0.18
100 0.22
101 0.25
102 0.3
103 0.3
104 0.34
105 0.4
106 0.49
107 0.57
108 0.61
109 0.67
110 0.71
111 0.79
112 0.82
113 0.81
114 0.8
115 0.75
116 0.72
117 0.68
118 0.65
119 0.56
120 0.48
121 0.45
122 0.38
123 0.32
124 0.27
125 0.21
126 0.14
127 0.11
128 0.12
129 0.11
130 0.1
131 0.09
132 0.08
133 0.08
134 0.08
135 0.08
136 0.07
137 0.07
138 0.11
139 0.13
140 0.14
141 0.14
142 0.14
143 0.14
144 0.14
145 0.14
146 0.09
147 0.07
148 0.13
149 0.16
150 0.23
151 0.24
152 0.26
153 0.32
154 0.32
155 0.32
156 0.29
157 0.27
158 0.22
159 0.22
160 0.25
161 0.19
162 0.2
163 0.26
164 0.29
165 0.33
166 0.32
167 0.31
168 0.26
169 0.26
170 0.27
171 0.24
172 0.22
173 0.18
174 0.23
175 0.23
176 0.24
177 0.23
178 0.23
179 0.19
180 0.18
181 0.17
182 0.13
183 0.13
184 0.14
185 0.16
186 0.15
187 0.15
188 0.17
189 0.16
190 0.14
191 0.19
192 0.17
193 0.17
194 0.21
195 0.2
196 0.18
197 0.2
198 0.21
199 0.2
200 0.2
201 0.22
202 0.26
203 0.27
204 0.3
205 0.31
206 0.31
207 0.29
208 0.3
209 0.28
210 0.21
211 0.23
212 0.2
213 0.17
214 0.16
215 0.16
216 0.16
217 0.18
218 0.18
219 0.14
220 0.15
221 0.16
222 0.17
223 0.17
224 0.16
225 0.13
226 0.19
227 0.26
228 0.29
229 0.32
230 0.34
231 0.38
232 0.47
233 0.56
234 0.59
235 0.55
236 0.53
237 0.55
238 0.51
239 0.48
240 0.41
241 0.32
242 0.25
243 0.21
244 0.19
245 0.14
246 0.13
247 0.12
248 0.09
249 0.08
250 0.06
251 0.05
252 0.05
253 0.05
254 0.05
255 0.05
256 0.05
257 0.04
258 0.05
259 0.05
260 0.09
261 0.1
262 0.13
263 0.15
264 0.15
265 0.16
266 0.16
267 0.16
268 0.14
269 0.12
270 0.1
271 0.09
272 0.09
273 0.13
274 0.13
275 0.16
276 0.17
277 0.16
278 0.16
279 0.15
280 0.15
281 0.13
282 0.15
283 0.18
284 0.19
285 0.2
286 0.22
287 0.23
288 0.24
289 0.23
290 0.21
291 0.21
292 0.24
293 0.3
294 0.35
295 0.45
296 0.52
297 0.56
298 0.62
299 0.65
300 0.68
301 0.7
302 0.72
303 0.65
304 0.58
305 0.56
306 0.5
307 0.44
308 0.35
309 0.27
310 0.19
311 0.2
312 0.16
313 0.15
314 0.15
315 0.13
316 0.14
317 0.14
318 0.13
319 0.17
320 0.23
321 0.29
322 0.29
323 0.38
324 0.4
325 0.41
326 0.39
327 0.33
328 0.3
329 0.24
330 0.29
331 0.22
332 0.19
333 0.19
334 0.19
335 0.18
336 0.15
337 0.15
338 0.1
339 0.1
340 0.11
341 0.11
342 0.11
343 0.1
344 0.11
345 0.11
346 0.1
347 0.08
348 0.07
349 0.09
350 0.1
351 0.1
352 0.13
353 0.15
354 0.18
355 0.22
356 0.3
357 0.3
358 0.3
359 0.31
360 0.33
361 0.39
362 0.43
363 0.49
364 0.47
365 0.53
366 0.61
367 0.69
368 0.69
369 0.69
370 0.68
371 0.67
372 0.65
373 0.64
374 0.59
375 0.51
376 0.49
377 0.42
378 0.38
379 0.28
380 0.26
381 0.24
382 0.27
383 0.26
384 0.23
385 0.24
386 0.23
387 0.23
388 0.23
389 0.2
390 0.18
391 0.18
392 0.19
393 0.18
394 0.18
395 0.2
396 0.26
397 0.35
398 0.38
399 0.46
400 0.51
401 0.53
402 0.61
403 0.69
404 0.71
405 0.72
406 0.73
407 0.75
408 0.79
409 0.84
410 0.82
411 0.8
412 0.79
413 0.78
414 0.79
415 0.78
416 0.75
417 0.71
418 0.75
419 0.76
420 0.7
421 0.69
422 0.67