Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A397TS41

Protein Details
Accession A0A397TS41    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
195-270EVKSRSSKSKSRERSKRDRSSSRNRGDKSSGRRNRSRSRSSRSPLPRKSSRSRSRSRSRSPRRRGGDWRADRCKYYHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
198-260SRSSKSKSRERSKRDRSSSRNRGDKSSGRRNRSRSRSSRSPLPRKSSRSRSRSRSRSPRRRGG
Subcellular Location(s) nucl 17.5, cyto_nucl 13.5, cyto 6.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR005037  PRP38  
Gene Ontology GO:0071011  C:precatalytic spliceosome  
GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
Pfam View protein in Pfam  
PF03371  PRP38  
Amino Acid Sequences MANRTVSDAIAIHGTNPQYLIEKIMRTRIYESLYWKEFCFGLTAETLIDKAIELTSFGGEYGNQKPTEFLCLTLKLLQLQPSKDIVMEFIRNEDYKYLRALGAFYLRLVGNSLEIYQTLEPLLNDYRKLRKRTNEGDFEIVCMDEFIEELLKEERVCDTIMPRILKRHVLEENGELQPRESGEQDQEGEEEEEGEVKSRSSKSKSRERSKRDRSSSRNRGDKSSGRRNRSRSRSSRSPLPRKSSRSRSRSRSRSPRRRGGDWRADRCKYYRIL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.16
2 0.15
3 0.15
4 0.15
5 0.15
6 0.15
7 0.2
8 0.19
9 0.23
10 0.25
11 0.32
12 0.33
13 0.33
14 0.36
15 0.36
16 0.36
17 0.36
18 0.39
19 0.39
20 0.42
21 0.41
22 0.38
23 0.35
24 0.3
25 0.27
26 0.23
27 0.16
28 0.13
29 0.12
30 0.12
31 0.11
32 0.11
33 0.11
34 0.08
35 0.08
36 0.06
37 0.06
38 0.06
39 0.06
40 0.06
41 0.07
42 0.07
43 0.07
44 0.07
45 0.07
46 0.07
47 0.1
48 0.14
49 0.18
50 0.18
51 0.18
52 0.19
53 0.2
54 0.26
55 0.22
56 0.21
57 0.2
58 0.21
59 0.23
60 0.24
61 0.24
62 0.2
63 0.21
64 0.26
65 0.26
66 0.26
67 0.26
68 0.25
69 0.25
70 0.23
71 0.21
72 0.16
73 0.15
74 0.16
75 0.14
76 0.14
77 0.16
78 0.16
79 0.16
80 0.17
81 0.15
82 0.14
83 0.16
84 0.15
85 0.13
86 0.13
87 0.13
88 0.12
89 0.13
90 0.12
91 0.11
92 0.11
93 0.11
94 0.1
95 0.11
96 0.09
97 0.07
98 0.07
99 0.08
100 0.06
101 0.06
102 0.08
103 0.07
104 0.07
105 0.06
106 0.06
107 0.06
108 0.08
109 0.11
110 0.1
111 0.11
112 0.14
113 0.23
114 0.29
115 0.35
116 0.39
117 0.43
118 0.51
119 0.58
120 0.62
121 0.6
122 0.55
123 0.54
124 0.48
125 0.41
126 0.33
127 0.24
128 0.17
129 0.1
130 0.08
131 0.04
132 0.03
133 0.03
134 0.03
135 0.03
136 0.05
137 0.05
138 0.06
139 0.06
140 0.07
141 0.07
142 0.08
143 0.08
144 0.08
145 0.08
146 0.12
147 0.16
148 0.18
149 0.18
150 0.21
151 0.23
152 0.28
153 0.27
154 0.29
155 0.27
156 0.28
157 0.29
158 0.27
159 0.29
160 0.26
161 0.26
162 0.21
163 0.18
164 0.16
165 0.15
166 0.14
167 0.11
168 0.11
169 0.12
170 0.14
171 0.14
172 0.14
173 0.13
174 0.13
175 0.13
176 0.11
177 0.1
178 0.07
179 0.08
180 0.08
181 0.09
182 0.07
183 0.07
184 0.11
185 0.13
186 0.19
187 0.24
188 0.31
189 0.37
190 0.48
191 0.58
192 0.66
193 0.73
194 0.77
195 0.83
196 0.87
197 0.9
198 0.89
199 0.89
200 0.88
201 0.89
202 0.9
203 0.88
204 0.87
205 0.78
206 0.74
207 0.72
208 0.7
209 0.69
210 0.69
211 0.69
212 0.68
213 0.74
214 0.77
215 0.8
216 0.81
217 0.83
218 0.81
219 0.81
220 0.83
221 0.82
222 0.83
223 0.84
224 0.85
225 0.83
226 0.83
227 0.82
228 0.81
229 0.84
230 0.85
231 0.84
232 0.84
233 0.85
234 0.86
235 0.88
236 0.9
237 0.9
238 0.9
239 0.92
240 0.93
241 0.93
242 0.93
243 0.89
244 0.88
245 0.87
246 0.87
247 0.87
248 0.86
249 0.86
250 0.85
251 0.82
252 0.77
253 0.7