Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A397TT57

Protein Details
Accession A0A397TT57    Localization Confidence High Confidence Score 15.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
20-45NSDPSSTIIKKQNKRRDSNDEETKKIHydrophilic
349-378RFNGRFGRSKKDKKKDDSKRREKRSGDGKSBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
352-375GRFGRSKKDKKKDDSKRREKRSGD
Subcellular Location(s) nucl 19.5, cyto_nucl 11.5, cyto 2.5, pero 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR000195  Rab-GAP-TBC_dom  
IPR035969  Rab-GAP_TBC_sf  
Pfam View protein in Pfam  
PF00566  RabGAP-TBC  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50086  TBC_RABGAP  
Amino Acid Sequences MDVVQSLIDDIKNPVIDTVNSDPSSTIIKKQNKRRDSNDEETKKIDWDFWTALIQDYTAVATKLPHLLAAKIQQGLPSKLRGLIWQSMCQASSTYLETMYSQLLSESSPYDKIIQRDLARTFPGVELFKEENGRGQTMLWNILKAYSLYDPLVGYCQGLGFLVGPLLMNMSEAQAFCVFVRLMETYDMRTMFTLNMEGLQQRLYQFSCLLSQILPKLHAHFHLHGIQSAMYASQWFLSLFAYTYPLPLVFRIYDVVFAEGAPETIMRVAIALLKKNEERLLDLGEFEDLLDFLTSRLYETYDNEPTGLIKDAMELSSVITKGKLDELSETYVHDMEDQKKRAEELVAVRFNGRFGRSKKDKKKDDSKRREKRSGDGKSDRWSFNAASLPSSRHSVATMQNLSTSSTSSTSSDLSASSDNEAPMPVTPSSASFSNNSASMGVLHQQIEDLVSALSVLQKEHADVTEQLVSIKMEKIDLVNEVEELNNRLRKENKRMSIDSSMTLNNDEGFESGRST
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.17
2 0.18
3 0.18
4 0.23
5 0.27
6 0.31
7 0.3
8 0.3
9 0.29
10 0.27
11 0.34
12 0.3
13 0.32
14 0.34
15 0.43
16 0.52
17 0.63
18 0.72
19 0.75
20 0.82
21 0.83
22 0.84
23 0.84
24 0.85
25 0.85
26 0.81
27 0.75
28 0.69
29 0.62
30 0.54
31 0.45
32 0.39
33 0.3
34 0.29
35 0.27
36 0.25
37 0.26
38 0.24
39 0.25
40 0.21
41 0.19
42 0.13
43 0.12
44 0.12
45 0.1
46 0.1
47 0.08
48 0.09
49 0.11
50 0.14
51 0.14
52 0.16
53 0.16
54 0.17
55 0.21
56 0.25
57 0.27
58 0.25
59 0.26
60 0.27
61 0.31
62 0.35
63 0.33
64 0.31
65 0.29
66 0.3
67 0.3
68 0.29
69 0.3
70 0.33
71 0.34
72 0.35
73 0.36
74 0.34
75 0.34
76 0.31
77 0.26
78 0.19
79 0.18
80 0.16
81 0.14
82 0.13
83 0.13
84 0.13
85 0.14
86 0.13
87 0.11
88 0.09
89 0.08
90 0.08
91 0.08
92 0.09
93 0.09
94 0.1
95 0.11
96 0.12
97 0.17
98 0.2
99 0.22
100 0.26
101 0.3
102 0.31
103 0.36
104 0.37
105 0.35
106 0.33
107 0.32
108 0.29
109 0.23
110 0.25
111 0.2
112 0.18
113 0.21
114 0.21
115 0.22
116 0.23
117 0.22
118 0.23
119 0.23
120 0.24
121 0.18
122 0.17
123 0.19
124 0.18
125 0.24
126 0.2
127 0.18
128 0.17
129 0.17
130 0.17
131 0.14
132 0.15
133 0.1
134 0.11
135 0.11
136 0.12
137 0.11
138 0.11
139 0.13
140 0.1
141 0.09
142 0.07
143 0.07
144 0.06
145 0.06
146 0.06
147 0.05
148 0.04
149 0.04
150 0.04
151 0.04
152 0.04
153 0.04
154 0.04
155 0.04
156 0.04
157 0.05
158 0.06
159 0.06
160 0.08
161 0.08
162 0.08
163 0.08
164 0.1
165 0.09
166 0.08
167 0.1
168 0.09
169 0.1
170 0.11
171 0.12
172 0.11
173 0.14
174 0.14
175 0.12
176 0.12
177 0.12
178 0.1
179 0.1
180 0.09
181 0.07
182 0.07
183 0.08
184 0.08
185 0.07
186 0.08
187 0.08
188 0.08
189 0.1
190 0.1
191 0.1
192 0.1
193 0.11
194 0.11
195 0.11
196 0.11
197 0.09
198 0.11
199 0.12
200 0.13
201 0.14
202 0.13
203 0.15
204 0.15
205 0.18
206 0.2
207 0.19
208 0.22
209 0.25
210 0.25
211 0.23
212 0.22
213 0.19
214 0.15
215 0.14
216 0.1
217 0.05
218 0.05
219 0.05
220 0.04
221 0.05
222 0.04
223 0.05
224 0.05
225 0.05
226 0.05
227 0.05
228 0.07
229 0.07
230 0.07
231 0.07
232 0.07
233 0.07
234 0.07
235 0.09
236 0.06
237 0.07
238 0.08
239 0.08
240 0.09
241 0.09
242 0.09
243 0.08
244 0.07
245 0.07
246 0.06
247 0.06
248 0.05
249 0.04
250 0.04
251 0.04
252 0.04
253 0.03
254 0.03
255 0.03
256 0.06
257 0.08
258 0.1
259 0.1
260 0.13
261 0.13
262 0.15
263 0.17
264 0.14
265 0.15
266 0.14
267 0.16
268 0.14
269 0.14
270 0.13
271 0.11
272 0.1
273 0.08
274 0.07
275 0.03
276 0.04
277 0.03
278 0.03
279 0.03
280 0.04
281 0.04
282 0.05
283 0.05
284 0.06
285 0.07
286 0.1
287 0.15
288 0.17
289 0.17
290 0.17
291 0.17
292 0.16
293 0.16
294 0.14
295 0.1
296 0.07
297 0.08
298 0.08
299 0.08
300 0.08
301 0.07
302 0.06
303 0.08
304 0.09
305 0.08
306 0.08
307 0.08
308 0.08
309 0.1
310 0.11
311 0.09
312 0.11
313 0.13
314 0.16
315 0.16
316 0.16
317 0.15
318 0.14
319 0.13
320 0.13
321 0.15
322 0.18
323 0.26
324 0.28
325 0.28
326 0.29
327 0.29
328 0.29
329 0.26
330 0.24
331 0.23
332 0.29
333 0.3
334 0.29
335 0.3
336 0.28
337 0.28
338 0.27
339 0.22
340 0.21
341 0.22
342 0.32
343 0.41
344 0.52
345 0.62
346 0.7
347 0.77
348 0.79
349 0.88
350 0.89
351 0.9
352 0.91
353 0.91
354 0.92
355 0.92
356 0.92
357 0.84
358 0.81
359 0.8
360 0.78
361 0.77
362 0.74
363 0.69
364 0.67
365 0.71
366 0.62
367 0.53
368 0.47
369 0.37
370 0.33
371 0.35
372 0.27
373 0.23
374 0.24
375 0.25
376 0.23
377 0.26
378 0.23
379 0.18
380 0.18
381 0.19
382 0.23
383 0.28
384 0.29
385 0.26
386 0.27
387 0.27
388 0.28
389 0.24
390 0.2
391 0.14
392 0.13
393 0.14
394 0.13
395 0.14
396 0.14
397 0.14
398 0.13
399 0.12
400 0.13
401 0.13
402 0.13
403 0.14
404 0.15
405 0.15
406 0.15
407 0.15
408 0.13
409 0.12
410 0.15
411 0.12
412 0.11
413 0.11
414 0.12
415 0.15
416 0.16
417 0.17
418 0.15
419 0.17
420 0.18
421 0.18
422 0.17
423 0.15
424 0.14
425 0.13
426 0.12
427 0.13
428 0.14
429 0.14
430 0.13
431 0.13
432 0.12
433 0.12
434 0.11
435 0.09
436 0.06
437 0.05
438 0.05
439 0.06
440 0.08
441 0.08
442 0.08
443 0.1
444 0.1
445 0.11
446 0.13
447 0.14
448 0.15
449 0.15
450 0.19
451 0.2
452 0.2
453 0.19
454 0.19
455 0.19
456 0.17
457 0.19
458 0.16
459 0.13
460 0.14
461 0.15
462 0.15
463 0.17
464 0.17
465 0.15
466 0.15
467 0.15
468 0.15
469 0.16
470 0.17
471 0.22
472 0.24
473 0.24
474 0.3
475 0.38
476 0.47
477 0.56
478 0.63
479 0.65
480 0.7
481 0.72
482 0.73
483 0.73
484 0.67
485 0.58
486 0.52
487 0.45
488 0.37
489 0.35
490 0.29
491 0.21
492 0.19
493 0.17
494 0.14
495 0.14