Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A397SYX5

Protein Details
Accession A0A397SYX5    Localization Confidence High Confidence Score 23.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
227-246DRNYRRSRSRSADRRSHRVRBasic
257-294RDRIRDSDRDHRDRRRSRSRHRRHRSSSRDHDRRGNHDBasic
305-330RRYDDDRRRRHDDDRHERRRSRSPRSBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
231-246RRSRSRSADRRSHRVR
251-290ERSRRERDRIRDSDRDHRDRRRSRSRHRRHRSSSRDHDRR
312-330RRRHDDDRHERRRSRSPRS
Subcellular Location(s) nucl 24.5, cyto_nucl 14.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR005037  PRP38  
Gene Ontology GO:0071011  C:precatalytic spliceosome  
GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
Pfam View protein in Pfam  
PF03371  PRP38  
Amino Acid Sequences MTRLFELGKTTAQKTSISKMKQSNKLETWGSETTMNLNNILYQNIQASPYFKHLYELKTYHEVIDEIFNHVESLEPFLKGTTASTAFCLLYKLWTLRLTVKQINGLIQHTDSPHIRALGFLYLRYVCKPVHLWEWFEEYLDDEEEVQVQGGPRPNIITIGKMCRQLLTEQKWLGTILPRIPVPIARDIDQKLKERSQPHLPPRRESPTYDLEPKHSAERSLRREDEDRNYRRSRSRSADRRSHRVRDYDYERSRRERDRIRDSDRDHRDRRRSRSRHRRHRSSSRDHDRRGNHDHDRRGSYDYDRRYDDDRRRRHDDDRHERRRSRSPRS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.33
2 0.4
3 0.43
4 0.42
5 0.48
6 0.54
7 0.62
8 0.68
9 0.71
10 0.71
11 0.66
12 0.68
13 0.63
14 0.55
15 0.52
16 0.44
17 0.39
18 0.3
19 0.27
20 0.25
21 0.28
22 0.28
23 0.22
24 0.2
25 0.21
26 0.21
27 0.22
28 0.18
29 0.13
30 0.15
31 0.15
32 0.16
33 0.14
34 0.15
35 0.16
36 0.22
37 0.23
38 0.21
39 0.24
40 0.27
41 0.3
42 0.36
43 0.36
44 0.34
45 0.37
46 0.38
47 0.34
48 0.31
49 0.27
50 0.2
51 0.24
52 0.2
53 0.18
54 0.18
55 0.17
56 0.15
57 0.15
58 0.15
59 0.1
60 0.15
61 0.13
62 0.13
63 0.13
64 0.13
65 0.14
66 0.13
67 0.13
68 0.11
69 0.11
70 0.12
71 0.13
72 0.14
73 0.14
74 0.14
75 0.15
76 0.11
77 0.11
78 0.13
79 0.13
80 0.15
81 0.16
82 0.18
83 0.22
84 0.27
85 0.31
86 0.32
87 0.32
88 0.33
89 0.32
90 0.33
91 0.29
92 0.25
93 0.2
94 0.18
95 0.18
96 0.15
97 0.17
98 0.15
99 0.16
100 0.16
101 0.15
102 0.15
103 0.13
104 0.14
105 0.15
106 0.15
107 0.12
108 0.13
109 0.14
110 0.15
111 0.15
112 0.16
113 0.12
114 0.14
115 0.16
116 0.17
117 0.23
118 0.24
119 0.25
120 0.24
121 0.3
122 0.27
123 0.25
124 0.23
125 0.17
126 0.16
127 0.14
128 0.12
129 0.07
130 0.07
131 0.07
132 0.07
133 0.05
134 0.05
135 0.05
136 0.07
137 0.11
138 0.11
139 0.11
140 0.11
141 0.11
142 0.14
143 0.14
144 0.13
145 0.12
146 0.17
147 0.2
148 0.21
149 0.21
150 0.19
151 0.2
152 0.2
153 0.26
154 0.26
155 0.28
156 0.27
157 0.27
158 0.26
159 0.25
160 0.23
161 0.19
162 0.15
163 0.12
164 0.14
165 0.13
166 0.13
167 0.13
168 0.15
169 0.14
170 0.18
171 0.18
172 0.17
173 0.21
174 0.22
175 0.29
176 0.31
177 0.33
178 0.32
179 0.34
180 0.38
181 0.37
182 0.41
183 0.44
184 0.48
185 0.54
186 0.6
187 0.59
188 0.58
189 0.61
190 0.64
191 0.56
192 0.5
193 0.46
194 0.43
195 0.44
196 0.47
197 0.41
198 0.37
199 0.38
200 0.36
201 0.35
202 0.29
203 0.27
204 0.28
205 0.36
206 0.4
207 0.45
208 0.45
209 0.45
210 0.48
211 0.51
212 0.53
213 0.55
214 0.52
215 0.53
216 0.55
217 0.56
218 0.6
219 0.6
220 0.58
221 0.57
222 0.63
223 0.65
224 0.7
225 0.76
226 0.75
227 0.8
228 0.8
229 0.79
230 0.73
231 0.69
232 0.65
233 0.64
234 0.65
235 0.65
236 0.66
237 0.66
238 0.65
239 0.66
240 0.67
241 0.65
242 0.66
243 0.66
244 0.67
245 0.69
246 0.74
247 0.75
248 0.77
249 0.76
250 0.77
251 0.77
252 0.77
253 0.75
254 0.76
255 0.79
256 0.79
257 0.84
258 0.85
259 0.85
260 0.87
261 0.9
262 0.92
263 0.92
264 0.94
265 0.95
266 0.94
267 0.95
268 0.94
269 0.93
270 0.93
271 0.93
272 0.92
273 0.86
274 0.84
275 0.8
276 0.78
277 0.75
278 0.72
279 0.71
280 0.7
281 0.73
282 0.72
283 0.7
284 0.64
285 0.6
286 0.55
287 0.52
288 0.52
289 0.51
290 0.49
291 0.48
292 0.48
293 0.5
294 0.57
295 0.59
296 0.61
297 0.64
298 0.67
299 0.72
300 0.74
301 0.78
302 0.78
303 0.79
304 0.8
305 0.81
306 0.84
307 0.85
308 0.86
309 0.84
310 0.85