FuNGI

A0A397TR61

Protein Details

Accession

A0A397TR61

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

10.8

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
80-103	VLPSRGKVKEVKAKSKQKLSNGVN	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
588-600	KRAAKRYWGKKPK

Subcellular Location(s)

nucl 7, plas 7, cyto 5, mito 2, E.R. 2, golg 2

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR012677 Nucleotide-bd_a/b_plait_sf IPR035979 RBD_domain_sf IPR007855 RNA-dep_RNA_pol_euk-typ IPR000504 RRM_dom
Gene Ontology	GO:0003723 F:RNA binding GO:0003968 F:RNA-dependent RNA polymerase activity GO:0031047 P:RNA-mediated gene silencing
Pfam	View protein in Pfam PF05183 RdRP PF00076 RRM_1
PROSITE	View protein in PROSITE PS50102 RRM

Amino Acid Sequences

MTKKEIYVKNIPNDAIANDVVEALSKYGPLSKFELKIPKDIRNDHAFFGYAEFEEEADADECLANAHYFPPECRGTTLCVLPSRGKVKEVKAKSKQKLSNGVNIATFPLSSMEIGNWGGQTLSITHTNGRRNRSDATQRFTFLSEWKYSHYYEKPTIRFSKAEEALILEGFNLPEDSLKRRVKISFRSLAENSRGIFLDTKSQEDGTISLYISLKQPPCLYRKADENIKAEKIGITLWYQEELDIWVRTVDWTGIVNVFGRCLVYRLNFRDNLDQLRHFLNDFVIRGIPRPMLQCAVICIEKSSYSRDYFDILCQVLPFKICFKLENLMSYGKLTLDEIEEELGERLVDLIYDEQEMMAWHALNQISTKHWDPFDNRYQERPLTVFDVALRNFRSRINVWYPSKPDFQLTNNSRCVWVNHATITPTRIYFDGPNYESSNRILRQYEDKTDHFLRVTFKDENFDRLFVNKNESADIINLRIVAIINAGLCLAGRHYEFLAFSSSQLKETSCWFVASNGEFNANFIRANMGDFSKIQAPSLYAARMGQCFTSTVGTLKLDQHQKINILDIERNDYKFSDGCGKISESLAKRAAKRYWGKKPKDKEIPSVFQFRYGGCKGVVAVDPSLEGDVLCIRPSQEKFEAPSSILEIVKTVKNPLPGHLNRQIILLLSTLGVQNEVFIELQNEMRTDIDSMMIDEVKACGIVKRNIGTRECSHVMRTILSMIDAGMMRGTVDPFLKALLECKRVFALKSLRYKARILMPKSFLLLGVIDETGILEEDEIYIQTSTIVSEHHTFDTAYNKVQREHKVWTGPAIITRNPCLHPGDIRMAHAVDASNKLSHLRNCIVFSQKGDRPLPNLLSGGDLDGDEFFVCFDERIFIIENEEPMDYDATDKKIIEDRPVEIADICEFFKDFMLNNRLGQIGNLHLALADYSVEGVRSKKCIELAELHSKAVDFNKTGVPVDDILPTIDKYPDFMEHKFKESYKSDKILGILYRNIKLDKPNSDPLLKYYVKNITPNEDFLFDGYQDYVEEAIVFRDYYNGEIRNLMKKYRVKTEAEILTSHLLGYKRIDGRKCQDIREAIAGTVSYIIHNCRKQFLMGLNQNTNENINADDITPFNLHTTIQVNDESKAKASAWYYVTYNQEEFPDRGGKTCLLSFPWVVADVLLAIRMENHLEKMNNLIRDIDFSLLERLY

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.41
2	0.35
3	0.27
4	0.2
5	0.15
6	0.14
7	0.12
8	0.11
9	0.11
10	0.09
11	0.09
12	0.08
13	0.09
14	0.15
15	0.17
16	0.19
17	0.25
18	0.3
19	0.33
20	0.39
21	0.49
22	0.45
23	0.53
24	0.56
25	0.58
26	0.6
27	0.62
28	0.63
29	0.63
30	0.63
31	0.55
32	0.51
33	0.44
34	0.36
35	0.32
36	0.27
37	0.18
38	0.17
39	0.15
40	0.13
41	0.12
42	0.11
43	0.12
44	0.1
45	0.1
46	0.09
47	0.08
48	0.08
49	0.09
50	0.1
51	0.07
52	0.07
53	0.09
54	0.13
55	0.14
56	0.16
57	0.21
58	0.23
59	0.25
60	0.27
61	0.28
62	0.29
63	0.32
64	0.35
65	0.33
66	0.34
67	0.36
68	0.37
69	0.43
70	0.44
71	0.41
72	0.43
73	0.44
74	0.49
75	0.56
76	0.61
77	0.65
78	0.69
79	0.77
80	0.81
81	0.85
82	0.83
83	0.81
84	0.82
85	0.76
86	0.75
87	0.69
88	0.63
89	0.53
90	0.47
91	0.4
92	0.3
93	0.25
94	0.16
95	0.13
96	0.11
97	0.11
98	0.11
99	0.09
100	0.11
101	0.12
102	0.12
103	0.11
104	0.1
105	0.09
106	0.09
107	0.09
108	0.08
109	0.11
110	0.13
111	0.14
112	0.19
113	0.25
114	0.33
115	0.39
116	0.44
117	0.45
118	0.46
119	0.49
120	0.53
121	0.59
122	0.58
123	0.59
124	0.57
125	0.54
126	0.52
127	0.49
128	0.42
129	0.35
130	0.34
131	0.31
132	0.28
133	0.31
134	0.32
135	0.32
136	0.38
137	0.39
138	0.41
139	0.45
140	0.53
141	0.52
142	0.57
143	0.61
144	0.57
145	0.54
146	0.51
147	0.53
148	0.47
149	0.44
150	0.36
151	0.33
152	0.3
153	0.28
154	0.23
155	0.13
156	0.11
157	0.1
158	0.1
159	0.08
160	0.06
161	0.09
162	0.12
163	0.16
164	0.25
165	0.29
166	0.31
167	0.35
168	0.41
169	0.47
170	0.54
171	0.58
172	0.57
173	0.56
174	0.61
175	0.59
176	0.59
177	0.55
178	0.49
179	0.4
180	0.34
181	0.32
182	0.26
183	0.26
184	0.2
185	0.26
186	0.24
187	0.26
188	0.25
189	0.25
190	0.24
191	0.22
192	0.22
193	0.15
194	0.15
195	0.13
196	0.14
197	0.14
198	0.15
199	0.16
200	0.22
201	0.2
202	0.22
203	0.26
204	0.29
205	0.33
206	0.38
207	0.4
208	0.37
209	0.44
210	0.48
211	0.52
212	0.55
213	0.55
214	0.55
215	0.53
216	0.5
217	0.42
218	0.36
219	0.27
220	0.2
221	0.17
222	0.12
223	0.12
224	0.13
225	0.14
226	0.13
227	0.12
228	0.12
229	0.12
230	0.14
231	0.12
232	0.12
233	0.1
234	0.11
235	0.11
236	0.11
237	0.09
238	0.08
239	0.08
240	0.09
241	0.1
242	0.1
243	0.12
244	0.11
245	0.11
246	0.1
247	0.1
248	0.09
249	0.1
250	0.12
251	0.14
252	0.22
253	0.27
254	0.33
255	0.36
256	0.38
257	0.44
258	0.44
259	0.46
260	0.43
261	0.39
262	0.35
263	0.34
264	0.33
265	0.26
266	0.23
267	0.2
268	0.19
269	0.18
270	0.17
271	0.17
272	0.16
273	0.17
274	0.19
275	0.17
276	0.16
277	0.18
278	0.18
279	0.18
280	0.19
281	0.17
282	0.17
283	0.19
284	0.18
285	0.16
286	0.15
287	0.14
288	0.16
289	0.16
290	0.2
291	0.2
292	0.21
293	0.23
294	0.23
295	0.25
296	0.23
297	0.24
298	0.23
299	0.19
300	0.17
301	0.16
302	0.16
303	0.14
304	0.14
305	0.13
306	0.12
307	0.15
308	0.16
309	0.17
310	0.18
311	0.23
312	0.23
313	0.25
314	0.25
315	0.22
316	0.22
317	0.21
318	0.19
319	0.14
320	0.13
321	0.11
322	0.09
323	0.08
324	0.09
325	0.08
326	0.08
327	0.08
328	0.08
329	0.08
330	0.07
331	0.06
332	0.05
333	0.05
334	0.04
335	0.04
336	0.04
337	0.05
338	0.05
339	0.06
340	0.06
341	0.06
342	0.06
343	0.06
344	0.07
345	0.07
346	0.06
347	0.06
348	0.09
349	0.1
350	0.1
351	0.1
352	0.11
353	0.12
354	0.16
355	0.18
356	0.18
357	0.19
358	0.23
359	0.26
360	0.32
361	0.39
362	0.44
363	0.43
364	0.44
365	0.47
366	0.44
367	0.42
368	0.36
369	0.29
370	0.24
371	0.22
372	0.19
373	0.17
374	0.21
375	0.2
376	0.22
377	0.22
378	0.2
379	0.21
380	0.21
381	0.24
382	0.2
383	0.27
384	0.3
385	0.37
386	0.39
387	0.44
388	0.47
389	0.47
390	0.48
391	0.42
392	0.38
393	0.32
394	0.31
395	0.35
396	0.37
397	0.4
398	0.39
399	0.39
400	0.37
401	0.35
402	0.34
403	0.29
404	0.28
405	0.23
406	0.22
407	0.22
408	0.22
409	0.22
410	0.23
411	0.19
412	0.14
413	0.14
414	0.13
415	0.13
416	0.14
417	0.16
418	0.2
419	0.2
420	0.22
421	0.24
422	0.24
423	0.23
424	0.23
425	0.26
426	0.21
427	0.23
428	0.21
429	0.21
430	0.28
431	0.3
432	0.35
433	0.34
434	0.34
435	0.37
436	0.38
437	0.37
438	0.3
439	0.29
440	0.26
441	0.23
442	0.27
443	0.24
444	0.23
445	0.26
446	0.26
447	0.3
448	0.28
449	0.26
450	0.22
451	0.21
452	0.25
453	0.2
454	0.25
455	0.21
456	0.2
457	0.2
458	0.2
459	0.19
460	0.16
461	0.16
462	0.11
463	0.1
464	0.09
465	0.08
466	0.08
467	0.07
468	0.06
469	0.05
470	0.05
471	0.04
472	0.04
473	0.04
474	0.04
475	0.03
476	0.03
477	0.03
478	0.05
479	0.05
480	0.06
481	0.06
482	0.07
483	0.07
484	0.08
485	0.11
486	0.1
487	0.1
488	0.14
489	0.14
490	0.15
491	0.15
492	0.15
493	0.13
494	0.15
495	0.19
496	0.14
497	0.15
498	0.14
499	0.14
500	0.17
501	0.17
502	0.16
503	0.12
504	0.13
505	0.12
506	0.12
507	0.12
508	0.1
509	0.09
510	0.07
511	0.09
512	0.07
513	0.08
514	0.08
515	0.08
516	0.08
517	0.09
518	0.1
519	0.13
520	0.13
521	0.12
522	0.12
523	0.12
524	0.12
525	0.13
526	0.12
527	0.08
528	0.09
529	0.1
530	0.1
531	0.1
532	0.09
533	0.08
534	0.08
535	0.09
536	0.09
537	0.08
538	0.08
539	0.08
540	0.09
541	0.1
542	0.11
543	0.16
544	0.2
545	0.21
546	0.22
547	0.22
548	0.24
549	0.23
550	0.23
551	0.19
552	0.16
553	0.17
554	0.15
555	0.2
556	0.19
557	0.19
558	0.18
559	0.16
560	0.16
561	0.15
562	0.15
563	0.18
564	0.17
565	0.17
566	0.17
567	0.18
568	0.17
569	0.18
570	0.22
571	0.14
572	0.18
573	0.23
574	0.24
575	0.25
576	0.29
577	0.31
578	0.34
579	0.4
580	0.45
581	0.51
582	0.58
583	0.64
584	0.67
585	0.72
586	0.74
587	0.76
588	0.71
589	0.69
590	0.66
591	0.64
592	0.59
593	0.59
594	0.49
595	0.41
596	0.39
597	0.3
598	0.29
599	0.24
600	0.22
601	0.15
602	0.15
603	0.13
604	0.14
605	0.15
606	0.1
607	0.09
608	0.08
609	0.08
610	0.08
611	0.08
612	0.05
613	0.04
614	0.03
615	0.05
616	0.05
617	0.05
618	0.05
619	0.06
620	0.11
621	0.12
622	0.17
623	0.18
624	0.19
625	0.22
626	0.24
627	0.25
628	0.21
629	0.2
630	0.17
631	0.16
632	0.14
633	0.12
634	0.1
635	0.11
636	0.11
637	0.11
638	0.12
639	0.12
640	0.19
641	0.19
642	0.21
643	0.28
644	0.28
645	0.34
646	0.38
647	0.38
648	0.32
649	0.32
650	0.3
651	0.21
652	0.2
653	0.14
654	0.07
655	0.06
656	0.06
657	0.06
658	0.06
659	0.06
660	0.05
661	0.05
662	0.05
663	0.05
664	0.05
665	0.04
666	0.05
667	0.06
668	0.07
669	0.07
670	0.07
671	0.07
672	0.07
673	0.08
674	0.08
675	0.07
676	0.07
677	0.07
678	0.07
679	0.07
680	0.07
681	0.06
682	0.06
683	0.05
684	0.05
685	0.05
686	0.04
687	0.06
688	0.1
689	0.13
690	0.15
691	0.18
692	0.22
693	0.27
694	0.28
695	0.31
696	0.29
697	0.33
698	0.33
699	0.31
700	0.28
701	0.27
702	0.26
703	0.22
704	0.21
705	0.15
706	0.12
707	0.12
708	0.1
709	0.06
710	0.07
711	0.06
712	0.06
713	0.05
714	0.05
715	0.05
716	0.05
717	0.06
718	0.05
719	0.06
720	0.06
721	0.06
722	0.07
723	0.07
724	0.06
725	0.11
726	0.15
727	0.2
728	0.2
729	0.21
730	0.23
731	0.23
732	0.24
733	0.26
734	0.29
735	0.3
736	0.38
737	0.43
738	0.45
739	0.47
740	0.47
741	0.45
742	0.45
743	0.46
744	0.42
745	0.43
746	0.43
747	0.41
748	0.41
749	0.37
750	0.28
751	0.21
752	0.17
753	0.1
754	0.08
755	0.07
756	0.06
757	0.05
758	0.05
759	0.05
760	0.05
761	0.04
762	0.03
763	0.03
764	0.03
765	0.04
766	0.04
767	0.05
768	0.04
769	0.04
770	0.05
771	0.05
772	0.05
773	0.05
774	0.05
775	0.07
776	0.09
777	0.11
778	0.12
779	0.12
780	0.13
781	0.14
782	0.19
783	0.18
784	0.19
785	0.23
786	0.24
787	0.27
788	0.33
789	0.37
790	0.36
791	0.4
792	0.41
793	0.41
794	0.4
795	0.38
796	0.35
797	0.3
798	0.31
799	0.29
800	0.26
801	0.23
802	0.26
803	0.26
804	0.25
805	0.26
806	0.24
807	0.23
808	0.22
809	0.24
810	0.29
811	0.26
812	0.26
813	0.25
814	0.23
815	0.21
816	0.2
817	0.17
818	0.11
819	0.13
820	0.13
821	0.12
822	0.12
823	0.15
824	0.18
825	0.19
826	0.23
827	0.24
828	0.26
829	0.27
830	0.31
831	0.33
832	0.31
833	0.32
834	0.34
835	0.32
836	0.36
837	0.38
838	0.35
839	0.34
840	0.37
841	0.36
842	0.3
843	0.28
844	0.21
845	0.2
846	0.18
847	0.15
848	0.11
849	0.09
850	0.07
851	0.07
852	0.07
853	0.05
854	0.05
855	0.04
856	0.05
857	0.05
858	0.05
859	0.05
860	0.06
861	0.06
862	0.08
863	0.11
864	0.1
865	0.13
866	0.14
867	0.15
868	0.14
869	0.14
870	0.13
871	0.12
872	0.12
873	0.09
874	0.1
875	0.12
876	0.13
877	0.15
878	0.15
879	0.16
880	0.21
881	0.22
882	0.26
883	0.26
884	0.25
885	0.28
886	0.29
887	0.27
888	0.21
889	0.21
890	0.17
891	0.15
892	0.14
893	0.1
894	0.09
895	0.09
896	0.1
897	0.1
898	0.09
899	0.16
900	0.21
901	0.21
902	0.22
903	0.23
904	0.23
905	0.22
906	0.21
907	0.15
908	0.12
909	0.13
910	0.12
911	0.1
912	0.09
913	0.09
914	0.09
915	0.08
916	0.06
917	0.04
918	0.05
919	0.05
920	0.05
921	0.07
922	0.09
923	0.11
924	0.14
925	0.15
926	0.17
927	0.2
928	0.21
929	0.24
930	0.28
931	0.34
932	0.41
933	0.41
934	0.38
935	0.36
936	0.34
937	0.32
938	0.28
939	0.25
940	0.15
941	0.17
942	0.2
943	0.21
944	0.21
945	0.21
946	0.19
947	0.17
948	0.17
949	0.17
950	0.14
951	0.13
952	0.14
953	0.14
954	0.13
955	0.14
956	0.12
957	0.12
958	0.14
959	0.2
960	0.22
961	0.25
962	0.33
963	0.33
964	0.38
965	0.41
966	0.4
967	0.41
968	0.42
969	0.48
970	0.45
971	0.47
972	0.45
973	0.43
974	0.43
975	0.4
976	0.38
977	0.33
978	0.32
979	0.32
980	0.33
981	0.33
982	0.33
983	0.31
984	0.35
985	0.37
986	0.38
987	0.41
988	0.46
989	0.48
990	0.5
991	0.48
992	0.44
993	0.46
994	0.41
995	0.36
996	0.34
997	0.38
998	0.38
999	0.43
1000	0.42
1001	0.41
1002	0.41
1003	0.44
1004	0.39
1005	0.33
1006	0.29
1007	0.25
1008	0.25
1009	0.17
1010	0.16
1011	0.13
1012	0.11
1013	0.1
1014	0.1
1015	0.09
1016	0.07
1017	0.07
1018	0.06
1019	0.07
1020	0.08
1021	0.08
1022	0.07
1023	0.09
1024	0.1
1025	0.12
1026	0.17
1027	0.18
1028	0.18
1029	0.23
1030	0.26
1031	0.32
1032	0.34
1033	0.34
1034	0.37
1035	0.41
1036	0.45
1037	0.51
1038	0.54
1039	0.51
1040	0.53
1041	0.59
1042	0.57
1043	0.53
1044	0.48
1045	0.41
1046	0.37
1047	0.32
1048	0.27
1049	0.22
1050	0.17
1051	0.16
1052	0.18
1053	0.24
1054	0.28
1055	0.35
1056	0.4
1057	0.44
1058	0.5
1059	0.58
1060	0.59
1061	0.55
1062	0.56
1063	0.54
1064	0.53
1065	0.51
1066	0.46
1067	0.36
1068	0.33
1069	0.29
1070	0.22
1071	0.2
1072	0.15
1073	0.1
1074	0.1
1075	0.15
1076	0.22
1077	0.26
1078	0.28
1079	0.3
1080	0.32
1081	0.32
1082	0.35
1083	0.37
1084	0.4
1085	0.44
1086	0.5
1087	0.5
1088	0.5
1089	0.5
1090	0.46
1091	0.41
1092	0.31
1093	0.24
1094	0.17
1095	0.14
1096	0.14
1097	0.13
1098	0.13
1099	0.12
1100	0.14
1101	0.14
1102	0.13
1103	0.13
1104	0.13
1105	0.13
1106	0.14
1107	0.17
1108	0.15
1109	0.18
1110	0.22
1111	0.22
1112	0.23
1113	0.26
1114	0.25
1115	0.23
1116	0.24
1117	0.22
1118	0.22
1119	0.22
1120	0.26
1121	0.26
1122	0.27
1123	0.28
1124	0.31
1125	0.36
1126	0.35
1127	0.35
1128	0.3
1129	0.31
1130	0.32
1131	0.31
1132	0.3
1133	0.32
1134	0.28
1135	0.3
1136	0.31
1137	0.29
1138	0.29
1139	0.3
1140	0.29
1141	0.25
1142	0.29
1143	0.26
1144	0.25
1145	0.24
1146	0.22
1147	0.19
1148	0.16
1149	0.13
1150	0.1
1151	0.1
1152	0.1
1153	0.08
1154	0.07
1155	0.07
1156	0.09
1157	0.12
1158	0.13
1159	0.15
1160	0.2
1161	0.21
1162	0.22
1163	0.3
1164	0.35
1165	0.33
1166	0.32
1167	0.33
1168	0.28
1169	0.31
1170	0.32
1171	0.26
1172	0.2
1173	0.2

A0A397TR61

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer