Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A397SGF0

Protein Details
Accession A0A397SGF0    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
108-129SDEQQRSTKRPRQQDQPDNTLSHydrophilic
433-457NDCPVRKQDSKKQRLNKLYNRYRPAHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 19.5, cyto_nucl 12, cyto 3.5, mito 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
IPR001878  Znf_CCHC  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50158  ZF_CCHC  
CDD cd00590  RRM_SF  
Amino Acid Sequences MQINKFISKFIFVLLHKYYNDVNDKQSLEKILKTLSSFASFFLHPQQQPHRSVKESNVNTVLGSSLHQRAKSPIPKSLTTSQVNETTSLDKNKEIIAQTFGTSSNPASDEQQRSTKRPRQQDQPDNTLSGNNNTSSSSTSSPRDHDQEDASTLVTNPIMITTARRTNHCAIAPYDYVKGKYMCIFFLDEKDLLDAIKLPITKSSKASPPVTENPNNNTTPEDHPDQPNPDLDTPPQFYFQKFSDAVPADDPNVKDDTNQRTVQVIDIPLGMKAHTVRASLSRYGDIESIKLVTRGLFQHAFIVYKSAISAITFVTYWGTYILRNAVRIFPKFLTNEQRQLRKNFGCKLTGLPNNIQARDLHDILRAMNAKSIFIPRNPVSYKPLNFAYINYESEDAKQKAMKTNYKLNGRDLFWCTENARTCNRCGSPSHLFNDCPVRKQDSKKQRLNKLYNRYRPAQHRKPRSYAEAARSNNTDKSRDHNPSAKNGNNSHRQDKRQQACATFSSSNLNGGTQQGGSIHGAQAEKFTAMYNEVLKLMEQINSRLSSIDKKIFLLEKRTSKQPEFLSPHARELREKNNSNIPSASDSVIENTASSSSSLTESQENPVDIEALKKESSETRSLTNTCVNILKQMQSYMGMDNPDDDADPENFENYDRDGDEDENMDEDEFDEEGYLLNPTDDALNKLTENWGN
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.33
2 0.36
3 0.33
4 0.35
5 0.35
6 0.35
7 0.42
8 0.38
9 0.38
10 0.39
11 0.41
12 0.4
13 0.41
14 0.39
15 0.35
16 0.34
17 0.32
18 0.29
19 0.3
20 0.29
21 0.3
22 0.28
23 0.29
24 0.27
25 0.26
26 0.26
27 0.23
28 0.23
29 0.27
30 0.32
31 0.29
32 0.37
33 0.45
34 0.49
35 0.56
36 0.62
37 0.61
38 0.58
39 0.61
40 0.62
41 0.63
42 0.59
43 0.58
44 0.53
45 0.47
46 0.43
47 0.38
48 0.3
49 0.2
50 0.18
51 0.16
52 0.2
53 0.24
54 0.25
55 0.26
56 0.3
57 0.4
58 0.47
59 0.46
60 0.46
61 0.48
62 0.5
63 0.55
64 0.57
65 0.55
66 0.51
67 0.5
68 0.47
69 0.46
70 0.45
71 0.39
72 0.35
73 0.31
74 0.32
75 0.33
76 0.3
77 0.26
78 0.27
79 0.27
80 0.3
81 0.28
82 0.25
83 0.25
84 0.24
85 0.23
86 0.23
87 0.22
88 0.18
89 0.17
90 0.15
91 0.14
92 0.14
93 0.14
94 0.17
95 0.25
96 0.29
97 0.32
98 0.4
99 0.42
100 0.48
101 0.57
102 0.61
103 0.62
104 0.67
105 0.71
106 0.72
107 0.79
108 0.83
109 0.8
110 0.81
111 0.75
112 0.66
113 0.59
114 0.52
115 0.43
116 0.36
117 0.31
118 0.23
119 0.21
120 0.2
121 0.2
122 0.19
123 0.2
124 0.19
125 0.21
126 0.24
127 0.27
128 0.3
129 0.34
130 0.36
131 0.34
132 0.34
133 0.33
134 0.31
135 0.3
136 0.26
137 0.21
138 0.17
139 0.16
140 0.14
141 0.11
142 0.09
143 0.07
144 0.06
145 0.07
146 0.07
147 0.09
148 0.13
149 0.21
150 0.23
151 0.25
152 0.31
153 0.34
154 0.4
155 0.39
156 0.37
157 0.32
158 0.36
159 0.35
160 0.31
161 0.31
162 0.26
163 0.25
164 0.25
165 0.24
166 0.21
167 0.24
168 0.23
169 0.19
170 0.19
171 0.22
172 0.19
173 0.22
174 0.23
175 0.19
176 0.18
177 0.18
178 0.16
179 0.13
180 0.12
181 0.1
182 0.08
183 0.11
184 0.11
185 0.1
186 0.16
187 0.2
188 0.22
189 0.24
190 0.28
191 0.31
192 0.36
193 0.39
194 0.36
195 0.39
196 0.44
197 0.49
198 0.5
199 0.48
200 0.47
201 0.49
202 0.47
203 0.4
204 0.35
205 0.31
206 0.29
207 0.3
208 0.29
209 0.27
210 0.3
211 0.33
212 0.35
213 0.33
214 0.32
215 0.31
216 0.28
217 0.26
218 0.24
219 0.25
220 0.25
221 0.25
222 0.26
223 0.24
224 0.22
225 0.24
226 0.24
227 0.25
228 0.22
229 0.21
230 0.24
231 0.25
232 0.25
233 0.24
234 0.23
235 0.19
236 0.21
237 0.21
238 0.16
239 0.16
240 0.15
241 0.15
242 0.21
243 0.26
244 0.28
245 0.29
246 0.27
247 0.27
248 0.27
249 0.26
250 0.23
251 0.16
252 0.11
253 0.11
254 0.11
255 0.1
256 0.1
257 0.09
258 0.07
259 0.07
260 0.1
261 0.1
262 0.1
263 0.11
264 0.15
265 0.18
266 0.19
267 0.2
268 0.18
269 0.17
270 0.18
271 0.19
272 0.15
273 0.12
274 0.11
275 0.11
276 0.1
277 0.09
278 0.08
279 0.07
280 0.09
281 0.1
282 0.14
283 0.13
284 0.13
285 0.15
286 0.16
287 0.16
288 0.13
289 0.15
290 0.1
291 0.1
292 0.09
293 0.07
294 0.07
295 0.06
296 0.07
297 0.05
298 0.06
299 0.05
300 0.06
301 0.06
302 0.06
303 0.06
304 0.06
305 0.06
306 0.06
307 0.06
308 0.11
309 0.11
310 0.12
311 0.13
312 0.16
313 0.19
314 0.2
315 0.22
316 0.19
317 0.22
318 0.22
319 0.25
320 0.29
321 0.29
322 0.36
323 0.38
324 0.44
325 0.45
326 0.46
327 0.49
328 0.46
329 0.48
330 0.46
331 0.44
332 0.38
333 0.34
334 0.35
335 0.35
336 0.34
337 0.31
338 0.26
339 0.31
340 0.32
341 0.31
342 0.29
343 0.22
344 0.22
345 0.23
346 0.23
347 0.16
348 0.15
349 0.15
350 0.14
351 0.18
352 0.16
353 0.12
354 0.14
355 0.13
356 0.12
357 0.13
358 0.17
359 0.15
360 0.14
361 0.2
362 0.19
363 0.25
364 0.26
365 0.27
366 0.28
367 0.33
368 0.34
369 0.31
370 0.31
371 0.28
372 0.27
373 0.25
374 0.26
375 0.22
376 0.21
377 0.19
378 0.19
379 0.16
380 0.18
381 0.24
382 0.19
383 0.18
384 0.19
385 0.2
386 0.26
387 0.33
388 0.37
389 0.35
390 0.43
391 0.49
392 0.54
393 0.54
394 0.52
395 0.51
396 0.46
397 0.46
398 0.4
399 0.35
400 0.28
401 0.28
402 0.24
403 0.25
404 0.27
405 0.25
406 0.29
407 0.28
408 0.29
409 0.34
410 0.34
411 0.31
412 0.29
413 0.33
414 0.34
415 0.37
416 0.39
417 0.35
418 0.34
419 0.34
420 0.42
421 0.37
422 0.32
423 0.3
424 0.34
425 0.37
426 0.44
427 0.51
428 0.52
429 0.61
430 0.67
431 0.73
432 0.76
433 0.81
434 0.84
435 0.83
436 0.83
437 0.84
438 0.84
439 0.8
440 0.75
441 0.72
442 0.72
443 0.74
444 0.73
445 0.73
446 0.75
447 0.76
448 0.78
449 0.76
450 0.72
451 0.69
452 0.65
453 0.63
454 0.61
455 0.56
456 0.52
457 0.5
458 0.46
459 0.43
460 0.39
461 0.35
462 0.27
463 0.3
464 0.36
465 0.39
466 0.42
467 0.44
468 0.44
469 0.48
470 0.55
471 0.54
472 0.52
473 0.52
474 0.54
475 0.57
476 0.59
477 0.6
478 0.6
479 0.61
480 0.64
481 0.69
482 0.68
483 0.67
484 0.66
485 0.6
486 0.57
487 0.53
488 0.5
489 0.41
490 0.35
491 0.3
492 0.27
493 0.26
494 0.22
495 0.2
496 0.15
497 0.15
498 0.15
499 0.1
500 0.1
501 0.08
502 0.09
503 0.1
504 0.11
505 0.1
506 0.11
507 0.12
508 0.12
509 0.13
510 0.12
511 0.11
512 0.1
513 0.1
514 0.08
515 0.1
516 0.11
517 0.11
518 0.12
519 0.12
520 0.12
521 0.12
522 0.13
523 0.12
524 0.15
525 0.15
526 0.16
527 0.19
528 0.19
529 0.2
530 0.18
531 0.19
532 0.21
533 0.26
534 0.3
535 0.27
536 0.27
537 0.31
538 0.36
539 0.37
540 0.39
541 0.41
542 0.45
543 0.48
544 0.55
545 0.58
546 0.55
547 0.58
548 0.55
549 0.57
550 0.55
551 0.56
552 0.57
553 0.53
554 0.59
555 0.58
556 0.55
557 0.5
558 0.5
559 0.54
560 0.55
561 0.56
562 0.53
563 0.56
564 0.56
565 0.54
566 0.49
567 0.41
568 0.35
569 0.34
570 0.3
571 0.21
572 0.2
573 0.19
574 0.19
575 0.17
576 0.12
577 0.11
578 0.11
579 0.1
580 0.1
581 0.08
582 0.08
583 0.1
584 0.11
585 0.13
586 0.17
587 0.17
588 0.21
589 0.24
590 0.24
591 0.22
592 0.21
593 0.2
594 0.16
595 0.18
596 0.16
597 0.16
598 0.16
599 0.15
600 0.17
601 0.22
602 0.27
603 0.3
604 0.3
605 0.3
606 0.36
607 0.38
608 0.39
609 0.39
610 0.34
611 0.31
612 0.33
613 0.29
614 0.3
615 0.31
616 0.32
617 0.28
618 0.29
619 0.27
620 0.25
621 0.27
622 0.22
623 0.22
624 0.19
625 0.18
626 0.17
627 0.17
628 0.16
629 0.14
630 0.13
631 0.14
632 0.13
633 0.17
634 0.16
635 0.16
636 0.16
637 0.17
638 0.17
639 0.16
640 0.19
641 0.16
642 0.18
643 0.19
644 0.2
645 0.21
646 0.21
647 0.19
648 0.17
649 0.17
650 0.14
651 0.12
652 0.11
653 0.11
654 0.09
655 0.08
656 0.08
657 0.07
658 0.07
659 0.08
660 0.08
661 0.07
662 0.07
663 0.07
664 0.07
665 0.1
666 0.11
667 0.14
668 0.15
669 0.17
670 0.18
671 0.19