Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A397T8X4

Protein Details
Accession A0A397T8X4    Localization Confidence High Confidence Score 20
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
56-78YEEFQRKKTNPIRQERKREAEKLHydrophilic
104-123VEKWEKKQEKKAKKANTGFTHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
110-116KQEKKAK
Subcellular Location(s) nucl 26
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR013260  mRNA_splic_SYF2  
Gene Ontology GO:0005681  C:spliceosomal complex  
GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
Pfam View protein in Pfam  
PF08231  SYF2  
Amino Acid Sequences MNIDPQREQAKKNEIHDSLSTNEVSRVEKMKARIDCLQKLRKRSDDALQANRQEVYEEFQRKKTNPIRQERKREAEKLLAKQEAQIRGENYERKRFWDYSAESVEKWEKKQEKKAKKANTGFTDFNQVAHKKYKKQINELRPDLVAYDEQKIATTLTTIENGKVVYIDTESSFYRDANSLQYASVDNVPSAQAVDRLVTDVNKQIAQRERFSRRKKVDDDNEITYINNRNRRFNEKIGRFYDKYTMEIRGNLERGTAL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.53
2 0.54
3 0.53
4 0.48
5 0.41
6 0.38
7 0.33
8 0.25
9 0.25
10 0.22
11 0.22
12 0.22
13 0.24
14 0.24
15 0.28
16 0.32
17 0.37
18 0.39
19 0.42
20 0.46
21 0.49
22 0.54
23 0.59
24 0.65
25 0.62
26 0.67
27 0.7
28 0.69
29 0.68
30 0.64
31 0.62
32 0.63
33 0.65
34 0.66
35 0.64
36 0.59
37 0.54
38 0.5
39 0.42
40 0.33
41 0.26
42 0.22
43 0.24
44 0.3
45 0.31
46 0.36
47 0.42
48 0.41
49 0.51
50 0.55
51 0.57
52 0.59
53 0.67
54 0.73
55 0.77
56 0.87
57 0.85
58 0.86
59 0.83
60 0.77
61 0.7
62 0.69
63 0.66
64 0.62
65 0.59
66 0.52
67 0.45
68 0.44
69 0.45
70 0.41
71 0.36
72 0.32
73 0.27
74 0.27
75 0.32
76 0.34
77 0.34
78 0.37
79 0.36
80 0.38
81 0.42
82 0.41
83 0.39
84 0.41
85 0.39
86 0.36
87 0.41
88 0.37
89 0.32
90 0.33
91 0.36
92 0.29
93 0.27
94 0.3
95 0.32
96 0.37
97 0.47
98 0.55
99 0.59
100 0.68
101 0.76
102 0.77
103 0.79
104 0.8
105 0.78
106 0.72
107 0.67
108 0.58
109 0.5
110 0.47
111 0.37
112 0.32
113 0.28
114 0.24
115 0.21
116 0.28
117 0.3
118 0.29
119 0.36
120 0.42
121 0.41
122 0.51
123 0.58
124 0.59
125 0.65
126 0.62
127 0.58
128 0.51
129 0.46
130 0.36
131 0.28
132 0.2
133 0.12
134 0.12
135 0.11
136 0.11
137 0.11
138 0.11
139 0.1
140 0.08
141 0.07
142 0.06
143 0.07
144 0.09
145 0.09
146 0.09
147 0.1
148 0.1
149 0.09
150 0.08
151 0.07
152 0.06
153 0.06
154 0.07
155 0.06
156 0.08
157 0.09
158 0.1
159 0.11
160 0.1
161 0.11
162 0.11
163 0.12
164 0.13
165 0.15
166 0.14
167 0.13
168 0.14
169 0.13
170 0.14
171 0.15
172 0.12
173 0.1
174 0.1
175 0.1
176 0.1
177 0.09
178 0.08
179 0.07
180 0.07
181 0.08
182 0.08
183 0.09
184 0.1
185 0.1
186 0.11
187 0.14
188 0.16
189 0.18
190 0.18
191 0.23
192 0.31
193 0.34
194 0.39
195 0.44
196 0.52
197 0.59
198 0.67
199 0.72
200 0.72
201 0.77
202 0.77
203 0.79
204 0.79
205 0.79
206 0.77
207 0.71
208 0.65
209 0.56
210 0.5
211 0.42
212 0.4
213 0.37
214 0.4
215 0.38
216 0.45
217 0.5
218 0.58
219 0.61
220 0.63
221 0.67
222 0.67
223 0.73
224 0.71
225 0.74
226 0.67
227 0.63
228 0.61
229 0.52
230 0.47
231 0.41
232 0.4
233 0.34
234 0.35
235 0.36
236 0.36
237 0.36
238 0.33