Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A397SFF4

Protein Details
Accession A0A397SFF4    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
112-141KDAYKYRTEKFPKKVKRRRKKEPWNSSIAFHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
118-133RTEKFPKKVKRRRKKE
Subcellular Location(s) nucl 20.5, cyto_nucl 14.333, cyto 5, cyto_mito 3.499
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR009071  HMG_box_dom  
IPR036910  HMG_box_dom_sf  
Amino Acid Sequences MTSQDNSSTLRACVFIDSSNPEFPNQIMNHSSHPFIKPPFPPLIDPKDLLIISKDNKPSRSPNAFIIYRKVFLKTTRDQGYFLPMTIVSSMASKSWDQESDEVRDYYKRLAKDAYKYRTEKFPKKVKRRRKKEPWNSSIAFQNDLHNTFFDNSNKSSSPELLPTENVFSQNSSPNLEQQIHETSLFNEPDFQSLFSSPNLSNNSSIISSPEITVIDNTESLLNYNYNSQNTEFNLHDDLNQINIESYDQNFTNLLNQELILNNNFPDYIPFNGNTFSNTSNQIDYNSMDSTVECLTMYPDLLNLTQQYQDVLGINMNGNTIYM
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.17
2 0.16
3 0.18
4 0.23
5 0.26
6 0.3
7 0.3
8 0.28
9 0.28
10 0.27
11 0.32
12 0.26
13 0.27
14 0.25
15 0.26
16 0.31
17 0.32
18 0.34
19 0.29
20 0.31
21 0.32
22 0.33
23 0.38
24 0.35
25 0.39
26 0.43
27 0.41
28 0.43
29 0.46
30 0.5
31 0.46
32 0.44
33 0.4
34 0.38
35 0.36
36 0.32
37 0.27
38 0.24
39 0.23
40 0.29
41 0.36
42 0.36
43 0.38
44 0.43
45 0.47
46 0.52
47 0.56
48 0.52
49 0.5
50 0.53
51 0.55
52 0.52
53 0.52
54 0.45
55 0.41
56 0.39
57 0.36
58 0.3
59 0.31
60 0.37
61 0.34
62 0.4
63 0.45
64 0.45
65 0.44
66 0.42
67 0.45
68 0.38
69 0.32
70 0.25
71 0.17
72 0.17
73 0.16
74 0.15
75 0.08
76 0.08
77 0.08
78 0.07
79 0.09
80 0.09
81 0.1
82 0.13
83 0.14
84 0.15
85 0.19
86 0.21
87 0.24
88 0.27
89 0.25
90 0.24
91 0.24
92 0.23
93 0.25
94 0.26
95 0.22
96 0.21
97 0.27
98 0.3
99 0.38
100 0.46
101 0.46
102 0.5
103 0.52
104 0.52
105 0.57
106 0.61
107 0.6
108 0.6
109 0.64
110 0.67
111 0.76
112 0.84
113 0.85
114 0.88
115 0.9
116 0.92
117 0.93
118 0.94
119 0.93
120 0.94
121 0.89
122 0.86
123 0.77
124 0.67
125 0.61
126 0.51
127 0.43
128 0.32
129 0.29
130 0.23
131 0.23
132 0.22
133 0.16
134 0.16
135 0.14
136 0.16
137 0.15
138 0.15
139 0.15
140 0.17
141 0.18
142 0.19
143 0.19
144 0.17
145 0.16
146 0.16
147 0.17
148 0.15
149 0.15
150 0.14
151 0.15
152 0.14
153 0.14
154 0.11
155 0.1
156 0.11
157 0.14
158 0.14
159 0.15
160 0.15
161 0.16
162 0.18
163 0.19
164 0.17
165 0.17
166 0.19
167 0.17
168 0.18
169 0.16
170 0.15
171 0.19
172 0.19
173 0.16
174 0.15
175 0.14
176 0.15
177 0.15
178 0.15
179 0.11
180 0.12
181 0.13
182 0.11
183 0.14
184 0.12
185 0.17
186 0.19
187 0.19
188 0.19
189 0.18
190 0.19
191 0.17
192 0.17
193 0.12
194 0.11
195 0.11
196 0.1
197 0.11
198 0.1
199 0.1
200 0.1
201 0.1
202 0.09
203 0.08
204 0.08
205 0.08
206 0.08
207 0.08
208 0.09
209 0.08
210 0.08
211 0.13
212 0.15
213 0.15
214 0.17
215 0.18
216 0.2
217 0.21
218 0.24
219 0.2
220 0.19
221 0.21
222 0.19
223 0.19
224 0.17
225 0.16
226 0.14
227 0.14
228 0.12
229 0.09
230 0.09
231 0.1
232 0.09
233 0.1
234 0.12
235 0.12
236 0.13
237 0.13
238 0.13
239 0.17
240 0.17
241 0.17
242 0.14
243 0.14
244 0.14
245 0.15
246 0.17
247 0.13
248 0.13
249 0.12
250 0.12
251 0.12
252 0.1
253 0.12
254 0.13
255 0.15
256 0.17
257 0.18
258 0.19
259 0.2
260 0.2
261 0.19
262 0.19
263 0.18
264 0.17
265 0.21
266 0.22
267 0.22
268 0.23
269 0.23
270 0.22
271 0.21
272 0.22
273 0.18
274 0.17
275 0.15
276 0.14
277 0.15
278 0.13
279 0.12
280 0.09
281 0.09
282 0.1
283 0.1
284 0.11
285 0.09
286 0.09
287 0.11
288 0.11
289 0.13
290 0.13
291 0.14
292 0.15
293 0.15
294 0.15
295 0.14
296 0.15
297 0.14
298 0.13
299 0.13
300 0.13
301 0.14
302 0.13
303 0.13