Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A397S6M1

Protein Details
Accession A0A397S6M1    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
241-266DEKCEKYGKECRKIKKEMKKKLGSEDBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
254-260IKKEMKK
Subcellular Location(s) nucl 19, cyto_nucl 12.5, mito 4, cyto 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR032675  LRR_dom_sf  
Amino Acid Sequences MGKGRKFNQVANINGGVKYLPITLTESTNTFPVSYSFKERPVSKTLIQSLLWKYERSEKKKVLIMIKHKEFWYPDEKRKVTVELNLDENLLKGDLIIEGITLRNLPNLKVFVAHNMYEKFKRLDIINCPQIKEIDIGNNHLTNLEFLDNLDFEKLTKLVIGESDFPSQDLSKFSKFENLENLDLRNTDTYGNLESLKNLTKLKRLDITGTDVDQEFLKELIEKKIELTRFKELEEDSPDYDEKCEKYGKECRKIKKEMKKKLGSEDMNEVRRVIKDCKKIARWQIELEKKLDSKQLLLGEKNQASQITNYYDNNHQKSEKKLVSYHDQIIQKLTDNEQNIVEPILEEKPVGRGGFAEVYRGK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.44
2 0.4
3 0.3
4 0.22
5 0.2
6 0.15
7 0.1
8 0.1
9 0.14
10 0.15
11 0.17
12 0.19
13 0.19
14 0.19
15 0.2
16 0.19
17 0.16
18 0.15
19 0.15
20 0.18
21 0.2
22 0.27
23 0.29
24 0.33
25 0.4
26 0.42
27 0.45
28 0.47
29 0.49
30 0.45
31 0.51
32 0.5
33 0.48
34 0.45
35 0.47
36 0.44
37 0.46
38 0.44
39 0.36
40 0.34
41 0.4
42 0.49
43 0.5
44 0.56
45 0.53
46 0.57
47 0.62
48 0.66
49 0.65
50 0.64
51 0.66
52 0.67
53 0.67
54 0.65
55 0.6
56 0.58
57 0.51
58 0.47
59 0.47
60 0.44
61 0.48
62 0.54
63 0.54
64 0.54
65 0.54
66 0.54
67 0.47
68 0.45
69 0.42
70 0.34
71 0.36
72 0.33
73 0.31
74 0.26
75 0.23
76 0.17
77 0.11
78 0.09
79 0.06
80 0.05
81 0.05
82 0.05
83 0.05
84 0.04
85 0.05
86 0.05
87 0.05
88 0.06
89 0.06
90 0.09
91 0.1
92 0.1
93 0.13
94 0.15
95 0.15
96 0.16
97 0.17
98 0.19
99 0.21
100 0.22
101 0.22
102 0.23
103 0.27
104 0.26
105 0.29
106 0.25
107 0.23
108 0.24
109 0.22
110 0.25
111 0.29
112 0.35
113 0.41
114 0.41
115 0.41
116 0.39
117 0.37
118 0.33
119 0.27
120 0.2
121 0.18
122 0.17
123 0.19
124 0.2
125 0.2
126 0.19
127 0.18
128 0.17
129 0.11
130 0.11
131 0.09
132 0.07
133 0.06
134 0.07
135 0.07
136 0.07
137 0.07
138 0.06
139 0.06
140 0.07
141 0.07
142 0.05
143 0.06
144 0.06
145 0.06
146 0.07
147 0.08
148 0.1
149 0.12
150 0.13
151 0.13
152 0.12
153 0.13
154 0.12
155 0.12
156 0.12
157 0.13
158 0.14
159 0.15
160 0.15
161 0.21
162 0.22
163 0.22
164 0.26
165 0.26
166 0.26
167 0.26
168 0.26
169 0.2
170 0.19
171 0.19
172 0.12
173 0.1
174 0.08
175 0.07
176 0.08
177 0.09
178 0.09
179 0.1
180 0.09
181 0.09
182 0.11
183 0.12
184 0.14
185 0.16
186 0.16
187 0.21
188 0.22
189 0.25
190 0.27
191 0.26
192 0.27
193 0.25
194 0.29
195 0.25
196 0.24
197 0.21
198 0.17
199 0.17
200 0.14
201 0.13
202 0.08
203 0.06
204 0.06
205 0.07
206 0.09
207 0.12
208 0.13
209 0.13
210 0.14
211 0.19
212 0.23
213 0.24
214 0.26
215 0.3
216 0.3
217 0.3
218 0.32
219 0.28
220 0.29
221 0.31
222 0.29
223 0.23
224 0.24
225 0.24
226 0.21
227 0.22
228 0.2
229 0.16
230 0.15
231 0.18
232 0.17
233 0.23
234 0.33
235 0.41
236 0.49
237 0.56
238 0.63
239 0.69
240 0.78
241 0.81
242 0.82
243 0.83
244 0.84
245 0.87
246 0.86
247 0.81
248 0.79
249 0.79
250 0.7
251 0.63
252 0.61
253 0.58
254 0.52
255 0.49
256 0.41
257 0.33
258 0.33
259 0.33
260 0.32
261 0.33
262 0.39
263 0.45
264 0.54
265 0.58
266 0.64
267 0.69
268 0.7
269 0.65
270 0.64
271 0.67
272 0.67
273 0.64
274 0.58
275 0.53
276 0.46
277 0.45
278 0.43
279 0.34
280 0.27
281 0.28
282 0.33
283 0.32
284 0.33
285 0.35
286 0.38
287 0.38
288 0.38
289 0.34
290 0.29
291 0.26
292 0.26
293 0.25
294 0.22
295 0.24
296 0.24
297 0.27
298 0.35
299 0.42
300 0.44
301 0.45
302 0.45
303 0.46
304 0.52
305 0.59
306 0.54
307 0.5
308 0.51
309 0.52
310 0.56
311 0.57
312 0.55
313 0.52
314 0.5
315 0.47
316 0.46
317 0.41
318 0.36
319 0.33
320 0.32
321 0.31
322 0.3
323 0.31
324 0.28
325 0.28
326 0.25
327 0.23
328 0.19
329 0.13
330 0.13
331 0.13
332 0.12
333 0.11
334 0.11
335 0.14
336 0.18
337 0.18
338 0.16
339 0.15
340 0.19
341 0.25
342 0.25