FuNGI

A0A397T4X3

Protein Details

Accession

A0A397T4X3

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

14.7

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
384-405	NPGNKKRNQVERYSRKKHKAGT	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
388-412	KKRNQVERYSRKKHKAGTPKFRSEK

Subcellular Location(s)

nucl 18, cyto 6, mito 1, E.R. 1, golg 1

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR013520 Exonuclease_RNaseT/DNA_pol3 IPR030843 PAN2 IPR028881 PAN2_UCH_dom IPR038765 Papain-like_cys_pep_sf IPR012337 RNaseH-like_sf IPR036397 RNaseH_sf IPR028889 USP_dom IPR015943 WD40/YVTN_repeat-like_dom_sf IPR036322 WD40_repeat_dom_sf
Gene Ontology	GO:0031251 C:PAN complex GO:0046872 F:metal ion binding GO:0003676 F:nucleic acid binding GO:0004535 F:poly(A)-specific ribonuclease activity GO:0006397 P:mRNA processing GO:0000289 P:nuclear-transcribed mRNA poly(A) tail shortening
Pfam	View protein in Pfam PF00929 RNase_T PF13423 UCH_1
PROSITE	View protein in PROSITE PS50235 USP_3
CDD	cd06143 PAN2_exo

Amino Acid Sequences

MDSWKEVRTACDTNLSVAASISAIAFDPYQELLWTGNEKGRVASHYSSGLHRYTSFRAHLNPVRQILVSDRGVITLSSDSVKMNNRRGLVRWTLSNEDTSDLHCMSYTTMPNSEILAAGKQHNMLVINVARGIVVKKVESESDIVVMRKSRLVCCGANSGEVTLRDPRTFKVEHRVQAHTGTISDIDTVGNLLLTCGSSARNGNLIIDPLVKVYDIRTMRPLVPMSFPTGPCFLKMHPKLSTTVFIVSRSGQFHVCDIGNPSNIHFYQANTSSYISAIDLSTSGEMLAFGDSASCVHLWGDRKEAKINAYSNPIELPAIPTPTPNITISEKSSLSLIGMPYYKEPLLSVWPSNMKFEVGNPPPKIDPDILRNMKMIDFVGYSPNPGNKKRNQVERYSRKKHKAGTPKFRSEKERELQSGKSLREPSSLFDDETELDATSTKMPKYYKRVEIQYSRFGVDDFDFEFYNKTHYAGLETHITNSYCNSLLQVLFFTPVLRLITRSHIGTACAKENCLCCELGFLFRMLENAKGRNCQASNFLRAFSTIPQASALGLFEPDEPDENTPYSMLIQNFNRFILEQLHQECNSNNNPRLLKSLPLEQTPLSMIQQLFGMQVASISKCQCEIQSERLTTPFVVDLQFFSKNHKGKERESKTKTFVDILRTSIQREIQQKAWCDNCQQYVPTTAKKIPKSLPPVLSINCGAGTSVPIEIWRTHDGQSAWLPKRISMDLDDNDLLTVKELPSDAIVDVNTSGSSKNANYELMAVISQVRVEKEIPHLVAFVKVPKSELESTSKSPWYLFNDFLVKNVTEQEVFNFQGVWKTPVVLYYSRVDISDLMDTSDLPSEIDKSILFEDISISKHHLTNKKLSVLLTPEELPQPGTLVAIDAEFVALNQEETEFRSDGTKSVIRPSRLSLARVSVLRGEGAKENIPFIDDYIAASEPVVDYLTEFSGIEVGDLDPASSKHTLVPLKIAYKKLRLLLDLGCVFVGHGLKKDFRIINILVPSEQVIDTVDIFHIKNRQRKISLRFLAWYLLNQNIQTDTHDSIEDARTALSIYKKYLQFKSEGRFEKVLEDIYNEGRKYNWKPTPGVFPTSCVESHLNSYSTLPETSETTNTTEILPPSTSEIIENQNF

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.36
2	0.33
3	0.26
4	0.22
5	0.2
6	0.12
7	0.12
8	0.09
9	0.07
10	0.06
11	0.07
12	0.07
13	0.07
14	0.09
15	0.09
16	0.1
17	0.09
18	0.1
19	0.1
20	0.13
21	0.16
22	0.16
23	0.19
24	0.21
25	0.22
26	0.23
27	0.24
28	0.25
29	0.28
30	0.28
31	0.27
32	0.29
33	0.31
34	0.32
35	0.34
36	0.32
37	0.29
38	0.29
39	0.31
40	0.31
41	0.35
42	0.35
43	0.35
44	0.38
45	0.45
46	0.5
47	0.53
48	0.55
49	0.52
50	0.51
51	0.46
52	0.43
53	0.38
54	0.37
55	0.31
56	0.27
57	0.24
58	0.22
59	0.22
60	0.21
61	0.19
62	0.13
63	0.13
64	0.12
65	0.12
66	0.12
67	0.16
68	0.25
69	0.31
70	0.37
71	0.41
72	0.43
73	0.46
74	0.49
75	0.51
76	0.51
77	0.48
78	0.45
79	0.45
80	0.48
81	0.46
82	0.45
83	0.39
84	0.33
85	0.3
86	0.26
87	0.24
88	0.19
89	0.18
90	0.15
91	0.15
92	0.15
93	0.2
94	0.21
95	0.21
96	0.22
97	0.23
98	0.23
99	0.24
100	0.22
101	0.17
102	0.15
103	0.15
104	0.15
105	0.16
106	0.18
107	0.17
108	0.17
109	0.18
110	0.18
111	0.15
112	0.19
113	0.18
114	0.17
115	0.17
116	0.17
117	0.14
118	0.14
119	0.15
120	0.13
121	0.13
122	0.13
123	0.15
124	0.17
125	0.18
126	0.19
127	0.2
128	0.17
129	0.18
130	0.2
131	0.19
132	0.19
133	0.2
134	0.2
135	0.22
136	0.24
137	0.23
138	0.26
139	0.3
140	0.29
141	0.3
142	0.36
143	0.33
144	0.32
145	0.31
146	0.27
147	0.25
148	0.24
149	0.24
150	0.23
151	0.25
152	0.26
153	0.26
154	0.26
155	0.29
156	0.31
157	0.32
158	0.36
159	0.41
160	0.46
161	0.49
162	0.52
163	0.48
164	0.48
165	0.47
166	0.37
167	0.3
168	0.24
169	0.19
170	0.15
171	0.13
172	0.11
173	0.08
174	0.07
175	0.07
176	0.06
177	0.06
178	0.05
179	0.05
180	0.05
181	0.05
182	0.05
183	0.06
184	0.07
185	0.08
186	0.1
187	0.12
188	0.14
189	0.14
190	0.16
191	0.16
192	0.17
193	0.16
194	0.16
195	0.14
196	0.12
197	0.12
198	0.1
199	0.1
200	0.09
201	0.16
202	0.16
203	0.18
204	0.21
205	0.24
206	0.25
207	0.3
208	0.31
209	0.25
210	0.27
211	0.27
212	0.29
213	0.3
214	0.3
215	0.28
216	0.3
217	0.28
218	0.27
219	0.27
220	0.23
221	0.29
222	0.33
223	0.36
224	0.36
225	0.37
226	0.38
227	0.39
228	0.4
229	0.31
230	0.32
231	0.27
232	0.24
233	0.24
234	0.23
235	0.23
236	0.22
237	0.22
238	0.19
239	0.18
240	0.18
241	0.2
242	0.18
243	0.16
244	0.19
245	0.21
246	0.22
247	0.22
248	0.22
249	0.25
250	0.25
251	0.26
252	0.22
253	0.2
254	0.22
255	0.25
256	0.26
257	0.21
258	0.22
259	0.19
260	0.19
261	0.18
262	0.12
263	0.1
264	0.08
265	0.07
266	0.07
267	0.07
268	0.07
269	0.06
270	0.06
271	0.05
272	0.05
273	0.05
274	0.05
275	0.04
276	0.04
277	0.04
278	0.04
279	0.04
280	0.06
281	0.05
282	0.05
283	0.05
284	0.09
285	0.13
286	0.15
287	0.23
288	0.25
289	0.28
290	0.31
291	0.33
292	0.32
293	0.34
294	0.35
295	0.3
296	0.33
297	0.31
298	0.28
299	0.26
300	0.24
301	0.18
302	0.16
303	0.17
304	0.13
305	0.16
306	0.15
307	0.15
308	0.16
309	0.17
310	0.2
311	0.16
312	0.18
313	0.18
314	0.2
315	0.23
316	0.25
317	0.23
318	0.21
319	0.21
320	0.17
321	0.15
322	0.14
323	0.12
324	0.11
325	0.11
326	0.12
327	0.12
328	0.15
329	0.14
330	0.12
331	0.12
332	0.11
333	0.15
334	0.17
335	0.17
336	0.17
337	0.23
338	0.23
339	0.25
340	0.24
341	0.2
342	0.17
343	0.19
344	0.25
345	0.26
346	0.33
347	0.32
348	0.33
349	0.33
350	0.34
351	0.34
352	0.28
353	0.25
354	0.23
355	0.33
356	0.33
357	0.34
358	0.34
359	0.32
360	0.29
361	0.27
362	0.21
363	0.12
364	0.11
365	0.1
366	0.14
367	0.13
368	0.14
369	0.15
370	0.19
371	0.22
372	0.27
373	0.34
374	0.35
375	0.46
376	0.51
377	0.6
378	0.6
379	0.65
380	0.71
381	0.75
382	0.8
383	0.79
384	0.81
385	0.79
386	0.8
387	0.78
388	0.76
389	0.76
390	0.77
391	0.78
392	0.78
393	0.79
394	0.79
395	0.77
396	0.75
397	0.7
398	0.68
399	0.63
400	0.6
401	0.54
402	0.52
403	0.48
404	0.48
405	0.47
406	0.39
407	0.39
408	0.35
409	0.32
410	0.33
411	0.32
412	0.28
413	0.29
414	0.29
415	0.23
416	0.2
417	0.21
418	0.17
419	0.18
420	0.17
421	0.09
422	0.08
423	0.08
424	0.08
425	0.1
426	0.12
427	0.11
428	0.14
429	0.16
430	0.22
431	0.3
432	0.37
433	0.42
434	0.46
435	0.51
436	0.55
437	0.61
438	0.59
439	0.58
440	0.52
441	0.45
442	0.39
443	0.34
444	0.28
445	0.2
446	0.17
447	0.11
448	0.1
449	0.1
450	0.1
451	0.11
452	0.09
453	0.12
454	0.11
455	0.11
456	0.1
457	0.1
458	0.13
459	0.12
460	0.14
461	0.16
462	0.16
463	0.16
464	0.17
465	0.17
466	0.15
467	0.15
468	0.14
469	0.1
470	0.1
471	0.1
472	0.09
473	0.09
474	0.09
475	0.09
476	0.07
477	0.07
478	0.07
479	0.07
480	0.06
481	0.07
482	0.08
483	0.07
484	0.09
485	0.1
486	0.13
487	0.15
488	0.15
489	0.15
490	0.15
491	0.16
492	0.18
493	0.19
494	0.2
495	0.18
496	0.18
497	0.2
498	0.2
499	0.2
500	0.18
501	0.16
502	0.11
503	0.13
504	0.14
505	0.13
506	0.12
507	0.1
508	0.09
509	0.09
510	0.1
511	0.09
512	0.12
513	0.12
514	0.15
515	0.16
516	0.18
517	0.18
518	0.22
519	0.22
520	0.19
521	0.24
522	0.24
523	0.28
524	0.27
525	0.26
526	0.22
527	0.22
528	0.22
529	0.16
530	0.17
531	0.12
532	0.12
533	0.12
534	0.12
535	0.11
536	0.1
537	0.09
538	0.05
539	0.04
540	0.05
541	0.05
542	0.05
543	0.05
544	0.06
545	0.07
546	0.08
547	0.09
548	0.09
549	0.09
550	0.08
551	0.08
552	0.08
553	0.1
554	0.1
555	0.12
556	0.14
557	0.16
558	0.17
559	0.17
560	0.16
561	0.13
562	0.14
563	0.14
564	0.13
565	0.14
566	0.17
567	0.19
568	0.19
569	0.2
570	0.19
571	0.2
572	0.24
573	0.26
574	0.25
575	0.27
576	0.28
577	0.28
578	0.32
579	0.29
580	0.26
581	0.23
582	0.27
583	0.25
584	0.25
585	0.26
586	0.21
587	0.21
588	0.18
589	0.17
590	0.11
591	0.12
592	0.11
593	0.09
594	0.1
595	0.09
596	0.08
597	0.08
598	0.07
599	0.04
600	0.05
601	0.05
602	0.06
603	0.07
604	0.07
605	0.07
606	0.08
607	0.09
608	0.09
609	0.13
610	0.15
611	0.21
612	0.26
613	0.27
614	0.27
615	0.27
616	0.28
617	0.23
618	0.21
619	0.14
620	0.09
621	0.09
622	0.08
623	0.08
624	0.1
625	0.13
626	0.12
627	0.17
628	0.24
629	0.27
630	0.3
631	0.37
632	0.38
633	0.43
634	0.54
635	0.57
636	0.61
637	0.64
638	0.66
639	0.63
640	0.62
641	0.56
642	0.48
643	0.42
644	0.39
645	0.34
646	0.31
647	0.31
648	0.28
649	0.28
650	0.26
651	0.26
652	0.24
653	0.27
654	0.27
655	0.28
656	0.32
657	0.32
658	0.34
659	0.36
660	0.32
661	0.31
662	0.31
663	0.29
664	0.26
665	0.25
666	0.22
667	0.23
668	0.25
669	0.24
670	0.25
671	0.27
672	0.32
673	0.34
674	0.38
675	0.36
676	0.4
677	0.46
678	0.49
679	0.46
680	0.43
681	0.45
682	0.41
683	0.39
684	0.32
685	0.25
686	0.19
687	0.16
688	0.12
689	0.08
690	0.08
691	0.06
692	0.06
693	0.05
694	0.05
695	0.07
696	0.08
697	0.12
698	0.14
699	0.15
700	0.15
701	0.19
702	0.19
703	0.21
704	0.26
705	0.31
706	0.3
707	0.32
708	0.31
709	0.29
710	0.32
711	0.3
712	0.26
713	0.2
714	0.24
715	0.21
716	0.25
717	0.23
718	0.2
719	0.19
720	0.18
721	0.15
722	0.09
723	0.09
724	0.06
725	0.06
726	0.06
727	0.07
728	0.07
729	0.08
730	0.07
731	0.07
732	0.07
733	0.07
734	0.07
735	0.07
736	0.06
737	0.06
738	0.06
739	0.06
740	0.07
741	0.07
742	0.1
743	0.11
744	0.11
745	0.11
746	0.12
747	0.12
748	0.11
749	0.1
750	0.08
751	0.07
752	0.07
753	0.07
754	0.07
755	0.07
756	0.08
757	0.09
758	0.11
759	0.15
760	0.19
761	0.19
762	0.18
763	0.18
764	0.17
765	0.19
766	0.18
767	0.17
768	0.16
769	0.15
770	0.16
771	0.16
772	0.21
773	0.21
774	0.23
775	0.25
776	0.27
777	0.3
778	0.34
779	0.35
780	0.3
781	0.28
782	0.3
783	0.3
784	0.29
785	0.27
786	0.26
787	0.3
788	0.3
789	0.3
790	0.29
791	0.22
792	0.2
793	0.2
794	0.18
795	0.13
796	0.13
797	0.15
798	0.15
799	0.16
800	0.15
801	0.14
802	0.13
803	0.16
804	0.17
805	0.17
806	0.13
807	0.14
808	0.14
809	0.16
810	0.19
811	0.16
812	0.17
813	0.17
814	0.19
815	0.18
816	0.18
817	0.17
818	0.14
819	0.15
820	0.15
821	0.13
822	0.11
823	0.11
824	0.11
825	0.11
826	0.12
827	0.1
828	0.08
829	0.08
830	0.09
831	0.09
832	0.1
833	0.09
834	0.1
835	0.1
836	0.11
837	0.11
838	0.09
839	0.11
840	0.12
841	0.13
842	0.12
843	0.14
844	0.15
845	0.18
846	0.25
847	0.3
848	0.33
849	0.41
850	0.45
851	0.47
852	0.46
853	0.44
854	0.41
855	0.38
856	0.35
857	0.29
858	0.24
859	0.22
860	0.21
861	0.21
862	0.18
863	0.14
864	0.13
865	0.11
866	0.1
867	0.08
868	0.07
869	0.07
870	0.06
871	0.06
872	0.05
873	0.05
874	0.04
875	0.04
876	0.05
877	0.05
878	0.05
879	0.05
880	0.06
881	0.06
882	0.09
883	0.12
884	0.11
885	0.11
886	0.14
887	0.15
888	0.15
889	0.2
890	0.21
891	0.19
892	0.28
893	0.34
894	0.35
895	0.36
896	0.39
897	0.42
898	0.42
899	0.43
900	0.36
901	0.34
902	0.36
903	0.34
904	0.32
905	0.25
906	0.23
907	0.22
908	0.2
909	0.18
910	0.17
911	0.19
912	0.21
913	0.19
914	0.19
915	0.18
916	0.18
917	0.16
918	0.14
919	0.13
920	0.1
921	0.1
922	0.11
923	0.12
924	0.1
925	0.1
926	0.1
927	0.07
928	0.08
929	0.08
930	0.05
931	0.06
932	0.07
933	0.08
934	0.08
935	0.08
936	0.07
937	0.08
938	0.08
939	0.08
940	0.07
941	0.07
942	0.07
943	0.07
944	0.07
945	0.07
946	0.08
947	0.11
948	0.11
949	0.12
950	0.12
951	0.19
952	0.22
953	0.22
954	0.27
955	0.29
956	0.35
957	0.4
958	0.45
959	0.45
960	0.48
961	0.51
962	0.51
963	0.49
964	0.43
965	0.41
966	0.36
967	0.38
968	0.33
969	0.29
970	0.23
971	0.2
972	0.18
973	0.18
974	0.18
975	0.11
976	0.15
977	0.18
978	0.2
979	0.22
980	0.3
981	0.29
982	0.28
983	0.33
984	0.3
985	0.33
986	0.34
987	0.34
988	0.27
989	0.26
990	0.25
991	0.2
992	0.19
993	0.13
994	0.1
995	0.1
996	0.1
997	0.11
998	0.11
999	0.11
1000	0.11
1001	0.15
1002	0.21
1003	0.28
1004	0.35
1005	0.41
1006	0.49
1007	0.55
1008	0.63
1009	0.67
1010	0.7
1011	0.7
1012	0.66
1013	0.61
1014	0.55
1015	0.51
1016	0.44
1017	0.39
1018	0.31
1019	0.29
1020	0.27
1021	0.24
1022	0.24
1023	0.22
1024	0.22
1025	0.22
1026	0.23
1027	0.2
1028	0.19
1029	0.2
1030	0.19
1031	0.2
1032	0.22
1033	0.2
1034	0.16
1035	0.14
1036	0.13
1037	0.13
1038	0.17
1039	0.18
1040	0.19
1041	0.22
1042	0.3
1043	0.35
1044	0.42
1045	0.47
1046	0.46
1047	0.47
1048	0.51
1049	0.55
1050	0.57
1051	0.58
1052	0.57
1053	0.55
1054	0.52
1055	0.5
1056	0.45
1057	0.4
1058	0.31
1059	0.28
1060	0.25
1061	0.28
1062	0.34
1063	0.3
1064	0.28
1065	0.27
1066	0.34
1067	0.38
1068	0.46
1069	0.46
1070	0.46
1071	0.5
1072	0.54
1073	0.63
1074	0.59
1075	0.61
1076	0.51
1077	0.47
1078	0.44
1079	0.43
1080	0.39
1081	0.33
1082	0.3
1083	0.24
1084	0.29
1085	0.3
1086	0.28
1087	0.26
1088	0.27
1089	0.26
1090	0.26
1091	0.24
1092	0.2
1093	0.17
1094	0.19
1095	0.22
1096	0.24
1097	0.22
1098	0.23
1099	0.24
1100	0.23
1101	0.24
1102	0.25
1103	0.23
1104	0.23
1105	0.22
1106	0.2
1107	0.23
1108	0.25
1109	0.23
1110	0.2
1111	0.22

A0A397T4X3

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer