Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A397SYT8

Protein Details
Accession A0A397SYT8    Localization Confidence High Confidence Score 15.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
112-137VRNEMLPKSQRKRKREKWNIISFEKPHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
119-142KSQRKRKREKWNIISFEKPTRRNP
Subcellular Location(s) nucl 19, cyto 6
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR009071  HMG_box_dom  
IPR036910  HMG_box_dom_sf  
Pfam View protein in Pfam  
PF00505  HMG_box  
Amino Acid Sequences MSSQIRNLACVFIDSNNSNQVIGLNSRPIIKVPFPPIIDPYNLVVKTKDGRIPARVPNAFIIYRKLFIETAKNDGYNLPMTVISSMASQSWEQESDVVKTEYKRLAKEAYEVRNEMLPKSQRKRKREKWNIISFEKPTRRNPALKSQKPAKTSTTEPIQLPSPISTPESQSINPSPVIPQSEPFNEISLEFDQIDFDFTQYMTPNVPSPEILSIEEDIINSIDLIEFGNNQLLPSPDLSNISSSEPNSQYEFNFEPFSDINESPIITEEELFDLLMPINEDHHMNSYEGLGISDSIEEFIPALPITDVTNSEEIFFSPEMLNMYTYNAINSTDATVTEPSYGLDFDYSYYL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.21
2 0.23
3 0.26
4 0.26
5 0.24
6 0.22
7 0.21
8 0.18
9 0.2
10 0.2
11 0.19
12 0.2
13 0.22
14 0.22
15 0.23
16 0.25
17 0.26
18 0.3
19 0.32
20 0.38
21 0.37
22 0.39
23 0.41
24 0.39
25 0.37
26 0.32
27 0.29
28 0.3
29 0.29
30 0.28
31 0.24
32 0.25
33 0.28
34 0.31
35 0.32
36 0.3
37 0.34
38 0.39
39 0.45
40 0.48
41 0.54
42 0.5
43 0.48
44 0.45
45 0.46
46 0.41
47 0.36
48 0.35
49 0.27
50 0.28
51 0.27
52 0.26
53 0.22
54 0.22
55 0.3
56 0.25
57 0.29
58 0.3
59 0.29
60 0.28
61 0.27
62 0.28
63 0.21
64 0.19
65 0.14
66 0.11
67 0.12
68 0.11
69 0.11
70 0.09
71 0.07
72 0.08
73 0.07
74 0.08
75 0.08
76 0.09
77 0.11
78 0.11
79 0.11
80 0.14
81 0.15
82 0.15
83 0.18
84 0.18
85 0.18
86 0.18
87 0.23
88 0.26
89 0.28
90 0.28
91 0.28
92 0.3
93 0.29
94 0.35
95 0.38
96 0.38
97 0.38
98 0.37
99 0.35
100 0.34
101 0.34
102 0.28
103 0.28
104 0.28
105 0.33
106 0.41
107 0.5
108 0.55
109 0.64
110 0.75
111 0.78
112 0.83
113 0.85
114 0.87
115 0.89
116 0.9
117 0.88
118 0.8
119 0.74
120 0.66
121 0.64
122 0.6
123 0.53
124 0.48
125 0.49
126 0.5
127 0.52
128 0.52
129 0.54
130 0.58
131 0.59
132 0.62
133 0.62
134 0.63
135 0.61
136 0.6
137 0.52
138 0.45
139 0.43
140 0.4
141 0.36
142 0.33
143 0.31
144 0.29
145 0.27
146 0.23
147 0.21
148 0.17
149 0.13
150 0.11
151 0.13
152 0.12
153 0.12
154 0.14
155 0.15
156 0.15
157 0.17
158 0.17
159 0.17
160 0.17
161 0.15
162 0.13
163 0.13
164 0.16
165 0.13
166 0.13
167 0.14
168 0.15
169 0.16
170 0.16
171 0.15
172 0.12
173 0.12
174 0.13
175 0.11
176 0.11
177 0.09
178 0.09
179 0.08
180 0.08
181 0.1
182 0.07
183 0.07
184 0.06
185 0.06
186 0.07
187 0.07
188 0.08
189 0.07
190 0.08
191 0.09
192 0.1
193 0.1
194 0.09
195 0.1
196 0.11
197 0.12
198 0.12
199 0.11
200 0.11
201 0.11
202 0.11
203 0.1
204 0.08
205 0.07
206 0.07
207 0.05
208 0.05
209 0.04
210 0.04
211 0.04
212 0.04
213 0.04
214 0.05
215 0.07
216 0.07
217 0.07
218 0.08
219 0.08
220 0.09
221 0.1
222 0.11
223 0.1
224 0.12
225 0.13
226 0.13
227 0.14
228 0.16
229 0.16
230 0.16
231 0.21
232 0.2
233 0.21
234 0.22
235 0.22
236 0.19
237 0.22
238 0.23
239 0.2
240 0.2
241 0.18
242 0.19
243 0.18
244 0.2
245 0.2
246 0.18
247 0.18
248 0.18
249 0.18
250 0.15
251 0.16
252 0.15
253 0.1
254 0.1
255 0.09
256 0.1
257 0.1
258 0.1
259 0.08
260 0.07
261 0.07
262 0.07
263 0.08
264 0.06
265 0.08
266 0.09
267 0.09
268 0.1
269 0.13
270 0.14
271 0.13
272 0.14
273 0.13
274 0.13
275 0.13
276 0.12
277 0.09
278 0.08
279 0.08
280 0.08
281 0.07
282 0.07
283 0.07
284 0.06
285 0.06
286 0.06
287 0.07
288 0.06
289 0.07
290 0.06
291 0.07
292 0.08
293 0.1
294 0.11
295 0.13
296 0.16
297 0.15
298 0.16
299 0.16
300 0.15
301 0.17
302 0.15
303 0.14
304 0.12
305 0.14
306 0.15
307 0.15
308 0.16
309 0.13
310 0.16
311 0.16
312 0.16
313 0.16
314 0.14
315 0.15
316 0.14
317 0.15
318 0.14
319 0.12
320 0.12
321 0.14
322 0.15
323 0.14
324 0.15
325 0.14
326 0.12
327 0.13
328 0.13
329 0.11
330 0.11
331 0.1