Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A397SGC5

Protein Details
Accession A0A397SGC5    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
287-311EAILYHRERKRREKQRKLAEMSRYNHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
294-303ERKRREKQRK
Subcellular Location(s) nucl 17.5, cyto_nucl 13, cyto 7.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR039900  Pat1-like  
IPR019167  PAT1_dom  
Gene Ontology GO:0005737  C:cytoplasm  
GO:0016853  F:isomerase activity  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0000290  P:deadenylation-dependent decapping of nuclear-transcribed mRNA  
Pfam View protein in Pfam  
PF09770  PAT1  
Amino Acid Sequences MSDSFFGFDTTLPPLNSDQLTGLGEDIGGQKDETEEELERKFKDFSLVSGEDFGVFDDEQNFYLSEQQLEETGDDLNDETFGNVGDIGQDFDYTKNTAKIVESIQKEEEIYVTRRENNNNSENVDEQNNRRPSYAALWGNDSNGIVNGHSKEVIITPPLPESPISPSIWGTFHSPSTRKDSLTLVQDSTIPQRYTPPQTSPPPPGFGLSSHPSSRMPMSLEEIEAQLHRQAGLPEKKMLSLAEVEAAIMGINGRPQQLPIHSAAEAIYREQETIAYLEQETALREQEAILYHRERKRREKQRKLAEMSRYNGLMTQSDKDWINKIQISQLVTDDPYADDFYYQVYTAIRNRQTQSQTSAFSPHGGAGFMGHERGRHRSRGSESGLLKMQQQVLRIVNDARRKPKLTQLSLEGALGKIALNSVRNPRQLLQVSSKHNDTHQHAGPSGGNHQQHQKIPSISSHGIIDHRKVLRSIENVYTAVLALEELRRNQPPLPRPYADHEREAIEKWNEEYTELAKTMWEELRVTEMIGVSYPHPFISILSVAKGKKVIPRVLRHCLPDQVLALITMLVANFETLDVCKGAIWGPQGIVSAAMLEEVELYMNTVVPPLLQFVAEAPMRIVLGLFGLFVERNNLVWVARSKVGLAFLTMFLSRTEILKQGGGAMQGLPLPEELELLQWQELYNRLFNILQNHFLSLFPPFNIGIDDMYVWQFLAAMAVGASTDQQHILVTEVRERVLDTVIQASRLTPDKASHKIANVNLFLNALGLDASQLKI
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.21
2 0.25
3 0.25
4 0.24
5 0.2
6 0.18
7 0.19
8 0.17
9 0.16
10 0.11
11 0.1
12 0.11
13 0.12
14 0.11
15 0.11
16 0.11
17 0.11
18 0.12
19 0.13
20 0.13
21 0.14
22 0.15
23 0.18
24 0.23
25 0.27
26 0.27
27 0.28
28 0.28
29 0.25
30 0.3
31 0.27
32 0.25
33 0.3
34 0.31
35 0.29
36 0.3
37 0.29
38 0.22
39 0.22
40 0.2
41 0.13
42 0.12
43 0.12
44 0.11
45 0.12
46 0.12
47 0.14
48 0.13
49 0.11
50 0.17
51 0.17
52 0.16
53 0.16
54 0.16
55 0.16
56 0.17
57 0.17
58 0.12
59 0.11
60 0.1
61 0.09
62 0.09
63 0.08
64 0.07
65 0.07
66 0.07
67 0.06
68 0.06
69 0.06
70 0.06
71 0.06
72 0.06
73 0.07
74 0.08
75 0.08
76 0.09
77 0.09
78 0.1
79 0.13
80 0.14
81 0.16
82 0.17
83 0.17
84 0.18
85 0.19
86 0.21
87 0.25
88 0.31
89 0.31
90 0.32
91 0.33
92 0.33
93 0.31
94 0.28
95 0.25
96 0.22
97 0.21
98 0.23
99 0.25
100 0.31
101 0.36
102 0.43
103 0.48
104 0.51
105 0.54
106 0.52
107 0.51
108 0.46
109 0.43
110 0.38
111 0.37
112 0.34
113 0.32
114 0.39
115 0.42
116 0.4
117 0.4
118 0.38
119 0.35
120 0.36
121 0.4
122 0.35
123 0.31
124 0.35
125 0.35
126 0.35
127 0.33
128 0.28
129 0.19
130 0.15
131 0.14
132 0.09
133 0.12
134 0.13
135 0.13
136 0.13
137 0.13
138 0.12
139 0.13
140 0.14
141 0.14
142 0.13
143 0.13
144 0.15
145 0.16
146 0.16
147 0.15
148 0.15
149 0.18
150 0.21
151 0.2
152 0.19
153 0.2
154 0.21
155 0.21
156 0.21
157 0.19
158 0.17
159 0.2
160 0.25
161 0.27
162 0.28
163 0.36
164 0.38
165 0.35
166 0.35
167 0.35
168 0.35
169 0.38
170 0.37
171 0.29
172 0.27
173 0.27
174 0.27
175 0.28
176 0.29
177 0.23
178 0.21
179 0.25
180 0.3
181 0.37
182 0.39
183 0.4
184 0.41
185 0.47
186 0.52
187 0.54
188 0.52
189 0.47
190 0.44
191 0.39
192 0.33
193 0.28
194 0.29
195 0.25
196 0.26
197 0.23
198 0.24
199 0.23
200 0.24
201 0.25
202 0.21
203 0.19
204 0.16
205 0.2
206 0.19
207 0.19
208 0.18
209 0.17
210 0.16
211 0.14
212 0.13
213 0.1
214 0.09
215 0.09
216 0.1
217 0.11
218 0.19
219 0.26
220 0.27
221 0.29
222 0.3
223 0.3
224 0.29
225 0.28
226 0.2
227 0.15
228 0.13
229 0.11
230 0.1
231 0.09
232 0.08
233 0.08
234 0.06
235 0.04
236 0.04
237 0.03
238 0.05
239 0.06
240 0.07
241 0.07
242 0.08
243 0.11
244 0.12
245 0.15
246 0.16
247 0.17
248 0.16
249 0.16
250 0.16
251 0.16
252 0.15
253 0.13
254 0.12
255 0.1
256 0.1
257 0.1
258 0.1
259 0.08
260 0.09
261 0.09
262 0.08
263 0.07
264 0.08
265 0.08
266 0.08
267 0.09
268 0.08
269 0.08
270 0.07
271 0.07
272 0.07
273 0.09
274 0.1
275 0.11
276 0.13
277 0.16
278 0.23
279 0.28
280 0.35
281 0.4
282 0.48
283 0.57
284 0.65
285 0.74
286 0.78
287 0.83
288 0.87
289 0.91
290 0.87
291 0.84
292 0.82
293 0.76
294 0.67
295 0.6
296 0.49
297 0.39
298 0.33
299 0.27
300 0.19
301 0.15
302 0.14
303 0.12
304 0.14
305 0.15
306 0.14
307 0.16
308 0.16
309 0.18
310 0.18
311 0.18
312 0.19
313 0.2
314 0.2
315 0.19
316 0.18
317 0.15
318 0.14
319 0.13
320 0.1
321 0.08
322 0.08
323 0.08
324 0.07
325 0.06
326 0.06
327 0.07
328 0.07
329 0.07
330 0.06
331 0.06
332 0.08
333 0.11
334 0.18
335 0.21
336 0.24
337 0.26
338 0.31
339 0.34
340 0.35
341 0.37
342 0.33
343 0.31
344 0.28
345 0.3
346 0.23
347 0.21
348 0.19
349 0.14
350 0.11
351 0.1
352 0.09
353 0.06
354 0.07
355 0.06
356 0.07
357 0.06
358 0.08
359 0.09
360 0.17
361 0.19
362 0.22
363 0.23
364 0.27
365 0.31
366 0.36
367 0.38
368 0.38
369 0.36
370 0.35
371 0.35
372 0.3
373 0.27
374 0.22
375 0.22
376 0.17
377 0.17
378 0.18
379 0.18
380 0.18
381 0.18
382 0.18
383 0.2
384 0.25
385 0.28
386 0.3
387 0.33
388 0.35
389 0.36
390 0.42
391 0.46
392 0.43
393 0.41
394 0.4
395 0.39
396 0.36
397 0.35
398 0.27
399 0.18
400 0.14
401 0.12
402 0.07
403 0.04
404 0.04
405 0.05
406 0.05
407 0.08
408 0.15
409 0.2
410 0.21
411 0.23
412 0.24
413 0.3
414 0.31
415 0.32
416 0.32
417 0.34
418 0.38
419 0.39
420 0.39
421 0.33
422 0.33
423 0.34
424 0.31
425 0.31
426 0.29
427 0.28
428 0.27
429 0.28
430 0.27
431 0.23
432 0.22
433 0.21
434 0.19
435 0.19
436 0.24
437 0.27
438 0.29
439 0.3
440 0.31
441 0.27
442 0.27
443 0.27
444 0.28
445 0.24
446 0.22
447 0.21
448 0.18
449 0.2
450 0.2
451 0.21
452 0.2
453 0.21
454 0.21
455 0.21
456 0.22
457 0.23
458 0.24
459 0.26
460 0.22
461 0.23
462 0.23
463 0.22
464 0.2
465 0.15
466 0.12
467 0.09
468 0.06
469 0.04
470 0.07
471 0.08
472 0.09
473 0.12
474 0.14
475 0.16
476 0.19
477 0.25
478 0.3
479 0.36
480 0.42
481 0.41
482 0.42
483 0.48
484 0.55
485 0.51
486 0.45
487 0.39
488 0.35
489 0.35
490 0.33
491 0.32
492 0.23
493 0.21
494 0.2
495 0.21
496 0.19
497 0.17
498 0.17
499 0.13
500 0.14
501 0.14
502 0.12
503 0.1
504 0.1
505 0.14
506 0.14
507 0.13
508 0.11
509 0.11
510 0.15
511 0.15
512 0.14
513 0.12
514 0.11
515 0.1
516 0.09
517 0.1
518 0.07
519 0.09
520 0.09
521 0.08
522 0.08
523 0.08
524 0.08
525 0.1
526 0.12
527 0.11
528 0.13
529 0.17
530 0.16
531 0.18
532 0.19
533 0.18
534 0.2
535 0.27
536 0.32
537 0.36
538 0.46
539 0.52
540 0.58
541 0.6
542 0.59
543 0.56
544 0.53
545 0.47
546 0.4
547 0.33
548 0.26
549 0.22
550 0.18
551 0.15
552 0.1
553 0.08
554 0.06
555 0.05
556 0.04
557 0.04
558 0.04
559 0.03
560 0.04
561 0.04
562 0.04
563 0.06
564 0.06
565 0.06
566 0.06
567 0.07
568 0.07
569 0.09
570 0.11
571 0.1
572 0.1
573 0.11
574 0.12
575 0.11
576 0.11
577 0.08
578 0.07
579 0.06
580 0.05
581 0.04
582 0.04
583 0.04
584 0.03
585 0.04
586 0.03
587 0.04
588 0.04
589 0.05
590 0.05
591 0.05
592 0.05
593 0.05
594 0.06
595 0.07
596 0.07
597 0.07
598 0.07
599 0.07
600 0.12
601 0.12
602 0.12
603 0.1
604 0.11
605 0.11
606 0.11
607 0.1
608 0.05
609 0.06
610 0.05
611 0.05
612 0.04
613 0.05
614 0.05
615 0.06
616 0.09
617 0.09
618 0.09
619 0.1
620 0.11
621 0.1
622 0.15
623 0.17
624 0.18
625 0.2
626 0.19
627 0.19
628 0.2
629 0.22
630 0.18
631 0.17
632 0.15
633 0.13
634 0.15
635 0.14
636 0.13
637 0.11
638 0.13
639 0.12
640 0.12
641 0.13
642 0.14
643 0.15
644 0.16
645 0.15
646 0.16
647 0.17
648 0.16
649 0.15
650 0.12
651 0.11
652 0.11
653 0.11
654 0.09
655 0.08
656 0.08
657 0.07
658 0.08
659 0.07
660 0.08
661 0.09
662 0.1
663 0.1
664 0.1
665 0.1
666 0.11
667 0.15
668 0.16
669 0.18
670 0.17
671 0.19
672 0.2
673 0.23
674 0.29
675 0.28
676 0.31
677 0.29
678 0.3
679 0.29
680 0.27
681 0.25
682 0.22
683 0.2
684 0.15
685 0.17
686 0.15
687 0.15
688 0.16
689 0.16
690 0.12
691 0.12
692 0.12
693 0.11
694 0.12
695 0.11
696 0.1
697 0.08
698 0.08
699 0.07
700 0.07
701 0.05
702 0.05
703 0.04
704 0.04
705 0.04
706 0.04
707 0.05
708 0.05
709 0.07
710 0.07
711 0.07
712 0.08
713 0.08
714 0.11
715 0.15
716 0.15
717 0.2
718 0.21
719 0.22
720 0.22
721 0.22
722 0.21
723 0.19
724 0.18
725 0.14
726 0.2
727 0.2
728 0.22
729 0.21
730 0.2
731 0.22
732 0.25
733 0.26
734 0.21
735 0.26
736 0.32
737 0.38
738 0.45
739 0.45
740 0.46
741 0.51
742 0.53
743 0.55
744 0.5
745 0.45
746 0.39
747 0.35
748 0.3
749 0.23
750 0.18
751 0.1
752 0.08
753 0.06
754 0.07