Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A397SPF0

Protein Details
Accession A0A397SPF0    Localization Confidence High Confidence Score 15.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
58-78ETQPNKGKKKRGRKPESDYQHBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
63-72KGKKKRGRKP
Subcellular Location(s) nucl 19, mito 4, pero 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR000679  Znf_GATA  
IPR013088  Znf_NHR/GATA  
Gene Ontology GO:0043565  F:sequence-specific DNA binding  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
GO:0006355  P:regulation of DNA-templated transcription  
Pfam View protein in Pfam  
PF00320  GATA  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00344  GATA_ZN_FINGER_1  
PS50114  GATA_ZN_FINGER_2  
CDD cd00202  ZnF_GATA  
Amino Acid Sequences MYWNEETVQTQTTRPLPSYYGTITGGTTALRYENLAQQIINGNHASDPTLRNYMVLAETQPNKGKKKRGRKPESDYQHIFSSLPSPTSTDGIRQGEIVQCSNCGVRDTPAWRRDLHGIALLCNACGL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.27
2 0.27
3 0.25
4 0.26
5 0.29
6 0.25
7 0.24
8 0.22
9 0.21
10 0.19
11 0.17
12 0.16
13 0.12
14 0.1
15 0.08
16 0.07
17 0.07
18 0.08
19 0.09
20 0.13
21 0.15
22 0.15
23 0.15
24 0.15
25 0.21
26 0.2
27 0.21
28 0.17
29 0.15
30 0.14
31 0.15
32 0.15
33 0.1
34 0.12
35 0.12
36 0.14
37 0.14
38 0.14
39 0.14
40 0.13
41 0.12
42 0.11
43 0.09
44 0.1
45 0.12
46 0.14
47 0.19
48 0.23
49 0.27
50 0.32
51 0.4
52 0.45
53 0.55
54 0.61
55 0.68
56 0.73
57 0.77
58 0.81
59 0.82
60 0.8
61 0.77
62 0.71
63 0.62
64 0.55
65 0.46
66 0.38
67 0.28
68 0.23
69 0.16
70 0.14
71 0.11
72 0.11
73 0.12
74 0.13
75 0.14
76 0.13
77 0.19
78 0.19
79 0.19
80 0.18
81 0.19
82 0.21
83 0.22
84 0.22
85 0.16
86 0.15
87 0.16
88 0.17
89 0.16
90 0.14
91 0.14
92 0.14
93 0.2
94 0.26
95 0.34
96 0.38
97 0.39
98 0.38
99 0.41
100 0.44
101 0.41
102 0.37
103 0.34
104 0.3
105 0.29
106 0.34
107 0.3