Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A397SKV0

Protein Details
Accession A0A397SKV0    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
6-25DDNRQHFKKQQNRQDYNGNAHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 20.5, cyto_nucl 13, cyto 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR028241  RAVE2/Rogdi  
Pfam View protein in Pfam  
PF10259  Rogdi_lz  
Amino Acid Sequences MAGAQDDNRQHFKKQQNRQDYNGNAKRKNSFAGNNKNVHNTTLPPTGTVTTSPTTPTSTSSNHTSFAGSGPALPSLKPAPDHVPVNNFNAQEVSNYLNNTWKETFDRYHDSNIPEAEKPELYRSDKAWGNGHVWGQKGHLMANGKDFYSELRKSSLAQASNAQPATANNDFLKGFITLDGSDIIKGELSVKLSSYNRGNLIKITINTKKPYFIEQLVDAQNYLTLALDALDRTSKDLTKESARELLDSVLIYIISSRSVLVCAHEEKLFPYKICDPQMFGTAIPEDLVIQFHVEGSSIVCSVYGLQYHSSLPSQKKNGGLLGTSKSSKICKYKDKYASILDEVIVKSHDPKLEEVMEGLEKLERECLAWKGKIALFKNLEMEN
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.66
2 0.71
3 0.74
4 0.78
5 0.8
6 0.81
7 0.78
8 0.79
9 0.77
10 0.75
11 0.69
12 0.68
13 0.68
14 0.61
15 0.58
16 0.55
17 0.55
18 0.56
19 0.62
20 0.65
21 0.67
22 0.67
23 0.69
24 0.62
25 0.56
26 0.48
27 0.4
28 0.38
29 0.38
30 0.35
31 0.29
32 0.3
33 0.29
34 0.27
35 0.25
36 0.23
37 0.17
38 0.18
39 0.19
40 0.19
41 0.2
42 0.2
43 0.21
44 0.22
45 0.23
46 0.27
47 0.31
48 0.31
49 0.3
50 0.3
51 0.28
52 0.24
53 0.22
54 0.2
55 0.13
56 0.13
57 0.12
58 0.15
59 0.14
60 0.13
61 0.15
62 0.15
63 0.17
64 0.17
65 0.2
66 0.22
67 0.26
68 0.29
69 0.29
70 0.34
71 0.35
72 0.39
73 0.4
74 0.35
75 0.3
76 0.28
77 0.26
78 0.19
79 0.18
80 0.17
81 0.14
82 0.15
83 0.15
84 0.2
85 0.2
86 0.24
87 0.23
88 0.22
89 0.23
90 0.27
91 0.29
92 0.29
93 0.35
94 0.32
95 0.37
96 0.4
97 0.38
98 0.37
99 0.36
100 0.33
101 0.28
102 0.26
103 0.23
104 0.19
105 0.19
106 0.2
107 0.23
108 0.24
109 0.26
110 0.26
111 0.3
112 0.32
113 0.33
114 0.32
115 0.29
116 0.27
117 0.27
118 0.29
119 0.25
120 0.23
121 0.21
122 0.19
123 0.19
124 0.18
125 0.15
126 0.16
127 0.16
128 0.16
129 0.21
130 0.21
131 0.18
132 0.18
133 0.17
134 0.16
135 0.2
136 0.21
137 0.16
138 0.18
139 0.18
140 0.19
141 0.25
142 0.28
143 0.23
144 0.23
145 0.25
146 0.25
147 0.29
148 0.28
149 0.21
150 0.17
151 0.15
152 0.21
153 0.18
154 0.17
155 0.13
156 0.15
157 0.15
158 0.14
159 0.15
160 0.09
161 0.09
162 0.07
163 0.08
164 0.07
165 0.07
166 0.08
167 0.07
168 0.07
169 0.07
170 0.06
171 0.05
172 0.05
173 0.05
174 0.06
175 0.07
176 0.07
177 0.07
178 0.11
179 0.12
180 0.15
181 0.16
182 0.17
183 0.18
184 0.2
185 0.2
186 0.17
187 0.19
188 0.18
189 0.17
190 0.21
191 0.23
192 0.26
193 0.29
194 0.29
195 0.29
196 0.28
197 0.31
198 0.29
199 0.26
200 0.24
201 0.22
202 0.26
203 0.25
204 0.24
205 0.19
206 0.15
207 0.14
208 0.11
209 0.1
210 0.05
211 0.03
212 0.03
213 0.04
214 0.04
215 0.04
216 0.04
217 0.05
218 0.05
219 0.07
220 0.09
221 0.1
222 0.12
223 0.14
224 0.17
225 0.22
226 0.23
227 0.24
228 0.28
229 0.27
230 0.26
231 0.24
232 0.22
233 0.17
234 0.15
235 0.13
236 0.07
237 0.07
238 0.06
239 0.06
240 0.05
241 0.04
242 0.05
243 0.05
244 0.05
245 0.06
246 0.06
247 0.08
248 0.11
249 0.12
250 0.14
251 0.15
252 0.15
253 0.16
254 0.22
255 0.22
256 0.19
257 0.22
258 0.25
259 0.3
260 0.35
261 0.34
262 0.31
263 0.3
264 0.34
265 0.3
266 0.24
267 0.2
268 0.16
269 0.16
270 0.13
271 0.11
272 0.08
273 0.07
274 0.08
275 0.06
276 0.06
277 0.06
278 0.06
279 0.06
280 0.06
281 0.06
282 0.06
283 0.07
284 0.07
285 0.06
286 0.06
287 0.06
288 0.07
289 0.08
290 0.09
291 0.09
292 0.1
293 0.12
294 0.13
295 0.14
296 0.16
297 0.21
298 0.26
299 0.32
300 0.36
301 0.39
302 0.42
303 0.43
304 0.44
305 0.39
306 0.35
307 0.31
308 0.31
309 0.31
310 0.28
311 0.27
312 0.27
313 0.28
314 0.34
315 0.38
316 0.42
317 0.48
318 0.55
319 0.64
320 0.71
321 0.73
322 0.71
323 0.68
324 0.66
325 0.58
326 0.52
327 0.42
328 0.36
329 0.31
330 0.27
331 0.21
332 0.16
333 0.17
334 0.2
335 0.23
336 0.2
337 0.22
338 0.27
339 0.28
340 0.28
341 0.25
342 0.23
343 0.22
344 0.2
345 0.19
346 0.15
347 0.13
348 0.13
349 0.16
350 0.13
351 0.14
352 0.17
353 0.22
354 0.27
355 0.29
356 0.3
357 0.34
358 0.36
359 0.43
360 0.42
361 0.46
362 0.43
363 0.44