Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A397SHJ5

Protein Details
Accession A0A397SHJ5    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
52-81NTRVTKRTQVFKHKEKKPKKKVAWSEEDETHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
63-72KHKEKKPKKK
Subcellular Location(s) nucl 23, cyto_nucl 13.333, mito_nucl 12.833
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR001878  Znf_CCHC  
IPR036875  Znf_CCHC_sf  
Gene Ontology GO:0003676  F:nucleic acid binding  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00098  zf-CCHC  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50158  ZF_CCHC  
Amino Acid Sequences MFRRSSNTTNMEQRNDNNKNNKICFNCKRPGHFARDCRALREVKSTIRNSQNTRVTKRTQVFKHKEKKPKKKVAWSEEDETYRQTIVKCAKAFANAEQEVLSIPGTSADEDITYAVSLLNEQNRAETWPERFEPKYDLSLAESPVKEALVAGRILIEFSNLTAKLHQELNYDPYWAINETSRIFSKVRGVEYDGDNLEWYDLGECDNSMEGLYTKKCISMDSNIF
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.61
2 0.63
3 0.65
4 0.65
5 0.67
6 0.7
7 0.71
8 0.71
9 0.67
10 0.69
11 0.7
12 0.68
13 0.7
14 0.68
15 0.7
16 0.72
17 0.72
18 0.71
19 0.71
20 0.7
21 0.68
22 0.72
23 0.66
24 0.6
25 0.58
26 0.52
27 0.46
28 0.46
29 0.42
30 0.4
31 0.47
32 0.47
33 0.5
34 0.55
35 0.59
36 0.57
37 0.62
38 0.64
39 0.62
40 0.65
41 0.63
42 0.58
43 0.61
44 0.62
45 0.62
46 0.61
47 0.65
48 0.68
49 0.72
50 0.78
51 0.78
52 0.83
53 0.85
54 0.88
55 0.88
56 0.9
57 0.89
58 0.89
59 0.9
60 0.89
61 0.87
62 0.81
63 0.74
64 0.67
65 0.61
66 0.5
67 0.41
68 0.33
69 0.24
70 0.2
71 0.15
72 0.16
73 0.19
74 0.24
75 0.23
76 0.24
77 0.24
78 0.26
79 0.27
80 0.25
81 0.28
82 0.22
83 0.22
84 0.2
85 0.19
86 0.16
87 0.15
88 0.12
89 0.05
90 0.04
91 0.04
92 0.05
93 0.05
94 0.05
95 0.04
96 0.04
97 0.05
98 0.05
99 0.04
100 0.04
101 0.04
102 0.04
103 0.03
104 0.04
105 0.05
106 0.07
107 0.08
108 0.08
109 0.09
110 0.09
111 0.1
112 0.12
113 0.13
114 0.14
115 0.16
116 0.17
117 0.21
118 0.21
119 0.22
120 0.23
121 0.23
122 0.23
123 0.2
124 0.2
125 0.2
126 0.21
127 0.21
128 0.22
129 0.19
130 0.17
131 0.17
132 0.16
133 0.13
134 0.11
135 0.09
136 0.07
137 0.07
138 0.07
139 0.07
140 0.07
141 0.07
142 0.07
143 0.07
144 0.05
145 0.06
146 0.1
147 0.09
148 0.1
149 0.1
150 0.12
151 0.13
152 0.16
153 0.17
154 0.16
155 0.18
156 0.21
157 0.21
158 0.21
159 0.19
160 0.16
161 0.16
162 0.15
163 0.14
164 0.12
165 0.15
166 0.16
167 0.2
168 0.2
169 0.22
170 0.21
171 0.22
172 0.28
173 0.29
174 0.3
175 0.28
176 0.31
177 0.32
178 0.34
179 0.36
180 0.29
181 0.25
182 0.23
183 0.21
184 0.17
185 0.13
186 0.11
187 0.08
188 0.07
189 0.08
190 0.08
191 0.07
192 0.08
193 0.09
194 0.08
195 0.07
196 0.08
197 0.08
198 0.13
199 0.14
200 0.16
201 0.16
202 0.19
203 0.19
204 0.21
205 0.25