Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A397SHB3

Protein Details
Accession A0A397SHB3    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
135-168KPDKVPSNKVLREKKERRKERKRKENVYIGKPEEBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
115-158ESEKKNKKQGETLPKEPAWAKPDKVPSNKVLREKKERRKERKRK
Subcellular Location(s) nucl 20, cyto_nucl 13.5, cyto 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR036612  KH_dom_type_1_sf  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50084  KH_TYPE_1  
CDD cd00105  KH-I  
Amino Acid Sequences MVLVPCSDKDICDYEESEALVWKQPTQEIPGDRLVNRNGPVSTPDMTWMIPPRSNQAKIMMHLKRIESKTNTHMAHNEDDGQIDMWGDTEDLEEALIQWNICSKNMHEMAKQHRESEKKNKKQGETLPKEPAWAKPDKVPSNKVLREKKERRKERKRKENVYIGKPEEPKLFNGFFMIPDTDISIELIIGKKNEILRPISINTKCNIWYDELPELQQFSNKIIKIAGDTQESVEAAIFRVKNLFIKTLSSRDISKGLVLHMIEPPSKPYKIRITDPPHEFYLPYDRLVPKLVNDQEVPLKYKLLEAVYEGEKIQVVGREAPKELRPSYDVNSSQKKRETNFNKIKESFLKALETIHLSDEEIKMRIRFGRVYLITDKDFDRNTLLPIKKLTSNILSKSKFATCIAEEREQLNHLFEELTDNNRQWNGSPFREFKIRTSRKTSDEEGLPPCVFEVQFKKDIIEKDGGNIKYDGKIGLWNVVIRPKNILDINLLSLDNDDYSWKLNIQTAKRLPNDRSCPQGKFVDGLRICQKGRLVYSNTSDITVASVCEKTKWKYWWKEDYVVEITKYEYWILSKYMKNIGIEVHLDKKKAKVSFGVTFYKKSWEDEFALNRDLGVGEVPGWHPQDIMDEGPTFFDDLKEFLKLLQEKLPMPNSYN
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.24
2 0.26
3 0.26
4 0.23
5 0.21
6 0.2
7 0.23
8 0.22
9 0.21
10 0.22
11 0.24
12 0.26
13 0.29
14 0.34
15 0.32
16 0.36
17 0.41
18 0.43
19 0.41
20 0.44
21 0.43
22 0.42
23 0.4
24 0.4
25 0.33
26 0.3
27 0.32
28 0.3
29 0.28
30 0.23
31 0.23
32 0.21
33 0.2
34 0.23
35 0.27
36 0.28
37 0.29
38 0.3
39 0.36
40 0.43
41 0.45
42 0.43
43 0.45
44 0.44
45 0.45
46 0.54
47 0.5
48 0.47
49 0.48
50 0.5
51 0.5
52 0.49
53 0.54
54 0.48
55 0.5
56 0.51
57 0.56
58 0.54
59 0.48
60 0.48
61 0.44
62 0.44
63 0.4
64 0.37
65 0.28
66 0.27
67 0.25
68 0.21
69 0.16
70 0.13
71 0.1
72 0.07
73 0.07
74 0.07
75 0.06
76 0.06
77 0.06
78 0.06
79 0.06
80 0.05
81 0.05
82 0.08
83 0.09
84 0.08
85 0.08
86 0.13
87 0.14
88 0.16
89 0.17
90 0.16
91 0.25
92 0.31
93 0.34
94 0.33
95 0.39
96 0.48
97 0.56
98 0.56
99 0.51
100 0.53
101 0.56
102 0.61
103 0.65
104 0.66
105 0.66
106 0.74
107 0.77
108 0.75
109 0.77
110 0.79
111 0.79
112 0.76
113 0.73
114 0.71
115 0.63
116 0.62
117 0.55
118 0.5
119 0.44
120 0.41
121 0.37
122 0.35
123 0.45
124 0.5
125 0.54
126 0.54
127 0.55
128 0.61
129 0.65
130 0.68
131 0.67
132 0.67
133 0.72
134 0.78
135 0.82
136 0.83
137 0.87
138 0.89
139 0.91
140 0.94
141 0.95
142 0.95
143 0.95
144 0.94
145 0.92
146 0.92
147 0.89
148 0.86
149 0.83
150 0.76
151 0.72
152 0.65
153 0.58
154 0.54
155 0.46
156 0.4
157 0.38
158 0.34
159 0.27
160 0.27
161 0.24
162 0.19
163 0.2
164 0.18
165 0.12
166 0.11
167 0.12
168 0.1
169 0.1
170 0.09
171 0.07
172 0.06
173 0.07
174 0.08
175 0.09
176 0.08
177 0.09
178 0.11
179 0.14
180 0.17
181 0.19
182 0.2
183 0.21
184 0.24
185 0.26
186 0.32
187 0.32
188 0.32
189 0.3
190 0.3
191 0.29
192 0.28
193 0.27
194 0.22
195 0.21
196 0.22
197 0.25
198 0.23
199 0.22
200 0.21
201 0.21
202 0.17
203 0.17
204 0.14
205 0.14
206 0.19
207 0.18
208 0.18
209 0.17
210 0.17
211 0.18
212 0.21
213 0.21
214 0.17
215 0.17
216 0.17
217 0.17
218 0.17
219 0.14
220 0.11
221 0.08
222 0.07
223 0.1
224 0.1
225 0.09
226 0.1
227 0.11
228 0.14
229 0.15
230 0.17
231 0.14
232 0.18
233 0.2
234 0.22
235 0.24
236 0.22
237 0.22
238 0.21
239 0.22
240 0.19
241 0.18
242 0.15
243 0.13
244 0.15
245 0.13
246 0.13
247 0.13
248 0.14
249 0.14
250 0.13
251 0.16
252 0.18
253 0.19
254 0.18
255 0.21
256 0.28
257 0.32
258 0.36
259 0.42
260 0.46
261 0.53
262 0.57
263 0.55
264 0.48
265 0.44
266 0.4
267 0.32
268 0.32
269 0.24
270 0.21
271 0.22
272 0.21
273 0.21
274 0.23
275 0.22
276 0.15
277 0.21
278 0.22
279 0.2
280 0.2
281 0.2
282 0.23
283 0.24
284 0.26
285 0.19
286 0.18
287 0.16
288 0.16
289 0.16
290 0.13
291 0.11
292 0.09
293 0.12
294 0.12
295 0.12
296 0.12
297 0.1
298 0.1
299 0.09
300 0.09
301 0.08
302 0.08
303 0.11
304 0.13
305 0.14
306 0.15
307 0.17
308 0.18
309 0.21
310 0.2
311 0.18
312 0.19
313 0.2
314 0.22
315 0.26
316 0.27
317 0.28
318 0.37
319 0.37
320 0.39
321 0.41
322 0.42
323 0.37
324 0.45
325 0.46
326 0.48
327 0.56
328 0.58
329 0.6
330 0.58
331 0.59
332 0.52
333 0.5
334 0.41
335 0.33
336 0.27
337 0.21
338 0.21
339 0.19
340 0.16
341 0.12
342 0.11
343 0.09
344 0.08
345 0.1
346 0.1
347 0.11
348 0.1
349 0.11
350 0.1
351 0.11
352 0.13
353 0.13
354 0.13
355 0.13
356 0.2
357 0.19
358 0.23
359 0.25
360 0.26
361 0.24
362 0.25
363 0.25
364 0.2
365 0.2
366 0.17
367 0.17
368 0.15
369 0.17
370 0.23
371 0.23
372 0.22
373 0.23
374 0.25
375 0.24
376 0.25
377 0.25
378 0.22
379 0.26
380 0.29
381 0.35
382 0.34
383 0.33
384 0.35
385 0.33
386 0.29
387 0.26
388 0.24
389 0.17
390 0.22
391 0.26
392 0.26
393 0.26
394 0.25
395 0.26
396 0.24
397 0.23
398 0.18
399 0.14
400 0.11
401 0.1
402 0.08
403 0.12
404 0.12
405 0.15
406 0.16
407 0.16
408 0.18
409 0.18
410 0.18
411 0.14
412 0.22
413 0.24
414 0.26
415 0.32
416 0.33
417 0.35
418 0.42
419 0.42
420 0.39
421 0.45
422 0.48
423 0.48
424 0.55
425 0.57
426 0.55
427 0.59
428 0.56
429 0.5
430 0.46
431 0.45
432 0.39
433 0.38
434 0.32
435 0.27
436 0.24
437 0.2
438 0.16
439 0.16
440 0.19
441 0.2
442 0.25
443 0.25
444 0.26
445 0.29
446 0.31
447 0.31
448 0.29
449 0.24
450 0.24
451 0.31
452 0.3
453 0.28
454 0.27
455 0.24
456 0.22
457 0.23
458 0.19
459 0.12
460 0.14
461 0.13
462 0.15
463 0.15
464 0.14
465 0.15
466 0.22
467 0.23
468 0.21
469 0.24
470 0.21
471 0.25
472 0.25
473 0.24
474 0.21
475 0.2
476 0.21
477 0.2
478 0.19
479 0.14
480 0.14
481 0.13
482 0.1
483 0.09
484 0.08
485 0.07
486 0.09
487 0.1
488 0.1
489 0.11
490 0.15
491 0.21
492 0.24
493 0.33
494 0.37
495 0.44
496 0.49
497 0.54
498 0.55
499 0.58
500 0.63
501 0.56
502 0.59
503 0.56
504 0.53
505 0.52
506 0.5
507 0.41
508 0.36
509 0.35
510 0.37
511 0.32
512 0.35
513 0.35
514 0.36
515 0.36
516 0.36
517 0.36
518 0.31
519 0.34
520 0.36
521 0.36
522 0.36
523 0.4
524 0.41
525 0.39
526 0.36
527 0.32
528 0.25
529 0.22
530 0.17
531 0.13
532 0.11
533 0.12
534 0.12
535 0.16
536 0.21
537 0.23
538 0.31
539 0.38
540 0.46
541 0.55
542 0.63
543 0.7
544 0.71
545 0.75
546 0.69
547 0.68
548 0.63
549 0.56
550 0.47
551 0.37
552 0.33
553 0.26
554 0.25
555 0.19
556 0.14
557 0.13
558 0.15
559 0.18
560 0.23
561 0.24
562 0.27
563 0.33
564 0.36
565 0.35
566 0.34
567 0.32
568 0.29
569 0.29
570 0.29
571 0.31
572 0.31
573 0.32
574 0.33
575 0.36
576 0.4
577 0.39
578 0.39
579 0.36
580 0.41
581 0.46
582 0.5
583 0.54
584 0.5
585 0.51
586 0.49
587 0.5
588 0.44
589 0.41
590 0.39
591 0.35
592 0.36
593 0.4
594 0.45
595 0.41
596 0.42
597 0.38
598 0.33
599 0.29
600 0.25
601 0.18
602 0.13
603 0.09
604 0.07
605 0.09
606 0.11
607 0.15
608 0.17
609 0.16
610 0.16
611 0.15
612 0.19
613 0.19
614 0.2
615 0.18
616 0.18
617 0.18
618 0.19
619 0.19
620 0.16
621 0.14
622 0.13
623 0.12
624 0.13
625 0.15
626 0.16
627 0.15
628 0.15
629 0.24
630 0.25
631 0.27
632 0.31
633 0.34
634 0.35
635 0.42
636 0.47