Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A397TDZ5

Protein Details
Accession A0A397TDZ5    Localization Confidence High Confidence Score 15.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
166-210KPEPYLKAELKRRTKKKSLKQVENKIQKLVKKEEMKRKRLKDLEIBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
173-205AELKRRTKKKSLKQVENKIQKLVKKEEMKRKRL
237-244KKKKKKKK
Subcellular Location(s) nucl 24, cyto_nucl 14.333, cyto 2.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
CDD cd12307  RRM_NIFK_like  
Amino Acid Sequences MDKNEKETTFIKLSTELLSSSEGEVSSDEEDYKVNDEIEGDTPTFSLNINNEKALKKKLDSIKNKGDKMTPGVIYLGRIPHGFYEEQMRSYLDQFGTVNKLKLYRNKKTGKSRHFAFIEFASNEVAEIVAETMNNYPLSNRLLRCKIVPEEKINQHMWIGANKVYKPEPYLKAELKRRTKKKSLKQVENKIQKLVKKEEMKRKRLKDLEIDYDFPGYAASVMPKSKHIIFENSDDEKKKKKKKK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.25
2 0.25
3 0.19
4 0.16
5 0.17
6 0.16
7 0.15
8 0.15
9 0.13
10 0.12
11 0.12
12 0.12
13 0.11
14 0.11
15 0.11
16 0.1
17 0.1
18 0.11
19 0.13
20 0.13
21 0.12
22 0.11
23 0.12
24 0.13
25 0.15
26 0.16
27 0.13
28 0.12
29 0.12
30 0.12
31 0.12
32 0.1
33 0.1
34 0.12
35 0.18
36 0.19
37 0.21
38 0.24
39 0.27
40 0.31
41 0.33
42 0.34
43 0.3
44 0.37
45 0.44
46 0.51
47 0.57
48 0.61
49 0.66
50 0.71
51 0.71
52 0.64
53 0.59
54 0.51
55 0.48
56 0.44
57 0.34
58 0.26
59 0.26
60 0.24
61 0.21
62 0.2
63 0.16
64 0.12
65 0.12
66 0.11
67 0.1
68 0.13
69 0.12
70 0.11
71 0.17
72 0.17
73 0.18
74 0.18
75 0.19
76 0.17
77 0.18
78 0.2
79 0.12
80 0.13
81 0.12
82 0.13
83 0.17
84 0.17
85 0.17
86 0.15
87 0.19
88 0.2
89 0.29
90 0.36
91 0.39
92 0.47
93 0.54
94 0.62
95 0.69
96 0.76
97 0.75
98 0.73
99 0.68
100 0.66
101 0.59
102 0.52
103 0.43
104 0.34
105 0.3
106 0.23
107 0.21
108 0.14
109 0.12
110 0.11
111 0.09
112 0.07
113 0.03
114 0.03
115 0.03
116 0.03
117 0.03
118 0.04
119 0.04
120 0.06
121 0.06
122 0.06
123 0.06
124 0.08
125 0.11
126 0.14
127 0.15
128 0.2
129 0.23
130 0.24
131 0.25
132 0.27
133 0.3
134 0.32
135 0.35
136 0.34
137 0.39
138 0.41
139 0.45
140 0.41
141 0.37
142 0.3
143 0.29
144 0.25
145 0.19
146 0.18
147 0.16
148 0.19
149 0.18
150 0.21
151 0.2
152 0.2
153 0.22
154 0.27
155 0.28
156 0.3
157 0.36
158 0.39
159 0.46
160 0.54
161 0.6
162 0.64
163 0.7
164 0.73
165 0.76
166 0.81
167 0.83
168 0.85
169 0.87
170 0.87
171 0.88
172 0.89
173 0.91
174 0.91
175 0.91
176 0.83
177 0.78
178 0.71
179 0.64
180 0.6
181 0.56
182 0.55
183 0.54
184 0.62
185 0.66
186 0.72
187 0.79
188 0.82
189 0.82
190 0.83
191 0.8
192 0.77
193 0.75
194 0.73
195 0.72
196 0.66
197 0.62
198 0.52
199 0.47
200 0.41
201 0.3
202 0.23
203 0.13
204 0.09
205 0.08
206 0.09
207 0.12
208 0.14
209 0.16
210 0.18
211 0.22
212 0.25
213 0.31
214 0.32
215 0.36
216 0.37
217 0.43
218 0.47
219 0.49
220 0.52
221 0.5
222 0.51
223 0.54
224 0.61