Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A397TAJ0

Protein Details
Accession A0A397TAJ0    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
281-316DYDRRSSYDRRSRSRSPGRRGNYSRRRSRTPPRRRQBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
289-316DRRSRSRSPGRRGNYSRRRSRTPPRRRQ
Subcellular Location(s) nucl 21, cyto_nucl 14.5, cyto 6
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR004882  Luc7-rel  
Gene Ontology GO:0005685  C:U1 snRNP  
GO:0003729  F:mRNA binding  
GO:0006376  P:mRNA splice site selection  
Pfam View protein in Pfam  
PF03194  LUC7  
Amino Acid Sequences MAAEARKALEALMGAEALGGDPDHMKYDDDKVCRNYLCGLCPHDLFTNTKMDLGACPKMHSERLKSEYEEAKKRKECDYEAEFERNLANFVADCDRKIASAQKRLDKTPEDSAKVTQLTKEIESLATEISELTKEVEVLGEEGKVTESMKLLQDVEAKKALKIEKEKELKNSAEGNGPSQQQKLRVCEVCSAYLSIFDSDRRLADHFGGKMHLGYLKIRDLLKELKEKNKDRGNDSRDGRSYHDRDRDRDRERERDRDRDRDRDRGYDRDRHRDYRGGRYDYDRRSSYDRRSRSRSPGRRGNYSRRRSRTPPRRRQ
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.08
2 0.08
3 0.08
4 0.06
5 0.06
6 0.05
7 0.04
8 0.06
9 0.07
10 0.1
11 0.11
12 0.12
13 0.14
14 0.23
15 0.28
16 0.31
17 0.37
18 0.38
19 0.43
20 0.43
21 0.42
22 0.41
23 0.38
24 0.38
25 0.36
26 0.37
27 0.34
28 0.34
29 0.36
30 0.31
31 0.31
32 0.3
33 0.27
34 0.29
35 0.26
36 0.27
37 0.24
38 0.21
39 0.22
40 0.24
41 0.28
42 0.22
43 0.23
44 0.25
45 0.28
46 0.34
47 0.36
48 0.38
49 0.4
50 0.44
51 0.46
52 0.45
53 0.49
54 0.5
55 0.52
56 0.56
57 0.52
58 0.57
59 0.59
60 0.6
61 0.6
62 0.58
63 0.54
64 0.52
65 0.53
66 0.49
67 0.48
68 0.49
69 0.42
70 0.36
71 0.35
72 0.26
73 0.22
74 0.16
75 0.12
76 0.08
77 0.1
78 0.15
79 0.14
80 0.14
81 0.15
82 0.15
83 0.15
84 0.17
85 0.23
86 0.24
87 0.33
88 0.38
89 0.44
90 0.47
91 0.49
92 0.52
93 0.48
94 0.45
95 0.45
96 0.45
97 0.41
98 0.39
99 0.38
100 0.37
101 0.35
102 0.31
103 0.22
104 0.2
105 0.18
106 0.17
107 0.17
108 0.14
109 0.12
110 0.12
111 0.12
112 0.09
113 0.07
114 0.06
115 0.05
116 0.05
117 0.05
118 0.05
119 0.05
120 0.05
121 0.05
122 0.05
123 0.06
124 0.05
125 0.06
126 0.06
127 0.05
128 0.05
129 0.05
130 0.05
131 0.05
132 0.05
133 0.05
134 0.05
135 0.07
136 0.08
137 0.08
138 0.08
139 0.1
140 0.15
141 0.15
142 0.16
143 0.19
144 0.19
145 0.18
146 0.21
147 0.21
148 0.21
149 0.26
150 0.28
151 0.33
152 0.38
153 0.4
154 0.41
155 0.44
156 0.4
157 0.37
158 0.36
159 0.28
160 0.27
161 0.25
162 0.23
163 0.22
164 0.23
165 0.21
166 0.21
167 0.21
168 0.22
169 0.26
170 0.27
171 0.3
172 0.31
173 0.31
174 0.34
175 0.34
176 0.29
177 0.27
178 0.24
179 0.18
180 0.16
181 0.15
182 0.11
183 0.1
184 0.09
185 0.1
186 0.1
187 0.1
188 0.11
189 0.11
190 0.12
191 0.14
192 0.18
193 0.17
194 0.17
195 0.17
196 0.16
197 0.15
198 0.14
199 0.14
200 0.11
201 0.11
202 0.13
203 0.15
204 0.18
205 0.18
206 0.18
207 0.2
208 0.24
209 0.27
210 0.33
211 0.36
212 0.42
213 0.51
214 0.55
215 0.6
216 0.61
217 0.61
218 0.59
219 0.64
220 0.61
221 0.6
222 0.6
223 0.59
224 0.55
225 0.53
226 0.52
227 0.51
228 0.5
229 0.5
230 0.56
231 0.52
232 0.54
233 0.62
234 0.66
235 0.63
236 0.68
237 0.66
238 0.68
239 0.7
240 0.75
241 0.73
242 0.74
243 0.75
244 0.76
245 0.76
246 0.76
247 0.75
248 0.74
249 0.72
250 0.7
251 0.68
252 0.68
253 0.67
254 0.66
255 0.68
256 0.68
257 0.71
258 0.67
259 0.67
260 0.65
261 0.63
262 0.65
263 0.67
264 0.61
265 0.57
266 0.6
267 0.64
268 0.62
269 0.65
270 0.56
271 0.51
272 0.54
273 0.59
274 0.61
275 0.63
276 0.65
277 0.66
278 0.72
279 0.76
280 0.79
281 0.83
282 0.82
283 0.82
284 0.83
285 0.81
286 0.84
287 0.85
288 0.85
289 0.85
290 0.85
291 0.86
292 0.84
293 0.85
294 0.84
295 0.86
296 0.86