Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A397SS05

Protein Details
Accession A0A397SS05    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
155-191HEGSNNTPKKKRNNRASKKQVKKTKANHNQQKIQKNTHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
162-179PKKKRNNRASKKQVKKTK
Subcellular Location(s) nucl 15.5, cyto_nucl 11, cyto 5.5, mito 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR036910  HMG_box_dom_sf  
Amino Acid Sequences MNSSFNDVLRTEPLIENINTKRVGPENKEEVISFIKKIDHSKIFPPKHSAYEIMVKELNKAGLPRRSMNCFFCFRHVVYLEVLSQGLLDLVKDGVFFTRVASEMWSSASKEDHDEYKRLSTELRKLQDEFHKDKIYSKNKPAHSVFVNCTEINFHEGSNNTPKKKRNNRASKKQVKKTKANHNQQKIQKNTNIINQNIQEISCSLDSQQLIDINSSFEFLYPYPYILYPQDVNNINNLNVYDQTQTYEYNSYYLGCY
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.24
2 0.24
3 0.29
4 0.29
5 0.32
6 0.3
7 0.29
8 0.31
9 0.33
10 0.4
11 0.39
12 0.46
13 0.46
14 0.48
15 0.49
16 0.45
17 0.41
18 0.39
19 0.35
20 0.26
21 0.22
22 0.23
23 0.24
24 0.29
25 0.34
26 0.34
27 0.36
28 0.45
29 0.53
30 0.55
31 0.56
32 0.6
33 0.55
34 0.53
35 0.52
36 0.45
37 0.38
38 0.42
39 0.38
40 0.34
41 0.34
42 0.29
43 0.28
44 0.28
45 0.25
46 0.17
47 0.19
48 0.22
49 0.25
50 0.29
51 0.33
52 0.35
53 0.42
54 0.45
55 0.47
56 0.45
57 0.45
58 0.43
59 0.42
60 0.41
61 0.35
62 0.36
63 0.33
64 0.29
65 0.24
66 0.24
67 0.2
68 0.17
69 0.16
70 0.1
71 0.08
72 0.07
73 0.06
74 0.04
75 0.04
76 0.03
77 0.04
78 0.04
79 0.04
80 0.04
81 0.05
82 0.06
83 0.06
84 0.06
85 0.07
86 0.07
87 0.08
88 0.09
89 0.09
90 0.08
91 0.1
92 0.1
93 0.1
94 0.1
95 0.11
96 0.1
97 0.12
98 0.13
99 0.17
100 0.18
101 0.19
102 0.2
103 0.23
104 0.23
105 0.21
106 0.22
107 0.2
108 0.25
109 0.31
110 0.32
111 0.31
112 0.31
113 0.35
114 0.39
115 0.42
116 0.38
117 0.37
118 0.36
119 0.34
120 0.39
121 0.45
122 0.47
123 0.46
124 0.5
125 0.52
126 0.51
127 0.58
128 0.54
129 0.49
130 0.44
131 0.42
132 0.36
133 0.34
134 0.35
135 0.27
136 0.26
137 0.22
138 0.2
139 0.18
140 0.17
141 0.11
142 0.11
143 0.12
144 0.15
145 0.24
146 0.29
147 0.3
148 0.35
149 0.41
150 0.5
151 0.61
152 0.68
153 0.69
154 0.75
155 0.82
156 0.88
157 0.93
158 0.93
159 0.92
160 0.92
161 0.9
162 0.87
163 0.87
164 0.84
165 0.85
166 0.84
167 0.85
168 0.85
169 0.85
170 0.85
171 0.84
172 0.84
173 0.79
174 0.75
175 0.68
176 0.64
177 0.59
178 0.58
179 0.56
180 0.48
181 0.47
182 0.41
183 0.39
184 0.34
185 0.3
186 0.23
187 0.16
188 0.18
189 0.13
190 0.12
191 0.1
192 0.14
193 0.14
194 0.14
195 0.16
196 0.15
197 0.15
198 0.16
199 0.16
200 0.13
201 0.13
202 0.14
203 0.11
204 0.09
205 0.11
206 0.1
207 0.15
208 0.14
209 0.15
210 0.15
211 0.16
212 0.18
213 0.18
214 0.22
215 0.18
216 0.19
217 0.25
218 0.28
219 0.28
220 0.3
221 0.31
222 0.27
223 0.27
224 0.26
225 0.21
226 0.19
227 0.2
228 0.18
229 0.16
230 0.18
231 0.18
232 0.19
233 0.19
234 0.22
235 0.2
236 0.19
237 0.19