Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A397TIW1

Protein Details
Accession A0A397TIW1    Localization Confidence High Confidence Score 15.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
69-98EPSKSKSIRSKYKTMQKKPRMNKDNSLKDFHydrophilic
170-191WEEWKRKKKPTGHLSTQPKRHNBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
176-177KK
Subcellular Location(s) nucl 22.5, cyto_nucl 14.5, cyto 3.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR016197  Chromo-like_dom_sf  
IPR000953  Chromo/chromo_shadow_dom  
IPR023780  Chromo_domain  
IPR008251  Chromo_shadow_dom  
IPR023779  Chromodomain_CS  
Gene Ontology GO:0000792  C:heterochromatin  
GO:0005634  C:nucleus  
GO:1901363  F:heterocyclic compound binding  
GO:0097159  F:organic cyclic compound binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00385  Chromo  
PF01393  Chromo_shadow  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00598  CHROMO_1  
PS50013  CHROMO_2  
Amino Acid Sequences MSNTGIIDLTMDIDSDHVNSPPPQSSFNPCPELISSPNSIYIYPIHSYAFQRFNSNHLPNPTESSSLSEPSKSKSIRSKYKTMQKKPRMNKDNSLKDFIVNDDDEIEEEEEEVAKGITVSAKKYPEVILDHKYDDEQLLYLVKWDNLSKSVNSWENAQTINDTTMLSTYWEEWKRKKKPTGHLSTQPKRHNYNCEDENNYDNDSEDSDKYELINKYPDAVAYTDPDVLINWNEEIDEVESIQHNHSDQLIAYVLWKSGLRSVHLLDELHEKAPKKMCKWYSTHLKFLDNKDLQTWY
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.08
2 0.1
3 0.11
4 0.09
5 0.12
6 0.14
7 0.18
8 0.22
9 0.24
10 0.26
11 0.29
12 0.37
13 0.4
14 0.45
15 0.47
16 0.41
17 0.42
18 0.4
19 0.41
20 0.35
21 0.33
22 0.29
23 0.25
24 0.29
25 0.27
26 0.25
27 0.22
28 0.21
29 0.2
30 0.18
31 0.19
32 0.16
33 0.18
34 0.21
35 0.26
36 0.3
37 0.28
38 0.32
39 0.32
40 0.36
41 0.42
42 0.43
43 0.42
44 0.4
45 0.42
46 0.38
47 0.43
48 0.4
49 0.32
50 0.29
51 0.29
52 0.27
53 0.27
54 0.27
55 0.24
56 0.24
57 0.25
58 0.32
59 0.28
60 0.32
61 0.38
62 0.46
63 0.53
64 0.58
65 0.64
66 0.65
67 0.74
68 0.79
69 0.81
70 0.82
71 0.82
72 0.87
73 0.87
74 0.9
75 0.89
76 0.84
77 0.83
78 0.83
79 0.83
80 0.76
81 0.72
82 0.61
83 0.53
84 0.48
85 0.39
86 0.32
87 0.21
88 0.18
89 0.12
90 0.12
91 0.11
92 0.11
93 0.1
94 0.07
95 0.06
96 0.06
97 0.06
98 0.06
99 0.05
100 0.04
101 0.03
102 0.03
103 0.03
104 0.06
105 0.07
106 0.09
107 0.13
108 0.14
109 0.15
110 0.16
111 0.17
112 0.17
113 0.2
114 0.22
115 0.22
116 0.23
117 0.24
118 0.23
119 0.22
120 0.19
121 0.15
122 0.12
123 0.08
124 0.06
125 0.06
126 0.06
127 0.07
128 0.07
129 0.07
130 0.08
131 0.08
132 0.08
133 0.1
134 0.11
135 0.1
136 0.11
137 0.15
138 0.17
139 0.17
140 0.19
141 0.18
142 0.18
143 0.19
144 0.17
145 0.14
146 0.12
147 0.12
148 0.1
149 0.08
150 0.07
151 0.07
152 0.07
153 0.07
154 0.06
155 0.07
156 0.13
157 0.18
158 0.22
159 0.29
160 0.39
161 0.46
162 0.55
163 0.62
164 0.64
165 0.69
166 0.77
167 0.79
168 0.77
169 0.78
170 0.8
171 0.8
172 0.8
173 0.76
174 0.71
175 0.67
176 0.64
177 0.64
178 0.57
179 0.57
180 0.54
181 0.52
182 0.51
183 0.47
184 0.45
185 0.38
186 0.34
187 0.26
188 0.21
189 0.17
190 0.14
191 0.15
192 0.13
193 0.14
194 0.13
195 0.13
196 0.13
197 0.19
198 0.18
199 0.18
200 0.22
201 0.19
202 0.2
203 0.2
204 0.2
205 0.15
206 0.16
207 0.15
208 0.14
209 0.15
210 0.13
211 0.13
212 0.13
213 0.11
214 0.11
215 0.11
216 0.1
217 0.09
218 0.08
219 0.08
220 0.08
221 0.09
222 0.09
223 0.08
224 0.07
225 0.08
226 0.1
227 0.11
228 0.12
229 0.12
230 0.11
231 0.12
232 0.12
233 0.12
234 0.11
235 0.12
236 0.12
237 0.1
238 0.11
239 0.11
240 0.11
241 0.11
242 0.12
243 0.11
244 0.14
245 0.17
246 0.18
247 0.2
248 0.22
249 0.24
250 0.26
251 0.25
252 0.23
253 0.28
254 0.27
255 0.26
256 0.29
257 0.26
258 0.3
259 0.39
260 0.44
261 0.41
262 0.5
263 0.54
264 0.58
265 0.63
266 0.67
267 0.69
268 0.68
269 0.73
270 0.67
271 0.67
272 0.66
273 0.66
274 0.67
275 0.58
276 0.54