Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A2Q8U0

Protein Details
Accession A2Q8U0    Localization Confidence High Confidence Score 16
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-20MRAKRSKKYRKLMHQYELTFHydrophilic
201-239AGDGEKTKKKRDLKKPKGPNPLSVKKPKKRAPEDTSGKABasic
258-283EDGDAAPKAKRRRRHHNRGAGKTDGDBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
204-278GEKTKKKRDLKKPKGPNPLSVKKPKKRAPEDTSGKAEKPKREAEERPAAEERDGEDGDAAPKAKRRRRHHNRGAG
Subcellular Location(s) nucl 14, mito_nucl 13.333, mito 11.5, cyto_nucl 8.333
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR006984  Fcf1/Utp23  
IPR029060  PIN-like_dom_sf  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0032040  C:small-subunit processome  
GO:0070181  F:small ribosomal subunit rRNA binding  
GO:0000480  P:endonucleolytic cleavage in 5'-ETS of tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA)  
GO:0000447  P:endonucleolytic cleavage in ITS1 to separate SSU-rRNA from 5.8S rRNA and LSU-rRNA from tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA)  
GO:0000472  P:endonucleolytic cleavage to generate mature 5'-end of SSU-rRNA from (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA)  
Pfam View protein in Pfam  
PF04900  Fcf1  
Amino Acid Sequences MRAKRSKKYRKLMHQYELTFGFREPYQVLVDSNFLRAVHSFKMDLIPALERTLQGKPKPLLTKCSLAAIMASQPINPRTNNPYRPDHLPPPTTLPLRHCSHNADSTPIDEVECLLSLLSPSAESKKNKEHYILATADPHNAKDKLLRRQARSIPGVPIVYVKRSVMVLEPMSDPSDAIREGVEKGKFRVGLNDEARKPTTAGDGEKTKKKRDLKKPKGPNPLSVKKPKKRAPEDTSGKAEKPKREAEERPAAEERDGEDGDAAPKAKRRRRHHNRGAGKTDGDEGGAQEAAAPADAMDD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.88
2 0.79
3 0.74
4 0.67
5 0.57
6 0.47
7 0.38
8 0.31
9 0.22
10 0.24
11 0.19
12 0.18
13 0.18
14 0.18
15 0.19
16 0.17
17 0.21
18 0.18
19 0.19
20 0.18
21 0.16
22 0.16
23 0.16
24 0.18
25 0.17
26 0.19
27 0.18
28 0.17
29 0.2
30 0.19
31 0.19
32 0.17
33 0.17
34 0.15
35 0.17
36 0.17
37 0.15
38 0.17
39 0.22
40 0.27
41 0.27
42 0.34
43 0.34
44 0.41
45 0.49
46 0.49
47 0.5
48 0.48
49 0.51
50 0.44
51 0.46
52 0.38
53 0.29
54 0.27
55 0.2
56 0.17
57 0.15
58 0.14
59 0.11
60 0.14
61 0.18
62 0.2
63 0.2
64 0.22
65 0.28
66 0.37
67 0.43
68 0.45
69 0.48
70 0.49
71 0.55
72 0.57
73 0.57
74 0.54
75 0.5
76 0.46
77 0.46
78 0.48
79 0.44
80 0.4
81 0.36
82 0.37
83 0.37
84 0.38
85 0.34
86 0.33
87 0.35
88 0.39
89 0.35
90 0.32
91 0.29
92 0.28
93 0.27
94 0.22
95 0.18
96 0.11
97 0.11
98 0.08
99 0.08
100 0.07
101 0.05
102 0.04
103 0.04
104 0.05
105 0.04
106 0.04
107 0.05
108 0.09
109 0.15
110 0.16
111 0.21
112 0.29
113 0.34
114 0.35
115 0.37
116 0.37
117 0.33
118 0.37
119 0.34
120 0.27
121 0.26
122 0.25
123 0.25
124 0.22
125 0.2
126 0.19
127 0.17
128 0.17
129 0.19
130 0.25
131 0.3
132 0.39
133 0.44
134 0.44
135 0.51
136 0.56
137 0.55
138 0.53
139 0.46
140 0.39
141 0.35
142 0.32
143 0.24
144 0.23
145 0.18
146 0.15
147 0.14
148 0.12
149 0.11
150 0.11
151 0.11
152 0.08
153 0.1
154 0.1
155 0.1
156 0.11
157 0.11
158 0.12
159 0.12
160 0.1
161 0.08
162 0.09
163 0.07
164 0.07
165 0.06
166 0.06
167 0.08
168 0.13
169 0.16
170 0.15
171 0.17
172 0.2
173 0.22
174 0.21
175 0.26
176 0.25
177 0.3
178 0.35
179 0.4
180 0.39
181 0.4
182 0.41
183 0.35
184 0.32
185 0.24
186 0.23
187 0.19
188 0.2
189 0.21
190 0.27
191 0.32
192 0.39
193 0.43
194 0.44
195 0.5
196 0.57
197 0.63
198 0.67
199 0.73
200 0.77
201 0.83
202 0.89
203 0.9
204 0.93
205 0.85
206 0.83
207 0.81
208 0.78
209 0.76
210 0.76
211 0.77
212 0.74
213 0.81
214 0.8
215 0.81
216 0.81
217 0.83
218 0.8
219 0.8
220 0.8
221 0.76
222 0.76
223 0.69
224 0.61
225 0.59
226 0.57
227 0.52
228 0.51
229 0.52
230 0.51
231 0.56
232 0.6
233 0.6
234 0.65
235 0.6
236 0.6
237 0.56
238 0.51
239 0.44
240 0.39
241 0.32
242 0.27
243 0.25
244 0.19
245 0.16
246 0.15
247 0.16
248 0.17
249 0.16
250 0.13
251 0.19
252 0.29
253 0.36
254 0.45
255 0.54
256 0.63
257 0.74
258 0.83
259 0.88
260 0.89
261 0.92
262 0.92
263 0.89
264 0.82
265 0.73
266 0.63
267 0.55
268 0.44
269 0.34
270 0.25
271 0.19
272 0.16
273 0.14
274 0.12
275 0.1
276 0.1
277 0.09
278 0.08
279 0.07