FuNGI

A0A395MDQ3

Protein Details

Accession

A0A395MDQ3

Localization Confidence

Low

Confidence Score

9.4

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
96-119	AADERKARGRSRFRSKRSRGDAMG	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
94-120	ERAADERKARGRSRFRSKRSRGDAMGR

Subcellular Location(s)

mito 20, cyto_nucl 4.5, nucl 4

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR007811 RPC4
Gene Ontology	GO:0005666 C:RNA polymerase III complex GO:0003677 F:DNA binding GO:0006383 P:transcription by RNA polymerase III
Pfam	View protein in Pfam PF05132 RNA_pol_Rpc4

Amino Acid Sequences

MNRGRASARGTRRGAAAASSRATGESSVDPSTAQATSGSATPAPYSISSTPTRGSNTTRATRAPAAGRFRPKNVRRDEAERDSLARQEEQKASERAADERKARGRSRFRSKRSRGDAMGRGGFGRGISGASGPFSSAAAGSGGRGGGGWFGGGGGGGFGGGGGGGRGFKSDSKSGFAQATRNREARINADKLHLHTPEEDLDSEDEAMMEALNSRTVSVLPMGIYRREHKDEGVVVATTAELEAAENAQAIPPSAAKEEESLWVDGDAGESQPTDENGEDGGIRDNESKPPVIKKEQDDSMDLDLESKMDTEAESKEASATPAPQAKKPAQESEETMIQADLEVLANELGAVEISEGAEGEGEEEKTQGPSNKDGRMYLFQFPPVLPPLKQVAQPKSTKIKPEPTEGEDDVLESTPAAADADPVDLTNDSNSNGFNIPGFEDPEQKAGFMSSLLSSGGMVGQLKVRKSGRVEMDWGGSTMELSPAVGMNFLTTAVIIEENDEKPRPGVVGGESIGMGKIMGRFVLAPKWDEEEEWEVSSEDLRAQ

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.44
2	0.4
3	0.36
4	0.31
5	0.3
6	0.28
7	0.27
8	0.25
9	0.25
10	0.2
11	0.18
12	0.16
13	0.17
14	0.18
15	0.18
16	0.17
17	0.17
18	0.19
19	0.16
20	0.13
21	0.1
22	0.1
23	0.11
24	0.12
25	0.13
26	0.11
27	0.12
28	0.12
29	0.12
30	0.14
31	0.13
32	0.17
33	0.17
34	0.21
35	0.23
36	0.25
37	0.27
38	0.28
39	0.32
40	0.3
41	0.34
42	0.38
43	0.43
44	0.47
45	0.49
46	0.47
47	0.49
48	0.49
49	0.48
50	0.46
51	0.45
52	0.46
53	0.5
54	0.59
55	0.57
56	0.61
57	0.67
58	0.68
59	0.7
60	0.71
61	0.71
62	0.67
63	0.71
64	0.73
65	0.7
66	0.68
67	0.6
68	0.55
69	0.48
70	0.45
71	0.4
72	0.34
73	0.29
74	0.3
75	0.32
76	0.33
77	0.38
78	0.36
79	0.35
80	0.35
81	0.34
82	0.33
83	0.36
84	0.38
85	0.35
86	0.42
87	0.48
88	0.51
89	0.55
90	0.59
91	0.63
92	0.67
93	0.74
94	0.77
95	0.79
96	0.83
97	0.86
98	0.87
99	0.85
100	0.83
101	0.77
102	0.75
103	0.73
104	0.68
105	0.62
106	0.52
107	0.44
108	0.36
109	0.31
110	0.22
111	0.15
112	0.09
113	0.07
114	0.06
115	0.07
116	0.07
117	0.07
118	0.07
119	0.07
120	0.07
121	0.07
122	0.07
123	0.06
124	0.06
125	0.06
126	0.06
127	0.06
128	0.06
129	0.06
130	0.05
131	0.05
132	0.05
133	0.04
134	0.04
135	0.04
136	0.03
137	0.03
138	0.03
139	0.03
140	0.03
141	0.02
142	0.02
143	0.02
144	0.02
145	0.02
146	0.02
147	0.02
148	0.02
149	0.02
150	0.02
151	0.03
152	0.03
153	0.04
154	0.05
155	0.08
156	0.12
157	0.16
158	0.18
159	0.21
160	0.22
161	0.24
162	0.26
163	0.26
164	0.29
165	0.3
166	0.36
167	0.37
168	0.38
169	0.37
170	0.37
171	0.37
172	0.37
173	0.39
174	0.35
175	0.32
176	0.34
177	0.34
178	0.34
179	0.37
180	0.31
181	0.25
182	0.22
183	0.22
184	0.2
185	0.2
186	0.18
187	0.14
188	0.14
189	0.13
190	0.12
191	0.1
192	0.08
193	0.06
194	0.06
195	0.04
196	0.04
197	0.04
198	0.04
199	0.05
200	0.05
201	0.05
202	0.06
203	0.06
204	0.07
205	0.06
206	0.07
207	0.06
208	0.09
209	0.1
210	0.12
211	0.14
212	0.17
213	0.22
214	0.25
215	0.26
216	0.23
217	0.25
218	0.24
219	0.24
220	0.22
221	0.16
222	0.12
223	0.11
224	0.1
225	0.07
226	0.06
227	0.04
228	0.02
229	0.03
230	0.03
231	0.03
232	0.03
233	0.03
234	0.03
235	0.04
236	0.04
237	0.04
238	0.04
239	0.05
240	0.06
241	0.06
242	0.07
243	0.07
244	0.08
245	0.09
246	0.11
247	0.12
248	0.11
249	0.11
250	0.1
251	0.1
252	0.09
253	0.08
254	0.06
255	0.04
256	0.04
257	0.04
258	0.04
259	0.05
260	0.05
261	0.06
262	0.05
263	0.05
264	0.05
265	0.06
266	0.05
267	0.05
268	0.07
269	0.06
270	0.07
271	0.09
272	0.1
273	0.12
274	0.13
275	0.14
276	0.14
277	0.18
278	0.22
279	0.25
280	0.29
281	0.31
282	0.35
283	0.38
284	0.38
285	0.35
286	0.33
287	0.29
288	0.24
289	0.2
290	0.16
291	0.12
292	0.1
293	0.09
294	0.06
295	0.05
296	0.04
297	0.05
298	0.06
299	0.06
300	0.08
301	0.08
302	0.08
303	0.09
304	0.09
305	0.1
306	0.09
307	0.09
308	0.11
309	0.16
310	0.18
311	0.19
312	0.24
313	0.26
314	0.32
315	0.34
316	0.36
317	0.33
318	0.34
319	0.35
320	0.33
321	0.33
322	0.26
323	0.23
324	0.17
325	0.15
326	0.13
327	0.1
328	0.06
329	0.04
330	0.04
331	0.04
332	0.04
333	0.04
334	0.03
335	0.03
336	0.03
337	0.02
338	0.03
339	0.02
340	0.03
341	0.03
342	0.03
343	0.03
344	0.03
345	0.03
346	0.03
347	0.04
348	0.05
349	0.06
350	0.06
351	0.07
352	0.07
353	0.08
354	0.11
355	0.14
356	0.15
357	0.22
358	0.26
359	0.3
360	0.31
361	0.31
362	0.33
363	0.35
364	0.36
365	0.34
366	0.3
367	0.27
368	0.27
369	0.26
370	0.25
371	0.23
372	0.22
373	0.17
374	0.19
375	0.23
376	0.24
377	0.29
378	0.33
379	0.36
380	0.4
381	0.43
382	0.46
383	0.5
384	0.52
385	0.55
386	0.54
387	0.57
388	0.53
389	0.59
390	0.58
391	0.53
392	0.56
393	0.49
394	0.44
395	0.33
396	0.31
397	0.23
398	0.18
399	0.14
400	0.08
401	0.07
402	0.05
403	0.05
404	0.05
405	0.04
406	0.05
407	0.05
408	0.07
409	0.07
410	0.07
411	0.08
412	0.07
413	0.08
414	0.09
415	0.09
416	0.09
417	0.1
418	0.1
419	0.11
420	0.11
421	0.11
422	0.1
423	0.1
424	0.12
425	0.13
426	0.16
427	0.15
428	0.19
429	0.2
430	0.24
431	0.24
432	0.21
433	0.2
434	0.17
435	0.16
436	0.11
437	0.12
438	0.07
439	0.08
440	0.08
441	0.08
442	0.07
443	0.07
444	0.07
445	0.07
446	0.07
447	0.07
448	0.12
449	0.15
450	0.16
451	0.23
452	0.24
453	0.28
454	0.32
455	0.39
456	0.41
457	0.42
458	0.45
459	0.41
460	0.43
461	0.39
462	0.35
463	0.27
464	0.2
465	0.16
466	0.13
467	0.11
468	0.07
469	0.07
470	0.07
471	0.07
472	0.07
473	0.07
474	0.07
475	0.06
476	0.07
477	0.07
478	0.06
479	0.05
480	0.06
481	0.06
482	0.07
483	0.06
484	0.08
485	0.12
486	0.14
487	0.18
488	0.19
489	0.19
490	0.19
491	0.21
492	0.19
493	0.16
494	0.17
495	0.15
496	0.19
497	0.18
498	0.19
499	0.18
500	0.17
501	0.16
502	0.13
503	0.11
504	0.08
505	0.09
506	0.08
507	0.08
508	0.09
509	0.1
510	0.13
511	0.19
512	0.2
513	0.2
514	0.22
515	0.27
516	0.27
517	0.26
518	0.29
519	0.28
520	0.28
521	0.27
522	0.26
523	0.21
524	0.21
525	0.21

A0A395MDQ3

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer