Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A395MIW1

Protein Details
Accession A0A395MIW1    Localization Confidence High Confidence Score 23.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
33-72DDGADVKKAKKEKRDKKFKKESRKERKDKRKDLQDLPEQDBasic
95-122VDTENSAKKDKKKKDKKDKTEESQQKDABasic
125-152DTETKDEPKKSKKDKKKKNKATDTAAVNHydrophilic
257-282TAGGGGKTKKRQDKIKEKNVKLNENRHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
26-63AKKRKREDDGADVKKAKKEKRDKKFKKESRKERKDKRK
102-113KKDKKKKDKKDK
132-144PKKSKKDKKKKNK
261-290GGKTKKRQDKIKEKNVKLNENRAKRIERER
Subcellular Location(s) nucl 25.5, cyto_nucl 14
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
Amino Acid Sequences MKSKRAREATEVDEKPVVSIDAEAPAKKRKREDDGADVKKAKKEKRDKKFKKESRKERKDKRKDLQDLPEQDDDVEEAEDTAMAGADDKPTDAAVDTENSAKKDKKKKDKKDKTEESQQKDASVDTETKDEPKKSKKDKKKKNKATDTAAVNDESAGAEADAADADANTNGKADRHIVFVGNLPFTATAETIRAHFASLNPVGVRCMSNPKDDKPCRGIAFVEFAKVWHMRTCLDKFHHSEFSDGTSYPRRINVELTAGGGGKTKKRQDKIKEKNVKLNENRAKRIERERVEKEENARANADTRSAGTDGIHPSRRAHIPGNHR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.43
2 0.36
3 0.31
4 0.24
5 0.14
6 0.14
7 0.12
8 0.16
9 0.18
10 0.19
11 0.22
12 0.31
13 0.37
14 0.42
15 0.49
16 0.51
17 0.58
18 0.66
19 0.7
20 0.72
21 0.76
22 0.76
23 0.75
24 0.72
25 0.66
26 0.62
27 0.62
28 0.58
29 0.58
30 0.63
31 0.67
32 0.73
33 0.81
34 0.86
35 0.9
36 0.94
37 0.94
38 0.94
39 0.94
40 0.95
41 0.95
42 0.95
43 0.95
44 0.95
45 0.96
46 0.96
47 0.95
48 0.94
49 0.94
50 0.91
51 0.89
52 0.87
53 0.85
54 0.79
55 0.73
56 0.65
57 0.54
58 0.45
59 0.36
60 0.27
61 0.19
62 0.13
63 0.08
64 0.06
65 0.05
66 0.05
67 0.05
68 0.05
69 0.04
70 0.03
71 0.04
72 0.04
73 0.06
74 0.06
75 0.06
76 0.06
77 0.06
78 0.07
79 0.06
80 0.06
81 0.06
82 0.08
83 0.09
84 0.12
85 0.15
86 0.16
87 0.2
88 0.24
89 0.31
90 0.4
91 0.5
92 0.57
93 0.66
94 0.76
95 0.84
96 0.91
97 0.93
98 0.94
99 0.94
100 0.9
101 0.9
102 0.87
103 0.83
104 0.79
105 0.68
106 0.58
107 0.48
108 0.41
109 0.3
110 0.24
111 0.18
112 0.11
113 0.13
114 0.13
115 0.16
116 0.2
117 0.22
118 0.26
119 0.33
120 0.42
121 0.51
122 0.61
123 0.69
124 0.76
125 0.84
126 0.9
127 0.93
128 0.94
129 0.94
130 0.94
131 0.9
132 0.86
133 0.81
134 0.73
135 0.64
136 0.54
137 0.43
138 0.32
139 0.25
140 0.18
141 0.11
142 0.08
143 0.05
144 0.03
145 0.03
146 0.03
147 0.03
148 0.03
149 0.03
150 0.02
151 0.02
152 0.02
153 0.03
154 0.03
155 0.03
156 0.04
157 0.04
158 0.05
159 0.06
160 0.08
161 0.09
162 0.11
163 0.11
164 0.11
165 0.12
166 0.15
167 0.16
168 0.13
169 0.12
170 0.1
171 0.1
172 0.1
173 0.1
174 0.07
175 0.05
176 0.07
177 0.07
178 0.07
179 0.09
180 0.09
181 0.08
182 0.09
183 0.09
184 0.12
185 0.13
186 0.14
187 0.12
188 0.13
189 0.13
190 0.13
191 0.13
192 0.1
193 0.18
194 0.18
195 0.26
196 0.29
197 0.34
198 0.43
199 0.46
200 0.5
201 0.46
202 0.5
203 0.44
204 0.43
205 0.39
206 0.29
207 0.33
208 0.27
209 0.24
210 0.18
211 0.16
212 0.18
213 0.18
214 0.17
215 0.15
216 0.16
217 0.15
218 0.22
219 0.25
220 0.28
221 0.32
222 0.36
223 0.38
224 0.42
225 0.47
226 0.41
227 0.4
228 0.34
229 0.34
230 0.3
231 0.26
232 0.24
233 0.25
234 0.26
235 0.26
236 0.29
237 0.28
238 0.27
239 0.3
240 0.29
241 0.26
242 0.25
243 0.24
244 0.22
245 0.19
246 0.18
247 0.19
248 0.18
249 0.19
250 0.26
251 0.33
252 0.41
253 0.49
254 0.58
255 0.66
256 0.75
257 0.8
258 0.84
259 0.87
260 0.84
261 0.86
262 0.84
263 0.84
264 0.79
265 0.79
266 0.78
267 0.75
268 0.76
269 0.73
270 0.7
271 0.66
272 0.7
273 0.69
274 0.67
275 0.68
276 0.69
277 0.71
278 0.72
279 0.7
280 0.65
281 0.64
282 0.6
283 0.54
284 0.48
285 0.41
286 0.38
287 0.34
288 0.31
289 0.23
290 0.2
291 0.2
292 0.19
293 0.19
294 0.16
295 0.21
296 0.25
297 0.31
298 0.35
299 0.33
300 0.35
301 0.41
302 0.45
303 0.44
304 0.46