Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A395MDC5

Protein Details
Accession A0A395MDC5    Localization Confidence Low Confidence Score 8.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
407-429AHLKSATHRRVVRKKARTSLVPVHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 12.5, mito 10.5, cyto_nucl 8.333, cyto_mito 7.333
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR039657  Dimethylallyltransferase  
IPR030666  IPP_transferase_euk  
IPR018022  IPT  
IPR003604  Matrin/U1-like-C_Znf_C2H2  
IPR027417  P-loop_NTPase  
IPR036236  Znf_C2H2_sf  
Gene Ontology GO:0005737  C:cytoplasm  
GO:0005524  F:ATP binding  
GO:0003676  F:nucleic acid binding  
GO:0052381  F:tRNA dimethylallyltransferase activity  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
GO:0008033  P:tRNA processing  
Pfam View protein in Pfam  
PF01715  IPPT  
PF12874  zf-met  
Amino Acid Sequences MSAKPPTAPLVVVLGSTGTGKSDLAVELATRLNGEIINADAMQLYNGLPIITNKITTEEQRGIPHHLLGHISLDEQPWDVDDFKREATRTIREIRDRGRLPILVGGSQYYVDPILFKEVILDDLELNTTESFPILQESAEVMLHELRKVDPVMAERWHPKDRRKIQRSLEIYLKSGKRASDYYAEQQARKEAAQQDANKEPWENLLFWVYSKREVLCERLDKRVDKMQTGGLMDEVRELYDFKHKKEAEGQILDMTKGIWQSIGYKQFEPYLAAIDERQDPAAIEKLKSAGLEKMKAATRQYASYQTRWIRLKQIPRIHEVGPEAMKNMYLLDSTDVSEYGKNVVEPAVQLAQQFLRGEERPLPTEISELAQEVLSQVGNPPPKSTPCKRTCEVCHTTLMTEEAWAAHLKSATHRRVVRKKARTSLVPVEQRKEKQKTETKEDGGDSGPELGSIFSE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.12
2 0.11
3 0.11
4 0.1
5 0.07
6 0.08
7 0.08
8 0.08
9 0.09
10 0.09
11 0.09
12 0.1
13 0.09
14 0.11
15 0.12
16 0.12
17 0.1
18 0.1
19 0.1
20 0.1
21 0.1
22 0.09
23 0.09
24 0.1
25 0.1
26 0.1
27 0.09
28 0.09
29 0.09
30 0.09
31 0.08
32 0.07
33 0.07
34 0.07
35 0.07
36 0.08
37 0.14
38 0.14
39 0.15
40 0.15
41 0.19
42 0.22
43 0.24
44 0.3
45 0.28
46 0.31
47 0.35
48 0.37
49 0.39
50 0.38
51 0.37
52 0.32
53 0.29
54 0.27
55 0.22
56 0.22
57 0.16
58 0.16
59 0.15
60 0.14
61 0.13
62 0.12
63 0.12
64 0.1
65 0.12
66 0.13
67 0.13
68 0.16
69 0.17
70 0.19
71 0.23
72 0.22
73 0.25
74 0.29
75 0.34
76 0.36
77 0.42
78 0.47
79 0.49
80 0.55
81 0.56
82 0.6
83 0.56
84 0.54
85 0.5
86 0.44
87 0.39
88 0.37
89 0.33
90 0.24
91 0.22
92 0.19
93 0.15
94 0.14
95 0.13
96 0.09
97 0.08
98 0.07
99 0.07
100 0.07
101 0.11
102 0.11
103 0.11
104 0.12
105 0.11
106 0.13
107 0.13
108 0.13
109 0.08
110 0.09
111 0.09
112 0.08
113 0.09
114 0.08
115 0.07
116 0.06
117 0.06
118 0.06
119 0.06
120 0.07
121 0.06
122 0.06
123 0.06
124 0.07
125 0.08
126 0.08
127 0.08
128 0.07
129 0.09
130 0.1
131 0.1
132 0.1
133 0.09
134 0.12
135 0.12
136 0.12
137 0.11
138 0.13
139 0.16
140 0.17
141 0.2
142 0.23
143 0.29
144 0.35
145 0.38
146 0.43
147 0.51
148 0.6
149 0.67
150 0.69
151 0.73
152 0.72
153 0.76
154 0.73
155 0.67
156 0.63
157 0.53
158 0.48
159 0.46
160 0.4
161 0.32
162 0.3
163 0.27
164 0.22
165 0.22
166 0.24
167 0.22
168 0.24
169 0.26
170 0.33
171 0.35
172 0.32
173 0.32
174 0.32
175 0.28
176 0.25
177 0.26
178 0.2
179 0.24
180 0.29
181 0.3
182 0.32
183 0.34
184 0.35
185 0.3
186 0.27
187 0.23
188 0.2
189 0.19
190 0.15
191 0.12
192 0.13
193 0.12
194 0.12
195 0.16
196 0.13
197 0.13
198 0.14
199 0.14
200 0.15
201 0.16
202 0.2
203 0.21
204 0.28
205 0.29
206 0.34
207 0.37
208 0.34
209 0.36
210 0.39
211 0.35
212 0.28
213 0.27
214 0.23
215 0.21
216 0.21
217 0.18
218 0.12
219 0.11
220 0.1
221 0.1
222 0.08
223 0.06
224 0.06
225 0.06
226 0.06
227 0.15
228 0.17
229 0.18
230 0.27
231 0.27
232 0.28
233 0.35
234 0.4
235 0.37
236 0.36
237 0.36
238 0.29
239 0.3
240 0.28
241 0.21
242 0.15
243 0.1
244 0.08
245 0.08
246 0.05
247 0.05
248 0.08
249 0.14
250 0.2
251 0.21
252 0.21
253 0.22
254 0.23
255 0.24
256 0.22
257 0.17
258 0.13
259 0.12
260 0.11
261 0.11
262 0.11
263 0.13
264 0.12
265 0.11
266 0.09
267 0.09
268 0.1
269 0.15
270 0.15
271 0.14
272 0.14
273 0.15
274 0.15
275 0.15
276 0.15
277 0.15
278 0.17
279 0.18
280 0.18
281 0.21
282 0.23
283 0.26
284 0.26
285 0.26
286 0.25
287 0.25
288 0.27
289 0.32
290 0.33
291 0.33
292 0.39
293 0.37
294 0.42
295 0.43
296 0.43
297 0.42
298 0.45
299 0.52
300 0.53
301 0.58
302 0.54
303 0.56
304 0.57
305 0.49
306 0.46
307 0.39
308 0.34
309 0.28
310 0.25
311 0.21
312 0.17
313 0.17
314 0.13
315 0.12
316 0.08
317 0.07
318 0.07
319 0.08
320 0.09
321 0.09
322 0.1
323 0.1
324 0.1
325 0.11
326 0.1
327 0.1
328 0.1
329 0.09
330 0.1
331 0.1
332 0.1
333 0.09
334 0.12
335 0.12
336 0.12
337 0.12
338 0.13
339 0.13
340 0.15
341 0.15
342 0.13
343 0.16
344 0.16
345 0.19
346 0.23
347 0.26
348 0.26
349 0.27
350 0.28
351 0.23
352 0.24
353 0.22
354 0.18
355 0.15
356 0.13
357 0.12
358 0.1
359 0.1
360 0.09
361 0.09
362 0.07
363 0.06
364 0.07
365 0.12
366 0.18
367 0.18
368 0.21
369 0.24
370 0.31
371 0.4
372 0.47
373 0.52
374 0.55
375 0.63
376 0.64
377 0.69
378 0.7
379 0.72
380 0.69
381 0.61
382 0.58
383 0.52
384 0.49
385 0.41
386 0.35
387 0.25
388 0.19
389 0.17
390 0.11
391 0.11
392 0.12
393 0.11
394 0.11
395 0.13
396 0.13
397 0.21
398 0.31
399 0.34
400 0.42
401 0.48
402 0.56
403 0.65
404 0.75
405 0.77
406 0.77
407 0.83
408 0.84
409 0.85
410 0.8
411 0.78
412 0.77
413 0.76
414 0.76
415 0.72
416 0.7
417 0.7
418 0.72
419 0.74
420 0.72
421 0.68
422 0.69
423 0.73
424 0.75
425 0.76
426 0.78
427 0.72
428 0.69
429 0.65
430 0.57
431 0.49
432 0.41
433 0.33
434 0.26
435 0.21
436 0.15
437 0.14