FuNGI

A2QYA8

Protein Details

Accession

A2QYA8

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

14.5

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
11-53	HPTGPARQSSPEKDRKRKHKDTTSPSKKKRKHESHASTSKKSS	Basic
411-447	EESPSKKKSSSSKEKKEKKEKKSKSSKKEKTLFVAGV	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
21-45	PEKDRKRKHKDTTSPSKKKRKHESH
415-440	SKKKSSSSKEKKEKKEKKSKSSKKEK

Subcellular Location(s)

cyto 10.5, cyto_nucl 10, nucl 8.5, mito 5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR036898 RNA_pol_Rpb7-like_N_sf IPR041178 RPA43_OB IPR045113 Rpb7-like
Gene Ontology	GO:0000428 C:DNA-directed RNA polymerase complex GO:0005730 C:nucleolus GO:0003677 F:DNA binding GO:0006352 P:DNA-templated transcription initiation
Pfam	View protein in Pfam PF17875 RPA43_OB

Amino Acid Sequences

MALDAMDLDPHPTGPARQSSPEKDRKRKHKDTTSPSKKKRKHESHASTSKKSSSKTSTSTSSNRPTTTIPDSPYTLTTATLYLPLSPISISPTHALASLLAEHLSPLLLTYYAPLKGIVLAYSNASISSTPPSSTNVVNAEDPNLPQPLTLARTAGEYGVLYVYLTATFLVFRPQRGQILEGWVNVQSEGFLGAIVLNLFSVGIERKRLPPSWKWIPPGEELEEEQQEQGQQASTTENEGDDSDSSNSETKKSAFDPAKELFRPIALAEDVNPLADTDPASTSTNNNATGDYDDDETAAAEGYFQSVSGHRVRGTIKFRVVDVDVIPGSERESGFLSIEGTMLDEEEEKRVLEEERTGVVSSAPSSSYGGGSTGMTPRKLGSVTTMSGALAIRSASASVAPEPEVVDVHVEESPSKKKSSSSKEKKEKKEKKSKSSKKEKTLFVAGVRWEYQKDLVSLTVVVVFGGVGISELEYFWEVWRTGVGHAH

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.19
2	0.26
3	0.28
4	0.35
5	0.43
6	0.51
7	0.6
8	0.68
9	0.73
10	0.77
11	0.83
12	0.87
13	0.89
14	0.91
15	0.92
16	0.92
17	0.92
18	0.92
19	0.94
20	0.94
21	0.94
22	0.94
23	0.94
24	0.91
25	0.91
26	0.92
27	0.91
28	0.9
29	0.9
30	0.9
31	0.9
32	0.92
33	0.9
34	0.84
35	0.78
36	0.75
37	0.68
38	0.6
39	0.58
40	0.55
41	0.54
42	0.53
43	0.54
44	0.52
45	0.54
46	0.58
47	0.58
48	0.6
49	0.58
50	0.53
51	0.5
52	0.47
53	0.46
54	0.47
55	0.43
56	0.37
57	0.36
58	0.37
59	0.36
60	0.35
61	0.31
62	0.24
63	0.2
64	0.17
65	0.15
66	0.13
67	0.14
68	0.13
69	0.11
70	0.11
71	0.11
72	0.1
73	0.1
74	0.09
75	0.11
76	0.12
77	0.13
78	0.14
79	0.14
80	0.14
81	0.15
82	0.15
83	0.11
84	0.11
85	0.1
86	0.1
87	0.09
88	0.08
89	0.07
90	0.07
91	0.07
92	0.05
93	0.05
94	0.05
95	0.05
96	0.05
97	0.06
98	0.09
99	0.1
100	0.1
101	0.1
102	0.09
103	0.1
104	0.11
105	0.1
106	0.09
107	0.09
108	0.09
109	0.1
110	0.1
111	0.08
112	0.09
113	0.08
114	0.08
115	0.11
116	0.11
117	0.12
118	0.13
119	0.15
120	0.17
121	0.18
122	0.19
123	0.18
124	0.19
125	0.2
126	0.19
127	0.19
128	0.18
129	0.18
130	0.17
131	0.16
132	0.13
133	0.12
134	0.12
135	0.12
136	0.13
137	0.13
138	0.12
139	0.11
140	0.12
141	0.13
142	0.12
143	0.1
144	0.07
145	0.07
146	0.07
147	0.06
148	0.05
149	0.04
150	0.05
151	0.04
152	0.04
153	0.04
154	0.04
155	0.04
156	0.05
157	0.11
158	0.12
159	0.14
160	0.17
161	0.19
162	0.22
163	0.22
164	0.24
165	0.18
166	0.24
167	0.25
168	0.22
169	0.2
170	0.18
171	0.18
172	0.16
173	0.14
174	0.07
175	0.06
176	0.06
177	0.05
178	0.04
179	0.03
180	0.03
181	0.04
182	0.04
183	0.04
184	0.03
185	0.03
186	0.03
187	0.03
188	0.03
189	0.05
190	0.06
191	0.09
192	0.1
193	0.15
194	0.19
195	0.23
196	0.27
197	0.31
198	0.39
199	0.46
200	0.49
201	0.48
202	0.48
203	0.47
204	0.45
205	0.43
206	0.36
207	0.28
208	0.24
209	0.23
210	0.2
211	0.18
212	0.15
213	0.12
214	0.09
215	0.09
216	0.08
217	0.06
218	0.05
219	0.05
220	0.06
221	0.06
222	0.07
223	0.07
224	0.06
225	0.07
226	0.07
227	0.07
228	0.06
229	0.07
230	0.07
231	0.07
232	0.08
233	0.1
234	0.1
235	0.11
236	0.12
237	0.11
238	0.13
239	0.14
240	0.21
241	0.21
242	0.23
243	0.27
244	0.28
245	0.32
246	0.3
247	0.3
248	0.23
249	0.2
250	0.19
251	0.13
252	0.13
253	0.08
254	0.08
255	0.08
256	0.1
257	0.1
258	0.09
259	0.09
260	0.07
261	0.07
262	0.07
263	0.07
264	0.05
265	0.06
266	0.08
267	0.1
268	0.1
269	0.11
270	0.14
271	0.16
272	0.16
273	0.16
274	0.14
275	0.14
276	0.14
277	0.15
278	0.12
279	0.11
280	0.1
281	0.09
282	0.09
283	0.08
284	0.07
285	0.06
286	0.04
287	0.03
288	0.03
289	0.04
290	0.04
291	0.04
292	0.05
293	0.06
294	0.09
295	0.11
296	0.13
297	0.13
298	0.16
299	0.18
300	0.24
301	0.29
302	0.31
303	0.32
304	0.32
305	0.31
306	0.31
307	0.31
308	0.25
309	0.2
310	0.18
311	0.14
312	0.13
313	0.14
314	0.11
315	0.11
316	0.12
317	0.11
318	0.09
319	0.11
320	0.12
321	0.12
322	0.12
323	0.12
324	0.09
325	0.09
326	0.08
327	0.07
328	0.06
329	0.05
330	0.05
331	0.06
332	0.06
333	0.08
334	0.08
335	0.08
336	0.08
337	0.1
338	0.1
339	0.1
340	0.12
341	0.13
342	0.14
343	0.15
344	0.15
345	0.14
346	0.13
347	0.12
348	0.11
349	0.1
350	0.09
351	0.09
352	0.09
353	0.1
354	0.1
355	0.09
356	0.09
357	0.09
358	0.09
359	0.1
360	0.15
361	0.17
362	0.17
363	0.17
364	0.17
365	0.19
366	0.19
367	0.17
368	0.17
369	0.18
370	0.19
371	0.2
372	0.19
373	0.17
374	0.18
375	0.17
376	0.12
377	0.08
378	0.07
379	0.06
380	0.06
381	0.06
382	0.05
383	0.06
384	0.08
385	0.08
386	0.1
387	0.1
388	0.1
389	0.11
390	0.11
391	0.11
392	0.1
393	0.1
394	0.09
395	0.1
396	0.1
397	0.1
398	0.11
399	0.15
400	0.21
401	0.22
402	0.24
403	0.23
404	0.29
405	0.38
406	0.48
407	0.56
408	0.6
409	0.69
410	0.79
411	0.88
412	0.93
413	0.94
414	0.94
415	0.93
416	0.94
417	0.93
418	0.93
419	0.94
420	0.94
421	0.94
422	0.95
423	0.94
424	0.93
425	0.92
426	0.87
427	0.83
428	0.8
429	0.73
430	0.65
431	0.6
432	0.51
433	0.47
434	0.43
435	0.37
436	0.3
437	0.28
438	0.28
439	0.26
440	0.25
441	0.22
442	0.2
443	0.19
444	0.19
445	0.17
446	0.15
447	0.12
448	0.1
449	0.09
450	0.07
451	0.06
452	0.06
453	0.05
454	0.03
455	0.04
456	0.04
457	0.05
458	0.05
459	0.06
460	0.08
461	0.08
462	0.09
463	0.13
464	0.13
465	0.13
466	0.16
467	0.16

A2QYA8

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer