Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A395MDM1

Protein Details
Accession A0A395MDM1    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
18-43LESLQRSISPPKKRARKPVAISSPWQHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
28-34PKKRARK
Subcellular Location(s) nucl 17, cyto_nucl 11.333, mito_nucl 10.833, cyto 4.5, mito 3.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR010347  Tdp1  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0008081  F:phosphoric diester hydrolase activity  
GO:0006281  P:DNA repair  
Pfam View protein in Pfam  
PF06087  Tyr-DNA_phospho  
CDD cd09194  PLDc_yTdp1_1  
Amino Acid Sequences MDRPAKRHWTTELGTDGLESLQRSISPPKKRARKPVAISSPWQLTWIRDLPGGDNKDAVTLRDLLGDPLISECWEFNFLHDIPFLMNAFDPDTRDLVDVHLVHGFWKREDENRIELENAAAEFKNVNIHIAPMPEMFGTHHSKMMILFRHDETAQVIIHTANMIPKDWTNMTNGVWKSPLLPKMSNTQGPESSPDDYPVGSGERFKIDLLNYLKSYDKRKITCKPLSDKLKEYDFSAVRAALIASVPGRHNVQDMSETSWGWAALKRCLQHVPCHQHGDSSIAAQVSSIATLGAKDDWLQKTLFDNLSRCKNTGLGRPKFKVVFPTADEIRRSLDGYASGGSIHTKIQSAQQAKQLEYLRPIFHHWANDSSTGASLPDYPLLVSGRKRAAPHIKTYIRSNQSTIDWGLLTSANISKQAWGEAARPTGEMRIASWEVGVLVWPELLEPDSVMVGTYRTDMPDVTQSPVEDEESRPVVGLRIPYNTPLQRYTSNEVPWVASMPHTEPDWAGRSWE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.37
2 0.33
3 0.28
4 0.2
5 0.2
6 0.14
7 0.11
8 0.11
9 0.12
10 0.15
11 0.25
12 0.32
13 0.4
14 0.48
15 0.57
16 0.67
17 0.75
18 0.84
19 0.84
20 0.86
21 0.85
22 0.87
23 0.87
24 0.81
25 0.76
26 0.71
27 0.65
28 0.54
29 0.49
30 0.39
31 0.3
32 0.33
33 0.32
34 0.28
35 0.26
36 0.27
37 0.28
38 0.36
39 0.38
40 0.31
41 0.29
42 0.27
43 0.29
44 0.29
45 0.26
46 0.2
47 0.18
48 0.17
49 0.2
50 0.2
51 0.16
52 0.17
53 0.15
54 0.13
55 0.12
56 0.12
57 0.09
58 0.09
59 0.08
60 0.09
61 0.12
62 0.12
63 0.12
64 0.18
65 0.18
66 0.19
67 0.19
68 0.17
69 0.15
70 0.17
71 0.16
72 0.11
73 0.11
74 0.1
75 0.12
76 0.13
77 0.14
78 0.14
79 0.15
80 0.15
81 0.15
82 0.15
83 0.13
84 0.18
85 0.16
86 0.15
87 0.16
88 0.14
89 0.16
90 0.21
91 0.21
92 0.17
93 0.21
94 0.23
95 0.27
96 0.32
97 0.35
98 0.35
99 0.37
100 0.38
101 0.34
102 0.31
103 0.26
104 0.22
105 0.18
106 0.14
107 0.11
108 0.1
109 0.09
110 0.09
111 0.13
112 0.12
113 0.13
114 0.11
115 0.13
116 0.14
117 0.15
118 0.16
119 0.11
120 0.12
121 0.11
122 0.11
123 0.1
124 0.14
125 0.19
126 0.18
127 0.2
128 0.19
129 0.2
130 0.21
131 0.25
132 0.25
133 0.21
134 0.24
135 0.23
136 0.26
137 0.25
138 0.24
139 0.2
140 0.18
141 0.15
142 0.12
143 0.12
144 0.08
145 0.09
146 0.08
147 0.08
148 0.08
149 0.08
150 0.09
151 0.09
152 0.1
153 0.14
154 0.15
155 0.15
156 0.16
157 0.17
158 0.18
159 0.24
160 0.24
161 0.21
162 0.2
163 0.19
164 0.19
165 0.23
166 0.26
167 0.23
168 0.24
169 0.25
170 0.31
171 0.35
172 0.36
173 0.33
174 0.32
175 0.29
176 0.28
177 0.3
178 0.26
179 0.24
180 0.2
181 0.19
182 0.17
183 0.15
184 0.14
185 0.12
186 0.11
187 0.09
188 0.1
189 0.1
190 0.11
191 0.11
192 0.11
193 0.12
194 0.11
195 0.18
196 0.2
197 0.22
198 0.21
199 0.22
200 0.25
201 0.26
202 0.3
203 0.3
204 0.33
205 0.34
206 0.41
207 0.48
208 0.54
209 0.58
210 0.6
211 0.6
212 0.62
213 0.67
214 0.64
215 0.6
216 0.54
217 0.52
218 0.45
219 0.4
220 0.37
221 0.28
222 0.25
223 0.22
224 0.18
225 0.14
226 0.14
227 0.13
228 0.06
229 0.06
230 0.05
231 0.04
232 0.06
233 0.06
234 0.07
235 0.08
236 0.08
237 0.09
238 0.09
239 0.09
240 0.1
241 0.11
242 0.13
243 0.13
244 0.13
245 0.12
246 0.13
247 0.12
248 0.1
249 0.12
250 0.09
251 0.12
252 0.15
253 0.15
254 0.17
255 0.22
256 0.23
257 0.27
258 0.35
259 0.38
260 0.39
261 0.44
262 0.42
263 0.38
264 0.37
265 0.33
266 0.24
267 0.17
268 0.15
269 0.1
270 0.1
271 0.09
272 0.09
273 0.06
274 0.06
275 0.05
276 0.03
277 0.03
278 0.03
279 0.04
280 0.04
281 0.04
282 0.05
283 0.11
284 0.12
285 0.13
286 0.14
287 0.14
288 0.15
289 0.19
290 0.21
291 0.18
292 0.2
293 0.22
294 0.31
295 0.32
296 0.3
297 0.27
298 0.29
299 0.3
300 0.36
301 0.42
302 0.41
303 0.47
304 0.48
305 0.52
306 0.49
307 0.47
308 0.44
309 0.37
310 0.34
311 0.29
312 0.33
313 0.31
314 0.33
315 0.33
316 0.27
317 0.25
318 0.22
319 0.21
320 0.15
321 0.14
322 0.11
323 0.11
324 0.11
325 0.09
326 0.08
327 0.08
328 0.08
329 0.08
330 0.08
331 0.08
332 0.08
333 0.08
334 0.13
335 0.2
336 0.23
337 0.26
338 0.32
339 0.34
340 0.34
341 0.4
342 0.38
343 0.32
344 0.33
345 0.33
346 0.28
347 0.27
348 0.3
349 0.28
350 0.28
351 0.29
352 0.26
353 0.27
354 0.28
355 0.28
356 0.25
357 0.2
358 0.18
359 0.15
360 0.13
361 0.1
362 0.09
363 0.08
364 0.08
365 0.08
366 0.08
367 0.09
368 0.11
369 0.14
370 0.15
371 0.19
372 0.23
373 0.26
374 0.27
375 0.34
376 0.42
377 0.43
378 0.49
379 0.53
380 0.54
381 0.54
382 0.59
383 0.61
384 0.56
385 0.54
386 0.49
387 0.42
388 0.38
389 0.38
390 0.33
391 0.25
392 0.19
393 0.17
394 0.16
395 0.13
396 0.12
397 0.1
398 0.11
399 0.11
400 0.12
401 0.12
402 0.13
403 0.13
404 0.15
405 0.14
406 0.15
407 0.16
408 0.19
409 0.21
410 0.2
411 0.2
412 0.19
413 0.19
414 0.19
415 0.17
416 0.14
417 0.18
418 0.18
419 0.18
420 0.17
421 0.15
422 0.13
423 0.13
424 0.13
425 0.07
426 0.06
427 0.06
428 0.06
429 0.06
430 0.06
431 0.07
432 0.07
433 0.06
434 0.06
435 0.07
436 0.07
437 0.07
438 0.06
439 0.06
440 0.07
441 0.09
442 0.09
443 0.1
444 0.11
445 0.11
446 0.13
447 0.21
448 0.22
449 0.23
450 0.24
451 0.23
452 0.25
453 0.26
454 0.27
455 0.21
456 0.21
457 0.23
458 0.24
459 0.23
460 0.21
461 0.2
462 0.19
463 0.19
464 0.23
465 0.2
466 0.22
467 0.24
468 0.26
469 0.35
470 0.37
471 0.38
472 0.37
473 0.39
474 0.4
475 0.45
476 0.49
477 0.48
478 0.47
479 0.46
480 0.44
481 0.4
482 0.36
483 0.32
484 0.25
485 0.2
486 0.21
487 0.2
488 0.22
489 0.21
490 0.21
491 0.2
492 0.24
493 0.26