Proteins with Predicted NoLSs

Proteins containing predicted nucleolar localization signals available in the database.

A0A395MD50

Protein Details
Accession A0A395MD50    Localization Confidence High Confidence Score 22.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
4-26MRNAVARRPHRERAQPLERKRLGBasic
39-58QDFNKKKKTLKNLQSKADERHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
12-17PHRERA
22-23RK
241-264MAKTKTSGGTTRKGKKIMIRARKR
Subcellular Location(s) nucl 24, mito 1, cyto 1, vacu 1, cyto_mito 1
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007144  SSU_processome_Utp11  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0032040  C:small-subunit processome  
GO:0006364  P:rRNA processing  
Pfam View protein in Pfam  
PF03998  Utp11  
Amino Acid Sequences MSSMRNAVARRPHRERAQPLERKRLGLLEKHKDYTLRAQDFNKKKKTLKNLQSKADERNEDEFYFGMMSRKGPGSKLKDGKKWQGTVAGDRGNKSLDVDTVRLLKTQDLGYVRTMRQVVSKEVAQLEEQVVLTRGFDKLDEDEEEEEDDGSDSEFDFATAPSKPKAPRKIVFMDDEQEREEILGDRLDMDDEDNEKKEGGKDEEERVKSLRRLRSQLENARKKLKVLTDAEHELEIQRAKMAKTKTSGGTTRKGKKIMIRARKR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.76
2 0.78
3 0.78
4 0.81
5 0.81
6 0.81
7 0.83
8 0.77
9 0.7
10 0.63
11 0.6
12 0.53
13 0.52
14 0.54
15 0.54
16 0.56
17 0.56
18 0.57
19 0.51
20 0.5
21 0.51
22 0.51
23 0.46
24 0.44
25 0.48
26 0.56
27 0.65
28 0.71
29 0.7
30 0.66
31 0.68
32 0.72
33 0.77
34 0.78
35 0.78
36 0.8
37 0.79
38 0.8
39 0.82
40 0.77
41 0.74
42 0.71
43 0.64
44 0.56
45 0.53
46 0.48
47 0.4
48 0.37
49 0.29
50 0.22
51 0.2
52 0.16
53 0.13
54 0.1
55 0.11
56 0.12
57 0.15
58 0.15
59 0.17
60 0.25
61 0.3
62 0.39
63 0.47
64 0.51
65 0.57
66 0.63
67 0.7
68 0.68
69 0.63
70 0.55
71 0.53
72 0.48
73 0.44
74 0.42
75 0.39
76 0.33
77 0.32
78 0.32
79 0.26
80 0.24
81 0.21
82 0.16
83 0.12
84 0.13
85 0.13
86 0.14
87 0.16
88 0.16
89 0.16
90 0.15
91 0.13
92 0.13
93 0.13
94 0.15
95 0.14
96 0.15
97 0.16
98 0.2
99 0.19
100 0.21
101 0.21
102 0.17
103 0.19
104 0.2
105 0.19
106 0.18
107 0.18
108 0.17
109 0.17
110 0.17
111 0.14
112 0.13
113 0.11
114 0.09
115 0.09
116 0.07
117 0.08
118 0.07
119 0.07
120 0.07
121 0.07
122 0.06
123 0.06
124 0.07
125 0.07
126 0.08
127 0.09
128 0.1
129 0.1
130 0.11
131 0.11
132 0.1
133 0.09
134 0.07
135 0.06
136 0.05
137 0.04
138 0.04
139 0.04
140 0.04
141 0.04
142 0.04
143 0.04
144 0.05
145 0.06
146 0.08
147 0.09
148 0.1
149 0.14
150 0.19
151 0.27
152 0.36
153 0.43
154 0.45
155 0.5
156 0.55
157 0.53
158 0.52
159 0.46
160 0.41
161 0.35
162 0.32
163 0.27
164 0.21
165 0.18
166 0.14
167 0.13
168 0.1
169 0.09
170 0.08
171 0.07
172 0.08
173 0.08
174 0.08
175 0.07
176 0.07
177 0.08
178 0.1
179 0.12
180 0.13
181 0.14
182 0.13
183 0.14
184 0.16
185 0.19
186 0.21
187 0.24
188 0.27
189 0.34
190 0.42
191 0.42
192 0.42
193 0.4
194 0.41
195 0.41
196 0.46
197 0.47
198 0.47
199 0.51
200 0.54
201 0.61
202 0.66
203 0.7
204 0.73
205 0.74
206 0.72
207 0.74
208 0.71
209 0.62
210 0.58
211 0.54
212 0.51
213 0.47
214 0.46
215 0.45
216 0.48
217 0.47
218 0.41
219 0.36
220 0.28
221 0.27
222 0.23
223 0.16
224 0.16
225 0.17
226 0.18
227 0.23
228 0.27
229 0.29
230 0.32
231 0.38
232 0.4
233 0.44
234 0.51
235 0.5
236 0.56
237 0.6
238 0.66
239 0.67
240 0.66
241 0.63
242 0.64
243 0.7
244 0.71