FuNGI

A0A395MFA7

Protein Details

Accession

A0A395MFA7

Localization Confidence

High

Confidence Score

23.2

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
17-51	HPNGASKSKKANPLRPMRKKPANPMVSRRPPPRPA	Hydrophilic
182-208	APVAKDPNPKRPKKQKEEKTTFNRAPK	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
20-52	GASKSKKANPLRPMRKKPANPMVSRRPPPRPAA
186-200	KDPNPKRPKKQKEEK
483-507	GTNTPSGKKPEGSKKSKSLKRAGSP
519-522	RKKL

Subcellular Location(s)

nucl 24, cyto 2

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR008851 TFIIF-alpha IPR011039 TFIIF_interaction
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003677 F:DNA binding GO:0003743 F:translation initiation factor activity GO:0032968 P:positive regulation of transcription elongation by RNA polymerase II GO:0006367 P:transcription initiation at RNA polymerase II promoter

Amino Acid Sequences

MSAPPPPGNPPANAPAHPNGASKSKKANPLRPMRKKPANPMVSRRPPPRPAAPSGSGAQNGAKPNIEEIRRQNGGWSEPPPAVYSDIPIMTTKKALLDGIRYHMMKFTQSKVGDRSIDPTDQDDFARPVTLHRRDARQPPPGRAVKVEAPEAPQPDEQEAERLAQVKAEREAQRAIDQAKIAPVAKDPNPKRPKKQKEEKTTFNRAPKTDAAKKESDLRYEEALPWHLEDAEGKNVWVGNYVSALSESNVAFMIDQSVFRMVPLEKWYRFTSKPPFQPYTIDEAEALMNKKVDVGRWVMKDEEKRAGRQDLEATRRMFYGGGQMVKTESATFKAASRSEKLDHDDIDFSGDEFQDDDEAPMFERNDDEDTKDAKERIRREQLGANLFGEGDEGEVDKELDEQLQEEIMRQKLGKTTKKALIKRDQENIYESDDSENNPWSSSSDDNSSDEDEDEEKKDEEKKDEEKKETGKDDKAQSGSGSKGTNTPSGKKPEGSKKSKSLKRAGSPALSESSGNESSRKKLKKNVTSAADSRSGTPLPQGAAARRAMGAGSGSDGEATAGEMSDGAASKRKKLKLVSHSARGTPSASRAGSPNPPGATSPGSPGGSIVEPAEILEKIPDEGITIGELIKLFNHRLGDRPGQMPKTEWIQLVKRICAYGSDKRLRRRS

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.43
2	0.4
3	0.42
4	0.43
5	0.4
6	0.35
7	0.39
8	0.42
9	0.41
10	0.46
11	0.48
12	0.56
13	0.63
14	0.69
15	0.7
16	0.77
17	0.84
18	0.85
19	0.89
20	0.89
21	0.9
22	0.89
23	0.89
24	0.89
25	0.87
26	0.84
27	0.83
28	0.84
29	0.84
30	0.85
31	0.82
32	0.8
33	0.77
34	0.77
35	0.77
36	0.72
37	0.69
38	0.69
39	0.64
40	0.59
41	0.55
42	0.52
43	0.42
44	0.37
45	0.32
46	0.28
47	0.28
48	0.26
49	0.25
50	0.21
51	0.25
52	0.31
53	0.31
54	0.33
55	0.36
56	0.43
57	0.43
58	0.43
59	0.43
60	0.4
61	0.42
62	0.4
63	0.37
64	0.32
65	0.31
66	0.32
67	0.28
68	0.26
69	0.24
70	0.2
71	0.19
72	0.19
73	0.18
74	0.18
75	0.19
76	0.19
77	0.17
78	0.19
79	0.17
80	0.15
81	0.16
82	0.17
83	0.17
84	0.22
85	0.24
86	0.27
87	0.32
88	0.31
89	0.3
90	0.32
91	0.3
92	0.29
93	0.3
94	0.29
95	0.32
96	0.33
97	0.37
98	0.38
99	0.42
100	0.4
101	0.37
102	0.37
103	0.33
104	0.33
105	0.3
106	0.28
107	0.25
108	0.23
109	0.23
110	0.22
111	0.19
112	0.17
113	0.19
114	0.16
115	0.2
116	0.28
117	0.33
118	0.38
119	0.42
120	0.48
121	0.53
122	0.62
123	0.64
124	0.65
125	0.64
126	0.63
127	0.68
128	0.66
129	0.61
130	0.54
131	0.52
132	0.47
133	0.45
134	0.41
135	0.33
136	0.32
137	0.33
138	0.33
139	0.31
140	0.26
141	0.24
142	0.23
143	0.23
144	0.19
145	0.18
146	0.17
147	0.15
148	0.15
149	0.16
150	0.14
151	0.16
152	0.17
153	0.17
154	0.18
155	0.25
156	0.26
157	0.27
158	0.3
159	0.29
160	0.3
161	0.31
162	0.3
163	0.24
164	0.22
165	0.21
166	0.2
167	0.2
168	0.18
169	0.15
170	0.16
171	0.18
172	0.23
173	0.32
174	0.33
175	0.42
176	0.52
177	0.58
178	0.67
179	0.73
180	0.79
181	0.8
182	0.88
183	0.87
184	0.89
185	0.91
186	0.9
187	0.88
188	0.87
189	0.82
190	0.79
191	0.75
192	0.64
193	0.6
194	0.56
195	0.56
196	0.54
197	0.53
198	0.51
199	0.47
200	0.47
201	0.52
202	0.49
203	0.44
204	0.38
205	0.35
206	0.32
207	0.31
208	0.31
209	0.24
210	0.23
211	0.2
212	0.18
213	0.16
214	0.13
215	0.11
216	0.11
217	0.12
218	0.14
219	0.13
220	0.12
221	0.13
222	0.13
223	0.13
224	0.14
225	0.11
226	0.08
227	0.09
228	0.09
229	0.08
230	0.08
231	0.09
232	0.07
233	0.09
234	0.08
235	0.08
236	0.08
237	0.08
238	0.07
239	0.07
240	0.09
241	0.06
242	0.07
243	0.07
244	0.08
245	0.08
246	0.08
247	0.1
248	0.08
249	0.1
250	0.16
251	0.21
252	0.21
253	0.25
254	0.28
255	0.3
256	0.32
257	0.36
258	0.41
259	0.43
260	0.49
261	0.53
262	0.53
263	0.49
264	0.51
265	0.47
266	0.44
267	0.37
268	0.3
269	0.22
270	0.2
271	0.19
272	0.18
273	0.16
274	0.1
275	0.09
276	0.09
277	0.11
278	0.1
279	0.1
280	0.1
281	0.14
282	0.18
283	0.19
284	0.2
285	0.2
286	0.23
287	0.26
288	0.27
289	0.31
290	0.27
291	0.28
292	0.3
293	0.31
294	0.28
295	0.27
296	0.3
297	0.27
298	0.3
299	0.33
300	0.31
301	0.29
302	0.28
303	0.27
304	0.21
305	0.15
306	0.17
307	0.14
308	0.15
309	0.14
310	0.14
311	0.14
312	0.14
313	0.14
314	0.09
315	0.07
316	0.07
317	0.08
318	0.09
319	0.1
320	0.13
321	0.15
322	0.17
323	0.18
324	0.19
325	0.2
326	0.22
327	0.24
328	0.23
329	0.22
330	0.21
331	0.19
332	0.16
333	0.16
334	0.14
335	0.1
336	0.1
337	0.09
338	0.07
339	0.07
340	0.07
341	0.06
342	0.06
343	0.06
344	0.05
345	0.05
346	0.06
347	0.07
348	0.07
349	0.06
350	0.07
351	0.08
352	0.1
353	0.11
354	0.12
355	0.13
356	0.15
357	0.16
358	0.18
359	0.18
360	0.19
361	0.25
362	0.28
363	0.34
364	0.41
365	0.41
366	0.42
367	0.45
368	0.47
369	0.44
370	0.41
371	0.32
372	0.23
373	0.21
374	0.18
375	0.14
376	0.08
377	0.05
378	0.04
379	0.04
380	0.04
381	0.04
382	0.04
383	0.04
384	0.04
385	0.04
386	0.05
387	0.04
388	0.05
389	0.05
390	0.06
391	0.06
392	0.07
393	0.1
394	0.11
395	0.12
396	0.11
397	0.13
398	0.17
399	0.26
400	0.31
401	0.34
402	0.4
403	0.46
404	0.54
405	0.58
406	0.61
407	0.63
408	0.64
409	0.63
410	0.65
411	0.61
412	0.54
413	0.52
414	0.45
415	0.39
416	0.31
417	0.26
418	0.2
419	0.18
420	0.18
421	0.16
422	0.17
423	0.14
424	0.14
425	0.13
426	0.12
427	0.14
428	0.14
429	0.15
430	0.15
431	0.17
432	0.18
433	0.19
434	0.2
435	0.18
436	0.16
437	0.16
438	0.14
439	0.14
440	0.14
441	0.14
442	0.14
443	0.15
444	0.21
445	0.22
446	0.25
447	0.29
448	0.36
449	0.45
450	0.51
451	0.54
452	0.54
453	0.56
454	0.58
455	0.59
456	0.56
457	0.51
458	0.51
459	0.51
460	0.5
461	0.46
462	0.41
463	0.35
464	0.32
465	0.28
466	0.25
467	0.21
468	0.16
469	0.19
470	0.21
471	0.26
472	0.26
473	0.3
474	0.34
475	0.4
476	0.42
477	0.42
478	0.48
479	0.52
480	0.59
481	0.62
482	0.62
483	0.65
484	0.73
485	0.75
486	0.75
487	0.73
488	0.72
489	0.71
490	0.72
491	0.67
492	0.61
493	0.57
494	0.51
495	0.45
496	0.36
497	0.29
498	0.22
499	0.23
500	0.22
501	0.21
502	0.23
503	0.22
504	0.27
505	0.36
506	0.42
507	0.41
508	0.47
509	0.57
510	0.63
511	0.7
512	0.73
513	0.7
514	0.7
515	0.68
516	0.63
517	0.58
518	0.48
519	0.41
520	0.35
521	0.3
522	0.23
523	0.22
524	0.2
525	0.16
526	0.19
527	0.19
528	0.18
529	0.22
530	0.23
531	0.22
532	0.2
533	0.19
534	0.15
535	0.14
536	0.12
537	0.08
538	0.08
539	0.08
540	0.08
541	0.07
542	0.07
543	0.07
544	0.06
545	0.06
546	0.05
547	0.04
548	0.04
549	0.04
550	0.05
551	0.06
552	0.06
553	0.07
554	0.14
555	0.15
556	0.23
557	0.31
558	0.35
559	0.4
560	0.48
561	0.57
562	0.61
563	0.71
564	0.71
565	0.72
566	0.72
567	0.69
568	0.63
569	0.54
570	0.46
571	0.37
572	0.33
573	0.3
574	0.27
575	0.25
576	0.26
577	0.29
578	0.34
579	0.35
580	0.37
581	0.32
582	0.32
583	0.32
584	0.33
585	0.32
586	0.27
587	0.27
588	0.28
589	0.27
590	0.25
591	0.24
592	0.24
593	0.2
594	0.2
595	0.16
596	0.1
597	0.1
598	0.1
599	0.12
600	0.09
601	0.09
602	0.1
603	0.1
604	0.1
605	0.11
606	0.1
607	0.09
608	0.1
609	0.1
610	0.09
611	0.09
612	0.08
613	0.09
614	0.09
615	0.08
616	0.11
617	0.14
618	0.14
619	0.18
620	0.22
621	0.22
622	0.27
623	0.34
624	0.4
625	0.41
626	0.46
627	0.51
628	0.5
629	0.5
630	0.48
631	0.45
632	0.43
633	0.42
634	0.39
635	0.38
636	0.4
637	0.46
638	0.49
639	0.48
640	0.44
641	0.41
642	0.38
643	0.38
644	0.4
645	0.41
646	0.46
647	0.52
648	0.57

A0A395MFA7

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer