Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A2QB18

Protein Details
Accession A2QB18    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
334-361VFQPGETRPTRPKKKIIKKAEISGQKRNHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
342-355PTRPKKKIIKKAEI
Subcellular Location(s) mito 10, cyto_mito 8.5, nucl 8, cyto 5, pero 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR011068  NuclTrfase_I-like_C  
IPR007012  PolA_pol_cen_dom  
IPR007010  PolA_pol_RNA-bd_dom  
Gene Ontology GO:0005829  C:cytosol  
GO:0033620  C:Mei2 nuclear dot complex  
GO:0005847  C:mRNA cleavage and polyadenylation specificity factor complex  
GO:1990251  C:nuclear exosome focus  
GO:0005524  F:ATP binding  
GO:0000287  F:magnesium ion binding  
GO:1990817  F:poly(A) RNA polymerase activity  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0006378  P:mRNA polyadenylation  
GO:0033621  P:nuclear-transcribed mRNA catabolic process, meiosis-specific transcripts  
GO:0098789  P:pre-mRNA cleavage required for polyadenylation  
GO:0071050  P:sno(s)RNA polyadenylation  
Pfam View protein in Pfam  
PF04928  PAP_central  
PF04926  PAP_RNA-bind  
Amino Acid Sequences NITGLLCAPSSLWAQRRAIYSNIVGFPGGVAWAMLVARVCQLYPQATGSVIVGKFFRIMNKWAWPQPVLLKPIEDGPLQMKVWNPKIYHGDRFHLMPIITPAYPSMCATHNVSMSTKAVILRELQRGGDIVDKIFLKQLRWEDLFARHTFFTKDYKYYLSITASSRTKEAESVWSGLVESKIRHLVGALDRKATIAIAHPFPKGFERVHRVSSEEEIEAVKTGSTKYQDKGTKTETTDEMKDAAHQAAAQNGAENTDVAAAENKPVDDTHVMYTTTYYIGLELKPLEPGASRSLDISTDAQIFKSTCTSWPGYQPGINDLAITHVRNFDLPEDVFQPGETRPTRPKKKIIKKAEISGQKRNIESLDVSARKKAKVAYEQRTGYHTNFDSSQVA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.31
2 0.36
3 0.39
4 0.4
5 0.4
6 0.38
7 0.36
8 0.36
9 0.35
10 0.32
11 0.27
12 0.24
13 0.21
14 0.17
15 0.13
16 0.07
17 0.05
18 0.04
19 0.05
20 0.05
21 0.06
22 0.06
23 0.06
24 0.08
25 0.09
26 0.09
27 0.09
28 0.13
29 0.14
30 0.15
31 0.17
32 0.16
33 0.16
34 0.17
35 0.16
36 0.19
37 0.17
38 0.16
39 0.15
40 0.14
41 0.16
42 0.16
43 0.2
44 0.17
45 0.21
46 0.24
47 0.32
48 0.38
49 0.41
50 0.44
51 0.4
52 0.4
53 0.44
54 0.45
55 0.41
56 0.36
57 0.32
58 0.29
59 0.31
60 0.3
61 0.23
62 0.18
63 0.17
64 0.21
65 0.2
66 0.21
67 0.21
68 0.26
69 0.32
70 0.37
71 0.35
72 0.36
73 0.44
74 0.47
75 0.53
76 0.49
77 0.47
78 0.43
79 0.44
80 0.39
81 0.34
82 0.29
83 0.21
84 0.21
85 0.2
86 0.18
87 0.16
88 0.15
89 0.13
90 0.14
91 0.14
92 0.13
93 0.11
94 0.13
95 0.17
96 0.2
97 0.19
98 0.2
99 0.2
100 0.21
101 0.2
102 0.18
103 0.17
104 0.14
105 0.13
106 0.13
107 0.16
108 0.18
109 0.22
110 0.22
111 0.21
112 0.2
113 0.19
114 0.19
115 0.2
116 0.15
117 0.11
118 0.13
119 0.13
120 0.13
121 0.17
122 0.17
123 0.14
124 0.18
125 0.21
126 0.24
127 0.26
128 0.27
129 0.26
130 0.3
131 0.34
132 0.3
133 0.29
134 0.23
135 0.23
136 0.23
137 0.22
138 0.22
139 0.21
140 0.22
141 0.21
142 0.23
143 0.24
144 0.24
145 0.24
146 0.21
147 0.2
148 0.2
149 0.24
150 0.23
151 0.22
152 0.21
153 0.2
154 0.18
155 0.17
156 0.16
157 0.16
158 0.16
159 0.17
160 0.16
161 0.15
162 0.15
163 0.14
164 0.14
165 0.11
166 0.09
167 0.09
168 0.11
169 0.11
170 0.11
171 0.1
172 0.12
173 0.17
174 0.24
175 0.23
176 0.22
177 0.22
178 0.22
179 0.22
180 0.18
181 0.13
182 0.09
183 0.1
184 0.12
185 0.14
186 0.14
187 0.14
188 0.15
189 0.16
190 0.16
191 0.14
192 0.17
193 0.22
194 0.25
195 0.27
196 0.27
197 0.27
198 0.26
199 0.27
200 0.23
201 0.16
202 0.14
203 0.12
204 0.11
205 0.1
206 0.09
207 0.07
208 0.05
209 0.06
210 0.08
211 0.11
212 0.14
213 0.14
214 0.23
215 0.27
216 0.29
217 0.34
218 0.36
219 0.38
220 0.37
221 0.39
222 0.34
223 0.33
224 0.32
225 0.28
226 0.25
227 0.19
228 0.19
229 0.17
230 0.14
231 0.1
232 0.09
233 0.09
234 0.09
235 0.1
236 0.09
237 0.09
238 0.08
239 0.09
240 0.09
241 0.08
242 0.06
243 0.06
244 0.06
245 0.06
246 0.08
247 0.07
248 0.08
249 0.09
250 0.09
251 0.09
252 0.09
253 0.11
254 0.11
255 0.12
256 0.13
257 0.15
258 0.15
259 0.15
260 0.15
261 0.14
262 0.12
263 0.11
264 0.08
265 0.07
266 0.08
267 0.08
268 0.09
269 0.1
270 0.1
271 0.1
272 0.1
273 0.1
274 0.1
275 0.12
276 0.14
277 0.14
278 0.14
279 0.14
280 0.15
281 0.15
282 0.16
283 0.15
284 0.14
285 0.15
286 0.15
287 0.15
288 0.16
289 0.16
290 0.15
291 0.17
292 0.15
293 0.14
294 0.19
295 0.23
296 0.23
297 0.29
298 0.32
299 0.32
300 0.33
301 0.31
302 0.3
303 0.29
304 0.26
305 0.2
306 0.16
307 0.18
308 0.18
309 0.18
310 0.16
311 0.15
312 0.16
313 0.17
314 0.18
315 0.15
316 0.17
317 0.17
318 0.18
319 0.19
320 0.19
321 0.18
322 0.17
323 0.18
324 0.14
325 0.21
326 0.2
327 0.23
328 0.33
329 0.44
330 0.54
331 0.6
332 0.7
333 0.73
334 0.82
335 0.88
336 0.89
337 0.89
338 0.86
339 0.86
340 0.86
341 0.85
342 0.8
343 0.79
344 0.77
345 0.71
346 0.64
347 0.58
348 0.5
349 0.43
350 0.38
351 0.33
352 0.34
353 0.35
354 0.36
355 0.41
356 0.43
357 0.41
358 0.43
359 0.42
360 0.41
361 0.46
362 0.55
363 0.56
364 0.62
365 0.65
366 0.63
367 0.64
368 0.59
369 0.5
370 0.48
371 0.41
372 0.35
373 0.33