Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A2Q7B4

Protein Details
Accession A2Q7B4    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
30-49ADPLVRPKRRPAIRPPAPTSHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
22-45VRIRRPKVADPLVRPKRRPAIRPP
Subcellular Location(s) nucl 22.5, cyto_nucl 13.5, cyto 3.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR008851  TFIIF-alpha  
IPR011039  TFIIF_interaction  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0032968  P:positive regulation of transcription elongation by RNA polymerase II  
GO:0006367  P:transcription initiation at RNA polymerase II promoter  
Pfam View protein in Pfam  
PF05793  TFIIF_alpha  
Amino Acid Sequences MTTPTNDQTLKTPTGSNGPPPVRIRRPKVADPLVRPKRRPAIRPPAPTSAANGASRMPNSRPVTSSQLPGARVEKSLNPKNDFSANGFSGPLLSENYVDYPIVTTRRALREGLKHHIARFTSKKSVDPRDESQFTRPVRLQRRDPRARPNEAHVERGQLNSKPGSEQSTQMDELEREELEARKAAREKERAENMAQIAPSVGSAPKRHNAPKQKTQQVTKTDMTPEEIARTRIKYEEALPWHLEDFDNKNIWVGNYEAALSETHAVFVLENTGKMRMIPVEKWYRFSAKNTFKALTIEEAERL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.35
2 0.36
3 0.37
4 0.4
5 0.39
6 0.45
7 0.48
8 0.55
9 0.58
10 0.65
11 0.67
12 0.68
13 0.73
14 0.74
15 0.78
16 0.79
17 0.76
18 0.75
19 0.79
20 0.79
21 0.8
22 0.74
23 0.73
24 0.73
25 0.73
26 0.72
27 0.72
28 0.72
29 0.74
30 0.81
31 0.78
32 0.75
33 0.71
34 0.64
35 0.57
36 0.52
37 0.47
38 0.38
39 0.32
40 0.27
41 0.26
42 0.27
43 0.26
44 0.22
45 0.27
46 0.3
47 0.32
48 0.32
49 0.34
50 0.41
51 0.39
52 0.4
53 0.36
54 0.35
55 0.34
56 0.35
57 0.33
58 0.26
59 0.25
60 0.24
61 0.25
62 0.3
63 0.37
64 0.41
65 0.43
66 0.43
67 0.44
68 0.45
69 0.41
70 0.36
71 0.34
72 0.28
73 0.24
74 0.23
75 0.2
76 0.17
77 0.16
78 0.13
79 0.08
80 0.08
81 0.07
82 0.08
83 0.09
84 0.09
85 0.09
86 0.08
87 0.08
88 0.1
89 0.11
90 0.11
91 0.12
92 0.16
93 0.2
94 0.22
95 0.22
96 0.25
97 0.31
98 0.35
99 0.4
100 0.42
101 0.4
102 0.39
103 0.42
104 0.38
105 0.37
106 0.38
107 0.36
108 0.36
109 0.36
110 0.4
111 0.43
112 0.5
113 0.49
114 0.5
115 0.49
116 0.49
117 0.51
118 0.47
119 0.44
120 0.43
121 0.37
122 0.36
123 0.34
124 0.35
125 0.41
126 0.45
127 0.51
128 0.54
129 0.64
130 0.69
131 0.71
132 0.74
133 0.71
134 0.72
135 0.64
136 0.6
137 0.6
138 0.52
139 0.51
140 0.4
141 0.37
142 0.31
143 0.31
144 0.29
145 0.19
146 0.2
147 0.17
148 0.17
149 0.14
150 0.14
151 0.17
152 0.16
153 0.17
154 0.18
155 0.2
156 0.2
157 0.19
158 0.2
159 0.15
160 0.15
161 0.14
162 0.11
163 0.08
164 0.09
165 0.1
166 0.1
167 0.12
168 0.11
169 0.14
170 0.17
171 0.21
172 0.27
173 0.32
174 0.35
175 0.42
176 0.46
177 0.45
178 0.43
179 0.42
180 0.37
181 0.33
182 0.28
183 0.2
184 0.15
185 0.12
186 0.11
187 0.08
188 0.08
189 0.09
190 0.12
191 0.15
192 0.19
193 0.25
194 0.31
195 0.39
196 0.49
197 0.55
198 0.63
199 0.69
200 0.74
201 0.75
202 0.76
203 0.75
204 0.7
205 0.68
206 0.6
207 0.53
208 0.47
209 0.41
210 0.38
211 0.32
212 0.27
213 0.25
214 0.25
215 0.25
216 0.25
217 0.26
218 0.24
219 0.23
220 0.24
221 0.21
222 0.23
223 0.27
224 0.29
225 0.31
226 0.31
227 0.3
228 0.29
229 0.28
230 0.25
231 0.21
232 0.21
233 0.22
234 0.23
235 0.22
236 0.22
237 0.22
238 0.22
239 0.2
240 0.17
241 0.13
242 0.11
243 0.12
244 0.11
245 0.11
246 0.11
247 0.1
248 0.11
249 0.1
250 0.09
251 0.09
252 0.09
253 0.09
254 0.09
255 0.14
256 0.12
257 0.13
258 0.14
259 0.16
260 0.16
261 0.16
262 0.17
263 0.17
264 0.2
265 0.22
266 0.3
267 0.39
268 0.4
269 0.44
270 0.47
271 0.49
272 0.47
273 0.51
274 0.53
275 0.52
276 0.58
277 0.6
278 0.57
279 0.52
280 0.51
281 0.48
282 0.42
283 0.36