Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A372RKD5

Protein Details
Accession A0A372RKD5    Localization Confidence Medium Confidence Score 13
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
90-111EDGSRKRGKKRVTNNPNPGRGNBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
94-122RKRGKKRVTNNPNPGRGNEFKRITKRVKV
Subcellular Location(s) nucl 20.5, cyto_nucl 13.833, cyto 4, cyto_pero 2.999
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR009057  Homeobox-like_sf  
IPR017930  Myb_dom  
IPR001005  SANT/Myb  
Pfam View protein in Pfam  
PF00249  Myb_DNA-binding  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51294  HTH_MYB  
CDD cd11660  SANT_TRF  
Amino Acid Sequences MDPKVTELSSKDQNDSSVNSVGKTEEPNNDKSLTYDLSRKTTRQETKESHSSSSSISQLPEQQTVDYMQTSSEESSTEQNSSNSSIEQTEDGSRKRGKKRVTNNPNPGRGNEFKRITKRVKVKWNERELHALEEGIRQYGKSWTNIKKKYGSEGQVLERRTQTQLKDKARSEFVRRLRDGVELGDFEIMDSI
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.35
2 0.35
3 0.33
4 0.3
5 0.27
6 0.25
7 0.24
8 0.23
9 0.23
10 0.24
11 0.24
12 0.27
13 0.3
14 0.33
15 0.35
16 0.35
17 0.33
18 0.3
19 0.3
20 0.24
21 0.23
22 0.26
23 0.26
24 0.32
25 0.35
26 0.34
27 0.37
28 0.44
29 0.5
30 0.49
31 0.55
32 0.53
33 0.58
34 0.66
35 0.62
36 0.55
37 0.48
38 0.43
39 0.36
40 0.34
41 0.28
42 0.2
43 0.19
44 0.18
45 0.21
46 0.23
47 0.23
48 0.21
49 0.18
50 0.18
51 0.18
52 0.18
53 0.13
54 0.11
55 0.08
56 0.08
57 0.09
58 0.09
59 0.08
60 0.07
61 0.08
62 0.11
63 0.12
64 0.12
65 0.12
66 0.12
67 0.13
68 0.15
69 0.14
70 0.12
71 0.11
72 0.1
73 0.1
74 0.1
75 0.1
76 0.11
77 0.13
78 0.14
79 0.18
80 0.22
81 0.28
82 0.35
83 0.4
84 0.44
85 0.5
86 0.6
87 0.67
88 0.73
89 0.76
90 0.8
91 0.81
92 0.82
93 0.74
94 0.65
95 0.6
96 0.54
97 0.49
98 0.46
99 0.43
100 0.41
101 0.46
102 0.52
103 0.51
104 0.54
105 0.57
106 0.57
107 0.63
108 0.67
109 0.72
110 0.74
111 0.79
112 0.74
113 0.68
114 0.67
115 0.58
116 0.52
117 0.42
118 0.32
119 0.23
120 0.22
121 0.2
122 0.14
123 0.13
124 0.1
125 0.11
126 0.16
127 0.18
128 0.2
129 0.27
130 0.36
131 0.46
132 0.52
133 0.56
134 0.57
135 0.57
136 0.59
137 0.6
138 0.54
139 0.5
140 0.49
141 0.51
142 0.49
143 0.49
144 0.45
145 0.39
146 0.37
147 0.36
148 0.36
149 0.34
150 0.39
151 0.47
152 0.52
153 0.59
154 0.6
155 0.62
156 0.65
157 0.66
158 0.64
159 0.64
160 0.64
161 0.66
162 0.63
163 0.6
164 0.53
165 0.51
166 0.44
167 0.37
168 0.32
169 0.23
170 0.22
171 0.2
172 0.18