FuNGI

A0A372QIQ9

Protein Details

Accession

A0A372QIQ9

Localization Confidence

High

Confidence Score

16.5

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
1-28	MARAKKRDNDRWMMRRWGKQNDNEKKIA	Hydrophilic
442-462	TIIKAFRKRIHEDARNKERLL	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
183-222	PSPAGKAPTKPKTSTKGKTPAKSTAEKPKGKIATASKTKS

Subcellular Location(s)

nucl 26.5, cyto_nucl 14

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR008851 TFIIF-alpha
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003677 F:DNA binding GO:0032968 P:positive regulation of transcription elongation by RNA polymerase II GO:0006367 P:transcription initiation at RNA polymerase II promoter

Amino Acid Sequences

MARAKKRDNDRWMMRRWGKQNDNEKKIADEEGGIVELKSVMKTVENEEDLFGSDDEGLRRPRRGIESDEEMEFEQVFEDDEEELPDDANPIDEENAEVVKLKKKAIHKPTSLEGEDENEDSFKLTQEGIQLKKLVRKFDDNEAYDDSDQESNPYASEIEESEEELSSESPAITPIIGAAGTKPSPAGKAPTKPKTSTKGKTPAKSTAEKPKGKIATASKTKSTAAKPIKSLSNLSASEEVPVKQKLKSSDIPAAKVPSKSHVKNMTAIPMSSTPEDSTKKPSSKPKSLKSVSPTSSKTSVSQSQIALKKQKPATTVRQPVSEMATSFGKKSSAHDSFVSDDDKSIKRTKQSETSTATASINRSANANISSTVRTSNGGVVKRVREGEDSTSFTGKKVRTDKPVSGPQTSTAAQGTDSSNSRLISEREVRQIINKNSELTVTTIIKAFRKRIHEDARNKERLLEITKNIAVLKNGYLVLK

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.81
2	0.8
3	0.79
4	0.79
5	0.77
6	0.78
7	0.82
8	0.82
9	0.81
10	0.77
11	0.69
12	0.62
13	0.55
14	0.48
15	0.38
16	0.28
17	0.22
18	0.19
19	0.18
20	0.16
21	0.13
22	0.11
23	0.11
24	0.11
25	0.09
26	0.09
27	0.08
28	0.11
29	0.13
30	0.18
31	0.24
32	0.25
33	0.25
34	0.26
35	0.26
36	0.24
37	0.24
38	0.19
39	0.13
40	0.11
41	0.13
42	0.13
43	0.17
44	0.23
45	0.24
46	0.27
47	0.29
48	0.34
49	0.39
50	0.42
51	0.44
52	0.44
53	0.49
54	0.49
55	0.47
56	0.42
57	0.36
58	0.32
59	0.25
60	0.18
61	0.11
62	0.08
63	0.08
64	0.07
65	0.07
66	0.07
67	0.08
68	0.09
69	0.1
70	0.1
71	0.09
72	0.09
73	0.09
74	0.08
75	0.09
76	0.08
77	0.07
78	0.08
79	0.07
80	0.08
81	0.09
82	0.09
83	0.08
84	0.1
85	0.11
86	0.17
87	0.19
88	0.21
89	0.26
90	0.34
91	0.44
92	0.53
93	0.6
94	0.59
95	0.61
96	0.65
97	0.67
98	0.59
99	0.51
100	0.41
101	0.34
102	0.31
103	0.27
104	0.21
105	0.14
106	0.13
107	0.13
108	0.12
109	0.09
110	0.09
111	0.08
112	0.09
113	0.15
114	0.21
115	0.22
116	0.24
117	0.27
118	0.28
119	0.34
120	0.36
121	0.36
122	0.34
123	0.39
124	0.4
125	0.46
126	0.53
127	0.48
128	0.49
129	0.46
130	0.45
131	0.37
132	0.34
133	0.26
134	0.19
135	0.17
136	0.15
137	0.14
138	0.11
139	0.11
140	0.11
141	0.09
142	0.08
143	0.09
144	0.08
145	0.08
146	0.08
147	0.09
148	0.09
149	0.09
150	0.09
151	0.08
152	0.08
153	0.06
154	0.06
155	0.06
156	0.05
157	0.05
158	0.06
159	0.05
160	0.04
161	0.04
162	0.04
163	0.04
164	0.04
165	0.04
166	0.07
167	0.07
168	0.07
169	0.08
170	0.08
171	0.09
172	0.1
173	0.16
174	0.18
175	0.26
176	0.35
177	0.43
178	0.48
179	0.5
180	0.55
181	0.58
182	0.62
183	0.59
184	0.59
185	0.61
186	0.64
187	0.66
188	0.64
189	0.64
190	0.6
191	0.59
192	0.55
193	0.55
194	0.57
195	0.55
196	0.52
197	0.52
198	0.48
199	0.44
200	0.45
201	0.39
202	0.39
203	0.44
204	0.44
205	0.38
206	0.38
207	0.38
208	0.37
209	0.34
210	0.34
211	0.34
212	0.35
213	0.35
214	0.37
215	0.39
216	0.35
217	0.35
218	0.28
219	0.26
220	0.23
221	0.23
222	0.22
223	0.19
224	0.18
225	0.18
226	0.17
227	0.13
228	0.15
229	0.15
230	0.14
231	0.17
232	0.19
233	0.24
234	0.26
235	0.28
236	0.33
237	0.34
238	0.34
239	0.33
240	0.33
241	0.3
242	0.29
243	0.25
244	0.24
245	0.29
246	0.29
247	0.34
248	0.38
249	0.37
250	0.39
251	0.4
252	0.39
253	0.32
254	0.31
255	0.26
256	0.2
257	0.2
258	0.16
259	0.16
260	0.11
261	0.15
262	0.18
263	0.17
264	0.24
265	0.28
266	0.31
267	0.36
268	0.45
269	0.49
270	0.58
271	0.65
272	0.65
273	0.69
274	0.69
275	0.68
276	0.65
277	0.65
278	0.57
279	0.55
280	0.5
281	0.44
282	0.44
283	0.4
284	0.35
285	0.32
286	0.34
287	0.31
288	0.31
289	0.28
290	0.33
291	0.36
292	0.39
293	0.42
294	0.38
295	0.43
296	0.44
297	0.46
298	0.42
299	0.44
300	0.49
301	0.51
302	0.58
303	0.52
304	0.51
305	0.49
306	0.47
307	0.44
308	0.35
309	0.25
310	0.19
311	0.2
312	0.18
313	0.18
314	0.18
315	0.16
316	0.15
317	0.17
318	0.24
319	0.24
320	0.26
321	0.26
322	0.28
323	0.28
324	0.3
325	0.29
326	0.2
327	0.18
328	0.2
329	0.21
330	0.22
331	0.26
332	0.27
333	0.32
334	0.37
335	0.42
336	0.47
337	0.51
338	0.54
339	0.54
340	0.53
341	0.48
342	0.45
343	0.4
344	0.33
345	0.29
346	0.26
347	0.22
348	0.2
349	0.19
350	0.18
351	0.2
352	0.18
353	0.18
354	0.14
355	0.15
356	0.16
357	0.16
358	0.17
359	0.15
360	0.15
361	0.15
362	0.19
363	0.22
364	0.23
365	0.26
366	0.29
367	0.31
368	0.34
369	0.35
370	0.31
371	0.29
372	0.3
373	0.33
374	0.33
375	0.35
376	0.33
377	0.35
378	0.33
379	0.3
380	0.34
381	0.29
382	0.32
383	0.37
384	0.41
385	0.47
386	0.54
387	0.6
388	0.62
389	0.7
390	0.66
391	0.62
392	0.57
393	0.49
394	0.47
395	0.41
396	0.34
397	0.26
398	0.21
399	0.17
400	0.18
401	0.18
402	0.17
403	0.19
404	0.2
405	0.22
406	0.21
407	0.22
408	0.24
409	0.24
410	0.28
411	0.33
412	0.35
413	0.4
414	0.42
415	0.41
416	0.45
417	0.53
418	0.51
419	0.52
420	0.49
421	0.44
422	0.43
423	0.43
424	0.37
425	0.3
426	0.29
427	0.22
428	0.22
429	0.23
430	0.25
431	0.29
432	0.34
433	0.38
434	0.38
435	0.45
436	0.5
437	0.57
438	0.65
439	0.7
440	0.74
441	0.78
442	0.82
443	0.81
444	0.75
445	0.68
446	0.61
447	0.57
448	0.55
449	0.51
450	0.44
451	0.44
452	0.45
453	0.43
454	0.41
455	0.37
456	0.32
457	0.27
458	0.25
459	0.22

A0A372QIQ9

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer