Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A372QU42

Protein Details
Accession A0A372QU42    Localization Confidence High Confidence Score 18.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
29-49DELTSVKPRKQPPPYGQRSGWHydrophilic
363-389EKVREREELRRDRRKEREREYRLSRMGBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
214-228KFKHKKIPRGPPSPP
317-327KEKEEKEKRLR
371-381LRRDRRKERER
Subcellular Location(s) nucl 17.5, mito_nucl 12, mito 5.5, cyto 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR017862  SKI-int_prot_SKIP  
IPR004015  SKI-int_prot_SKIP_SNW-dom  
Gene Ontology GO:0005681  C:spliceosomal complex  
GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
Pfam View protein in Pfam  
PF02731  SKIP_SNW  
Amino Acid Sequences MLCSIHVLPKPRQQLLSSEQQNKYERKYDELTSVKPRKQPPPYGQRSGWKPKTQEDFGNGGAFPEIHVAQYPLDMGRSTTTKSVESLALQVDAEGNIQYDAIAKHGHTESRVIHSQFKDLVPLNQRADIEKVTLERPGEDEVKETTEKTREALEKIVQGKIKAAQPKNVKVNKPLEPTYIRYTPGQQGETYNSGATQRIIRMVEMPVDPMEPPKFKHKKIPRGPPSPPAPVLHSPPRKVTAKEQQEWIIPPCISNWKNAKGYTIPLDKRLAADGRGLQEVTINDNFSKLSEALFAADRHAREEVKQRALMRDKLAQKEKEEKEKRLRMLAQKAREERAGISSASGGATGAVAESESESESDEEKVREREELRRDRRKEREREYRLSRMGAEQRAKYLAREQNRDISEKIALGLAKPTLSKESMFDARLFNQSEGLDSGFKDDEAYDLYDKPLFAGASSSSIYRPKKEYDSDLYGGGNAESVNKMLNVDRFGITKGFQGADAAHSRDGPVEFEKEEADPFGFNQFLDDAKKGSKRGLDTS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.53
2 0.52
3 0.57
4 0.57
5 0.58
6 0.57
7 0.61
8 0.66
9 0.63
10 0.64
11 0.62
12 0.55
13 0.52
14 0.53
15 0.49
16 0.51
17 0.52
18 0.51
19 0.54
20 0.61
21 0.6
22 0.62
23 0.67
24 0.68
25 0.72
26 0.76
27 0.76
28 0.78
29 0.81
30 0.82
31 0.8
32 0.79
33 0.79
34 0.8
35 0.79
36 0.75
37 0.7
38 0.7
39 0.74
40 0.69
41 0.65
42 0.6
43 0.55
44 0.49
45 0.48
46 0.39
47 0.3
48 0.26
49 0.2
50 0.15
51 0.13
52 0.12
53 0.09
54 0.1
55 0.11
56 0.11
57 0.11
58 0.12
59 0.09
60 0.1
61 0.1
62 0.1
63 0.12
64 0.14
65 0.16
66 0.18
67 0.2
68 0.2
69 0.21
70 0.22
71 0.21
72 0.2
73 0.2
74 0.18
75 0.16
76 0.15
77 0.14
78 0.12
79 0.11
80 0.1
81 0.08
82 0.07
83 0.06
84 0.06
85 0.06
86 0.08
87 0.08
88 0.09
89 0.1
90 0.09
91 0.14
92 0.16
93 0.18
94 0.16
95 0.2
96 0.21
97 0.27
98 0.33
99 0.31
100 0.36
101 0.35
102 0.38
103 0.37
104 0.35
105 0.33
106 0.29
107 0.33
108 0.32
109 0.37
110 0.35
111 0.35
112 0.35
113 0.32
114 0.33
115 0.28
116 0.23
117 0.19
118 0.19
119 0.16
120 0.19
121 0.17
122 0.15
123 0.16
124 0.18
125 0.19
126 0.17
127 0.18
128 0.17
129 0.2
130 0.2
131 0.19
132 0.19
133 0.21
134 0.21
135 0.2
136 0.25
137 0.24
138 0.26
139 0.29
140 0.28
141 0.3
142 0.32
143 0.35
144 0.3
145 0.27
146 0.27
147 0.28
148 0.3
149 0.33
150 0.33
151 0.37
152 0.42
153 0.5
154 0.58
155 0.61
156 0.59
157 0.57
158 0.62
159 0.62
160 0.6
161 0.55
162 0.5
163 0.46
164 0.48
165 0.46
166 0.42
167 0.36
168 0.31
169 0.33
170 0.33
171 0.34
172 0.31
173 0.25
174 0.25
175 0.27
176 0.28
177 0.25
178 0.19
179 0.15
180 0.15
181 0.15
182 0.14
183 0.12
184 0.1
185 0.13
186 0.13
187 0.13
188 0.14
189 0.14
190 0.16
191 0.14
192 0.14
193 0.11
194 0.12
195 0.11
196 0.13
197 0.15
198 0.13
199 0.15
200 0.25
201 0.31
202 0.32
203 0.43
204 0.5
205 0.58
206 0.66
207 0.76
208 0.75
209 0.77
210 0.78
211 0.75
212 0.71
213 0.65
214 0.57
215 0.47
216 0.43
217 0.37
218 0.38
219 0.4
220 0.4
221 0.37
222 0.37
223 0.41
224 0.39
225 0.39
226 0.41
227 0.42
228 0.45
229 0.46
230 0.46
231 0.43
232 0.42
233 0.41
234 0.36
235 0.29
236 0.2
237 0.18
238 0.16
239 0.23
240 0.21
241 0.25
242 0.28
243 0.3
244 0.34
245 0.34
246 0.35
247 0.28
248 0.29
249 0.29
250 0.32
251 0.27
252 0.27
253 0.28
254 0.26
255 0.25
256 0.25
257 0.2
258 0.14
259 0.15
260 0.14
261 0.14
262 0.14
263 0.13
264 0.11
265 0.12
266 0.12
267 0.13
268 0.12
269 0.11
270 0.1
271 0.11
272 0.11
273 0.09
274 0.11
275 0.07
276 0.07
277 0.07
278 0.07
279 0.08
280 0.1
281 0.09
282 0.1
283 0.12
284 0.12
285 0.12
286 0.14
287 0.13
288 0.14
289 0.23
290 0.27
291 0.29
292 0.32
293 0.32
294 0.37
295 0.41
296 0.42
297 0.36
298 0.38
299 0.39
300 0.43
301 0.49
302 0.45
303 0.44
304 0.51
305 0.52
306 0.55
307 0.56
308 0.56
309 0.6
310 0.64
311 0.62
312 0.59
313 0.61
314 0.57
315 0.62
316 0.61
317 0.58
318 0.59
319 0.6
320 0.55
321 0.5
322 0.43
323 0.34
324 0.3
325 0.25
326 0.17
327 0.15
328 0.12
329 0.12
330 0.11
331 0.09
332 0.06
333 0.04
334 0.04
335 0.03
336 0.03
337 0.03
338 0.03
339 0.03
340 0.03
341 0.04
342 0.04
343 0.04
344 0.05
345 0.06
346 0.07
347 0.09
348 0.11
349 0.11
350 0.14
351 0.16
352 0.16
353 0.2
354 0.21
355 0.28
356 0.36
357 0.46
358 0.53
359 0.61
360 0.67
361 0.72
362 0.8
363 0.82
364 0.82
365 0.81
366 0.83
367 0.81
368 0.84
369 0.82
370 0.8
371 0.73
372 0.65
373 0.56
374 0.52
375 0.5
376 0.48
377 0.46
378 0.38
379 0.37
380 0.39
381 0.38
382 0.33
383 0.35
384 0.35
385 0.37
386 0.42
387 0.43
388 0.47
389 0.49
390 0.5
391 0.42
392 0.37
393 0.31
394 0.25
395 0.23
396 0.17
397 0.15
398 0.12
399 0.14
400 0.12
401 0.11
402 0.11
403 0.13
404 0.14
405 0.15
406 0.15
407 0.15
408 0.2
409 0.23
410 0.24
411 0.25
412 0.24
413 0.25
414 0.3
415 0.31
416 0.25
417 0.24
418 0.22
419 0.22
420 0.2
421 0.19
422 0.15
423 0.13
424 0.16
425 0.13
426 0.13
427 0.12
428 0.11
429 0.1
430 0.12
431 0.14
432 0.13
433 0.13
434 0.15
435 0.16
436 0.16
437 0.15
438 0.16
439 0.13
440 0.11
441 0.12
442 0.12
443 0.13
444 0.14
445 0.14
446 0.14
447 0.22
448 0.25
449 0.27
450 0.31
451 0.33
452 0.4
453 0.44
454 0.49
455 0.49
456 0.54
457 0.51
458 0.48
459 0.43
460 0.36
461 0.31
462 0.24
463 0.17
464 0.09
465 0.09
466 0.09
467 0.09
468 0.09
469 0.09
470 0.1
471 0.13
472 0.17
473 0.17
474 0.2
475 0.21
476 0.21
477 0.23
478 0.23
479 0.21
480 0.2
481 0.21
482 0.19
483 0.17
484 0.17
485 0.16
486 0.2
487 0.23
488 0.23
489 0.21
490 0.2
491 0.21
492 0.23
493 0.22
494 0.21
495 0.2
496 0.21
497 0.2
498 0.21
499 0.22
500 0.2
501 0.2
502 0.19
503 0.16
504 0.14
505 0.14
506 0.16
507 0.15
508 0.14
509 0.15
510 0.14
511 0.15
512 0.19
513 0.19
514 0.19
515 0.25
516 0.3
517 0.3
518 0.35
519 0.38