Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A372QCX5

Protein Details
Accession A0A372QCX5    Localization Confidence High Confidence Score 21.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
3-22SYPSIPSQQQQQQQHQQQQQHydrophilic
337-364GTKFRIVYPHDRKRPKKTKEFKFSLQQLHydrophilic
605-631DKIEKDRERDARRKRRQTRGRRGVILPBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
348-353RKRPKK
610-628DRERDARRKRRQTRGRRGV
Subcellular Location(s) nucl 25.5, cyto_nucl 14
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR006939  SNF5  
IPR000679  Znf_GATA  
IPR013088  Znf_NHR/GATA  
Gene Ontology GO:0000228  C:nuclear chromosome  
GO:0070603  C:SWI/SNF superfamily-type complex  
GO:0043565  F:sequence-specific DNA binding  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
GO:0006338  P:chromatin remodeling  
GO:0006355  P:regulation of DNA-templated transcription  
Pfam View protein in Pfam  
PF00320  GATA  
PF04855  SNF5  
CDD cd00202  ZnF_GATA  
Amino Acid Sequences MDSYPSIPSQQQQQQQHQQQQQAGYNNNPLNHALLQQAPTHQYNFGTHSINTRVMNTQQQHMAMERNYGAMGNPNLQQMRGLNGEGGNNMANQYTFQGRQSLQTSSAHPIPPISALGGPIYNNNNMNTTNMLGFPSQNNINGLGLEVFQQPVINRALGQTVSQRPNIMLLQQQQQQQQQQQQQQIQQRQYQQQHHQQNQQQQQLAAARQRQRIQQQQQQMMQQIRRPMTNPPPAQNLHQRSSHQKQSAEPVKKPASTVAKPYEPAPDLTDVQKQYLEQYVRRDTLYQKALDLQHKRQMNIISEKRKEITQAELRHQTRQSTLLFGPGYEGYGNGITGTKFRIVYPHDRKRPKKTKEFKFSLQQLREIAEKEDLLVPIRLEIDGADGYKLRDTFTWNINETLITPEHFAEVLCDDLHFPVATFVPAIVKQIRDQLQGYISHPLSSLDQFSTSPILPSLSNPSEDPDIKEEVDNENTLSNSEESNIHEELRILIKIDVTIGNISLVDQFEWDVNCQKNDPELFAEILTAELGLGGEFRTAIAHSIREQIQIYVKSLILVGHPFDGSPIQDDDLRQSLLPPVTNIIRKEDTVDQHTPILVELTEAEIDKIEKDRERDARRKRRQTRGRRGVILPDREPPKTHRTLLHSTTIIPDPTDESGFITLISSGMPPVMRKASSMGYDNYSAISEKVPTPGKVRGRGRTAGSGLRSIISVNSPDITDLNNTGRSGSVGPSSQGRESRDSLKKSSRRTGKESEEWHCDGCGCPQTATPLLRKGPNGDKTLCNACGKSLDTMNSWNHPKGLYFQKNNTLRPISQTTNEDELGLIKQETNQSMDKPLQPSQDNLSTPNLPFDFTINDKQPNTLNEQNLVSKQQFETRENQNLAHSPVTSAKSPVTTPNTPSNKSVFPEWIIQQREQLQQKYPRDRFEIVQKSENFRIKCSDCPGRLYQPGPGLSLENFEIHLKNRDHRFNVEKRLNPDWTSHVAETSGSVIDNGGTIPGTIDASEFSSPVSGTGDPFTSLNTNNRTIGLAEGPITSNIPMRSDFSRLHSSSSQSLEMSGTESARSSRGGMEITSSINDVNSPGYEVAAVEVFIDNSNGIPHT
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.66
2 0.74
3 0.81
4 0.78
5 0.77
6 0.73
7 0.7
8 0.67
9 0.63
10 0.58
11 0.52
12 0.54
13 0.51
14 0.48
15 0.44
16 0.38
17 0.35
18 0.32
19 0.29
20 0.23
21 0.23
22 0.24
23 0.25
24 0.27
25 0.28
26 0.3
27 0.3
28 0.29
29 0.27
30 0.28
31 0.3
32 0.3
33 0.29
34 0.27
35 0.31
36 0.34
37 0.37
38 0.35
39 0.33
40 0.33
41 0.33
42 0.42
43 0.38
44 0.39
45 0.38
46 0.38
47 0.37
48 0.35
49 0.37
50 0.29
51 0.31
52 0.26
53 0.23
54 0.22
55 0.2
56 0.18
57 0.19
58 0.2
59 0.19
60 0.21
61 0.26
62 0.26
63 0.26
64 0.28
65 0.22
66 0.24
67 0.24
68 0.22
69 0.19
70 0.2
71 0.21
72 0.19
73 0.19
74 0.15
75 0.13
76 0.13
77 0.11
78 0.1
79 0.09
80 0.12
81 0.15
82 0.16
83 0.17
84 0.22
85 0.22
86 0.28
87 0.3
88 0.3
89 0.28
90 0.3
91 0.32
92 0.32
93 0.37
94 0.32
95 0.29
96 0.27
97 0.26
98 0.24
99 0.22
100 0.18
101 0.13
102 0.13
103 0.14
104 0.14
105 0.14
106 0.16
107 0.19
108 0.21
109 0.22
110 0.23
111 0.24
112 0.23
113 0.24
114 0.22
115 0.2
116 0.18
117 0.16
118 0.17
119 0.15
120 0.16
121 0.15
122 0.18
123 0.19
124 0.2
125 0.2
126 0.2
127 0.2
128 0.18
129 0.18
130 0.13
131 0.11
132 0.11
133 0.11
134 0.1
135 0.1
136 0.11
137 0.1
138 0.13
139 0.15
140 0.13
141 0.13
142 0.13
143 0.16
144 0.15
145 0.17
146 0.2
147 0.27
148 0.3
149 0.31
150 0.31
151 0.29
152 0.32
153 0.31
154 0.26
155 0.24
156 0.24
157 0.3
158 0.34
159 0.39
160 0.4
161 0.45
162 0.49
163 0.5
164 0.54
165 0.56
166 0.58
167 0.61
168 0.61
169 0.63
170 0.66
171 0.67
172 0.65
173 0.63
174 0.63
175 0.64
176 0.67
177 0.69
178 0.69
179 0.71
180 0.75
181 0.76
182 0.78
183 0.75
184 0.76
185 0.76
186 0.74
187 0.66
188 0.56
189 0.53
190 0.48
191 0.46
192 0.42
193 0.41
194 0.41
195 0.45
196 0.49
197 0.51
198 0.56
199 0.62
200 0.65
201 0.65
202 0.68
203 0.69
204 0.69
205 0.67
206 0.64
207 0.61
208 0.55
209 0.51
210 0.48
211 0.43
212 0.41
213 0.38
214 0.39
215 0.42
216 0.49
217 0.49
218 0.46
219 0.51
220 0.51
221 0.55
222 0.57
223 0.54
224 0.48
225 0.48
226 0.48
227 0.51
228 0.56
229 0.59
230 0.55
231 0.5
232 0.49
233 0.55
234 0.61
235 0.59
236 0.54
237 0.54
238 0.53
239 0.52
240 0.5
241 0.47
242 0.46
243 0.41
244 0.46
245 0.44
246 0.42
247 0.42
248 0.43
249 0.42
250 0.34
251 0.33
252 0.28
253 0.26
254 0.24
255 0.25
256 0.3
257 0.24
258 0.24
259 0.24
260 0.21
261 0.2
262 0.25
263 0.26
264 0.23
265 0.29
266 0.34
267 0.34
268 0.35
269 0.35
270 0.31
271 0.36
272 0.38
273 0.32
274 0.27
275 0.31
276 0.35
277 0.41
278 0.45
279 0.41
280 0.43
281 0.46
282 0.45
283 0.44
284 0.44
285 0.42
286 0.46
287 0.49
288 0.52
289 0.51
290 0.54
291 0.5
292 0.47
293 0.43
294 0.35
295 0.35
296 0.34
297 0.37
298 0.4
299 0.49
300 0.5
301 0.52
302 0.52
303 0.45
304 0.39
305 0.38
306 0.32
307 0.27
308 0.26
309 0.25
310 0.24
311 0.21
312 0.21
313 0.17
314 0.17
315 0.12
316 0.12
317 0.08
318 0.08
319 0.08
320 0.06
321 0.07
322 0.06
323 0.07
324 0.09
325 0.1
326 0.11
327 0.11
328 0.16
329 0.19
330 0.3
331 0.4
332 0.49
333 0.56
334 0.66
335 0.73
336 0.8
337 0.86
338 0.84
339 0.85
340 0.85
341 0.86
342 0.87
343 0.87
344 0.82
345 0.8
346 0.8
347 0.78
348 0.7
349 0.62
350 0.52
351 0.47
352 0.43
353 0.34
354 0.27
355 0.19
356 0.16
357 0.14
358 0.15
359 0.14
360 0.14
361 0.13
362 0.12
363 0.11
364 0.11
365 0.1
366 0.08
367 0.07
368 0.07
369 0.07
370 0.07
371 0.07
372 0.07
373 0.08
374 0.1
375 0.1
376 0.09
377 0.09
378 0.14
379 0.17
380 0.21
381 0.25
382 0.25
383 0.25
384 0.25
385 0.24
386 0.2
387 0.2
388 0.15
389 0.11
390 0.11
391 0.1
392 0.11
393 0.1
394 0.1
395 0.08
396 0.07
397 0.08
398 0.07
399 0.07
400 0.06
401 0.07
402 0.07
403 0.06
404 0.06
405 0.06
406 0.06
407 0.06
408 0.06
409 0.06
410 0.07
411 0.07
412 0.09
413 0.1
414 0.1
415 0.11
416 0.18
417 0.2
418 0.21
419 0.21
420 0.21
421 0.22
422 0.22
423 0.23
424 0.22
425 0.2
426 0.18
427 0.17
428 0.16
429 0.15
430 0.14
431 0.14
432 0.09
433 0.1
434 0.1
435 0.1
436 0.12
437 0.1
438 0.1
439 0.09
440 0.09
441 0.09
442 0.1
443 0.15
444 0.14
445 0.15
446 0.15
447 0.17
448 0.19
449 0.19
450 0.2
451 0.16
452 0.17
453 0.16
454 0.17
455 0.16
456 0.15
457 0.16
458 0.15
459 0.12
460 0.11
461 0.11
462 0.11
463 0.1
464 0.08
465 0.07
466 0.08
467 0.09
468 0.09
469 0.13
470 0.13
471 0.12
472 0.12
473 0.12
474 0.12
475 0.12
476 0.11
477 0.09
478 0.09
479 0.08
480 0.08
481 0.09
482 0.08
483 0.07
484 0.07
485 0.06
486 0.06
487 0.05
488 0.06
489 0.06
490 0.06
491 0.05
492 0.05
493 0.05
494 0.06
495 0.06
496 0.07
497 0.11
498 0.12
499 0.12
500 0.13
501 0.13
502 0.15
503 0.15
504 0.16
505 0.12
506 0.12
507 0.12
508 0.12
509 0.11
510 0.08
511 0.08
512 0.06
513 0.04
514 0.03
515 0.02
516 0.02
517 0.02
518 0.02
519 0.02
520 0.02
521 0.02
522 0.03
523 0.03
524 0.03
525 0.05
526 0.05
527 0.06
528 0.07
529 0.11
530 0.11
531 0.13
532 0.13
533 0.13
534 0.16
535 0.16
536 0.17
537 0.14
538 0.14
539 0.12
540 0.12
541 0.11
542 0.08
543 0.08
544 0.07
545 0.06
546 0.06
547 0.06
548 0.06
549 0.06
550 0.06
551 0.07
552 0.07
553 0.07
554 0.08
555 0.08
556 0.1
557 0.11
558 0.11
559 0.09
560 0.09
561 0.11
562 0.11
563 0.12
564 0.1
565 0.1
566 0.13
567 0.16
568 0.16
569 0.18
570 0.18
571 0.18
572 0.21
573 0.23
574 0.23
575 0.26
576 0.27
577 0.23
578 0.22
579 0.22
580 0.19
581 0.15
582 0.13
583 0.07
584 0.05
585 0.04
586 0.05
587 0.05
588 0.05
589 0.05
590 0.05
591 0.05
592 0.06
593 0.07
594 0.09
595 0.11
596 0.13
597 0.19
598 0.28
599 0.35
600 0.44
601 0.53
602 0.62
603 0.71
604 0.8
605 0.83
606 0.86
607 0.89
608 0.91
609 0.91
610 0.91
611 0.87
612 0.81
613 0.73
614 0.71
615 0.67
616 0.61
617 0.51
618 0.47
619 0.43
620 0.39
621 0.39
622 0.35
623 0.35
624 0.35
625 0.36
626 0.35
627 0.38
628 0.44
629 0.45
630 0.45
631 0.38
632 0.34
633 0.33
634 0.3
635 0.24
636 0.17
637 0.14
638 0.11
639 0.12
640 0.12
641 0.09
642 0.08
643 0.09
644 0.09
645 0.08
646 0.07
647 0.06
648 0.05
649 0.05
650 0.04
651 0.04
652 0.05
653 0.05
654 0.05
655 0.07
656 0.1
657 0.1
658 0.1
659 0.12
660 0.14
661 0.16
662 0.18
663 0.18
664 0.18
665 0.19
666 0.18
667 0.16
668 0.14
669 0.13
670 0.1
671 0.1
672 0.09
673 0.08
674 0.13
675 0.15
676 0.16
677 0.19
678 0.26
679 0.31
680 0.38
681 0.43
682 0.45
683 0.47
684 0.5
685 0.49
686 0.46
687 0.43
688 0.39
689 0.34
690 0.29
691 0.25
692 0.21
693 0.18
694 0.14
695 0.12
696 0.1
697 0.09
698 0.08
699 0.08
700 0.08
701 0.08
702 0.09
703 0.09
704 0.09
705 0.1
706 0.12
707 0.13
708 0.13
709 0.13
710 0.13
711 0.13
712 0.13
713 0.12
714 0.12
715 0.1
716 0.11
717 0.14
718 0.16
719 0.18
720 0.2
721 0.22
722 0.24
723 0.26
724 0.35
725 0.39
726 0.41
727 0.44
728 0.5
729 0.53
730 0.56
731 0.62
732 0.62
733 0.61
734 0.65
735 0.67
736 0.65
737 0.67
738 0.66
739 0.62
740 0.59
741 0.54
742 0.48
743 0.4
744 0.32
745 0.25
746 0.23
747 0.23
748 0.17
749 0.16
750 0.16
751 0.2
752 0.24
753 0.26
754 0.25
755 0.26
756 0.28
757 0.31
758 0.31
759 0.33
760 0.38
761 0.42
762 0.43
763 0.4
764 0.39
765 0.4
766 0.44
767 0.42
768 0.35
769 0.29
770 0.25
771 0.25
772 0.24
773 0.23
774 0.2
775 0.19
776 0.18
777 0.23
778 0.24
779 0.27
780 0.29
781 0.28
782 0.26
783 0.25
784 0.24
785 0.25
786 0.34
787 0.37
788 0.39
789 0.42
790 0.51
791 0.57
792 0.58
793 0.58
794 0.52
795 0.43
796 0.44
797 0.45
798 0.39
799 0.37
800 0.37
801 0.36
802 0.35
803 0.35
804 0.29
805 0.23
806 0.21
807 0.18
808 0.16
809 0.12
810 0.08
811 0.1
812 0.13
813 0.15
814 0.17
815 0.18
816 0.18
817 0.22
818 0.25
819 0.27
820 0.28
821 0.31
822 0.33
823 0.33
824 0.34
825 0.35
826 0.38
827 0.35
828 0.33
829 0.33
830 0.3
831 0.29
832 0.32
833 0.27
834 0.21
835 0.21
836 0.2
837 0.19
838 0.2
839 0.27
840 0.25
841 0.3
842 0.3
843 0.31
844 0.34
845 0.32
846 0.36
847 0.36
848 0.34
849 0.31
850 0.33
851 0.34
852 0.33
853 0.34
854 0.27
855 0.24
856 0.23
857 0.27
858 0.3
859 0.3
860 0.34
861 0.38
862 0.45
863 0.44
864 0.44
865 0.41
866 0.39
867 0.39
868 0.34
869 0.27
870 0.21
871 0.24
872 0.26
873 0.23
874 0.22
875 0.2
876 0.21
877 0.22
878 0.27
879 0.29
880 0.3
881 0.33
882 0.42
883 0.47
884 0.47
885 0.49
886 0.46
887 0.42
888 0.41
889 0.4
890 0.33
891 0.3
892 0.32
893 0.33
894 0.37
895 0.37
896 0.35
897 0.37
898 0.39
899 0.45
900 0.46
901 0.46
902 0.47
903 0.52
904 0.61
905 0.67
906 0.67
907 0.64
908 0.64
909 0.63
910 0.58
911 0.6
912 0.6
913 0.54
914 0.57
915 0.55
916 0.56
917 0.61
918 0.64
919 0.54
920 0.46
921 0.49
922 0.44
923 0.46
924 0.47
925 0.49
926 0.44
927 0.49
928 0.52
929 0.51
930 0.54
931 0.5
932 0.47
933 0.44
934 0.43
935 0.38
936 0.33
937 0.28
938 0.23
939 0.25
940 0.21
941 0.15
942 0.15
943 0.15
944 0.16
945 0.17
946 0.25
947 0.26
948 0.32
949 0.4
950 0.47
951 0.49
952 0.54
953 0.61
954 0.61
955 0.69
956 0.7
957 0.68
958 0.66
959 0.69
960 0.66
961 0.59
962 0.53
963 0.48
964 0.45
965 0.44
966 0.39
967 0.33
968 0.28
969 0.27
970 0.24
971 0.2
972 0.15
973 0.09
974 0.09
975 0.08
976 0.08
977 0.08
978 0.07
979 0.06
980 0.05
981 0.05
982 0.06
983 0.06
984 0.07
985 0.06
986 0.07
987 0.07
988 0.1
989 0.1
990 0.1
991 0.09
992 0.1
993 0.1
994 0.1
995 0.12
996 0.1
997 0.11
998 0.13
999 0.14
1000 0.14
1001 0.14
1002 0.16
1003 0.16
1004 0.19
1005 0.25
1006 0.28
1007 0.3
1008 0.3
1009 0.31
1010 0.3
1011 0.27
1012 0.26
1013 0.21
1014 0.17
1015 0.15
1016 0.15
1017 0.16
1018 0.15
1019 0.16
1020 0.14
1021 0.16
1022 0.16
1023 0.17
1024 0.17
1025 0.2
1026 0.22
1027 0.25
1028 0.27
1029 0.29
1030 0.38
1031 0.36
1032 0.41
1033 0.41
1034 0.43
1035 0.43
1036 0.45
1037 0.4
1038 0.31
1039 0.31
1040 0.26
1041 0.23
1042 0.21
1043 0.17
1044 0.14
1045 0.12
1046 0.13
1047 0.14
1048 0.14
1049 0.15
1050 0.14
1051 0.15
1052 0.17
1053 0.17
1054 0.16
1055 0.19
1056 0.19
1057 0.2
1058 0.19
1059 0.18
1060 0.15
1061 0.14
1062 0.14
1063 0.11
1064 0.12
1065 0.1
1066 0.12
1067 0.12
1068 0.12
1069 0.12
1070 0.11
1071 0.12
1072 0.1
1073 0.1
1074 0.08
1075 0.08
1076 0.09
1077 0.09
1078 0.1
1079 0.08
1080 0.08