FuNGI

A0A372RCE2

Protein Details

Accession

A0A372RCE2

Localization Confidence

High

Confidence Score

18.5

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
59-85	DDDYEDNKRRDKKRHKGNKNDPSKFIL	Basic
247-266	LYSSKKFIKRLSPKEKQDLM	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
66-77	KRRDKKRHKGNK
648-656	RGRDRGRGR

Subcellular Location(s)

nucl 25.5, cyto_nucl 13.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR005824 KOW IPR005100 NGN-domain IPR036735 NGN_dom_sf IPR014722 Rib_L2_dom2 IPR039659 SPT5 IPR024945 Spt5_C_dom IPR022581 Spt5_N IPR008991 Translation_prot_SH3-like_sf
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0032784 P:regulation of DNA-templated transcription elongation GO:0006357 P:regulation of transcription by RNA polymerase II
Pfam	View protein in Pfam PF12815 CTD PF03439 Spt5-NGN PF11942 Spt5_N

Amino Acid Sequences

MSKRKQNLSDDDESRLNETDGGWSAGEEGEEATQDQQNEDYDDYEDYEQESEVQEEDEDDDYEDNKRRDKKRHKGNKNDPSKFILNEADVDDEEEEEDDDEDAIYGREDFIDNREIETELSAYHRDSTRLADIDIERSVFAEDNFDAERVAQVLNERYRSTAGRLSDDDDDLTKPELASVDKLFAVKCRKGHVYHAIEKLENLKKLRSDPLRIKKVIAIDGIEDFVYIEADKEQDVQNAAMRCNKYLYSSKKFIKRLSPKEKQDLMAPKRPRLNIQMGSFVRINKRDEYFGDLARVTSYTADELIEVEIIPRILVDQDGASLKRKRKETDTYIKTYNRGYLKVKYKIKDLVYSNMDLLLQDVEDFLKAKFDNETIMMELSNVASKITVYEIQDEIKVLQGSLKGSVGTVTSANDGVLTATDKDNSSKVFKVNSEECVKNINVHDYVQITNGPYQGQSGFVFNCDRHVMTMYLDHTNKQISVFAKDLKKCVQNSINNEFGGFRYFDLILLKDSSIGIIIDIRKAQKNYEYDVLNTENNLIKNVTSARIKRTLIDTKSQAFKKSDQVTTTKFESINNKQQSIYEVFRIYDSNVFVRTYDDDTNLGFSCFKAKDLKLKYESARPSNRINDPLINIPGQRSRSSNNYNRGGRGRDRGRGRGRQIYQNPLLNKRVQASQGALKGYQGTVKGVYGNMADVEFDAKLTTIKVELGQLFYVNEKGEALDPVLPRNHESSRNSMDMSPGLGSYSEPSWTTGLSKQQKSWGYSLGSAMTPNSHLLDNTNSGLNMEGSKTPALLHSSGSLSGSKTPALRNSSANNGNSSASLGSKTPAWDLGSKTPAYGIMSDGRDGSKTPAWDSGSHTPHTSGIVGSGSSTSGNNSVNSISNIFGSGGNSTTNAANSAMNMTTVETPGGYSTVATPAADAPNYPPVFTPANTGNLMPPTPRPFTPGNIPMTPANMIPQTPFATQHSANHAVHPGRDPKKPPDVKDFGEWLTPGIEVRIVPIDGIQSFENGRYDSRVGVVVRVDRPNSGFIKLDDSDGMTISVEQKYLKPTEVQRRDDIKVIFGEHKGELGFLAAIDNLEGVVRSQGGDHSFINIYYLAKYRGSEIEDLMQIS

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.47
2	0.4
3	0.32
4	0.24
5	0.21
6	0.2
7	0.19
8	0.19
9	0.16
10	0.15
11	0.15
12	0.15
13	0.14
14	0.1
15	0.09
16	0.08
17	0.08
18	0.09
19	0.11
20	0.13
21	0.13
22	0.14
23	0.15
24	0.16
25	0.18
26	0.18
27	0.17
28	0.16
29	0.17
30	0.19
31	0.18
32	0.17
33	0.15
34	0.15
35	0.14
36	0.13
37	0.14
38	0.12
39	0.11
40	0.11
41	0.1
42	0.1
43	0.12
44	0.13
45	0.12
46	0.12
47	0.12
48	0.13
49	0.18
50	0.24
51	0.25
52	0.31
53	0.4
54	0.47
55	0.58
56	0.68
57	0.74
58	0.78
59	0.87
60	0.9
61	0.92
62	0.95
63	0.95
64	0.95
65	0.91
66	0.84
67	0.8
68	0.73
69	0.63
70	0.56
71	0.49
72	0.39
73	0.34
74	0.32
75	0.27
76	0.22
77	0.22
78	0.18
79	0.14
80	0.13
81	0.11
82	0.1
83	0.08
84	0.09
85	0.07
86	0.07
87	0.07
88	0.07
89	0.07
90	0.06
91	0.06
92	0.06
93	0.06
94	0.07
95	0.08
96	0.09
97	0.12
98	0.18
99	0.18
100	0.19
101	0.2
102	0.2
103	0.19
104	0.19
105	0.16
106	0.11
107	0.13
108	0.13
109	0.13
110	0.17
111	0.18
112	0.18
113	0.19
114	0.23
115	0.26
116	0.26
117	0.26
118	0.27
119	0.26
120	0.28
121	0.28
122	0.24
123	0.18
124	0.17
125	0.18
126	0.14
127	0.12
128	0.13
129	0.11
130	0.13
131	0.14
132	0.14
133	0.13
134	0.12
135	0.13
136	0.1
137	0.1
138	0.08
139	0.11
140	0.18
141	0.23
142	0.25
143	0.25
144	0.26
145	0.29
146	0.3
147	0.31
148	0.29
149	0.27
150	0.29
151	0.3
152	0.32
153	0.31
154	0.3
155	0.27
156	0.23
157	0.22
158	0.18
159	0.19
160	0.16
161	0.13
162	0.13
163	0.14
164	0.14
165	0.16
166	0.16
167	0.16
168	0.16
169	0.17
170	0.17
171	0.21
172	0.27
173	0.28
174	0.3
175	0.34
176	0.39
177	0.41
178	0.48
179	0.52
180	0.53
181	0.56
182	0.6
183	0.57
184	0.51
185	0.5
186	0.51
187	0.46
188	0.43
189	0.37
190	0.34
191	0.35
192	0.38
193	0.47
194	0.45
195	0.48
196	0.53
197	0.62
198	0.67
199	0.65
200	0.63
201	0.57
202	0.55
203	0.49
204	0.41
205	0.31
206	0.23
207	0.22
208	0.21
209	0.18
210	0.13
211	0.1
212	0.08
213	0.07
214	0.06
215	0.05
216	0.05
217	0.06
218	0.06
219	0.08
220	0.09
221	0.11
222	0.12
223	0.13
224	0.16
225	0.18
226	0.2
227	0.24
228	0.24
229	0.23
230	0.24
231	0.24
232	0.24
233	0.31
234	0.38
235	0.4
236	0.48
237	0.54
238	0.6
239	0.65
240	0.65
241	0.68
242	0.7
243	0.73
244	0.75
245	0.78
246	0.77
247	0.81
248	0.8
249	0.7
250	0.67
251	0.67
252	0.63
253	0.63
254	0.6
255	0.56
256	0.58
257	0.59
258	0.55
259	0.52
260	0.53
261	0.51
262	0.49
263	0.52
264	0.46
265	0.48
266	0.45
267	0.41
268	0.38
269	0.35
270	0.36
271	0.31
272	0.33
273	0.32
274	0.31
275	0.36
276	0.33
277	0.3
278	0.3
279	0.25
280	0.23
281	0.21
282	0.2
283	0.13
284	0.1
285	0.1
286	0.08
287	0.08
288	0.08
289	0.07
290	0.07
291	0.07
292	0.07
293	0.06
294	0.06
295	0.06
296	0.06
297	0.05
298	0.05
299	0.05
300	0.05
301	0.05
302	0.05
303	0.04
304	0.06
305	0.09
306	0.1
307	0.16
308	0.22
309	0.27
310	0.33
311	0.38
312	0.41
313	0.46
314	0.55
315	0.58
316	0.64
317	0.65
318	0.64
319	0.66
320	0.64
321	0.58
322	0.51
323	0.47
324	0.39
325	0.36
326	0.35
327	0.36
328	0.43
329	0.5
330	0.56
331	0.51
332	0.53
333	0.56
334	0.54
335	0.53
336	0.47
337	0.45
338	0.41
339	0.4
340	0.35
341	0.29
342	0.26
343	0.19
344	0.16
345	0.09
346	0.06
347	0.05
348	0.05
349	0.05
350	0.05
351	0.06
352	0.05
353	0.08
354	0.09
355	0.09
356	0.1
357	0.11
358	0.12
359	0.12
360	0.13
361	0.11
362	0.11
363	0.1
364	0.09
365	0.09
366	0.08
367	0.07
368	0.06
369	0.05
370	0.05
371	0.05
372	0.05
373	0.07
374	0.1
375	0.1
376	0.12
377	0.13
378	0.14
379	0.14
380	0.14
381	0.13
382	0.13
383	0.12
384	0.09
385	0.1
386	0.11
387	0.11
388	0.12
389	0.12
390	0.09
391	0.09
392	0.09
393	0.08
394	0.07
395	0.07
396	0.07
397	0.07
398	0.07
399	0.07
400	0.07
401	0.06
402	0.05
403	0.05
404	0.06
405	0.06
406	0.07
407	0.08
408	0.08
409	0.1
410	0.11
411	0.13
412	0.15
413	0.16
414	0.18
415	0.19
416	0.2
417	0.25
418	0.26
419	0.29
420	0.31
421	0.3
422	0.28
423	0.29
424	0.28
425	0.25
426	0.24
427	0.22
428	0.18
429	0.18
430	0.18
431	0.16
432	0.17
433	0.14
434	0.14
435	0.12
436	0.12
437	0.12
438	0.11
439	0.09
440	0.1
441	0.09
442	0.1
443	0.09
444	0.1
445	0.09
446	0.1
447	0.12
448	0.11
449	0.13
450	0.12
451	0.12
452	0.11
453	0.13
454	0.12
455	0.11
456	0.14
457	0.14
458	0.17
459	0.18
460	0.17
461	0.17
462	0.17
463	0.16
464	0.14
465	0.15
466	0.12
467	0.14
468	0.16
469	0.2
470	0.25
471	0.26
472	0.28
473	0.29
474	0.33
475	0.31
476	0.35
477	0.38
478	0.38
479	0.43
480	0.45
481	0.44
482	0.39
483	0.38
484	0.32
485	0.25
486	0.21
487	0.15
488	0.1
489	0.08
490	0.09
491	0.09
492	0.1
493	0.1
494	0.09
495	0.1
496	0.09
497	0.08
498	0.08
499	0.07
500	0.06
501	0.05
502	0.04
503	0.06
504	0.06
505	0.07
506	0.09
507	0.11
508	0.13
509	0.14
510	0.15
511	0.18
512	0.2
513	0.22
514	0.25
515	0.24
516	0.22
517	0.24
518	0.25
519	0.19
520	0.17
521	0.16
522	0.14
523	0.14
524	0.14
525	0.11
526	0.09
527	0.1
528	0.11
529	0.12
530	0.14
531	0.16
532	0.19
533	0.24
534	0.24
535	0.24
536	0.3
537	0.34
538	0.32
539	0.35
540	0.34
541	0.32
542	0.38
543	0.38
544	0.36
545	0.3
546	0.3
547	0.34
548	0.37
549	0.36
550	0.31
551	0.34
552	0.33
553	0.34
554	0.34
555	0.28
556	0.23
557	0.23
558	0.28
559	0.31
560	0.38
561	0.37
562	0.36
563	0.34
564	0.34
565	0.35
566	0.32
567	0.27
568	0.2
569	0.18
570	0.17
571	0.17
572	0.17
573	0.15
574	0.13
575	0.12
576	0.11
577	0.11
578	0.11
579	0.11
580	0.12
581	0.12
582	0.13
583	0.13
584	0.13
585	0.13
586	0.13
587	0.14
588	0.13
589	0.12
590	0.09
591	0.08
592	0.11
593	0.11
594	0.13
595	0.15
596	0.16
597	0.25
598	0.29
599	0.36
600	0.34
601	0.39
602	0.39
603	0.42
604	0.46
605	0.45
606	0.47
607	0.43
608	0.44
609	0.46
610	0.47
611	0.42
612	0.4
613	0.34
614	0.3
615	0.3
616	0.27
617	0.22
618	0.19
619	0.17
620	0.19
621	0.19
622	0.19
623	0.18
624	0.19
625	0.25
626	0.34
627	0.39
628	0.43
629	0.49
630	0.5
631	0.51
632	0.53
633	0.5
634	0.45
635	0.47
636	0.43
637	0.42
638	0.45
639	0.51
640	0.55
641	0.58
642	0.59
643	0.6
644	0.58
645	0.6
646	0.6
647	0.59
648	0.55
649	0.52
650	0.5
651	0.46
652	0.46
653	0.38
654	0.36
655	0.3
656	0.28
657	0.25
658	0.23
659	0.21
660	0.22
661	0.24
662	0.23
663	0.21
664	0.18
665	0.18
666	0.16
667	0.16
668	0.12
669	0.1
670	0.09
671	0.09
672	0.1
673	0.09
674	0.1
675	0.08
676	0.08
677	0.07
678	0.06
679	0.06
680	0.05
681	0.06
682	0.05
683	0.05
684	0.05
685	0.05
686	0.05
687	0.05
688	0.05
689	0.05
690	0.06
691	0.06
692	0.09
693	0.09
694	0.1
695	0.11
696	0.11
697	0.1
698	0.1
699	0.11
700	0.09
701	0.08
702	0.07
703	0.07
704	0.08
705	0.08
706	0.08
707	0.11
708	0.11
709	0.14
710	0.16
711	0.16
712	0.16
713	0.2
714	0.22
715	0.24
716	0.27
717	0.31
718	0.34
719	0.35
720	0.35
721	0.31
722	0.29
723	0.23
724	0.22
725	0.15
726	0.1
727	0.09
728	0.08
729	0.08
730	0.08
731	0.08
732	0.08
733	0.08
734	0.09
735	0.1
736	0.1
737	0.12
738	0.14
739	0.22
740	0.3
741	0.32
742	0.32
743	0.39
744	0.43
745	0.44
746	0.43
747	0.38
748	0.32
749	0.31
750	0.3
751	0.24
752	0.2
753	0.17
754	0.15
755	0.11
756	0.1
757	0.1
758	0.1
759	0.09
760	0.09
761	0.1
762	0.13
763	0.14
764	0.15
765	0.14
766	0.13
767	0.13
768	0.13
769	0.12
770	0.1
771	0.09
772	0.09
773	0.1
774	0.1
775	0.1
776	0.1
777	0.11
778	0.14
779	0.13
780	0.13
781	0.13
782	0.14
783	0.14
784	0.15
785	0.14
786	0.12
787	0.13
788	0.14
789	0.14
790	0.15
791	0.17
792	0.21
793	0.26
794	0.27
795	0.28
796	0.3
797	0.36
798	0.4
799	0.39
800	0.35
801	0.32
802	0.3
803	0.26
804	0.24
805	0.17
806	0.12
807	0.12
808	0.1
809	0.09
810	0.1
811	0.11
812	0.11
813	0.13
814	0.14
815	0.17
816	0.2
817	0.25
818	0.27
819	0.27
820	0.26
821	0.23
822	0.23
823	0.21
824	0.18
825	0.14
826	0.15
827	0.16
828	0.17
829	0.17
830	0.16
831	0.16
832	0.16
833	0.18
834	0.16
835	0.16
836	0.17
837	0.22
838	0.24
839	0.25
840	0.3
841	0.35
842	0.36
843	0.36
844	0.35
845	0.31
846	0.29
847	0.29
848	0.23
849	0.14
850	0.12
851	0.11
852	0.1
853	0.09
854	0.09
855	0.08
856	0.08
857	0.08
858	0.08
859	0.1
860	0.12
861	0.11
862	0.12
863	0.13
864	0.15
865	0.16
866	0.16
867	0.14
868	0.12
869	0.13
870	0.13
871	0.12
872	0.11
873	0.1
874	0.1
875	0.1
876	0.1
877	0.1
878	0.1
879	0.1
880	0.1
881	0.1
882	0.1
883	0.1
884	0.12
885	0.1
886	0.1
887	0.1
888	0.1
889	0.1
890	0.11
891	0.1
892	0.08
893	0.08
894	0.08
895	0.09
896	0.07
897	0.06
898	0.07
899	0.09
900	0.1
901	0.09
902	0.1
903	0.11
904	0.14
905	0.13
906	0.13
907	0.13
908	0.21
909	0.22
910	0.21
911	0.19
912	0.21
913	0.24
914	0.24
915	0.26
916	0.2
917	0.24
918	0.25
919	0.25
920	0.24
921	0.23
922	0.24
923	0.21
924	0.23
925	0.24
926	0.27
927	0.27
928	0.29
929	0.29
930	0.33
931	0.4
932	0.42
933	0.42
934	0.39
935	0.42
936	0.38
937	0.37
938	0.34
939	0.26
940	0.22
941	0.17
942	0.16
943	0.15
944	0.18
945	0.19
946	0.19
947	0.21
948	0.21
949	0.26
950	0.27
951	0.3
952	0.34
953	0.37
954	0.36
955	0.37
956	0.4
957	0.35
958	0.36
959	0.38
960	0.4
961	0.39
962	0.45
963	0.49
964	0.5
965	0.6
966	0.65
967	0.64
968	0.65
969	0.66
970	0.63
971	0.63
972	0.6
973	0.5
974	0.46
975	0.41
976	0.31
977	0.25
978	0.22
979	0.16
980	0.12
981	0.12
982	0.09
983	0.11
984	0.13
985	0.12
986	0.11
987	0.12
988	0.14
989	0.12
990	0.15
991	0.13
992	0.12
993	0.13
994	0.15
995	0.16
996	0.15
997	0.16
998	0.18
999	0.19
1000	0.18
1001	0.18
1002	0.21
1003	0.19
1004	0.21
1005	0.24
1006	0.26
1007	0.3
1008	0.34
1009	0.34
1010	0.32
1011	0.33
1012	0.37
1013	0.35
1014	0.32
1015	0.29
1016	0.25
1017	0.3
1018	0.29
1019	0.28
1020	0.23
1021	0.23
1022	0.21
1023	0.19
1024	0.18
1025	0.12
1026	0.12
1027	0.14
1028	0.14
1029	0.13
1030	0.14
1031	0.15
1032	0.21
1033	0.23
1034	0.24
1035	0.27
1036	0.36
1037	0.46
1038	0.54
1039	0.58
1040	0.61
1041	0.65
1042	0.66
1043	0.66
1044	0.58
1045	0.5
1046	0.44
1047	0.42
1048	0.38
1049	0.33
1050	0.33
1051	0.26
1052	0.27
1053	0.23
1054	0.2
1055	0.16
1056	0.13
1057	0.11
1058	0.08
1059	0.09
1060	0.07
1061	0.07
1062	0.07
1063	0.07
1064	0.05
1065	0.05
1066	0.05
1067	0.05
1068	0.06
1069	0.07
1070	0.07
1071	0.08
1072	0.12
1073	0.14
1074	0.17
1075	0.16
1076	0.19
1077	0.2
1078	0.19
1079	0.2
1080	0.18
1081	0.17
1082	0.17
1083	0.2
1084	0.19
1085	0.2
1086	0.21
1087	0.23
1088	0.26
1089	0.29
1090	0.28
1091	0.27
1092	0.29

A0A372RCE2

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer